宏基因组二代测序诊断兽类衣原体重症肺炎合并多器官衰竭1例

兽类衣原体是一种革兰阴性专性细胞内病原体,属于衣原体科,可广泛感染动物,包括绵羊、山羊、牛和野生动物。人感染兽类衣原体是罕见病,临床症状无特异。本报告中的患者,男性,75岁,因腹痛、恶心、呕吐、腹泻伴发热、呼吸短促,被诊断为重症社区获得性肺炎、呼吸衰竭、休克和急性肾损伤。有羊密切接触史,胸部CT提示炎性渗出,右肺斑片影,左肺实变。通过宏基因组二代测序(mNGS)从患者支气管肺泡灌洗液中检测出兽类衣原体,结合临床表现、病史,确诊为兽类衣原体重症肺炎合并多器官衰竭。经针对性抗感染及综合治疗后,患者病情无明显改善,自动出院。通过报告此病例的诊疗经过,旨在提高临床医生对兽类衣原体感染的认识,早期采取针对性治疗,降低其死亡风险。

家畜衣原体ompA基因实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

为快速检测家畜衣原体,选取家畜衣原体ompA基因的高度保守区域,设计了针对家畜衣原体的引物和探针,优化反应条件,建立家畜衣原体荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法的最低检测限为1.68×10^(1)copies/μL,在1.68×10^(2)~1.68×10^(6)copies/μL范围内具有良好的线性关系;该方法可特异性检测家畜衣原体,与肺炎衣原体、沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体、流产衣原体4种4个菌株无交叉反应,表明特异性好;其批间重复试验和批内重复试验的变异系数分别为0.14%~0.51%、1.09%~1.49%,表明重复性良好。本方法可用于家畜衣原体的早期检测和流行病学调查。