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吴茱萸属4种药用植物的叶绿体基因组比较与系统发育分析
1
作者
张万祥
刘浩
+1 位作者
王龙
张水寒
《中医药导报》
2023年第6期44-50,65,共8页
目的:明确楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸和石虎4种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,为吴茱萸药材的分子鉴定提供依据。方法:使用CTAB法提取叶片总基因组DNA,通过Illumina NovaSeq 6000平台测序,再用SPAdes软件组装叶绿体基因组序...
目的:明确楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸和石虎4种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,为吴茱萸药材的分子鉴定提供依据。方法:使用CTAB法提取叶片总基因组DNA,通过Illumina NovaSeq 6000平台测序,再用SPAdes软件组装叶绿体基因组序列,利用condonW、REPuter、mVISTA等软件进行序列特征分析并构建ML系统发育树。结果:4种吴茱萸属植物叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组大小在158563~158762 bp之间,总GC含量为38.34%~38.37%。均注释到134个编码基因,包括89个蛋白编码基因(PCGs),37个tRNA基因和8个rRNA基因。共检测到79~98个简单重复序列(SSR)和35~41个长重复序列。叶绿体基因组比较分析表明4个物种的反向重复区(IR)边界存在差异,单拷贝区(SC)比IR区表现出更高的变异性,筛选出了trnS-trnG、ycf4-cemA和psbM-trnA等10个高多样性片段,这些片段可用于吴茱萸属物种鉴定和系统发育研究。系统发育分析结果表明,吴茱萸与石虎聚为一支,楝叶吴萸和臭辣吴萸聚为一支,且这两支互为姊妹关系。结论:本研究为芸香科植物的分类、系统发育和分子育种等研究提供了有价值的遗传信息。
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关键词
吴朱萸属
芸香科
楝叶吴萸
臭辣吴萸
吴茱萸
石虎
叶绿体基因组
系统发育
物种鉴定
下载PDF
职称材料
吴茱萸和臭辣吴萸果实化学成分及不同采收时间主要成分含量的变化
被引量:
11
2
作者
李懿恒
黄佳楠
+4 位作者
刘潇
印敏
刘飞
冯煦
王奇志
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期112-114,共3页
吴茱萸〔Evodia rutaecarpa(Juss.) Benth.〕及其变种石虎〔E.rutaecarpa var.officinalis(Dode) Huang〕和疏毛吴茱萸〔E.rutaecarpa var.bodinieri(Dode) Huang〕的干燥近成熟果实均为中药材吴茱萸的原植物,可散寒止痛、降逆止呕、助...
吴茱萸〔Evodia rutaecarpa(Juss.) Benth.〕及其变种石虎〔E.rutaecarpa var.officinalis(Dode) Huang〕和疏毛吴茱萸〔E.rutaecarpa var.bodinieri(Dode) Huang〕的干燥近成熟果实均为中药材吴茱萸的原植物,可散寒止痛、降逆止呕、助阳止泻,其天然成分对心血管系统、胃肠道系统和免疫系统也有一定功效[1]171,[2-3]。吴茱萸果实主要含生物碱、苦味素和挥发油等[4],吴茱萸碱、吴茱萸次碱和柠檬苦素含量是吴茱萸药材质量的评价标准[1]172。近年来,对吴茱萸的研究多集中于其不同产地和品种的药用成分研究[5-6]。同属的臭辣吴萸(E.fargesii Dode)果实在湖北民间用作吴茱萸代品,具相同药效[7]。为进一步明确吴茱萸和臭辣吴萸果实的化学成分,弄清药用有效成分随采收时间的变化规律,作者对吴茱萸和臭辣吴萸果实的化学成分进行了分离和鉴定,并分析了不同采收时间二者果实中主要成分含量的变化。
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关键词
吴茱萸碱
成熟果实
化学成分
采收时间
心血管系统
ARPA
药用有效成分
吴茱萸次碱
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职称材料
题名
吴茱萸属4种药用植物的叶绿体基因组比较与系统发育分析
1
作者
张万祥
刘浩
王龙
张水寒
机构
湖南中医药大学
湖南省中医药研究院
中国药科大学
出处
《中医药导报》
2023年第6期44-50,65,共8页
基金
2017年中医药公共卫生服务补助专项“全国中药资源普查项目”(财社〔2017〕66号)
中央本级重大增减支项目(2060302)
湖南省中医药科研计划项目(2021052)。
文摘
目的:明确楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸和石虎4种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系,为吴茱萸药材的分子鉴定提供依据。方法:使用CTAB法提取叶片总基因组DNA,通过Illumina NovaSeq 6000平台测序,再用SPAdes软件组装叶绿体基因组序列,利用condonW、REPuter、mVISTA等软件进行序列特征分析并构建ML系统发育树。结果:4种吴茱萸属植物叶绿体基因组为典型的四分体结构,基因组大小在158563~158762 bp之间,总GC含量为38.34%~38.37%。均注释到134个编码基因,包括89个蛋白编码基因(PCGs),37个tRNA基因和8个rRNA基因。共检测到79~98个简单重复序列(SSR)和35~41个长重复序列。叶绿体基因组比较分析表明4个物种的反向重复区(IR)边界存在差异,单拷贝区(SC)比IR区表现出更高的变异性,筛选出了trnS-trnG、ycf4-cemA和psbM-trnA等10个高多样性片段,这些片段可用于吴茱萸属物种鉴定和系统发育研究。系统发育分析结果表明,吴茱萸与石虎聚为一支,楝叶吴萸和臭辣吴萸聚为一支,且这两支互为姊妹关系。结论:本研究为芸香科植物的分类、系统发育和分子育种等研究提供了有价值的遗传信息。
关键词
吴朱萸属
芸香科
楝叶吴萸
臭辣吴萸
吴茱萸
石虎
叶绿体基因组
系统发育
物种鉴定
Keywords
evodia
Rutaceae
Lianyezhuyu(Tetradium glabrifolium)
choulazhuyu
(
evodia
fargesii
dode
)
Wuzhuyu(Euodia rutaecarpa)
Shihu(Euodia rutaecarpa var.officinalis)
chloroplast genome
phylogenetic
species identification
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
吴茱萸和臭辣吴萸果实化学成分及不同采收时间主要成分含量的变化
被引量:
11
2
作者
李懿恒
黄佳楠
刘潇
印敏
刘飞
冯煦
王奇志
机构
江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)江苏省植物资源研究与利用重点实验室江苏省农业种质资源保护与利用平台
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第1期112-114,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目(31470425
31570359)
江苏省科技计划项目(BM2015019)
文摘
吴茱萸〔Evodia rutaecarpa(Juss.) Benth.〕及其变种石虎〔E.rutaecarpa var.officinalis(Dode) Huang〕和疏毛吴茱萸〔E.rutaecarpa var.bodinieri(Dode) Huang〕的干燥近成熟果实均为中药材吴茱萸的原植物,可散寒止痛、降逆止呕、助阳止泻,其天然成分对心血管系统、胃肠道系统和免疫系统也有一定功效[1]171,[2-3]。吴茱萸果实主要含生物碱、苦味素和挥发油等[4],吴茱萸碱、吴茱萸次碱和柠檬苦素含量是吴茱萸药材质量的评价标准[1]172。近年来,对吴茱萸的研究多集中于其不同产地和品种的药用成分研究[5-6]。同属的臭辣吴萸(E.fargesii Dode)果实在湖北民间用作吴茱萸代品,具相同药效[7]。为进一步明确吴茱萸和臭辣吴萸果实的化学成分,弄清药用有效成分随采收时间的变化规律,作者对吴茱萸和臭辣吴萸果实的化学成分进行了分离和鉴定,并分析了不同采收时间二者果实中主要成分含量的变化。
关键词
吴茱萸碱
成熟果实
化学成分
采收时间
心血管系统
ARPA
药用有效成分
吴茱萸次碱
Keywords
evodia
rutaecarpa(Juss.) Benth.
evodia
fargesii
dode
indoloquinazolinea
limpiiin
quinolones
分类号
Q946.8 [生物学—植物学]
R284 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
吴茱萸属4种药用植物的叶绿体基因组比较与系统发育分析
张万祥
刘浩
王龙
张水寒
《中医药导报》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
吴茱萸和臭辣吴萸果实化学成分及不同采收时间主要成分含量的变化
李懿恒
黄佳楠
刘潇
印敏
刘飞
冯煦
王奇志
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
11
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职称材料
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