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Clinprot系统筛选子宫内膜异位症标志物磁珠选择 被引量:3
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作者 赵旸 李艺 +4 位作者 昌晓红 田莉 胡晓慧 叶雪 崔恒 《生物医学工程与临床》 CAS 2008年第3期189-192,共4页
目的检测Clinprot系统中2种磁珠对于同种样品的蛋白分选能力,初步探讨磁珠选择的步骤、指标。方法分别同时利用Cu2+螯合(IMAC-Cu)磁珠和弱阳离子(WCX)磁珠检测同样30例血清标本,其中子宫内膜异位症10例,其他良性卵巢肿物10例,健康人10... 目的检测Clinprot系统中2种磁珠对于同种样品的蛋白分选能力,初步探讨磁珠选择的步骤、指标。方法分别同时利用Cu2+螯合(IMAC-Cu)磁珠和弱阳离子(WCX)磁珠检测同样30例血清标本,其中子宫内膜异位症10例,其他良性卵巢肿物10例,健康人10例。比较2种磁珠分选后的蛋白质谱图基本参数、组内一致性和2种磁珠寻找差异的能力。结果①对于该实验样本,WCX磁珠在蛋白质谱图中总峰数量、峰面积均优于Cu2+磁珠(P<0.001)。而在峰高度上,Cu2+有一定优势;②比较3个组的质谱图组内一致性,WCX与IMAC-Cu均有良好的一致性;③初步了解2种磁珠寻找差异的能力,WCX磁珠与IMAC-Cu磁珠均能区分疾病组与正常组,相对WCX磁珠构建的模型更为稳定。结论在Clinprot实验开始前,选择合适的样本量,综合多个衡量指标,结合多个选择步骤评价不同磁珠抓取蛋白的能力,选择一种磁珠扩大样本量,可以为进一步实验中寻找差异蛋白奠定良好基础。就该实验样品,WCX磁珠更利于扩大样本时应用。 展开更多
关键词 clinprot 子宫内膜异位症 磁珠
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应用Clinprot筛选子宫内膜异位症患者腹腔液中的诊断标志物 被引量:4
2
作者 王琳 刘海元 郎景和 《现代妇产科进展》 CSCD 2013年第1期41-44,共4页
目的:采用Clinprot技术建立子宫内膜异位症(内异症)患者腹腔液中的蛋白表达图谱,初步建立内异症的诊断模型。方法:内异症组39例,对照组34例,采用Clinprot技术及相关分析软件分析上述73份腹腔液样本,获得差异表达蛋白峰。采用遗传算法(GA... 目的:采用Clinprot技术建立子宫内膜异位症(内异症)患者腹腔液中的蛋白表达图谱,初步建立内异症的诊断模型。方法:内异症组39例,对照组34例,采用Clinprot技术及相关分析软件分析上述73份腹腔液样本,获得差异表达蛋白峰。采用遗传算法(GA)等生物统计学及生物信息学建立诊断模型,选取诊断效率最优的算法并反向验证其诊断效率。结果:相对分子量800~10000Da范围内,提取了信噪比>5的蛋白峰107个,其中18个蛋白峰差异有统计学意义(P<0.01),差异最显著的两个蛋白峰m/z为5583.61Da和5552.46Da。GA为最优算法,利用5个信号峰组成的模型(m/z=4458.23,2379.3,8519.94,6376.99,6190.27)反向验证,敏感性和特异性分别为88.5%和88.5%。结论:Clinprot技术分析内异症患者腹腔液中的蛋白图谱,建立的诊断模型效率较高,为研究内异症发病机制及筛选诊断标记物提供了线索。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 腹腔液 clinprot 蛋白质类 阳离子
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应用ClinProt技术筛查寻常性银屑病不同中医证型患者的相关蛋白表达特征 被引量:2
3
作者 伍慧媚 吴玮 +4 位作者 卢传坚 胡坤华 晏卉 李挺滨 姚丹霓 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期304-306,310,共4页
目的应用Clin Prot技术联合MALDI-TOF技术,检测正常人和不同中医证型寻常性银屑病患者血浆及血T淋巴细胞膜上的相关蛋白。方法选择血热证、血瘀证、血燥证的寻常性银屑病患者各10例,同时选取10例健康人作为对照组,采用ClinProt技术联合M... 目的应用Clin Prot技术联合MALDI-TOF技术,检测正常人和不同中医证型寻常性银屑病患者血浆及血T淋巴细胞膜上的相关蛋白。方法选择血热证、血瘀证、血燥证的寻常性银屑病患者各10例,同时选取10例健康人作为对照组,采用ClinProt技术联合MALDI-TOF技术建立血浆和T淋巴细胞膜差异蛋白图谱进行对比。结果与对照组的T淋巴细胞膜蛋白相比,血热组有1个表达上调的差异蛋白峰(4 747D),血瘀组有1个表达上调(4 747D)、2个表达下调的差异蛋白峰(2 068D、7 764D),血燥组有1个表达上调的差异蛋白峰(4 747D)。而对照组和不同证型银屑病患者的血浆差异蛋白相比较,血热组有3个表达上调的差异蛋白峰(6 631D,9 288D,4 965D),血瘀组有5个表达上调的差异蛋白峰(2863D,4 418D,6 631D,4 965D,3 241D),血燥组有2个表达上调的差异蛋白峰(4 965D,9 288D)和1个表达下调的差异蛋白峰(3 957D)。结论不同证型寻常性银屑病患者与健康人相比,血T淋巴细胞膜上及血浆中存在差异蛋白峰,这些蛋白可能与各个证型寻常性银屑病的发病机制有关。 展开更多
关键词 银屑病 中医证型 蛋白组学 clinprot技术
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应用ClinProt系统分析食管癌家族史相关血清蛋白表达谱
4
作者 李秀敏 赵志敏 +7 位作者 许洁 常廷民 崔娟 申芳芳 周福有 王建坡 常扶保 王立东 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2012年第3期191-196,共6页
目的寻找可能与食管癌患者食管癌家族史相关的血清标志物。方法收集林州及其周边食管癌高发区食管癌家族史阳性食管癌患者28例和食管癌家族史阴性食管癌患者38例血清样本,经Clinprot磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-T... 目的寻找可能与食管癌患者食管癌家族史相关的血清标志物。方法收集林州及其周边食管癌高发区食管癌家族史阳性食管癌患者28例和食管癌家族史阴性食管癌患者38例血清样本,经Clinprot磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析建立相应的蛋白质指纹图谱,应用ClinProTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱。比较食管癌家族史阳性和阴性的食管癌患者血清蛋白表达谱,筛选出可能与食管癌家族史相关的差异蛋白。每组样品采用sigma血清进行批间重复性检测。结果平均CV值为0.232;在相对分子质量800~10 000范围内,共检测到家族史阳性与阴性食管癌患者血清差异蛋白101个。选取组合分组能力最好的5个质荷比(M/Z)分别为5 248.24、5 905.05、2 023.12、2 953.07、4 467.16的蛋白峰建立模型并验证,显示食管癌家族史阳性组和阴性组的血清差异蛋白表达无显著性差异(P>0.05)。对食管癌家族史阳性组与阴性组进行分析,采用GA(遗传算法)模型算法选取差异蛋白,识别率为82.62%;准确性为家族史阳性组69.23%,家族史阴性组96%;预测能力为61.89%;采用SNN(遗传算法)选取差异蛋白,食管癌家族史阳性组及阴性组识别率和准确性均为100%,预测能力为53.25%。结论应用ClinProt系统未检测到与食管癌家族史相关的特异性蛋白质,推测食管发生癌变后所产生的反应蛋白可能与食管癌家族史无明显相关性。要寻找食管癌发生及家族聚集的原因,还需要对更多因素进行进一步分析、检测以及大样本的分子流行病学研究。 展开更多
关键词 液体蛋白芯片飞行时间质谱系统 食管癌 家族史 遗传易感性
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Clinprot技术筛选帕金森病血清标志物的研究
5
作者 郑明慧 李竞 +3 位作者 鲍蕴文 潘昆贻 朱树华 胡坤华 《新医学》 2017年第12期888-894,共7页
目的利用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROTTMMALDI-TOF/TOF MS,Clinprot技术)寻找帕金森病敏感的血清分子标志物。方法对51例帕金森病患者的血清和51例性别、年龄相匹配的正常对照者血清进行Clinprot技术分析,选择P≤0.05和表达... 目的利用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROTTMMALDI-TOF/TOF MS,Clinprot技术)寻找帕金森病敏感的血清分子标志物。方法对51例帕金森病患者的血清和51例性别、年龄相匹配的正常对照者血清进行Clinprot技术分析,选择P≤0.05和表达差异大于2倍的蛋白峰进行质谱分析。采用遗传算法建立疾病诊断模型,验证模型敏感度和特异度。结果成功建立了帕金森病和正常血清的疾病诊断模型,模型特异度为98.45%,敏感度为91.83%。采用Clinprot技术同时找到5个感兴趣的蛋白差异峰,相对分子量分别为1 946、2 211、2 368、4 055和4 212,通过二级质谱检索Mascot数据库获得匹配蛋白,分别为核苷二磷酸激酶6、睾丸表达序列13B蛋白、核糖核酸酶7、THAP结构域蛋白3、氨转运蛋白Rh型C蛋白。结论 Clinprot技术能够客观显示出帕金森病患者与正常对照者血清差异蛋白,该研究鉴定出的5种蛋白有望成为帕金森病诊断的新分子标志物。 展开更多
关键词 帕金森病 液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术 蛋白质组学
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基于质谱技术应用CLINPROT系统建立乳腺癌诊断模型 被引量:3
6
作者 杨帆 陈英剑 胡成进 《国际检验医学杂志》 CAS 2016年第24期3388-3390,共3页
目的应用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROT)系统筛选乳腺肿瘤患者血清中潜在的肿瘤标志物,并基于差异蛋白建立乳腺癌诊断预测模型。方法收集病理确诊的乳腺癌患者血清标本43例及健康女性血清标本24例,并随机分为建模组和验证组... 目的应用液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术(CLINPROT)系统筛选乳腺肿瘤患者血清中潜在的肿瘤标志物,并基于差异蛋白建立乳腺癌诊断预测模型。方法收集病理确诊的乳腺癌患者血清标本43例及健康女性血清标本24例,并随机分为建模组和验证组。应用ClinProt Tools系统对建模组中的乳腺癌患者和健康女性血清进行差异蛋白的筛选,建立差异蛋白质图谱,应用ClinProTools v3.0软件建立乳腺癌诊断预测模型,而后利用该诊断模型对验证组血清标本进行分组验证,初步评估该模型的诊断效能。结果通过分析病例组和对照组质谱峰信息,得到24个具有明显差异的蛋白峰(P<0.05)。根据遗传算法选取表达差异最显著的3个蛋白质建立乳腺癌诊断预测模型,该模型对建模组乳腺癌的识别能力为91.67%。后利用验证组标本对该模型的诊断效能进行评估,结果显示其对验证组乳腺癌识别准确率为85.7%。结论利用ClinProt Tools v3.0软件成功建立并评估了乳腺癌诊断预测模型,为乳腺癌诊断提供了新的途径。 展开更多
关键词 液体蛋白芯片-飞行时间质谱技术 乳腺癌 诊断模型
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应用ClinProt系统分析结肠腺癌患者血清蛋白表达谱 被引量:1
7
作者 张勇 《中国现代药物应用》 2013年第18期23-25,共3页
目的寻找可能与结肠腺癌相关的血清候选蛋白,为结肠腺癌的综合防治提供重要的理论基础和手段。方法收集36例结肠腺癌患者和22例正常对照组血清,经Clinprot磁珠纯化,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-FOF-MS)分析建立相应的蛋白... 目的寻找可能与结肠腺癌相关的血清候选蛋白,为结肠腺癌的综合防治提供重要的理论基础和手段。方法收集36例结肠腺癌患者和22例正常对照组血清,经Clinprot磁珠纯化,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-FOF-MS)分析建立相应的蛋白质指纹图谱,应用Clinpro Tools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱。对不同质荷比(M/Z)的差异蛋白通过在数据库中的分析比对,筛选出可能与结肠腺癌发病相关的血清候选蛋白。结果结肠腺癌和正常对照组血清样本蛋白丰度平均变异系数为0.229,与对照组比较,结肠腺癌组有15种蛋白上调,7种蛋白下调。选取差异最为明显的两个蛋白:M2369.93Da和M6051.12,建立结肠腺癌组和正常对照组差异表达蛋白平均谱图,采用GA模型算法,选取差异蛋白,结肠腺癌阳性和阴性识别率为79.7%,准确性结肠癌阳性组为96.1%,结肠癌阴性组为85.5%,预测能力为72.8%。结论通过液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为分析工具,发现15种蛋白上调,7种蛋白下调,这些蛋白可能为潜在的结肠腺癌肿瘤标志物。 展开更多
关键词 结肠腺癌 液体蛋白芯片飞行时间质谱系统 蛋白质谱
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基于CLINPROT技术鉴定弓形虫感染的血清分子标志物
8
作者 徐安健 赵高潮 +4 位作者 乌姗娜 靳庆娥 邹洋 吕治 谷俊朝 《中国热带医学》 CAS 2014年第10期1165-1168,共4页
目的旨在通过液体蛋白芯片-MS/MS技术(即CLINPROT技术)发现并鉴定弓形虫感染的血清分子标记物,并分析其应用于临床检测的敏感性和特异性。方法运用CLINPROT技术对弓形虫感染患者的血清样本进行分析,并进一步采用蛋白电泳、质谱鉴定等方... 目的旨在通过液体蛋白芯片-MS/MS技术(即CLINPROT技术)发现并鉴定弓形虫感染的血清分子标记物,并分析其应用于临床检测的敏感性和特异性。方法运用CLINPROT技术对弓形虫感染患者的血清样本进行分析,并进一步采用蛋白电泳、质谱鉴定等方法对筛选的蛋白分子进行鉴定,最后通过ELISA方法对其在健康正常人和弓形虫感染患者的血清样品中的表达情况进行了检测,并采用ROC曲线评价了其临床应用价值。结果通过CLINPROT技术,发现了一个在弓形虫感染的血清样本中特异性上调的蛋白,进一步通过蛋白电泳和质谱鉴定方法,发现该特异性上调蛋白为SAA;采用ROC曲线分析显示,其敏感性和特异性分别为84.1%和80%。结论可将CLINPROT技术应用于弓形虫感染血清分子标记物的寻找和鉴定;可将SAA蛋白用作为弓形虫感染的血清分子标志物。 展开更多
关键词 弓形虫病 血清分子标志物 液体蛋白芯片-MS/MS技术
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应用液体芯片-飞行时间质谱技术筛选血清中肺癌标志蛋白 被引量:2
9
作者 杨拴盈 田应选 +5 位作者 南岩东 卜丽娜 霍树芬 林秀丽 杜洁 尚文丽 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期17-22,共6页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析肺癌与对照组血清差异表达蛋白,筛选肺癌标志蛋白。方法将105例肺癌患者和90例对照者[44名正常人,46例良性肺疾病(BLDs)]的血清随机分成训练组(肺癌和对照各60例)和验证组[肺癌45例(早期13例,晚... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析肺癌与对照组血清差异表达蛋白,筛选肺癌标志蛋白。方法将105例肺癌患者和90例对照者[44名正常人,46例良性肺疾病(BLDs)]的血清随机分成训练组(肺癌和对照各60例)和验证组[肺癌45例(早期13例,晚期32例),对照30例(正常及BLDs各15例)]。应用ClinProt及相关分析工具软件ClinProTools结合遗传算法(GA)等生物统计学和生物信息学方法分析上述195份血清。进行归一化平滑处理总离子流图(TIC),消除化学及电物理噪声;分析组间差异蛋白并计算差异大小,后按差异大小由大到小排列;应用GA对各差异蛋白的敏感性及特异性进行初步评价,建立判别模型并验证。结果比较肺癌及对照血清蛋白表达谱时共发现98个差异蛋白峰。质荷比(m/z)分别为1 865.81 u和4 054 u的蛋白在两组间差异最大,且这两种蛋白在肺癌组各样品谱图中的丰度大于正常对照组;以蛋白1 865.81 u为X轴,4 054 u为Y轴建立坐标系(坐标值代表相应蛋白丰度),观察样品分布,可见两组样品混杂差区域较小,说明这两种蛋白的区分肺癌和对照(正常人和BLDs)的能力良好。应用GA,以训练组数据建立判别模型时,系统筛选出一个由m/z分别为3 192.082、862.554、643.495、336.64、3 954.88、9 288.98 u及4 209.64 u的7个特征峰组成的诊断模型。以验证组数据进行交叉验证时,该模型对肺癌及对照的识别率分别为82.22%(37/45)和80.00%(24/30),对早期肺癌的识别率为76.92%(10/13)。鉴定所得到的m/z分别为1 778、1 8654、209 u蛋白峰,得出前两个蛋白峰均为C3f,而4 209 u则为真核细胞肽链释放因子。结论肺癌患者与正常人及BLDs患者血清蛋白质表达谱之间存在差异;使用ClinProTools结合GA等生物信息学方法有望筛选出肺癌诊断标志蛋白。 展开更多
关键词 液体芯片质谱技术 肺癌 诊断 血清蛋白组学 clinprot系统
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利用血清蛋白质组差异分析多发性骨髓瘤的耐药机制 被引量:2
10
作者 王剑利 白菊 +1 位作者 何爱丽 张王刚 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期340-343,共4页
目的应用弱阳离子交换纳米磁珠(WCX-MB)分离血清蛋白并联合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,对比分析临床上难治复发与治疗敏感的多发性骨髓瘤(MM)患者血清蛋白质组的差异,以期为阐明多发性骨髓瘤的耐药机制提供线... 目的应用弱阳离子交换纳米磁珠(WCX-MB)分离血清蛋白并联合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,对比分析临床上难治复发与治疗敏感的多发性骨髓瘤(MM)患者血清蛋白质组的差异,以期为阐明多发性骨髓瘤的耐药机制提供线索。方法选择临床确诊的19例MM患者,按实际疗效分为难治复发组(11例)和治疗敏感组(8例),以WCX-MB捕获各自的血清蛋白质组分,MALDI-TOF-MS检测蛋白质谱,再利用ClinprotoolsTM 2.2软件进行数据分析,筛选出与耐药相关的差异蛋白质分子。结果在分子量0.7~10ku的范围内,共得到59个有统计学意义的差异多肽峰(P<0.05);与治疗敏感组相比,难治复发组MM患者的血清多肽峰有34个表达上调,有25个表达下调;将区分难治复发组与治疗敏感组MM患者能力最强的10个质谱峰建成了一个诊断GA模型,其灵敏度及特异性均为100%。结论利用CLINPROT系统筛选血清差异表达蛋白能够为研究多发性骨髓瘤的耐药机制和临床预后判定提供有价值的线索。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 血清蛋白质组学 耐药 clinprot系统
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急性髓系白血病血清标志物初步筛选及临床意义 被引量:2
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作者 何爱丽 白菊 +5 位作者 黄辰 张王刚 杨娟 王剑利 蒙昕 田炜 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2010年第5期1132-1137,共6页
本研究初步分析初诊急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者与正常人群血清蛋白质质谱的差异,筛选AML血清特征性肿瘤标志物及探讨AML患者血清蛋白质组学特征及在白血病发病机制中的意义.选择AML患者14例和健康对照28例,应用弱... 本研究初步分析初诊急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者与正常人群血清蛋白质质谱的差异,筛选AML血清特征性肿瘤标志物及探讨AML患者血清蛋白质组学特征及在白血病发病机制中的意义.选择AML患者14例和健康对照28例,应用弱阳离子交换纳米磁珠捕获血清蛋白质组分及Autoflex II基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪检测各样品的蛋白质质谱,再利用CliprotoolsTM2.2软件进行数据分析,筛选差异蛋白质分子并建立AML诊断模型.选取验证组7例AML血清和14例健康对照血清对产生的模型用盲法进行验证.结果表明,在分子量700-10 000 Da范围内,可检测到69个左右的蛋白质谱峰.与健康组比较,AML患者组中共检测出有显著意义的蛋白峰差44个(p<0.0001),其中10个蛋白峰高表达,34个蛋白峰低表达.将区分疾病组与对照组能力最强的3个质谱峰建成一个基于QC(Quick Classifier Algorithm)算法的诊断模型,质荷比(mass charge ratio,m/z)分别为3216.57,4089.7,7762.87,在该训练集中其判断AML的预期敏感性为86.4%,预期特异性为82.8%.分类验证中该模型能正确识别7例AML病例中的6例和14例健康对照中的12例.交叉验证显示,该模型的敏感性和特异性均为85.7%.结论:初步应用Clinprot系统建立的急性髓系白血病QC模型由3个显著差异蛋白质峰构成,似能有效区分AML患者与正常对照者,其敏感性和特异性较高,有可能作为AML的血清标记物,其中m/z7762.87为血小板源性的趋化因子,其有可能为AML发病机制、分子分型、疗效及预后判断提供重要的实验依据. 展开更多
关键词 clinprot系统 急性髓系白血病 血清蛋白质组学
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乳腺癌术后骨转移患者血清差异蛋白的质谱分析 被引量:2
12
作者 张朋 锡林宝勒日 +4 位作者 白靖平 江仁兵 陈勇忠 黄哲 李星 《重庆医学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期566-568,571,共4页
目的获取乳腺癌术后骨转移患者和无转移患者的血清肽质量指纹图谱(PMF),筛选并鉴定与乳腺癌骨转移相关的血清差异蛋白,同时建立乳腺癌骨转移的诊断模型。方法采用Clinprot液体芯片飞行时间质谱系统(Clinprot TM MALDITOF MS)获得两组血... 目的获取乳腺癌术后骨转移患者和无转移患者的血清肽质量指纹图谱(PMF),筛选并鉴定与乳腺癌骨转移相关的血清差异蛋白,同时建立乳腺癌骨转移的诊断模型。方法采用Clinprot液体芯片飞行时间质谱系统(Clinprot TM MALDITOF MS)获得两组血清标本(单纯骨转移及无转移患者各18例)的PMF,然后使用内嵌的统计分析软件筛选两组血清标本中有统计意义的差异蛋白峰。每组样品检测2次。结果所有标本5d后重复检测,2次质谱图基本一致,随机选择4个蛋白峰计算变异系数(CV)均小于30%,说明该系统具有良好的可重复性。两组患者血清的PMF相比较,蛋白峰差异无统计学意义(P>0.05)。结论乳腺癌术后单纯骨转移与无转移患者无血清差异蛋白存在,不能通过检测外周血的方法筛选乳腺癌骨转移差异蛋白。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 骨转移 差异蛋白 clinprot系统
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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统研究卵巢癌的血清蛋白表达谱 被引量:6
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作者 王静 张小为 +6 位作者 袁杨 郭红燕 熊光武 于中连 张健 胡晓慧 殷汝雷 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2008年第2期88-91,共4页
目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以利于卵巢癌的早期诊断。方法:收集2组卵巢肿瘤患者(其中卵巢浆液性乳头状囊腺癌20例、卵巢浆液性乳头状囊腺瘤9例)和1组正常人... 目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以利于卵巢癌的早期诊断。方法:收集2组卵巢肿瘤患者(其中卵巢浆液性乳头状囊腺癌20例、卵巢浆液性乳头状囊腺瘤9例)和1组正常人(10例)血清样本,经ClinProt磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinProTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱。每组样品重复检测3次。结果:3组血清样品的蛋白丰度的平均变异系数(CV值),分别为0.151、0.246和0.147,证实该试验标准具有良好重复性。质荷比(m/z)为1451和2673的蛋白峰能较好地鉴别卵巢癌和非癌组。结论:液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为研究蛋白表达谱的工具,具有较好的重复性与精度,筛选得到的m/z为1451和2673的蛋白可能为潜在的卵巢癌肿瘤标志物。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 液体蛋白芯片飞行质谱 蛋白质谱 早期诊断
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应用液体蛋白芯片筛查糖尿病性视网膜病变的血清蛋白标志物 被引量:4
14
作者 潘颖 朱文华 +5 位作者 沈鲜安 卢冰 沈莉雯 张莉 严言 钟绍 《中国现代医学杂志》 CAS 北大核心 2015年第4期17-20,共4页
目的应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析2型糖尿病性视网膜病变的血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以便于糖尿病视网膜病变的早期诊断。方法收集2型糖尿病但不伴糖尿病视网膜病变的患者24例,2型糖尿病合并糖尿病... 目的应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析2型糖尿病性视网膜病变的血清蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以便于糖尿病视网膜病变的早期诊断。方法收集2型糖尿病但不伴糖尿病视网膜病变的患者24例,2型糖尿病合并糖尿病视网膜病变的患者21例血清样本,通过Clin Prot磁珠纯化、飞行时间质谱分析、Clin Pro Tools生物信息学方法研究糖尿病视网膜病变的血清蛋白表达谱。结果质荷比(m/z)为1945.53的蛋白峰能较好地鉴别糖尿病性视网膜病变。其识别率和预测能力分别为88.57%和82.08%。结论以液体蛋白芯片飞行时间质谱系统工具研究蛋白表达谱,筛选得到的质荷比为1945.53的蛋白可能为潜在的2型糖尿病性视网膜病变的血清标志物。 展开更多
关键词 液体蛋白芯片飞行质谱 糖尿病性视网膜病变 2型糖尿病 蛋白质谱
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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱技术研究原发性肝癌门静脉癌栓形成相关标志物 被引量:1
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作者 李长煜 王小林 +6 位作者 龚高全 程洁敏 陈颐 刘凌晓 李国平 王成刚 施东华 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期459-463,共5页
目的应用液体蛋白质芯片飞行时间质谱技术研究肝癌门静脉癌栓(portal vein tumor thrombus,PVTT)形成相关标志物,并建立预测模型。方法采取非PVTT和PVTT原发性肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)患者血清各20例,采用磁珠分离系统纯化、... 目的应用液体蛋白质芯片飞行时间质谱技术研究肝癌门静脉癌栓(portal vein tumor thrombus,PVTT)形成相关标志物,并建立预测模型。方法采取非PVTT和PVTT原发性肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)患者血清各20例,采用磁珠分离系统纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization ti me of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析及ClinProTools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱,通过神经网络算法(statistical neural networks,SNN)建立图谱诊断模型并进行验证。结果经数据对比分析找到39个差异有统计学意义的质荷比(m/z)峰(P<0.05),从中筛选出最具划分能力的8个质荷比峰(m/z=4 420.43、4 055.19、2 988.80、4 091.46、4 072.24、6 935.04、4 109.53和5 321.17),并以此建立HCC的PVTT诊断模型,模型识别率达到97.5%,而预测率达到92.73%。非PVTT组和PVTT组的准确性分别为100%和95%。结论筛选得到的蛋白可能成为原发性肝癌PVTT的相关标志物,诊断模型可能对预测PVTT的形成具有重要临床意义。 展开更多
关键词 原发性肝癌 门静脉癌栓 液体蛋白芯片飞行时间质谱 蛋白质组
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应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统研究胃癌、肝癌血清差异蛋白表达 被引量:2
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作者 李莉 谌宏鸣 +1 位作者 李甜 胡晓慧 《第四军医大学学报》 北大核心 2009年第8期733-737,共5页
目的:研究胃癌、肝癌和正常人的血清差异蛋白表达,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以利于胃癌、肝癌的早期诊断.方法:收集胃癌患者20例和肝癌患者10例以及正常人20例血清样本,经ClinProt磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(... 目的:研究胃癌、肝癌和正常人的血清差异蛋白表达,寻找具有潜在诊断意义的血清标志物,以利于胃癌、肝癌的早期诊断.方法:收集胃癌患者20例和肝癌患者10例以及正常人20例血清样本,经ClinProt磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinPro-Tools生物信息学方法研究其血清蛋白表达谱.结果:质荷比(m/z)为2863u和4965u的蛋白峰能较好地鉴别胃癌和非癌组.m/z为1618u和4965u的蛋白峰能较好地鉴别肝癌和非癌组.m/z为4965u的蛋白峰在胃癌、肝癌中较正常人均异常高表达.结论:液体蛋白芯片飞行时间质谱系统作为研究蛋白表达谱的工具,具有较好的重复性与精度,筛选得到的m/z为2863,1618,4965u的蛋白可能为潜在的胃癌、肝癌肿瘤标志物. 展开更多
关键词 胃肿瘤 肝肿瘤 液体蛋白芯片飞行质谱 差异蛋白 早期诊断
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血浆中卵巢癌相关蛋白质的筛选 被引量:2
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作者 郝婷 熊光武 +7 位作者 张小为 李晓倩 王颖 郭琳琳 郭红燕 张璐芳 韩劲松 王静 《肿瘤预防与治疗》 2010年第4期274-279,共6页
目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血浆蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血浆肿瘤标志物,以利于卵巢癌的早期诊断。方法:收集卵巢浆液性癌30例、卵巢浆液性瘤18例、妇科良性疾病(包括卵巢囊肿和子宫肌瘤)30例的血... 目的:应用液体蛋白芯片飞行时间质谱系统分析卵巢癌的血浆蛋白质表达谱,寻找具有潜在诊断意义的血浆肿瘤标志物,以利于卵巢癌的早期诊断。方法:收集卵巢浆液性癌30例、卵巢浆液性瘤18例、妇科良性疾病(包括卵巢囊肿和子宫肌瘤)30例的血浆样本,经磁珠纯化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分析及ClinproTools生物信息学方法研究其血浆蛋白表达谱。结果:在卵巢癌组和非癌组间,得到差异性蛋白48个(P<0.05),用其中四个联合分组能力最强的蛋白质4 210.91(m/z),4 470.17(m/z),2 210.9(m/z),1866.88(m/z)建立了诊断模型,癌组和非癌组的识别率为100%。结论:利用液体芯片-飞行质谱技术进行血浆卵巢癌相关蛋白质的研究,得到了差异蛋白和诊断模型,对卵巢癌的诊断具有潜在价值。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 液体蛋白芯片飞行质谱 蛋白质谱 早期诊断
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运用激光解析电离飞行时间质谱技术检测肺腺癌的血清蛋白表达 被引量:1
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作者 刘丹 刘伦旭 +3 位作者 袁泉 李晓亮 黄娜 杨小东 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期498-500,556,共4页
目的运用激光解析电离飞行时间质谱技术(ClinProt技术)寻找肺腺癌相关蛋白,以期对肺癌的早期诊断、治疗效果及预后等做出判断。方法应用ClinProt技术对10例患者及10例正常人进行质谱分析寻找差异蛋白,观察差异蛋白在肺腺癌患者术后1周... 目的运用激光解析电离飞行时间质谱技术(ClinProt技术)寻找肺腺癌相关蛋白,以期对肺癌的早期诊断、治疗效果及预后等做出判断。方法应用ClinProt技术对10例患者及10例正常人进行质谱分析寻找差异蛋白,观察差异蛋白在肺腺癌患者术后1周的变化。结果正常人与肺腺癌患者血清比较,发现6个差异蛋白峰,其中相对分子质量为2661、2991的蛋白在肺腺癌组表达增高且术后继续呈增高趋势,相对分子质量为4091、4210、4644、5336的蛋白在肺腺癌组表达降低且术后继续呈降低趋势。结论肺腺癌患者与正常人之间的差异蛋白可能成为潜在的肺腺癌血清标志物。发现差异蛋白在术后的变化,可能有助于治疗效果的检测及预后的判定。 展开更多
关键词 肺腺癌 激光解析电离飞行时间质谱技术 差异蛋白
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尿毒症患者血清肽谱的差异性研究
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作者 陈洁晶 张岳 +3 位作者 眭维国 莫秋菊 刘华英 戴勇 《中国血液净化》 2011年第2期87-90,共4页
目的比较尿毒症患者与正常人的血清肽谱,寻找差异表达的血清肽谱。方法将研究对象分成试验组和对照组。试验组为30例尿毒症患者,包括10例未透析患者、10例腹膜透析患者和10例血液透析患者;对照组为13例健康志愿者。采用ClinProt磁珠浓... 目的比较尿毒症患者与正常人的血清肽谱,寻找差异表达的血清肽谱。方法将研究对象分成试验组和对照组。试验组为30例尿毒症患者,包括10例未透析患者、10例腹膜透析患者和10例血液透析患者;对照组为13例健康志愿者。采用ClinProt磁珠浓缩和基质辅助激光解吸电离法分析两组研究对象血清肽谱的差异。结果与对照组相比,未透析组、腹膜透析组、血液透析组分别筛选出7个、7个、9个显著表达的差异性多肽;比较未透析组与腹膜透析组、未透析组与血液透析组、腹膜透析组与血液透析组,分别筛选出2个、5个、1个显著表达的差异性多肽。采用遗传算法对样本进行分类并建立诊断预测模型,对区分未透析组、腹膜透析组、血液透析组与对照组的交叉验证能力分别为99.30%、95.12%和98.61%,而识别率均为100%;对区分未透析组与腹膜透析组、未透析组与血液透析组、腹膜透析组与血液透析组的交叉验证能力分别为95.00%、90.59%和79.72%,识别率分别为96.88%、100%和100%。结论应用蛋白组学建立了尿毒症患者的血清肽谱模型,为人们更好地了解尿毒症的发病机制提供了新的思路。 展开更多
关键词 尿毒症 血清肽谱 clinprot技术平台 蛋白质组
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液体芯片飞行时间质谱技术在肿瘤临床研究中的应用 被引量:1
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作者 林秀丽 杨拴盈 +1 位作者 卜丽娜 王逢鹏 《国际呼吸杂志》 2009年第2期113-116,共4页
液体芯片飞行时间质谱技术(ClinProt系统)是近年开发的蛋白质组学新技术,其利用纳米磁珠俘获肿瘤患者与对照者体液中低丰度或低相对分子质量特异蛋白/多肽,经基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱测定和软件分析,建立由两者差异表达... 液体芯片飞行时间质谱技术(ClinProt系统)是近年开发的蛋白质组学新技术,其利用纳米磁珠俘获肿瘤患者与对照者体液中低丰度或低相对分子质量特异蛋白/多肽,经基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱测定和软件分析,建立由两者差异表达蛋白/多肽组成的质谱图模型,用于预测未知样品的归属。该系统具有良好的特异性、灵敏性和重复性,高通量,操作简单、快捷等优点,能对所获得的差异蛋白/多肽进行蛋白鉴定,是极具潜力的临床肿瘤早期诊断工具。本文将就目前ClinProt系统在临床肿瘤研究中的应用进行综述。 展开更多
关键词 液体芯片 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 蛋白质组学 诊断 clinprot系统
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