红肉蜜柚PDR型转运蛋白基因的发掘及CmPDR11-2表达与耐草甘膦初步分析

基于红肉蜜柚RNA-seq数据库,筛选出50个ABC转运蛋白家族基因,其中包含11条PDR型基因。对11条柚PDR基因进行命名和生物信息学分析。同源性分析结果表明:CmPDR11-2编码的氨基酸序列与拟南芥中转运百草枯除草剂的AtPDR11基因同源性最高,达69.25%,利用RT-PCR技术克隆得到CmPDR11-2的ORF序列。该序列长度为4 371 bp,编码一个含有1 456个氨基酸的蛋白质,分子量165.138 03 ku,该蛋白属于稳定的亲水性蛋白,无信号肽,具有12个跨膜结构,定位于细胞膜。实时荧光定量PCR结果表明,草甘膦除草剂胁迫处理条件下,1~15 d处理组柚叶的CmPDR11-2基因相对表达量呈整体上升趋势,且均高于对照组,反应迅速且持久,这表明CmPDR11-2基因表达与红肉蜜柚耐草甘膦有关。