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印度南瓜Na^+/H^+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
被引量:
6
1
作者
时丕彪
洪立洲
+4 位作者
王军
费月跃
王伟义
吕远大
顾闽峰
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2638-2646,共9页
Na^+/H^+逆向转运蛋白(SOS1)是植物耐盐的关键因子之一,在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用。为解析印度南瓜SOS1基因的序列特征和功能,利用生物信息学和分子生物学方法对其进行研究。结果表明,克隆获得印度南瓜SOS1基因cDNA全...
Na^+/H^+逆向转运蛋白(SOS1)是植物耐盐的关键因子之一,在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用。为解析印度南瓜SOS1基因的序列特征和功能,利用生物信息学和分子生物学方法对其进行研究。结果表明,克隆获得印度南瓜SOS1基因cDNA全长序列,命名为CmaSOS1,GenBank登录号:NW019272028。序列分析表明,CmaSOS1基因的cDNA全长3940 bp,包含一个3429 bp的开放阅读框架,编码1142个氨基酸。CmaSOS1基因含有23个外显子和22个内含子,全长46314 bp。CmaSOS1蛋白的分子量为126.7 kDa,理论等电点为5.92,包含12个跨膜结构区域,具有一个NaHExchanger superfamily结构域和一个CAPED superfamily结构域;CmaSOS1蛋白属于疏水性稳定蛋白,二级结构元件多为无规卷曲和α-螺旋。CmaSOS1蛋白与葫芦科的中国南瓜、西葫芦、甜瓜、黄瓜和苦瓜Na^+/H^+逆向转运蛋白的同源性较高,序列一致性分别为98%、98%、90%、89%和89%。实时荧光定量PCR分析表明,CmaSOS1基因在印度南瓜的根和叶中表达量较高,在茎、花、果实中的表达量较低;该基因受NaCl和聚乙二醇(PEG)诱导后均呈上调表达,推测CmaSOS1基因可能在印度南瓜抵御盐分胁迫和干旱胁迫过程中发挥重要作用。本研究为进一步揭示CmSOS1在非生物胁迫下的功能奠定了基础。
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关键词
印度南瓜
cmasos1
基因
基因克隆
序列分析
表达分析
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职称材料
题名
印度南瓜Na^+/H^+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
被引量:
6
1
作者
时丕彪
洪立洲
王军
费月跃
王伟义
吕远大
顾闽峰
机构
盐城市新洋农业试验站
江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2638-2646,共9页
基金
江苏现代农业(蔬菜)产业技术体系(盐城)推广示范基地项目(JATS(2018)137)
江苏省自然科学基金项目(BK20160582)
+1 种基金
江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2015)
江苏沿海地区农业科学研究所科研基金项目(YHS201706)。
文摘
Na^+/H^+逆向转运蛋白(SOS1)是植物耐盐的关键因子之一,在植物响应非生物胁迫过程中发挥着重要作用。为解析印度南瓜SOS1基因的序列特征和功能,利用生物信息学和分子生物学方法对其进行研究。结果表明,克隆获得印度南瓜SOS1基因cDNA全长序列,命名为CmaSOS1,GenBank登录号:NW019272028。序列分析表明,CmaSOS1基因的cDNA全长3940 bp,包含一个3429 bp的开放阅读框架,编码1142个氨基酸。CmaSOS1基因含有23个外显子和22个内含子,全长46314 bp。CmaSOS1蛋白的分子量为126.7 kDa,理论等电点为5.92,包含12个跨膜结构区域,具有一个NaHExchanger superfamily结构域和一个CAPED superfamily结构域;CmaSOS1蛋白属于疏水性稳定蛋白,二级结构元件多为无规卷曲和α-螺旋。CmaSOS1蛋白与葫芦科的中国南瓜、西葫芦、甜瓜、黄瓜和苦瓜Na^+/H^+逆向转运蛋白的同源性较高,序列一致性分别为98%、98%、90%、89%和89%。实时荧光定量PCR分析表明,CmaSOS1基因在印度南瓜的根和叶中表达量较高,在茎、花、果实中的表达量较低;该基因受NaCl和聚乙二醇(PEG)诱导后均呈上调表达,推测CmaSOS1基因可能在印度南瓜抵御盐分胁迫和干旱胁迫过程中发挥重要作用。本研究为进一步揭示CmSOS1在非生物胁迫下的功能奠定了基础。
关键词
印度南瓜
cmasos1
基因
基因克隆
序列分析
表达分析
Keywords
Cucurbita maxima
cmasos1 gene
gene
cloning
sequence analysis
expression analysis
分类号
S642.1 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
印度南瓜Na^+/H^+逆向转运蛋白基因CmaSOS1的克隆与表达分析
时丕彪
洪立洲
王军
费月跃
王伟义
吕远大
顾闽峰
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
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