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Molecular characterization of two candidate genes associated with coat color in Tibetan sheep(Ovis arise) 被引量:1
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作者 HAN Ji-long YANG Min +5 位作者 GUO Ting-ting YUE Yao-jing LIU Jian-bin NIU Chun-e WANG Chao-feng YANG Bo-hui 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2015年第7期1390-1397,共8页
Coat color is a key economic trait in sheep. Some candidate genes associated with animal's coat color were found. Partic- ularly, v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog (KIT) and microphthalm... Coat color is a key economic trait in sheep. Some candidate genes associated with animal's coat color were found. Partic- ularly, v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog (KIT) and microphthalmia-associated transcription factor (MITF) play a key role in the modulation of hair pigmentation in mammals. This study investigated those two candidate genes' mutations and expressions associated with wool color in Tibetan sheep. First, the gene polymorphisms of those two genes were analyzed, and then, relative mRNA expression levels of those two genes in skin tissue with different coat colors were compared. Thirdly, KIT and MITF protein expression levels were detected through Western blot and immune- histochemical. Allele C was predominant allele in the white coat color Tibetan sheep population of the MITF coding region g. 1548 C/T loci. The relative MITF mRNA expression in black coat skin tissue was significantly higher than white (P〈0.01). However, no significant differences were detected in the KIT gene's mRNA expression of these two different coat color skin tissues (P〉0.05), while the level of KIT protein expression in skin tissues of white and black coats was also roughly equivalent. Our study observed that, the level of MITF protein expression in black coat skin tissue was significantly higher than that in white coat skin tissue, and positive staining for MITF protein expression was detected mainly in the epidermis and the dermal papilla, bulb, and outer root sheath of hair follicles. We conclude that the black coat of Tibetan sheep is related to high MITF expression in the hair follicles, and MITF may be important for coat color formation of Tibetan sheep. 展开更多
关键词 Tibetan sheep KIT MITF gene polymorphism gene expression coat color
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家马不同毛色遗传特性研究综述
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作者 安塔娜 韩海格 +3 位作者 陶克涛 宝音德力格尔 李文博 芒来 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3297-3308,共12页
家马的毛色是识别马匹和进行品种登记的主要内容及依据。古DNA研究表明,最先出现的家马毛色是骝色,在后续的演化过程中出现黑色和栗色,这3种毛色统称为基础毛色。与其他哺乳动物一样,家马的色素细胞通过真黑素和棕黑素的不同组合产生不... 家马的毛色是识别马匹和进行品种登记的主要内容及依据。古DNA研究表明,最先出现的家马毛色是骝色,在后续的演化过程中出现黑色和栗色,这3种毛色统称为基础毛色。与其他哺乳动物一样,家马的色素细胞通过真黑素和棕黑素的不同组合产生不同毛色。本文系统地总结了家马的13种不同毛色分类,综述了近三十年内关于家马不同毛色形成的候选基因研究进展,为深入解析家马不同毛色形成遗传机理、减少相关遗传疾病的发生以及后续的系谱登记和选种选育工作提供理论参考和依据。 展开更多
关键词 家马 毛色多样性 候选基因 黑色素
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哺乳动物毛色候选基因c-KIT的研究进展
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作者 黄芩 徐睿 +3 位作者 王晋康 八千张加 陈俊宇 黄秋月 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期41-46,共6页
哺乳动物的皮毛颜色主要受毛发中黑色素的种类和数量影响。c-KIT基因编码一种酪氨酸激酶跨膜受体,被称为肥大/干细胞生长因子受体,与黑色素生物合成相关。c-KIT基因突变会抑制干细胞生长因子受体功能,导致黑色素细胞的生成、成熟、增殖... 哺乳动物的皮毛颜色主要受毛发中黑色素的种类和数量影响。c-KIT基因编码一种酪氨酸激酶跨膜受体,被称为肥大/干细胞生长因子受体,与黑色素生物合成相关。c-KIT基因突变会抑制干细胞生长因子受体功能,导致黑色素细胞的生成、成熟、增殖、分化和迁移等过程受到影响。本文就哺乳动物毛色形成的机制和主效基因、c-KIT基因的作用机理及其对哺乳动物毛色的影响进行综述,以期为深入研究哺乳动物毛色遗传机制以及不同毛色的选种和选育提供参考依据。 展开更多
关键词 哺乳动物 C-KIT基因 毛色
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农业经济动物稀释毛色表型形成研究进展
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作者 许继国 崔芳芳 +1 位作者 张国生 许桥 《广东农业科学》 CAS 2024年第2期1-15,共15页
毛色是家畜驯化过程中最早被选择的性状之一,对该性状的偏好性选择导致家畜毛色丰富多样。家畜的毛色表型是由黑素细胞中真黑色素(产生黑色/棕色)和褐黑色素(产生黄色/红色)的相对含量决定,当真黑色素或褐黑色素的合成被稀释,或者两种... 毛色是家畜驯化过程中最早被选择的性状之一,对该性状的偏好性选择导致家畜毛色丰富多样。家畜的毛色表型是由黑素细胞中真黑色素(产生黑色/棕色)和褐黑色素(产生黄色/红色)的相对含量决定,当真黑色素或褐黑色素的合成被稀释,或者两种色素的合成均被稀释时,就会形成不同的稀释毛色表型。为深入理解家畜毛色变异的遗传机制,许多学者已经进行了大量的毛色遗传学研究,以确定家畜的毛色相关基因和因果突变。目前,已鉴定出超过300个基因座和150个与毛色相关的基因。稀释毛色表型作为动物毛色遗传研究领域的一个重要研究方向,其遗传学研究已取得了一定进展。已发现多个因果基因可以引起哺乳动物的毛色稀释和禽类的羽色稀释,这些基因通过影响潜在的色素形成途径来影响黑素细胞的发育和分化、黑色素的合成以及黑素小体的运输。相似的毛色稀释表型通常在不同物种间被发现,可能由保守的或不同的毛色稀释基因引起。在同一物种中,可能有多个基因导致相同或相似的稀释毛色表型。该文对农业经济动物(主要是猪、马、牛、羊、鸡)稀释毛色(羽色)表型的类型及其形成的因果基因和突变,以及遗传机理等研究进展进行综述,以期为动物稀释毛色(羽色)遗传机制的深入研究提供参考。 展开更多
关键词 农业动物 毛色变异 稀释毛色 毛色稀释基因 遗传机制
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不同毛色巴什拜羊皮肤组织中10个候选基因表达水平分析
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作者 柴婷 左晓佳 +4 位作者 赛迪古丽 王乐 吕雪峰 胡昕 许艳丽 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第3期39-44,共6页
为探讨可能影响动物毛色的10个候选基因(TCF25、TYR、TYRP1、ASIP、KIT、MITF、EDNRB、SLC7A11、MC1R和DCT)与巴什拜羊毛色的关系,利用实时荧光定量PCR技术对30只1周岁不同毛色(棕色、白色和黑色各10只)被毛的巴什拜羊皮肤组织中与毛色... 为探讨可能影响动物毛色的10个候选基因(TCF25、TYR、TYRP1、ASIP、KIT、MITF、EDNRB、SLC7A11、MC1R和DCT)与巴什拜羊毛色的关系,利用实时荧光定量PCR技术对30只1周岁不同毛色(棕色、白色和黑色各10只)被毛的巴什拜羊皮肤组织中与毛色相关基因的mRNA表达量进行了研究,所有数据使用SPSS 23.0进行单因素方差分析。结果显示,在不同毛色被毛巴什拜羊皮肤中,TCF25、ASIP和EDNRB基因在白色被毛皮肤中的表达量均显著高于黑色和棕色被毛皮肤(P<0.05);TYR、TYRP1、DCT和MC1R基因在黑色被毛皮肤中的表达量均显著高于白色和棕色被毛皮肤(P<0.05);MITF基因在棕色被毛皮肤中的表达量显著高于白色和黑色被毛皮肤(P<0.05),而KIT和SLC7A11基因在不同毛色皮肤组织中均无显著差异(P>0.05)。综上可知,TCF25和ASIP基因主要与巴什拜羊白色被毛性状相关,TYR、TYRP1、DCT和MC1R主要与巴什拜羊黑色被毛性状相关,而MITF和EDNRB基因参与调控巴什拜羊棕色和白色被毛性状的具体作用机制还有待进一步探究。 展开更多
关键词 毛色性状 巴什拜羊 毛色相关基因 QRT-PCR
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白菜种子cDNA酵母文库的构建及BrTTG1互作蛋白的筛选及分析
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作者 任延靖 张鲁刚 +2 位作者 赵孟良 李江 邵登魁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期223-232,共10页
【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库... 【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库,通过gateway技术构建诱饵载体pGBKT7-TTG1并进行酵母双杂交筛库。【结果】酵母文库库容为1.2×10^(7)CFU,文库滴度是5.0×10^(7)CFU/mL,插入片段平均长度大于1000 bp,诱饵载体在酵母中无自激活活性。通过构建的诱饵载体pGBKT7-TTG1与构建的cDNA文库杂交,共获得了38个阳性互作蛋白,功能预测显示其中一个蛋白注释为MYB转录因子,注释为MYB73,序列分析结果显示该基因含有R2R3-MYB型抑制子保守基序C1和C2,推测该基因为白菜中参与种皮颜色形成的R2R3-MYB型抑制子,暗示着白菜中可能存在不同MYB转录因子参与的调控网络,影响着原花青素的形成。【结论】本研究构建了白菜种子组织的酵母双杂交cDNA文库,获得了38个TTG1阳性互作蛋白,首次挖掘到了可能影响白菜种皮颜色原花青素形成的R2R3-MYB型抑制子MYB73,为后期探究白菜种皮原花青素的调控网络奠定良好的基础。 展开更多
关键词 白菜种皮颜色 CDNA文库 酵母双杂交 互作蛋白 MYB73 基因克隆 表达分析
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哺乳动物青毛色相关基因研究进展 被引量:3
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作者 李媛媛 毕晓昆 赵春江 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期6-10,共5页
青毛色是哺乳动物中广泛存在的毛色,它既是品种特征性状,有时也与其他重要性状密切相关。本文介绍了哺乳动物青毛色的定义,阐述了马、小鼠、牛、羊、驴、狗、兔等常见哺乳动物青毛色基因的研究进展,并指明了该领域尚需进一步研究的问题... 青毛色是哺乳动物中广泛存在的毛色,它既是品种特征性状,有时也与其他重要性状密切相关。本文介绍了哺乳动物青毛色的定义,阐述了马、小鼠、牛、羊、驴、狗、兔等常见哺乳动物青毛色基因的研究进展,并指明了该领域尚需进一步研究的问题,以期为哺乳动物青毛色遗传机制的深入研究和该毛色相关的选种选育提供参考依据。 展开更多
关键词 哺乳动物 青毛色 青毛相关基因
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MC1R基因多态性与杜黑猪毛色关系研究
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作者 巩静 杨晴 +5 位作者 王艺盼 王彦平 朱晓东 张传生 耿立英 王继英 《山东农业科学》 北大核心 2023年第10期152-157,共6页
黑色素皮质素受体1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因。为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以390头杜黑猪F_(2)代个体和18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F_(2)代群体进行... 黑色素皮质素受体1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因。为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以390头杜黑猪F_(2)代个体和18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F_(2)代群体进行毛色表型类型分组,利用液相芯片捕获测序技术鉴定MC1R基因中影响毛色的10个SNP位点的基因型。结果表明,杜黑猪F_(2)代群体出现了毛色分离,其中,75.13%的个体为全黑色,13.08%的个体为棕红色,其余11.79%的个体呈现混杂色,包括黑红条纹、棕色偏黄、棕色偏白等。测定的5个多态SNP位点中,E^(D1)等位基因3个SNP位点(rs45435031、rs45434630、rs45434629)的突变纯合型(GG、GG、TT)个体表现为黑红条纹,野生纯合型(AA、AA、CC)个体表现为棕红色,杂合基因型(GA、GA、TC)个体大部分(80.83%)表现为黑色,少部分(19.17%)为黑色红纹、棕色偏黄和棕色偏白。e等位基因2个SNP位点(rs45435032、rs321432333)的突变纯合基因型(AA、TT)个体全部为棕红色,野生纯合基因型(GG、CC)个体全部为黑色毛色,杂合基因型(GA、TC,AA、TC,GA、TT)大部分(80.99%)为黑色毛色,少部分个体(19.01%)毛色为黑红条纹、棕色偏黄和棕色偏白。HaploView单倍型分析表明5个SNP高度连锁,位于1个单倍型块内。本研究结果表明,杜黑猪毛色黑色对棕红色为不完全显性,利用MC1R基因的5个SNP标记进行毛色分子标记辅助选择可快速剔除隐性棕红色等位基因,使杜黑猪新品种的毛色迅速固定为全黑色,以加速新品种培育进程。 展开更多
关键词 杜黑猪 毛色 MC1R基因 SNP 基因型
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大豆红色种皮的色素鉴定和基因定位
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作者 曹杰 谷勇哲 +5 位作者 洪慧龙 吴海涛 张霞 孙建强 包立高 邱丽娟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第14期2643-2659,共17页
【目的】揭示种子发育过程中种皮花青素(anthocyanin)的含量变化以及导致泰兴矮脚红(TXAJH)红色种皮的主要花青素成分;定位控制花青素合成积累的关键基因,为深入了解红色种皮形成的调控机制奠定基础。【方法】利用超高效液相色谱串联质... 【目的】揭示种子发育过程中种皮花青素(anthocyanin)的含量变化以及导致泰兴矮脚红(TXAJH)红色种皮的主要花青素成分;定位控制花青素合成积累的关键基因,为深入了解红色种皮形成的调控机制奠定基础。【方法】利用超高效液相色谱串联质谱(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-ESI-MS/MS)检测黄色种皮大豆绥农14(SN14)和红色种皮大豆TXAJH不同发育阶段种皮的花青素成分与含量,分析与种皮颜色变化密切相关的花青素成分;利用SN14和TXAJH杂交构建的重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体进行分离群体分组混合分析(bulked segregant analysis,BSA),初步定位红色种皮相关基因的候选区域,在此基础上,结合标记连锁分析缩小候选区间并预测红色种皮候选基因;最后通过qRT-PCR验证候选基因的表达情况。【结果】检测SN14和TXAJH 4个发育阶段的种皮,共发现12种花青素。在成分上,总花青素的聚类分析表明,TXAJH与SN14之间以及TXAJH显色前后之间的种皮花青素组成均存在明显差异。在含量上,种子发育过程中,SN14种皮花青素的含量逐渐下降,而TXAJH种皮的含量迅速升高并保持稳定,种皮显色后,二者的花青素含量呈现极显著差异,在成熟阶段,TXAJH种皮花青素的含量是SN14的200倍以上。矢车菊素-3-O-葡萄糖苷(Cyanidin-3-O-glucoside,Cy-3-glu)、芍药花素-3-O-葡萄糖苷(Peonidin-3-O-glucoside,Pn-3-glu)和牵牛花素-3-O-葡萄糖苷(Petunidin-3-O-glucoside,Pt-3-glu)是导致TXAJH种皮呈现红色的重要原因。BSA-seq关联分析将红色种皮基因的候选区间定位于第8染色体上,长度为8.66 Mb。利用27个多态性标记进行连锁分析得到10种单倍型,最终将候选区间缩小至702 kb。该区间中在亲本间存在非同义变异的基因共37个,其中,Glyma.08g059900编码MYB转录因子,Glyma.08g061300和Glyma.08g063900编码bHLH转录因子,它们可能参与花青素的生物合成调控;Glyma.08g062000编码花青素还原酶1,可以将花青素转化为原花青素(proanthocyanidin,PA)。基因表达分析结果表明,候选基因和花青素生物合成途径相关基因在SN14与TXAJH中的表达模式相似,均为前者低于后者。种皮花青素主要成分与候选基因表达水平的关联分析结果显示二者之间存在极强的相关性。【结论】SN14与TXAJH的种皮花青素组成存在差异,TXAJH红色种皮呈现红色可能是Cy-3-glu、Pn-3-glu和Pt-3-glu积累的结果。预测Glyma.08g059900、Glyma.08g061300、Glyma.08g062000和Glyma.08g063900为红色种皮候选基因,其中Glyma.08g059900、Glyma.08g061300和Glyma.08g063900可能对花青素生物合成途径的多个基因产生调控作用。 展开更多
关键词 大豆 种皮色 花青素 BSA-seq 基因定位 转录因子
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新疆山羊皮肤组织中MC1R·Agouti和MITF基因的差异表达研究 被引量:1
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作者 许艳丽 吕雪峰 +3 位作者 柴婷 赛迪古丽 胡昕 王乐 《安徽农业科学》 CAS 2023年第2期99-101,共3页
[目的]研究MC1R、Agouti和MITF基因在不同毛色新疆山羊皮肤组织中的差异表达,为确定其与新疆山羊毛色形成的相关性提供依据。[方法]采用实时荧光定量PCR技术,检测3种不同毛色(白色、褐色、黑色)新疆山羊皮肤组织中MC1R、Agouti和MITF基... [目的]研究MC1R、Agouti和MITF基因在不同毛色新疆山羊皮肤组织中的差异表达,为确定其与新疆山羊毛色形成的相关性提供依据。[方法]采用实时荧光定量PCR技术,检测3种不同毛色(白色、褐色、黑色)新疆山羊皮肤组织中MC1R、Agouti和MITF基因mRNA的表达差异。[结果]MC1R、Agouti及MITF基因mRNA在不同毛色新疆山羊皮肤组织中均有表达;MC1R、MITF基因mRNA在黑色新疆山羊皮肤组织中的表达量高于褐色和白色新疆山羊(P>0.05),Agouti基因mRNA在白色新疆山羊皮肤组织中的表达量显著高于褐色和黑色新疆山羊(P<0.05)。[结论]MC1R、Agouti和MITF基因对新疆山羊毛色形成有一定影响,为今后新疆山羊毛色选育与品种改良提供了参考。 展开更多
关键词 新疆山羊 MC1R基因 Agouti基因 MITF基因 毛色
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大豆种皮色相关基因研究进展 被引量:16
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作者 宋健 郭勇 +1 位作者 于丽杰 邱丽娟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期687-694,共8页
大豆种皮色在从野生大豆到栽培大豆的演变过程中逐渐从黑色变成黄色,是重要的形态标记,因此,大豆种皮色相关基因研究无论对进化理论还是育种实践都具有重要的意义。种皮颜色是通过各种花色苷的沉积而形成的。虽然很多植物色素沉积的分... 大豆种皮色在从野生大豆到栽培大豆的演变过程中逐渐从黑色变成黄色,是重要的形态标记,因此,大豆种皮色相关基因研究无论对进化理论还是育种实践都具有重要的意义。种皮颜色是通过各种花色苷的沉积而形成的。虽然很多植物色素沉积的分子调控机制比较明晰,但大豆中控制种皮颜色形成的基因尚未被完全了解。文章综述了控制大豆种皮色基因与位点的相关研究进展,主要有I、T、W1、R、O 5个经典遗传位点,其中I位点被定位在第8号染色体(A2连锁群)一个富含查尔酮合成酶(CHS)的区域,CHS基因在大豆中是多基因家族且同源性较高;定位于第6号染色体(C2连锁群)T位点的基因F3’H已被克隆和转基因验证,由于碱基缺失导致所编码的氨基酸缺少了保守域GGEK,从而不能与血红素结合而丧失功能;R位点定位在第9号染色体(K连锁群)A668-1与K387-1两标记之间,可能是R2R3类MYB转录因子,也可能是UDP类黄酮3-O糖基转移酶;O位点定位在第8号染色体(A2连锁群)Satt207与Satt493两标记之间,其分子特性尚不清楚;W1位点可能由F3’5’H基因控制遗传。 展开更多
关键词 大豆 种皮色 基因 研究进展
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牛黑素皮质素受体1(MC1R)基因与毛色表型的研究 被引量:18
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作者 甘海云 李建斌 +4 位作者 王洪梅 高运东 刘文浩 李景鹏 仲跻峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期195-200,共6页
牛MC1R基因不仅与毛色有关,而且与牛乳中乳蛋白的含量有关。利用PCR-RFLP和DNA测序技术分析了中国荷斯坦黑白花牛,中国荷斯坦红白花牛,鲁西黄牛和渤海黑牛共4个品种的MC1R基因。共检测出3种等位基因(ED,E+,e)。中国荷斯坦黑白花牛主要... 牛MC1R基因不仅与毛色有关,而且与牛乳中乳蛋白的含量有关。利用PCR-RFLP和DNA测序技术分析了中国荷斯坦黑白花牛,中国荷斯坦红白花牛,鲁西黄牛和渤海黑牛共4个品种的MC1R基因。共检测出3种等位基因(ED,E+,e)。中国荷斯坦黑白花牛主要是ED和E+等位基因(ED=0.12、E+=0.80);渤海黑牛也主要是ED和E+等位基因(ED=0.52、E+=0.47);中国荷斯坦红白花牛和鲁西黄牛大多为e等位基因(e=0.95)。中国荷斯坦红白花牛和鲁西黄牛还存在E+/e基因型。由此推测ED和E+等位基因导致黑色素合成。另外发现牛MC1R基因编码区725处存在一重要的SNP(单核苷酸多态性)。 展开更多
关键词 牛毛色 MC1R基因 PCR-RFL
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动物毛色形成的原因和机制 被引量:17
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作者 王乐 吕雪峰 +3 位作者 郑文新 张斌 高维明 陶卫东 《草食家畜》 2009年第1期20-21,共2页
动物毛色的表现形式除受基因控制外,还与环境因素有关。本文描述了影响动物毛色的基因以及后天的环境和管理对动物毛色的影响。
关键词 动物毛色 毛色基因
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黑素皮质激素受体1基因与牛的毛色 被引量:11
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作者 甘海云 李建斌 +2 位作者 王红梅 李景鹏 仲跻峰 《家畜生态学报》 2007年第3期99-102,共4页
简述了牛毛色形成的机制,并介绍了牛MC1R基因的定位、突变、多态检测及对毛色的影响。最后对牛毛色形成的调控机制提出了一个假设模型,并对MC1R基因进一步研究提出了一些看法。
关键词 牛毛色 MC1R基因 突变
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水貂酪氨酸酶基因外显子1的鉴定及序列变异分析 被引量:5
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作者 宋兴超 徐超 +4 位作者 岳志刚 王雷 丛波 刘琳玲 杨福合 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第11期205-212,共8页
根据GenBank中公布的雪貂(登录号:EF405957)、大熊猫(登录号:XM_002930310)、家犬(登录号:CFU42219)及猫(登录号:AY959314)的酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因DNA序列保守区域,设计1对特异性引物,利用PCR及克隆技术测定了短... 根据GenBank中公布的雪貂(登录号:EF405957)、大熊猫(登录号:XM_002930310)、家犬(登录号:CFU42219)及猫(登录号:AY959314)的酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因DNA序列保守区域,设计1对特异性引物,利用PCR及克隆技术测定了短毛黑水貂、红眼白水貂和米黄色水貂的TYR基因外显子1部分序列,并对该序列进行了BLAST鉴定及变异位点分析,基于该基因编码氨基酸序列构建了16个物种的系统进化树。结果表明,测定的3种毛色水貂TYR基因序列长度均为796bp,包括795bp的外显子1和1bp 5′UTR,共检测到5个单一突变位点:g.A34G、g.T138A、g.T248C、g.A545G和g.C765A,包含4个错义突变:g.A34G(p.Ser12Gly)、g.T248C(p.Val83Ala)、g.A545G(p.Tyr182Cys)和g.C765A(p.His255Gln),1个移码突变分别出现在短毛黑水貂和红眼白水貂个体间:g.T138A(p.Cys46*),获得TYR基因GenBank登录号分别为:短毛黑水貂(KJ198847)、红眼白水貂(KJ658343)和米黄色水貂(KJ152769)。水貂与雪貂、大熊猫、家犬、猫、家兔、猪、羊驼、山羊、绵羊、牛、人、猕猴、黑猩猩、原鸡和日本鹌鹑的TYR基因核苷酸序列同源性为72.8%~98.6%,相应氨基酸序列同源性为75.0%~98.1%。TYR基因分子进化树显示水貂与雪貂遗传关系最近,分化时间约为1000万年前,且与原鸡和日本鹌鹑亲缘关系最远。该结果为进一步开展TYR基因多态性与水貂毛色表型的相关性研究奠定了生物信息学基础。 展开更多
关键词 水貂 毛色变异 酪氨酸酶基因 遗传进化
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豫医无毛小鼠近交系毛色基因遗传学测试 被引量:4
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作者 章金涛 康巧珍 +4 位作者 杜献堂 王纯耀 杜春燕 李洪涛 祝庆蕃 《河南医科大学学报》 北大核心 2001年第6期697-698,共2页
目的 :考核豫医无毛小鼠 (YYHL)近交系纯化程度及毛色基因型。方法 :用复隐性基因小鼠DBA/ 2、6 15分别对YYHL近交系进行了毛色基因测试。结果和结论 :杂交所生的F1代全部为野生色 ,表明其毛色基因为纯合 ,其基因型为AABBccDD。豫医无... 目的 :考核豫医无毛小鼠 (YYHL)近交系纯化程度及毛色基因型。方法 :用复隐性基因小鼠DBA/ 2、6 15分别对YYHL近交系进行了毛色基因测试。结果和结论 :杂交所生的F1代全部为野生色 ,表明其毛色基因为纯合 ,其基因型为AABBccDD。豫医无毛小鼠近交系已达到近交系的国际标准。 展开更多
关键词 豫医无毛小鼠 近交系 毛色基因 遗传学 YYHL 实验动物
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哺乳动物毛色色素Agouti基因位点的研究进展 被引量:17
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作者 范瑞文 董常生 +1 位作者 赫晓燕 张俊珍 《动物医学进展》 CSCD 2004年第3期59-61,共3页
哺乳动物毛色的形成是由毛囊黑色素细胞产生的真黑素和棕黑素之间的转换而引起的 ,控制哺乳动物毛色的基因位点很多 ,且以错综复杂的方式互相作用。鼠灰色 (Agouti)基因是其中之一 ,结构复杂 ,其位点不是一个单一的基因位点 ,而是一个... 哺乳动物毛色的形成是由毛囊黑色素细胞产生的真黑素和棕黑素之间的转换而引起的 ,控制哺乳动物毛色的基因位点很多 ,且以错综复杂的方式互相作用。鼠灰色 (Agouti)基因是其中之一 ,结构复杂 ,其位点不是一个单一的基因位点 ,而是一个含有许多等位基因的位点。Agouti基因的表达会引起棕黑素的产生 ,而Agouti不表达时则会引起真黑素的表达 ,从而调节色素合成的真黑素和棕黑素之间的转换。Agouti在鼠皮肤内表达 ,通过对抗黑色素细胞内的黑色素细胞刺激激素受体 (MC1 R)信号来调节毛色色素。Agouti基因位点会发生许多突变 ,一些突变不仅影响毛色 ,而且干扰许多不同的生物学过程。本文就 展开更多
关键词 哺乳动物 毛色 Agouti基因 基因位点 真黑素 棕黑素
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陆川猪MC1R和KIT基因型鉴定 被引量:3
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作者 秦珂 黄翔 +6 位作者 曾检华 王晨 孙冠杰 宋德清 陈瑶生 刘小红 何祖勇 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第3期773-781,共9页
为了检测陆川猪种群的纯度,本研究以4个华南地方猪种(莆田黑猪、粤东黑猪、大花白猪、巴马香猪)和3个外来猪种(杜洛克猪、大白猪、长白猪)作为对照,利用PCR测序法对陆川猪群体56个样本的MC1R和KIT基因进行基因型鉴定。测序结果表明,大... 为了检测陆川猪种群的纯度,本研究以4个华南地方猪种(莆田黑猪、粤东黑猪、大花白猪、巴马香猪)和3个外来猪种(杜洛克猪、大白猪、长白猪)作为对照,利用PCR测序法对陆川猪群体56个样本的MC1R和KIT基因进行基因型鉴定。测序结果表明,大白猪和长白猪KIT基因内含子17的第1个碱基发生G>A剪接突变,而陆川猪和4个华南地方猪种,以及杜洛克猪中KIT基因型一样,均为野生型的GG基因型;MC1R基因编码区分析表明,以海南野猪MC1R基因型作为参考序列,陆川猪和4个华南地方猪种在MC1R基因编码区存在95Val>Met和102Leu>Pro两个错义突变;MC1R基因非编码区分析表明,与大白猪、长白猪和杜洛克猪相比,陆川猪和4个华南地方猪种MC1R基因的5′UTR分别存在5~6个SNPs,3′UTR存在1个A碱基的缺失。另外,试验对一窝毛色异常的陆川猪仔猪及其亲本的KIT和MC1R基因进行测序分析,结果表明,仔猪及其亲本的KIT基因型均为GG野生型,仔猪和母本的MC1R基因均存在ED1和Ep两种不同的基因型,父本的MC1R基因型为ED1,因Ep对应于皮特兰猪的斑块表型,所以初步判定母本渗入了外来猪种的血统。本研究通过检测陆川猪等8个猪种的毛色相关基因KIT和MC1R基因的基因型,证实了中外猪种间在毛色遗传上的分子差异,为今后深入研究猪毛色遗传的分子调控机理提供参考。 展开更多
关键词 陆川猪 毛色 KIT基因 MC1R基因
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云南地方有色米种质资源多样性及Rc基因的遗传变异分析 被引量:4
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作者 李霞 杜娟 +3 位作者 杨晓梦 普晓英 杨加珍 曾亚文 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第12期2719-2723,共5页
【目的】云南省作为中国最大的稻种遗传多样性中心和生态多样性中心,蕴含丰富的有色米种质资源。但云南有色米种质资源的鉴定依旧停留在外部形态及地域分类阶段,因此有必要利用现代分子生物学手段对云南有色米种质资源进行深度评价及功... 【目的】云南省作为中国最大的稻种遗传多样性中心和生态多样性中心,蕴含丰富的有色米种质资源。但云南有色米种质资源的鉴定依旧停留在外部形态及地域分类阶段,因此有必要利用现代分子生物学手段对云南有色米种质资源进行深度评价及功能基因鉴定。【方法】以来自云南省23个州、县的35份地方水稻种质资源为研究对象,利用分子标记技术对其进行遗传多样性分析;同时探究已报导的Rc基因在上述35份种质材料中的遗传变异。【结果】在云南地方有色米品种中粳稻间的遗传差异较籼稻更大。且总体来看云南地方种质资源中,同一来源地的地方品种遗传相似性不高。35份云南地方水稻资源中,红米Rc基因表现为野生型,白米rc基因表现为突变型,且突变类型与已报导的突变位点一致,均表现为第6外显子内的14 bp缺失。【结论】云南地方有色米品种中粳稻间的遗传差异较籼稻地方种更大,且同一来源地的地方品种遗传相似性不高。红米白米的颜色差异是由Rc基因第六外显子缺失突变产生。 展开更多
关键词 有色稻米 遗传多样性 Rc基因 种皮颜色
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美洲水貂刺鼠信号蛋白基因SNPs检测及其与毛色表型的关联分析 被引量:5
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作者 宋兴超 徐超 +4 位作者 刘宗岳 岳志刚 丛波 刘琳玲 杨福合 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期723-732,共10页
旨在检测刺鼠信号蛋白(Agouti signaling protein,Agouti)基因外显子2、内含子2、外显子3及部分内含子3的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在不同毛色美洲水貂群体中的分布,探讨该基因变异与水貂被毛颜色表型的相... 旨在检测刺鼠信号蛋白(Agouti signaling protein,Agouti)基因外显子2、内含子2、外显子3及部分内含子3的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)在不同毛色美洲水貂群体中的分布,探讨该基因变异与水貂被毛颜色表型的相关性。以金州黑水貂、吉林白水貂、银蓝水貂、咖啡水貂和珍珠色水貂共计430个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR扩增和Sanger双脱氧链终止测序技术,对Agouti基因序列进行SNPs检测,并将突变位点与水貂毛色表型进行关联分析。结果表明,获得的美洲水貂Agouti基因长度为2 510bp,内含子2存在4个SNPs:g.18G>A、g.159A>G、g.235G>T和g.1189C>T,部分内含子3检测到6个SNPs:g.252C>T、g.290A>C、g.298G>C、g.340A>G、g.343T>C和g.379T>C,在外显子2和3区域并未检测到SNPs位点。关联分析表明,Agouti基因7个SNPs(内含子2:g.1189C>T;内含子3:g.252C>T、g.290A>C、g.298G>C、g.340A>G、g.343T>C和g.379T>C)位点的基因型均与水貂毛色表型极显著相关(P<0.000 1),且部分内含子3中的5个SNPs位点(g.290A>C、g.298G>C、g.340A>G、g.343T>C和g.379T>C)可能处于紧密连锁状态。研究结果初步表明,Agouti基因可能是影响美洲水貂被毛颜色的候选基因或与决定毛色性状主效基因相连锁的分子标记。 展开更多
关键词 美洲水貂 Agouti基因 毛色表型 单核苷酸多态性 关联分析
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