X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系TRAPPC2基因缺失突变的高通量测序分析

目的·研究一个X连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)家系的致病基因及突变类型。方法·提取一个SEDT家系6名成员外周血基因组DNA。应用Clearseq遗传性疾病试剂盒靶向捕获先证者基因组样本中与罕见遗传性疾病相关的致病区域,并进行高通量测序,过滤去除高频突变。采用外显子组隐马尔科夫模型(exome hidden Markov model,XHMM)分析拷贝数变异(copy number variant,CNV),并进一步对6名家系成员基因缺失片段的拷贝数进行实时定量PCR分析。结果·高通量测序分析结果显示,先证者X染色体存在2.5 kb缺失(chrX:13732385~13734927),该区域覆盖转运蛋白复合体亚单位2(transport protein particle complex subunit 2,TRAPPC2)基因的第4~6个外显子。定量PCR结果证实先证者及其表哥均存在该缺失,先证者母亲为杂合缺失,先证者父亲、姐姐和表型正常的舅舅拷贝数均正常。结论·TRAPPC2基因第4~6个外显子片段的缺失为SEDT的致病性突变;同时高通量测序分析中运用XHMM算法可检测到致病基因多个外显子的缺失。

肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基4、环氧合酶2在结直肠癌组织中的表达及与患者临床特征和预后的关系

目的 探讨肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基4(ARPC4)、环氧合酶2(COX2)在结直肠癌组织中的表达及与患者临床特征和预后的关系。方法 收集96例结直肠癌患者的病历资料,所有患者均采用免疫组织化学染色法检测ARPC4、COX2表达情况,比较不同临床特征结直肠癌患者结直肠癌组织中ARPC4、COX2阳性表达率,采用回归分析法分析结直肠癌组织中ARPC4与COX2表达的相关性,比较不同ARPC4、COX2表达情况结直肠癌患者的3年生存率。结果 结直肠癌患者中ARPC4阳性表达率为61.46%(59/96),COX2阳性表达率为59.38%(57/96)。有淋巴结转移、低分化、Ⅲ~Ⅳ期结直肠癌患者结直肠癌组织中ARPC4、COX2阳性表达率均高于无淋巴结转移、中高分化、Ⅰ~Ⅱ期患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结直肠癌组织中ARPC4与COX2的表达呈正相关(r=0.618,P﹤0.05)。ARPC4阳性表达结直肠癌患者的3年生存率低于ARPC4阴性表达患者,COX2阳性表达结直肠癌患者的3年生存率低于COX2阴性表达患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论结直肠癌组织中ARPC4与COX2的表达呈正相关,其表达与结直肠癌患者的临床特征及预后有关。

下调肌动蛋白相关蛋白2/3复合体5对肺鳞癌细胞株SK-MES-1增殖、侵袭和转移能力的影响

背景与目的:肌动蛋白相关蛋白2/3复合体5(actin related protein 2/3 complex subunit5,ARPC5)参与肌动蛋白的组装,影响细胞的运动能力,在形成癌细胞侵袭性伪足的过程中起到重要作用。本研究通过基因沉默手段,探讨下调ARPC5基因表达对肺鳞癌细胞株SK-MES-1增殖、侵袭和转移能力的影响。方法:应用阳离子脂质体转染法构建ARPC5基因沉默(si-ARPC5)的SK-MES-1肺鳞癌细胞株,qRT-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)鉴定转染效率和表达情况。实验设置si-ARPC5实验组、空白对照组(mock组)及阴性对照组(NC组)。采用细胞技术试剂盒(cell couiting kit-8,CCK-8)法测定si-ARPC5对SK-MES-1细胞的增殖的影响;划痕修复实验测定si-ARPC5对SK-MES-1细胞迁移能力的影响;Transwell小室体外侵袭实验测定siARPC5对SK-MES-1细胞的侵袭能力的影响。结果:转染si-ARPC5后的SK-MES-1细胞在mRNA和蛋白水平上均下调ARPC5的表达。与mock组及NC组比较,si-ARPC5实验组SK-MES-1细胞增殖能力明显下降(t=7.993,t=8.681,P<0.05)。si-ARPC5实验组划痕修复率(43.32±0.23)%,而mock组和NC组划痕修复率分别为(73.11±0.43)%和(76.58±0.88)%,差异有统计学意义(t=7.348,t=10.614,P<0.05)。si-ARPC5组的SK-MES-1细胞穿膜数为(27±6)个,mock组为(101±11)个,NC组为(92±9)个。si-ARPC5组穿膜细胞数明显少于其他2组,差异有统计学意义(t=10.229,t=8.391,P<0.05)。结论:下调ARPC5基因的表达能够显著抑制肺鳞癌细胞株SK-MES-1的增殖、侵袭和转移能力。

AP3M2在胃癌中的作用及临床意义分析

目的探讨接头相关复合体蛋白3亚基2(adaptor related protein complex 3 subunit mu 2,AP3M2)在胃癌中的表达情况及其临床意义。方法通过TCGA数据库、实时荧光定量PCR及免疫印迹实验检测AP3M2基因的mRNA及蛋白在胃癌组织中的表达情况。通过检测KM Plotter网站探索AP3M2的表达与胃癌患者预后的关系。通过平板克隆形成实验检测AP3M2对胃癌细胞的作用。结果TCGA数据库数据及本研究收集的胃癌患者组织显示AP3M2相比于癌旁组织,其在胃癌组织中的mRNA表达水平升高,同时AP3M2的蛋白在胃癌组织中的表达也有上调的现象。同时本研究通过KM Plotter网站分析得到AP3M2的mRNA表达水平与胃癌患者的预后有关,高表达AP3M2的胃癌患者其预后较低表达AP3M2的胃癌患者差。通过在AGS细胞(人胃腺癌细胞)中过表达AP3M2并检测其平板克隆形成能力的变化,发现过表达AP3M2可以增强胃癌细胞的克隆形成能力。结论AP3M2在胃癌中高表达,高表达AP3M2与胃癌患者的不良预后有关,且能增强胃癌细胞的克隆形成能力。

肝细胞癌组织COPB2基因水平变化及其临床意义探讨

目的探讨肝细胞癌(HCC)组织衣被蛋白复合体亚基β2(coatomer protein complex subunit beta 2,COPB2)基因水平变化及其临床意义。方法在113例HCC患者,采取肝癌切除术治疗,取癌组织和癌旁肝组织,采用RT-PCR法检测COPB2 mRNA水平,采用Western blot法和免疫组化法检测COPB2蛋白表达水平。建立多变量COX比例风险回归模型分析影响HCC患者预后的独立危险因素。结果HCC组织和癌旁肝组织COPB2基因mRNA水平分别为1.32±0.40和0.47±0.14,差异具有统计学意义(P=0.013),两者COPB2蛋白相对表达水平分别为1.35±0.56和0.44±0.12,也具有显著性统计学差异(P=0.035);本组癌组织COPB2蛋白高表达45例(39.8%),低表达或阴性68例(60.2%);有无HBV感染、术前血清AFP水平、不同肿瘤结节数目、肿瘤分化程度和有无血管浸润患者癌组织COPB2蛋白表达强度不同(P<0.05);本组113例患者死亡68例(59.8%),生存时间为(1047.0±167.7)d,中位生存时间1046 d;COPB2蛋白高表达组平均生存时间为(747.3±116.3)d,中位生存时间为610 d,COPB2蛋白低表达组平均生存时间为(1673.7±213.5)d,中位生存时间为1462 d(P=0.001);多因素Cox比例风险回归模型分析结果显示,术前血清AFP水平、血管浸润、肿瘤结节数目和肝癌组织COPB2表达水平是影响HCC患者总生存时间的独立影响因素(P<0.05)。结论HCC患者癌组织COPB2过表达可能预示不良预后,该基因及其蛋白表达可能与肿瘤细胞侵袭转移密切相关,COPB2可能成为预警HCC患者不良预后的一个新的分子标志物并可能成为潜在的治疗靶点。

钙敏感受体信号通路相关高钙血症患儿的临床及遗传学分析

本研究探讨钙敏感受体(CaSR)信号通路相关高钙血症患儿的临床特点、基因变异类型及随访资料。采用回顾性收集2017年7月至2022年11月首都儿科研究所内分泌科诊治的6例高钙血症患儿的临床资料并进行致病基因测序,分析其临床特征和基因变异特点及转归。结果显示,6例患儿是男3例、女3例,就诊时年龄范围在2个月至8岁之间,临床表现从无症状到呕吐、脱水、生长迟缓及智力低下、癫痫不等,除1例血钙显著升高外(4.63 mmol/L),余病例血钙波动于2.98~3.17 mmol/L,6例患者中5例甲状旁腺激素(parathyroid hormone,PTH)升高,1例正常;3例24 h尿钙/尿肌酐清除率明显降低。全外显子测序发现1例CaSR复合杂合变异、4例CaSR杂合变异,1例AP2S1杂合变异。明确诊断后1例行甲状旁腺全切术,术后钙剂补充治疗,3例予鲑降钙素,2例低钙饮食,血钙均控制在正常水平。综上,CaSR信号通路相关高钙血症较为罕见,基因检测为明确诊断的主要方法。家族性低尿钙性高钙血症(FHH)应用鲑降钙素治疗可收到良好效果。