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一株多药耐药Comamonas kerstersii细菌的基因组分析
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作者 王慧 明德松 王明席 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期35-46,共12页
从1名尿路感染患者中分离出了1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acidovorax菌种进行基因组比较分析,包括使用Ortho... 从1名尿路感染患者中分离出了1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acidovorax菌种进行基因组比较分析,包括使用OrthoANI分析平均核苷酸同一性(ANI),以及通过snpTree网络服务器进行单核苷酸多态性(SNP)分析。最后,使用RAST服务器进行基因组序列,使用OrthoVenn软件对同源簇进行功能注释,通过CARD数据库对抗生素耐药基因(ARGs)进行预测,并利用CRISPR识别工具预测CRISPR,以及利用PHAST软件预测前噬菌体。结果表明:C.kerstersii 121606是一种多药耐药细菌,其遗传成分与其他7个Comamonas和Acidovorax菌种相似;其基因组中存在的ARGs有助于解释其多药耐药机制。这些发现为研究新型抗生素来控制多药耐药C.kerstersii感染提供了有价值的见解。 展开更多
关键词 comamonas kerstersii 多药耐药性 比较基因组分析 抗生素耐药性基因 CRISPR 前噬菌体
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Comamonas kerstersii细菌致病性的基因组分析
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作者 王慧 明德松 王明席 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期394-416,共23页
为了更好地管理Comamonas kerstersii(C.kerstersii)感染,通过分析C.kerstersii菌株121606基因组中的毒力因子基因(VFGs)来了解其毒力和致病性。对已经完成测序的C.kerstersii 121606基因组,通过BLAST搜索VFDB数据库来预测其VFGs。结果... 为了更好地管理Comamonas kerstersii(C.kerstersii)感染,通过分析C.kerstersii菌株121606基因组中的毒力因子基因(VFGs)来了解其毒力和致病性。对已经完成测序的C.kerstersii 121606基因组,通过BLAST搜索VFDB数据库来预测其VFGs。结果表明:C.kerstersii含有大量VFGs,其中一些与其在人体内的生存和生长,以及在胃肠道和肺部的致病性有关。基因组分析表明:C.kerstersii可能是一种细胞内病原体。C.kerstersii所携带的VFGs有助于解释其在文献中所报道的胃肠道感染和临床工作中所遇到的肺部感染中的毒力和致病性,这些数据也为新型抗生素和疫苗开发提供了理想的靶点,以用于治疗C.kerstersii感染。 展开更多
关键词 comamonas kerstersii 毒力因子基因 致病性 细胞内病原体 胃肠道感染 肺部感染
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Maternal peripartum bacteremia caused by intrauterine infection with Comamonas kerstersii:A case report
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作者 Hai Qu Yi-Hong Zhao +2 位作者 Wen-Mei Zhu Lu Liu Ming Zhu 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2022年第21期7585-7591,共7页
BACKGROUND Comamonas kerstersii(C.kerstersii)infections have considered as non-pathogenic to humans,however due to new techniques such as matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry(MA... BACKGROUND Comamonas kerstersii(C.kerstersii)infections have considered as non-pathogenic to humans,however due to new techniques such as matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF-MS),more cases have been identified.CASE SUMMARY This is the first report of a maternal patient with a C.kerstersii bacteremia following caesarean section.Due to the severity of the patient’s condition;high fever and rapidly progressing organ damage,the patient was transferred to the intensive care unit.C.kerstersii was detected by metagenomic next-generation sequencing testing.Based on the drug sensitivity test,appropriate antibiotic treatment was given and the patient recovered fully.CONCLUSION This case report confirms that the detection via MALDI-TOF-MS and metagenomic next-generation sequencing testing provides a reliable basis for the diagnosis of this rare bacterial infection. 展开更多
关键词 comamonas kerstersii BACTEREMIA Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry Metagenomic next-generation sequencing testing Caesarean section Case report
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