目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonary nodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考。方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结,构建肺结节处方数据库...目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonary nodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考。方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结,构建肺结节处方数据库,运用R语言对处方进行频次统计和关联规则、聚类分析。利用网络药理学方法预测核心药物的潜在作用靶点和通路,从TCMSP数据库和OMIM等数据库中分别获取药物与肺结节相关的靶点,取交集靶点后上传至STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape 3.7.2软件中,运用Network Analyzer工具计算网络拓扑参数并得到关键靶点。最后通过分子对接技术对关键成分与靶点进行反向验证。结果 数据库共筛选得到53首处方,涉及213味中药,统计发现这些中药多味甘、苦,性寒,归肺经。关联规则分析提示甘草与茯苓、半夏是具有强关联性的3组合药对。核心药物组合“甘草-茯苓-半夏”与肺结节的交集靶点85个,经拓扑分析得到其治疗肺结节的17个关键靶点,包括转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)等。基于DIVID平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,提示主要涉及肿瘤相关信号通路如癌症中的蛋白多糖(proteoglycans in cancer)、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路和丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路,以及病毒相关通路如乙型肝炎(hepatitis B)、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)和糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路等多种复杂信号通路。分子对接结果显示关键活性成分与靶点对接良好,其中黄芩素与MAPK3结合性最好。结论 中医药治疗肺结节组方用药多以健脾益肺、行气化痰、活血祛瘀为主,辅以清热散结的同时,注重调畅气机;其核心药物组合“甘草-茯苓-半夏”治疗肺结节的潜在靶点和作用机制主要参与炎症反应、免疫调控等生物学过程,为中医药治疗肺结节提供理论依据,以及进一步发掘其潜在作用机制提供方向。展开更多
文摘目的 探究中医药治疗肺结节(pulmonary nodule,PN)的用药规律,预测核心药物组合的潜在作用机制,以期为后续实验研究和临床应用提供依据和参考。方法 检索中英文数据库中关于中医药治疗肺结节的文献,并进行归纳总结,构建肺结节处方数据库,运用R语言对处方进行频次统计和关联规则、聚类分析。利用网络药理学方法预测核心药物的潜在作用靶点和通路,从TCMSP数据库和OMIM等数据库中分别获取药物与肺结节相关的靶点,取交集靶点后上传至STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape 3.7.2软件中,运用Network Analyzer工具计算网络拓扑参数并得到关键靶点。最后通过分子对接技术对关键成分与靶点进行反向验证。结果 数据库共筛选得到53首处方,涉及213味中药,统计发现这些中药多味甘、苦,性寒,归肺经。关联规则分析提示甘草与茯苓、半夏是具有强关联性的3组合药对。核心药物组合“甘草-茯苓-半夏”与肺结节的交集靶点85个,经拓扑分析得到其治疗肺结节的17个关键靶点,包括转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)等。基于DIVID平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,提示主要涉及肿瘤相关信号通路如癌症中的蛋白多糖(proteoglycans in cancer)、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路和丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路,以及病毒相关通路如乙型肝炎(hepatitis B)、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染(Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection)和糖尿病并发症中晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路等多种复杂信号通路。分子对接结果显示关键活性成分与靶点对接良好,其中黄芩素与MAPK3结合性最好。结论 中医药治疗肺结节组方用药多以健脾益肺、行气化痰、活血祛瘀为主,辅以清热散结的同时,注重调畅气机;其核心药物组合“甘草-茯苓-半夏”治疗肺结节的潜在靶点和作用机制主要参与炎症反应、免疫调控等生物学过程,为中医药治疗肺结节提供理论依据,以及进一步发掘其潜在作用机制提供方向。
