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流感疫苗应答过程中抗体谱发育的生物信息学分析
1
作者
张璐
张清晨
+2 位作者
裘天颐
曹志伟
唐凯临
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期133-139,共7页
目的 分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征,为后续抗体研发提供理论依据.方法 基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine,TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据,从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determin...
目的 分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征,为后续抗体研发提供理论依据.方法 基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine,TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据,从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determining region 3,CDR3)氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征.结果 疫苗刺激后抗体的突变频率显著提高.CDR3的特征分析显示,带电荷氨基酸和芳香族氨基酸的使用频率较高;原始B细胞(naive B cell)中CDR3长度服从正态分布,而疫苗刺激后,15~18个氨基酸长度的CDR3序列形成主导地位.另外,免疫前后VDJ基因的使用发生明显变化,带有抗体重链胚系基因IGHV3-7的抗体序列对疫苗具有显著应答;免疫后第7天应答最为强烈,随着时间的增加应答强度逐渐减弱.结论 疫苗刺激下,抗体谱动态进化以产生特异性应答的抗体,从序列层面分析应答特征有助于衡量免疫应答的有效性.
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关键词
疫苗
抗体谱
B细胞
CDR3
免疫应答
complementarity-determining
region
3
(CDR3)
原文传递
题名
流感疫苗应答过程中抗体谱发育的生物信息学分析
1
作者
张璐
张清晨
裘天颐
曹志伟
唐凯临
机构
上海同济大学生命科学与技术学院生物信息学系
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期133-139,共7页
文摘
目的 分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征,为后续抗体研发提供理论依据.方法 基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine,TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据,从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determining region 3,CDR3)氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征.结果 疫苗刺激后抗体的突变频率显著提高.CDR3的特征分析显示,带电荷氨基酸和芳香族氨基酸的使用频率较高;原始B细胞(naive B cell)中CDR3长度服从正态分布,而疫苗刺激后,15~18个氨基酸长度的CDR3序列形成主导地位.另外,免疫前后VDJ基因的使用发生明显变化,带有抗体重链胚系基因IGHV3-7的抗体序列对疫苗具有显著应答;免疫后第7天应答最为强烈,随着时间的增加应答强度逐渐减弱.结论 疫苗刺激下,抗体谱动态进化以产生特异性应答的抗体,从序列层面分析应答特征有助于衡量免疫应答的有效性.
关键词
疫苗
抗体谱
B细胞
CDR3
免疫应答
complementarity-determining
region
3
(CDR3)
Keywords
Vaccine
Antibody repertoire
B cell
Immune response
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
流感疫苗应答过程中抗体谱发育的生物信息学分析
张璐
张清晨
裘天颐
曹志伟
唐凯临
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
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