Contracaecum ogmorhini复合种线粒体rrnL基因的多态性

本项目应用聚合酶链式反应单链构象多态性(PCR SSCP) 及DNA序列分析的方法, 研究了南半球Contracaecum ogmorhini两个不同种群和北半球C. margolisi一个种群在线粒体核糖体大亚基( rrnL) 基因部分序列的差异及种群遗传关系。结果显示: 南半球C. ogmorhini 两个种群在种群间及种群内的rrnL 序列相似性很高; 而北半球种群与南半球种群的rrnL序列相似性则相对较低, 它们之间rrnL 序列种间遗传差异大于种内遗传变异, 而且存在着可区分两个姊妹种的2个碱基差异。rrnL 序列分析结果支持北半球C. margolisi 相对于南半球C. ogmorhini而言, 的确是一个不同的物种。

Contracaecum ogmorhini复合种分类鉴定特异PCR方法的建立

根据作者已测得的Contracaecumogmorhini复合种 (包括Contracaecumogmorhini和Contracaecummargolisi)线粒体DNAcox1基因的部分核苷酸序列 ,设计、合成了一对针对C .margolisi的特异性引物(CHL1,CHL2 ) ,通过PCR条件优化和扩增 ,C .margolisi扩增出 1条清晰的 30 6bp大小的特异DNA片段 ,而其他虫体如C .ogmorhini、拟地新线虫、鲁道夫对盲囊线虫、猪蛔虫、犬弓首蛔虫、猪有齿食道口线虫等 14个对照样本均未扩增出特异性片段。敏感性实验可检测到C .margolisiDNA的最低浓度为 0 34ng μL ,从而初步建立了鉴定C .ogmorhini复合种的特异PCR方法。该方法特异性强、敏感度高、重复性好 ,不仅可用于C .ogmorhini复合种的分类鉴定 ,也可用于它们所导致的寄生虫病的诊断、防制和流行病学调查 ,同时也为C .

线粒体cox1序列分析支持北半球欧氏对盲囊线虫是一个新种

欧氏对盲囊线虫 (Contracaecumogmorhini )是一种重要的人畜共患寄生虫病—异尖线虫病的病原之一。来自南北半球三个不同种群的C ogmorhini有着明显的地理分布差异和宿主特异性。应用PCR_SSCP技术分析了三个不同地理株的C ogmorhini在线粒体DNA(mtDNA)细胞色素c氧化酶第I亚基 (cox1)部分序列的差异及种群遗传关系。用同位素 (γ3 3 P)对保守引物进行标记 ,通过PCR从单个欧氏对盲囊线虫DNA中扩增出一条长为 4 4 1bp的cox1基因片段 ,取阳性PCR扩增产物 ,对三个不同地理株的C ogmorhini进行SSCP分析 ,结果显示 :三个不同地理株的C ogmorhini4 4 1bp的cox1基因片段存在着一定的多态性 ,其中南半球的不同地理株其SSCP带型差异很小 ,而北半球和南半球的带型差异则略微明显。将SSCP分析筛选出的代表性样品进行克隆、测序 ,序列分析表明 :南半球的样品序列同源性很高 ,而北半球种群与南半球种群的序列同源性则相对较低 ,它们之间存在着 3个可作为其遗传标记的基因位点 ,从而说明北半球的C ogmorhini相对于南半球的C ogmorhini来说确实存在着遗传差异 ,很可能代表着一个新种。

欧氏和玛氏对盲囊线虫线粒体nad1基因部分序列的比较研究

欧氏对盲囊线虫(Contracaecum ogmorhini)和玛氏对盲囊线虫(Contracaecum margolisi)是属于欧氏对盲囊线虫复合种中的两个种,前者来自于南半球,后者来自于北半球,二者在地理分布和宿主特异性方面均有明显的不同。本研究用γ33P对引物进行标记,通过聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR- SSCP)分析和DNA序列分析技术对来自南半球两个不同地理种群的欧氏对盲囊线虫和北半球种群的玛氏对盲囊线虫在线粒体NADH脱氢酶亚单位 基因(nad1)部分序列的差异及种群遗传关系进行了研究。结果显示:南半球两个种群的序列相似性很高,而北半球种群与南半球种群的序列相似性则相对较低,它们之间nad1部分序列种间遗传差异大于种内,且存在着2个可作为区分两者的遗传标记。