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猪COPG2和MEST克隆、印记状况和组织表达分析 被引量:1
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作者 李顺 蒋曹德 +3 位作者 石萍 董然然 魏晋 田家伟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期4901-4909,共9页
【目的】为了在猪中找到更多新的候选印记基因并分析它们在哺乳动物之间的保守性,以期为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息和分子标记。【方法】以长白与荣昌猪杂交F1代一月龄个体为研究对象,通过比较生物学的方法,克隆COPG2和MEST... 【目的】为了在猪中找到更多新的候选印记基因并分析它们在哺乳动物之间的保守性,以期为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息和分子标记。【方法】以长白与荣昌猪杂交F1代一月龄个体为研究对象,通过比较生物学的方法,克隆COPG2和MEST全长cDNA,并分析基因的序列特点,然后利用IMpRH(法国农业科学院的辐射杂种克隆板)分析COPG2和MEST在猪染色体上定位信息。通过RT-PCR产物直接测序方法分析了这些基因在一月龄F1代个体11个不同组织(心、胃、肌肉、肾脏、肺、肝、小肠、膀胱、舌头、脾和脂肪)的印记状况,并进一步利用Real-timePCR方法,分析其在一月龄F1代个体11个不同组织的表达情况。【结果】克隆得到2817bp COPG2和2219bp MEST序列。其中COPG2包括2616bp完整CDS(coding sequenc,编码序列)区域,分析表明其编码含871个氨基酸的蛋白质,MEST包括981bp完整CDS区域,编码326个氨基酸的蛋白质。IMpRH分析结果表明,猪COPG2和MEST都位于猪18号染色体上并且与标记CL365941紧密连锁,LOD值分别为14.32和8.5。印记分析表明COPG2在11个组织中呈双等位表达,MEST在心脏、胃、肌肉、肾、肺、膀胱、舌头和脂肪中表达父方等位基因,但在肝脏、小肠和脾脏中呈双等位表达。荧光定量结果显示COPG2和MEST总的表达量在一月龄个体各组织间存在着显著性差异(P<0.01),其中COPG2和MEST在肾脏中表达量均高于其它各组织(P<0.01)。【结论】在哺乳动物之间,COPG2序列较为保守但是印记状况却缺乏保守性;MEST序列和印记状况均较为保守,但MEST在猪中印记状况具有组织特异性。此外,染色体定位信息和印记状况证实了在猪的18号染色体上有由COPG2和MEST构成的新的印记域。 展开更多
关键词 copg2 MEST 克隆 染色体定位 组织表达
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CopG蛋白介导的DNA弯曲对σ^(54)依赖型启动子转录起始的调控作用
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作者 陈彦丞 杨恩策 +2 位作者 刘臻峰 田哲贤 王忆平 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第6期672-678,共7页
以glnAp2,nifLp和glnHp2为研究对象,在不改变上游序列增强子元件和核心启动子之间距离的前提下,将DNA弯曲蛋白CopG的靶位点替换插入到两者之间的不同位置,构建了一系列的同源启动子.在大肠杆菌中,这些同源启动子的活性被CopG介导的DNA... 以glnAp2,nifLp和glnHp2为研究对象,在不改变上游序列增强子元件和核心启动子之间距离的前提下,将DNA弯曲蛋白CopG的靶位点替换插入到两者之间的不同位置,构建了一系列的同源启动子.在大肠杆菌中,这些同源启动子的活性被CopG介导的DNA弯曲激活或者被抑制.不同位置的CopG靶位点,在具有相同调控模式的同源启动子中(无论是激活还是抑制)相距为整数个螺旋,在具有相反调控模式的同源启动子中相距为整数加半个螺旋.我们的实验结果表明,CopG介导的DNA弯曲可能通过改变σ54RNA聚合酶和NtrC在DNA螺旋上的相对相位关系进而可以调控σ54依赖型启动子的转录起始. 展开更多
关键词 σ^54依赖型启动子DNA弯曲 copg蛋白 螺旋相位
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The role of CopG mediated DNA bending on the regulation of the σ^(54)-dependent promoters in E. coli
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作者 YANG Ence 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2006年第8期934-940,共7页
In order to investigate the role of DNA bending on the regulation of σ54-dependent promot- ers, we introduced the CopG binding site between the enhancer-like element and the core promoter of glnAp2, nifLp and glnHp2,... In order to investigate the role of DNA bending on the regulation of σ54-dependent promot- ers, we introduced the CopG binding site between the enhancer-like element and the core promoter of glnAp2, nifLp and glnHp2, without changing the dis- tance in between. The expression activities of these homologous promoters were either activated or re- pressed by the CopG-induced DNA bending in E. coli. In this case, similar regulatory pattern (either acti- vated or repressed) could be observed, when the bending centers from CopG are in integral DNA he- lixes interval, while opposite regulatory pattern could be observed, when the bending centers from CopG are in integral plus a half DNA helixes interval. These results suggested that CopG-induced DNA bending can exert regulatory effects on the transcription of σ54-dependent promoters probably by altering the relative DNA helix phase of 54 RNA polymerase and NtrC. 展开更多
关键词 DNA copg 启动子 大肠杆菌
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