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基于网络药理学探讨麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制
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作者 尚艳花 邓敬华 +2 位作者 张晓阳 马真 王玉栋 《世界中西医结合杂志》 2024年第3期542-549,共8页
目的基于网络药理学分析麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的潜在机制。方法应用TCMSP中药系统药理学数据库及相关文献资料等检索麻射安金丸中的生物活性成分,筛选出作用靶点,构建麻射安金... 目的基于网络药理学分析麻射安金丸治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的潜在机制。方法应用TCMSP中药系统药理学数据库及相关文献资料等检索麻射安金丸中的生物活性成分,筛选出作用靶点,构建麻射安金丸的药物-有效成分-作用靶点网络。根据Drugbank和Genecards等数据库建立其与COPD的相关疾病靶点,并与麻射安金丸的有效成分靶点相匹配获得潜在治疗靶点。基于Metascape数据库和DAVID数据库对潜在治疗靶点进行GO生物过程、KEGG信号通路分析,并分析蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI),用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析。结果麻射安金丸中有效化学成分有1525种,包括半夏22种、赤芍18种、川芎22种、甘草95种、僵蚕3种、苦杏仁26种、麻黄43种、牡蛎1种、木香29种、砂仁23种、射干12种和浙贝母5种,有效成分作用靶点基因298个。在药物-有效成分-靶点网络内重要性前10的有效成分中,来源自麻黄6种,赤芍、苦杏仁、僵蚕3种,射干、甘草、半夏、川芎、砂仁2种,浙贝母1种。KEGG富集分析显示,在得出的全部20调信号通路中,得到10条靠前的信号通路。GO功能富集分析显示,前10个生物过程包括酶结合、DNA依赖的转录正调控等;前10个分子功能包括核质、细胞质等;前10个细胞定位包括蛋白质变性调节、蛋白质代谢调节等。PPI网络经提取后获得了包含21个节点的核心网络,其中JUN、MAPK1、MAPK3、TNF、RELA、MYC、STAT3、TP53、AKT1、MAPK8、EGFR、MAPK14和PRKCA基因是核心靶点。动物实验显示:模型组和对照组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。模型组和对照组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均高于空白组,差异有统计学意义(P<0.05);模型组大鼠MAPK1、MAPK3、MYC的mRNA表达水平均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论麻射安金丸通过多成分、多靶点和多通路治疗COPD,其中麻射安金丸的潜在有效成分主要来源于麻黄、射干、柴胡、白芍、白术和甘草,麻射安金丸治疗作用的核心靶点主要有JUN、MAPK1、MAPK3等基因。 展开更多
关键词 麻射安金丸 慢性阻塞性肺疾病 网络药理学 基因 核心靶点
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便血方剂“核心配伍-作用靶点”的关联性研究
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作者 张媛婷 胡宗仁 +3 位作者 梁璠琦 别明珂 欧广洋 陈新宇 《亚太传统医药》 2024年第2期136-141,共6页
目的:研究治疗便血方剂的用药规律及其“核心配伍-作用靶点”的关联性。方法:从《中医方剂大辞典》中筛选治疗便血的方剂,录入数据库,进行频数、聚类和关联分析,从中发现配伍组方规律。找到核心配伍组合后,再使用中药分子机制的生物信... 目的:研究治疗便血方剂的用药规律及其“核心配伍-作用靶点”的关联性。方法:从《中医方剂大辞典》中筛选治疗便血的方剂,录入数据库,进行频数、聚类和关联分析,从中发现配伍组方规律。找到核心配伍组合后,再使用中药分子机制的生物信息学分析工具(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)对核心配伍组合进行活性成分-靶点预测,从而分析核心配伍组合的共同作用靶点。结果:共收录便血方剂616首,涉及中药340味;排名前10的高频药物依次是当归、甘草、黄连、芍药、枳壳、生地黄、黄芩、地榆、槐花、黄芪;主要使用的中药类别依次是补虚药、清热药、止血药。发现生地黄、黄芩、赤芍,人参、白术、茯苓,侧柏叶、地榆、槐花,当归和川芎等是治疗便血的四组核心配伍组合;经分析发现这四组核心配伍组合均有AR、ESR1、NR3C1、PGR、VDR这5个共同作用靶点,即治疗便血的11个核心药物有5个共同作用靶点。结论:《中医方剂大辞典》所载便血方剂的核心配伍组合关联的AR、NR3C1、PGR、VDR等靶点与肠炎、结直肠癌、胃癌等常导致便血的相关疾病密切相关,提示其“核心配伍-作用靶点”的关联性对于指导临床用药以及相关基础研究和新药开发有一定参考意义。 展开更多
关键词 中医方剂大辞典 便血 方剂 配伍规律 核心药物 作用靶点
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靶点射频热凝术联合核心肌群训练治疗腰椎间盘突出患者的效果
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作者 胡晓莉 范后宝 +3 位作者 徐峰 朱敏 刘佩 张帅 《国际医药卫生导报》 2024年第3期479-483,共5页
目的探究靶点射频热凝术联合核心肌群训练治疗腰椎间盘突出患者的效果。方法本研究为随机对照试验,选取2021年1月至2023年1月徐州市第一人民医院中医骨伤科收治的92例腰椎间盘突出患者作为研究对象,按照随机数字表法分为观察组(46例)和... 目的探究靶点射频热凝术联合核心肌群训练治疗腰椎间盘突出患者的效果。方法本研究为随机对照试验,选取2021年1月至2023年1月徐州市第一人民医院中医骨伤科收治的92例腰椎间盘突出患者作为研究对象,按照随机数字表法分为观察组(46例)和对照组(46例)。观察组男25例、女21例,年龄(42.23±10.57)岁,病程(36.24±11.71)个月;对照组男28例、女18例,年龄(43.37±9.82)岁,病程(38.58±12.39)个月。对照组采用靶点射频热凝术治疗,观察组采用靶点射频热凝术联合核心肌群训练治疗。对比两组患者疼痛程度[视觉模拟评分法(VAS)]、腰椎功能情况、治疗效果以及并发症发生情况。计数资料行χ^(2)检验,符合正态分布计量资料采用重复测量方差分析,行SNK-q检验。结果两组患者的VAS评分及腰椎功能情况组间、时间、交互比较,差异均有统计学意义(F组间=5.236,F时间=6.025,F交互=5.842;F组间=12.364,F时间=11.482,F交互=14.217,均P<0.05);组间比较,治疗后7 d、1个月、3个月、6个月,观察组患者的VAS评分[(4.02±1.46)分、(3.22±1.34)分、(2.21±1.11)分、(1.03±0.42)分]及腰椎功能评分[(25.21±7.31)分、(15.37±6.85)分、(10.05±5.32)分、(5.53±3.64)分]均低于对照组[(4.76±1.78)分、(3.85±1.55)分、(2.74±1.37)分、(1.65±0.69)分及(28.34±7.65)分、(18.35±7.42)分、(12.65±6.51)分、(7.45±3.87)分],差异均有统计学意义(均P<0.05);组内比较,治疗后7 d、1个月、3个月、6个月,两组患者的VAS评分及腰椎功能评分均逐渐降低(均P<0.05)。治疗后1个月、3个月、6个月,观察组优良率为69.57%(32/46)、82.61%(38/46)、93.48%(43/46),均高于对照组[45.65%(21/46)、63.04%(29/46)、73.91%(34/46)],差异均有统计学意义(χ^(2)=5.386、4.449、6.452,均P<0.05)。观察组治疗后并发症发生率为6.52%(3/46),低于对照组的21.74%(10/46),差异有统计学意义(χ^(2)=4.389,P=0.036)。结论靶点射频热凝术联合核心肌群训练可以减轻腰椎间盘突出患者疼痛,改善腰椎功能,减少并发症的发生,治疗效果显著。 展开更多
关键词 靶点射频热凝术 核心肌群训练 腰椎间盘突出 效果
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大尺寸砂岩靶射孔孔道损伤评价
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作者 郭书生 梁豪 崔佳莉 《中国海上油气》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期134-142,共9页
射孔高速金属射流穿透油气层的同时也在孔眼附近形成压实带,造成油气层的孔隙度和渗透率损伤,严重影响油气井产能。当前对于射孔效果的检验主要基于地面水泥靶、钢靶或小尺寸砂岩靶进行实验,无法真实评价原位地层条件下的射孔效果、流... 射孔高速金属射流穿透油气层的同时也在孔眼附近形成压实带,造成油气层的孔隙度和渗透率损伤,严重影响油气井产能。当前对于射孔效果的检验主要基于地面水泥靶、钢靶或小尺寸砂岩靶进行实验,无法真实评价原位地层条件下的射孔效果、流动效率,对于射孔孔道压实损伤机理认识不足,缺乏定量评价手段。针对上述问题,研发了模拟原位地层条件下的大型射孔物理模拟装置及实验技术,基于稳态气流注入技术的岩心自动扫描系统点测砂岩靶上任意点的渗透率以及纵、横波速,结合微CT、扫描电镜等手段实现对射孔砂岩损伤程度定量评价。结果表明:对比混凝土靶的射孔数据,砂岩靶穿深急剧下降且不存在明显的裂纹,不同弹型射孔穿深下降幅度为17%~40%,温度对射孔深度无明显影响;射孔孔道径向表现为破碎带、过渡带、压实带及原状带等4个区域,平均压实带厚度17.10~79.95 mm,压实损伤率12%~63%;孔道内壁受剪胀作用,孔隙度、渗透率增加,压实区域受塑性挤压,大幅降低喉道直径,导致孔隙度、渗透率显著下降。本文研究成果对于明确射孔孔道损伤机理、指导射孔参数设计优化具有借鉴意义。 展开更多
关键词 砂岩靶 射孔损伤 岩心扫描 渗透率 压实
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载木犀草素纳米纤维膜的制备与性能
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作者 刘明迪 邹梦君 +2 位作者 周菊英 许海棠 赵彦芝 《现代塑料加工应用》 CAS 北大核心 2024年第1期1-4,共4页
采用2种pH敏感材料(Eudragit S100和Eudragit RS100),通过同轴静电纺丝技术制备了壳/核结构载木犀草素纳米纤维膜,通过扫描电子显微镜(SEM)、透射电子显微镜(TEM)、傅里叶变换红外光谱仪(FTIR)、X射线衍射仪(XRD)等研究了壳/核结构载木... 采用2种pH敏感材料(Eudragit S100和Eudragit RS100),通过同轴静电纺丝技术制备了壳/核结构载木犀草素纳米纤维膜,通过扫描电子显微镜(SEM)、透射电子显微镜(TEM)、傅里叶变换红外光谱仪(FTIR)、X射线衍射仪(XRD)等研究了壳/核结构载木犀草素纳米纤维膜的表面形貌、化学结构和药物释放性能。结果表明:壳/核结构载木犀草素纳米纤维膜表面整体较光滑,纳米纤维平均直径随木犀草素含量增加而增大。该纳米纤维膜具有良好的结肠靶向性和生物相容性。 展开更多
关键词 同轴静电纺丝技术 壳/核结构 木犀草素 结肠靶向 缓释控释
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基于伪全局Swin Transformer的遥感图像识别算法 被引量:1
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作者 王科平 左鑫浩 +1 位作者 杨艺 费树岷 《模式识别与人工智能》 EI CSCD 北大核心 2023年第9期818-831,共14页
如何在多目标并列的情况下,确定符合人类思维习惯的核心目标是遥感图像识别的关键之一.因此,在全局视野下,为各目标分配符合人类视觉习惯的注意力,是甄选核心目标的有效途径之一.文中结合Transformer提取全局特征的思想和Swin Transfor... 如何在多目标并列的情况下,确定符合人类思维习惯的核心目标是遥感图像识别的关键之一.因此,在全局视野下,为各目标分配符合人类视觉习惯的注意力,是甄选核心目标的有效途径之一.文中结合Transformer提取全局特征的思想和Swin Transformer对图像栅格化处理可降低计算量的优点,提出基于伪全局Swin Transformer的遥感图像识别算法.构建伪全局Swin Transformer模块,将遥感图像栅格化后的各局部信息聚合为一个特征值,替代以像素为基础的全局信息,以较小计算量为代价,获取全局特征,有效提升模型对所有目标的感知能力.同时,通过以可变形卷积为基础的感受野自适应缩放模块,使感受野向核心目标偏移,提高网络对核心目标信息的关注,从而实现对遥感图像的精确识别.在RSSCN7、AID和OPTIMAL-31遥感图像数据集上的实验表明,文中算法取得较高的识别精度和参数识别效率. 展开更多
关键词 遥感图像识别 TRANSFORMER Swin TRANSFORMER 核心目标
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基于核心素养培养的数学大单元教学策略探究
7
作者 陈涛 《成才之路》 2024年第15期137-140,共4页
核心素养是学科育人价值的综合体现,对新时期数学教学工作的推进具有指导意义。落实核心素养,关键在于结构化整合教学内容,有序开展相关工作,指导学生认识、理解、迁移应用新的理论与方法。文章简要介绍大单元教学内涵及其理论基础,分... 核心素养是学科育人价值的综合体现,对新时期数学教学工作的推进具有指导意义。落实核心素养,关键在于结构化整合教学内容,有序开展相关工作,指导学生认识、理解、迁移应用新的理论与方法。文章简要介绍大单元教学内涵及其理论基础,分析核心素养对现阶段数学教学的具体要求,并从实践角度出发提出紧扣素养目标统筹大单元教学设计、立足思维发展组织大单元教学活动的教学策略,以期为提高数学教学质量、推进核心素养落实提供参考。 展开更多
关键词 核心素养 小学数学 大单元教学 教学策略 教学目标
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Photochemical synthesis and characterization of novel narrow size distribution core-shell magnetic nanogels
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作者 SUNHanwen YUJiahui +4 位作者 GONGPeijun XUDongmei HONGJun ZHANGChunfu YAOSide 《辐射研究与辐射工艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期73-73,共1页
关键词 磁性纳米凝胶体 光化学法 核-壳结构 颗粒分布
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基于网络药理学和分子对接探讨人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤的作用机制 被引量:2
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作者 赵倩琳 赖颖蓉 姜丽红 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期970-978,共9页
目的采用网络药理学方法、分子对接技术及实验研究,探究人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MIRI)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP数据库及文献补充筛选人参-红景天的有效活性成分及靶点,检索... 目的采用网络药理学方法、分子对接技术及实验研究,探究人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MIRI)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP数据库及文献补充筛选人参-红景天的有效活性成分及靶点,检索GENECARDS、DISGENET、DRUGBANK数据库得到MIRI靶点,使用STRING数据库构造功能蛋白相互作用网络(PPI),筛出核心靶点;并选择DAVID数据库进行基因本体功能分析(GO)和KEGG信号通路富集分析;最后借助分子对接技术及实验研究进行初步验证。结果获得人参-红景天有效活性成分43种,潜在靶点348个,并发现IL-6、TNF-α、VEGFA等靶点与MIRI密切相关,主要涉及TNF、PI3K-Akt、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示,豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷与IL-6、TNF-α、Caspase-3等靶点均有较好的结合作用且匹配度高,其中结合性最好的是Caspase-3与人参皂苷rh2,实验研究结果显示,人参-红景天可改善MIRI后心肌组织坏死,减轻心肌细胞水肿及血管充血情况,并降低MIRI大鼠中TNF-α及IL-6的表达水平。结论人参-红景天可能通过豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷来调控IL-6、TNF-α、Caspase-3等多个靶点,抑制炎症及氧化应激反应,减轻心肌细胞损伤,发挥对MIRI的治疗作用。 展开更多
关键词 人参-红景天 心肌缺血/再灌注损伤 网络药理学 分子对接 核心靶点 信号通路
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转录组测序结合TMT蛋白质组学技术对脊髓损伤小鼠关键基因预测及相关病理机制研究
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作者 杨祝歆 唐成林 +3 位作者 赵鸿娣 李明娇 王嘉培 黄思琴 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1149-1158,共10页
目的:通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)和TMT蛋白质组学技术,筛选差异表达的基因及蛋白,探讨脊髓损伤后复杂的病理机制。方法:50只雌性C57BL/6小鼠随机分为假手术组、模型组,每组25只。采用钳夹法在腰1处制备小鼠脊髓损伤模型,1... 目的:通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)和TMT蛋白质组学技术,筛选差异表达的基因及蛋白,探讨脊髓损伤后复杂的病理机制。方法:50只雌性C57BL/6小鼠随机分为假手术组、模型组,每组25只。采用钳夹法在腰1处制备小鼠脊髓损伤模型,14 d后进行取材。采用后肢运动功能评分(basso mouse scale,BMS)评估小鼠后肢运动功能变化;HE染色法观察脊髓损伤区病理形态学变化;RNA-Seq技术筛选差异基因;TMT蛋白组学分析筛选差异蛋白;结合2种测序技术筛选变化趋势吻合的mRNA和蛋白并进行生物信息学分析。结果:与假手术组相比,模型组中BMS评分明显降低(P<0.05);HE染色显示脊髓损伤区域结构疏松紊乱,出现空洞,细胞核固缩,炎性浸润严重,神经元坏死;RNA-Seq共筛选出565个差异mRNA,其中545个上调,20个下调,TMT蛋白组学共筛选出339个差异蛋白,其中278个上调,61个下调;2种测序的聚类热图显示2组样本的表达模式差异大;韦恩图分析获得83个趋势上调的mRNA或蛋白;蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析获得11个核心靶点;GO富集分析显示分子功能或生物过程主要在免疫应答、溶酶体途径、细菌反应、液泡裂解等方面;KEGG富集通路主要在结核病变、溶酶体、吞噬小体途径等通路。结论:本研究筛选出的11个mRNA或蛋白可能是调控脊髓损伤病理过程的核心靶点,病理机制可能与免疫应答途径、溶酶体和吞噬小体等通路密切相关。 展开更多
关键词 脊髓损伤 转录组测序 TMT蛋白组学 核心靶点 病理机制
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面向关键核心技术突破的国家创新体系构建
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作者 张玉臣 仪静雯 廖凯诚 《科技管理研究》 北大核心 2023年第23期1-10,共10页
认识到制约我国关键核心技术突破的根本要素在于国家创新体系,对面向关键核心技术突破的国家创新体系构建问题进行研究。首先,界定国家创新体系构建的两种主要形式,包括基础性构建和针对性构建,并研究两种构建形式的基本逻辑,提出前者... 认识到制约我国关键核心技术突破的根本要素在于国家创新体系,对面向关键核心技术突破的国家创新体系构建问题进行研究。首先,界定国家创新体系构建的两种主要形式,包括基础性构建和针对性构建,并研究两种构建形式的基本逻辑,提出前者的逻辑是新兴技术演化为关键核心技术的各个阶段对国家创新体系的支撑需求,而后者的逻辑是针对性弥补国家创新体系的功能缺口;其次,论证国家创新体系构建应以功能结构为导引、以构成要素为基本对象,并总结不同构建形式的可行路径;最后,分析不同构建形式的构建机制,比较利益驱动机制和使命驱动机制的异同及各自适合的应用场景。 展开更多
关键词 关键核心技术 国家创新体系 基础性构建 针对性构建 构建逻辑 可行路径
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牛膝-杜仲、金银花-连翘和丁香-郁金三种药对配伍差异的网络药理学研究
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作者 袁开智 李欣悦 +1 位作者 王冰 孙艳涛 《海峡药学》 2023年第11期20-26,共7页
目的应用网络药理学方法在分子层面探究相须、相使、相畏药对配伍前后变化规律及配伍差异。方法预测和筛选相须药对“牛膝-杜仲”、相使药对“金银花-连翘”与相畏药对“郁金-丁香”及药对中单味药的有效成分和预测靶点。筛选3组药对及... 目的应用网络药理学方法在分子层面探究相须、相使、相畏药对配伍前后变化规律及配伍差异。方法预测和筛选相须药对“牛膝-杜仲”、相使药对“金银花-连翘”与相畏药对“郁金-丁香”及药对中单味药的有效成分和预测靶点。筛选3组药对及单味药与其治疗疾病的预测靶点。构建“药物-有效成分-疾病-核心靶点”网络架构。对核心靶点的基因本体(GO)注释和KEGG通路进行蛋白功能归属和富集分析。根据网络架构中有效成分及GO富集分析与KEGG富集分析结果进行3组药对配伍前后的比对分析。结果相须、相使药对与其单味药比较,有效成分、核心靶点、生物功能及信号通路配伍前后结果基本一致,但相畏药对与单味药比对差异较为明显。结论相须药对、相使药对配伍后有效成分可能产生叠加作用,相畏药对配伍后可能产生抵消作用影响有效成分网络架构中贡献值及信号通路调控能力。 展开更多
关键词 药对 网络药理学 核心靶点 有效成分
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基于网络药理学的积雪草酸治疗IA1期宫颈癌治疗机制的研究
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作者 张军丹 秦海霞 +1 位作者 张运峰 李华伟 《唐山师范学院学报》 2023年第6期60-64,共5页
通过网络药理学方法筛选获得积雪草酸与IA1期宫颈癌的交集靶点,分析GO功能和信号通路,经拓扑学筛选核心靶点,进行分子对接验证。结果表明,积雪草酸与IA1期宫颈癌有60个交集靶点,涉及101项GO功能和30条KEGG信号通路,确定了4个核心靶点(I... 通过网络药理学方法筛选获得积雪草酸与IA1期宫颈癌的交集靶点,分析GO功能和信号通路,经拓扑学筛选核心靶点,进行分子对接验证。结果表明,积雪草酸与IA1期宫颈癌有60个交集靶点,涉及101项GO功能和30条KEGG信号通路,确定了4个核心靶点(IL1B、CXCL8、CCL2和TLR4),分子对接验证结果显示积雪草酸与核心靶点结合稳定。 展开更多
关键词 积雪草酸 宫颈癌 网络药理学 核心靶点
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基于泛基因组学和消减蛋白质组学挖掘新型抗诺卡氏菌药物靶点
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作者 黎尔彤 苏雅琳 +1 位作者 刘文彬 金小宝 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期974-982,共9页
【目的】诺卡氏菌是一种病原体,可引起人体的机会性感染,呈全球性分布。近年来发现诺卡氏菌对常用药物已产生耐药性,因此,挖掘新抗诺卡氏菌药物靶点、开发新药物具有迫切需求。【方法】取GenBank数据库中31株诺卡氏菌的全基因组序列,利... 【目的】诺卡氏菌是一种病原体,可引起人体的机会性感染,呈全球性分布。近年来发现诺卡氏菌对常用药物已产生耐药性,因此,挖掘新抗诺卡氏菌药物靶点、开发新药物具有迫切需求。【方法】取GenBank数据库中31株诺卡氏菌的全基因组序列,利用BPGA进行泛基因组学分析,利用消减蛋白组学筛选药物靶点。在此基础上,同源建模预测靶点蛋白的3D结构,采用DrugBank对靶点蛋白进行潜在药物的预测,并使用分子对接技术验证药物与靶点的结合活性。【结果】31株诺卡氏菌的泛基因组中有1421个核心蛋白,消减蛋白组学分析获得15个候选药物靶点蛋白。其中,OG1493蛋白的理化性质(氨基酸数目、分子量、等电点、总平均亲水性、脂肪指数和不稳定性指数Ⅱ等)最符合作为靶点蛋白的理化性质。运用DrugBank数据库筛选出Adenosine-5'-Rp-Alpha-Thio-Triphos⁃phate、alpha,beta-Methyleneadenosine 5'-triphosphate、Phosphoaminophosphonic Acid-Adenylate Ester、Radicicol、2-Hydroxyestradiol、p-Coumaric acid、Ethylmercurithiosalicylic acid等7个化合物可能会针对该靶点蛋白发挥抗诺卡氏菌作用,分子对接结果显示靶点与化合物结合力良好。经实验验证发现根赤壳霉素可能是针对该靶点的抗诺卡氏菌药物。【结论】泛基因组学和消减蛋白质组学可应用于挖掘新型抗诺卡氏菌药物靶点。 展开更多
关键词 诺卡氏菌 泛基因组学 消减蛋白质组学 核心基因 药物靶点
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基于生物信息学和机器学习筛选溃疡性结肠炎特征基因及其靶向中药预测
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作者 梁家浩 张馨慧 王海 《山东科学》 CAS 2023年第6期56-67,共12页
为确定溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的潜在生物标志物,并预测其靶向中药,从GEO数据库下载包含人类UC和健康对照组织(GSE179285、GSE206285和GSE87466)的数据集,合并GSE179285和GSE206285数据集,通过limma R软件包筛选出UC与健... 为确定溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的潜在生物标志物,并预测其靶向中药,从GEO数据库下载包含人类UC和健康对照组织(GSE179285、GSE206285和GSE87466)的数据集,合并GSE179285和GSE206285数据集,通过limma R软件包筛选出UC与健康对照组织之间的差异表达基因(DEGs)。采用LASSO回归模型和支持向量机递归特征消除算法筛选出核心生物标志物。GSE87466数据集用作验证队列,受试者工作特征曲线用于评估诊断效能。利用CIBERSORT探讨UC中的免疫浸润特性,并进一步分析潜在生物标志物与不同免疫细胞之间的相关性。最后,在HERB数据库预测核心生物标志物靶向中药。共筛选出157个DEGs,其中102个基因上调,55个基因下调。功能富集分析显示,这些DEGs主要参与IL-17信号通路、TNF信号通路、类风湿关节炎、趋化因子信号通路、体液免疫反应、中性粒细胞趋化和迁移等。LOC389023、OLFM4、AQP8和CWH43被鉴定为UC的潜在生物标志物,且其诊断价值在GSE87466验证数据集中有显著意义。CIBERSORT免疫浸润分析显示,UC与健康对照组织的免疫浸润特征存在显著差异。UC组发现高水平的CD4+记忆活化T细胞、M1巨噬细胞和中性粒细胞,而健康对照组发现高水平的记忆B细胞、CD4+记忆静息T细胞、M2巨噬细胞和静息树突状细胞。在HERB数据库预测到淡豆豉、牡荆子、骨节草、酒、苦豆子、鹿茸和紫河车7味靶向中药。研究认为,LOC389023、OLFM4、AQP8和CWH43可能作为UC的诊断生物标志物;淡豆豉等7味靶向中药可能通过调节肺肠菌群、影响炎症通路、调节免疫等方面发挥对UC的治疗作用。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 生物信息学 机器学习 免疫浸润 核心基因 靶向中药
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基于网络药理学及分子对接技术探讨中药复方射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘的作用机制 被引量:5
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作者 朱栋 何翔 李国平 《环球中医药》 CAS 2023年第2期210-217,共8页
目的利用网络药理学和分子对接技术研究射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘药效成分的可能靶点,为其临床应用及科研提供理论依据。方法在TCMSP数据库中查询9味组方药物的有效活性成分靶点;在GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank数据库... 目的利用网络药理学和分子对接技术研究射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘药效成分的可能靶点,为其临床应用及科研提供理论依据。方法在TCMSP数据库中查询9味组方药物的有效活性成分靶点;在GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank数据库中查询咳嗽变异性哮喘的疾病相关基因;将药物靶点与疾病相关基因取交集并用Cytoscape构建中药复方调控网络;查找网络核心基因后用R语言进行GO及KEGG富集分析;使用Vina对蛋白受体和小分子配体进行对接。结果本研究共筛选出254个药物靶点;筛选到网络核心基因9个,分别为TNF、MAPK14、AKT1、ESR1、STAT1、MAPK1、EGFR、TP53和MAPK3;GO富集分析氧化应激反应富集最明显;KEGG富集分析主要涉及流体剪切力与动脉粥样硬化通路;分子对接发现槲皮素与TNF和AKT1基因具有较好的结合性。结论本研究体现了中药复方射干麻黄汤多成分、多靶点及多途径的作用特点,为射干麻黄汤治疗咳嗽变异性哮喘作用机制提供新思路和新靶点。 展开更多
关键词 射干麻黄汤 咳嗽变异性哮喘 网络药理学 分子对接 药物靶点 核心基因
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基于网络药理学和实验验证的甘麦大枣汤抗抑郁的物质基础及作用机制研究
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作者 蒲莲莲 刘漫 +4 位作者 杨颖 嵇晶 何苗 程建明 刘陶世 《中医药临床杂志》 2023年第7期1347-1358,共12页
目的:采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析、鉴定甘麦大枣汤的主要化学成分,并在此基础上通过网络药理学及动物实验进一步对甘麦大枣汤抗抑郁的作用机制进行探讨。方法:根据采集到的质谱数据,通过PubChem数据库结合相关参考文献进行化学成分... 目的:采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析、鉴定甘麦大枣汤的主要化学成分,并在此基础上通过网络药理学及动物实验进一步对甘麦大枣汤抗抑郁的作用机制进行探讨。方法:根据采集到的质谱数据,通过PubChem数据库结合相关参考文献进行化学成分的鉴定。将鉴定出的化学成分输入SwissADME数据库,根据Pharmacokinetics、Druglikeness进行筛选。利用SuperPred和SwissTargetPrediction数据库预测筛选成分的相关靶点,同时在GeneCards、DrugBank等数据库搜索抑郁症相关疾病靶点。利用STRING数据库构建“成分-靶点”及PPI蛋白互作网络,筛选药效作用的核心靶点。采用Metascape数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果:共分析鉴定了95个化合物,包括黄酮类、萜类、有机酸类、氨基酸类以及其他类。进一步筛选了12个关键活性成分,40个活性成分与疾病交集靶点,通过网络拓扑分析获得TNF、SLC6A3、MAOB等16个核心靶点;富集分析发现甘麦大枣汤抗抑郁作用通路有神经营养相关通路、内分泌相关通路、炎症免疫相关通路等;动物实验结果显示,与模型组比较,甘麦大枣汤可显著减少小鼠悬尾及强迫游泳静止不动时间、下调小鼠血浆IL-1β、TNF-α含量、上调小鼠血浆5-HT、NE水平(P<0.01)。结论:该研究初步阐明了甘麦大枣汤中的化学成分,同时整合网络药理学及动物实验探讨其发挥药效的关键成分、核心靶点、相关通路,为甘麦大枣汤的药效物质基础及作用机制研究提供了参考。 展开更多
关键词 甘麦大枣汤 化学成分 总黄酮 UPLC-Q-TOF-MS/MS 网络药理学 动物实验 核心靶点
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融合多光谱成像与深度学习的作物植株叶绿素检测系统研究
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作者 王楠 李震 +3 位作者 李佳盟 张源 孙红 李民赞 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第S02期260-269,共10页
为了满足田间作物长势快速检测与指导变量管理的需求,以玉米为例设计了基于多光谱成像的田间作物植株叶绿素检测系统,包括可见光(RGB)和近红外(Near-infrared,NIR)图像采集模块、主控处理器模块、模型加速模块、显示及电源模块,用于实... 为了满足田间作物长势快速检测与指导变量管理的需求,以玉米为例设计了基于多光谱成像的田间作物植株叶绿素检测系统,包括可见光(RGB)和近红外(Near-infrared,NIR)图像采集模块、主控处理器模块、模型加速模块、显示及电源模块,用于实现玉米植株智能识别与叶绿素指标一体化检测。首先,采集玉米苗期和拔节期冠层图像数据集,比较了植株冠层实例分割与株心目标检测两种深度学习模型,构建了基于MobileDet+SSDLite(Single shot multibox detector lite)轻量化网络的玉米植株定位检测模型,实现玉米植株识别。其次,提取被识别的植株株心RGB-NIR图像,开展RGB和NIR图像匹配与分割,提取R、G、B和NIR灰度值计算植被指数,使用SPXY算法(Sample set portioning based on joint X-Y distances)和连续投影算法(Successive projections algorithm,SPA)分别对数据集进行样本划分及特征变量筛选,选择高斯过程回归(Gaussian process regression,GPR)算法建立叶绿素指标检测模型。结果显示,玉米株心目标检测模型在遮挡重叠的复杂环境下识别率达到88.7%,在不交叉重叠时识别精度达到90%以上;叶绿素含量指标检测模型建模集的模型决定系数R^(2)为0.62,测试集模型决定系数R^(2)为0.61。对开发系统进行田间测试,结果显示,系统检测速率可达14.6 f/s,平均精度为92.9%。研究结果能够有效解决大田环境下玉米营养状态的检测问题,满足大田环境实时检测需求,为作物生产智慧感知提供解决思路和技术支持。 展开更多
关键词 玉米 叶绿素含量检测 目标检测 株心识别 多光谱成像 深度学习
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创伤后应激障碍物理治疗潜在脑区靶点的研究进展
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作者 刘斌 陈晨 +4 位作者 宋磊 马续龙 高幸 李西萍 杨群 《空军军医大学学报》 CAS 2023年第11期1118-1122,1127,共6页
创伤后应激障碍(PTSD)是一种严重威胁个体健康和生存的精神疾病,大量研究发现特定大脑区域的状态异常是导致PTSD核心症状的重要原因。这些状态异常的脑区中,既包括功能状态异常的脑区如杏仁核,也包括连接状态异常的脑区如腹内侧前额叶... 创伤后应激障碍(PTSD)是一种严重威胁个体健康和生存的精神疾病,大量研究发现特定大脑区域的状态异常是导致PTSD核心症状的重要原因。这些状态异常的脑区中,既包括功能状态异常的脑区如杏仁核,也包括连接状态异常的脑区如腹内侧前额叶皮质。由于物理治疗可以作用于特定大脑区域并引起其功能状态或连接状态改变,因此可将PTSD患者状态异常的脑区作为物理治疗PTSD核心症状的潜在脑区靶点。目前,一些脑区靶点已被应用到PTSD的物理治疗如背外侧前额叶皮质,一些仍然处于理论研究阶段如岛叶皮质。本文旨在总结与PTSD核心症状相关的功能异常或连接异常的脑区,为后续物理治疗PTSD提供可针对的脑区靶点。 展开更多
关键词 创伤后应激障碍 物理治疗 核心症状 靶点
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分段弹芯对陶瓷/钢复合装甲的侵彻行为
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作者 王明扬 郑宇轩 +2 位作者 李天鹏 程春 王远超 《兵工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第12期3667-3675,共9页
针对高速弹靶作用时穿甲弹芯发生变形及破碎的现象,设计一种两级分段弹芯结构,采用有限元仿真软件对两级弹芯结构侵彻陶瓷/钢复合靶板进行数值模拟。根据弹靶作用过程中的弹靶破坏模式、两级弹芯结构的运动规律,对侵彻过程进行阶段分析... 针对高速弹靶作用时穿甲弹芯发生变形及破碎的现象,设计一种两级分段弹芯结构,采用有限元仿真软件对两级弹芯结构侵彻陶瓷/钢复合靶板进行数值模拟。根据弹靶作用过程中的弹靶破坏模式、两级弹芯结构的运动规律,对侵彻过程进行阶段分析,并在此基础上探讨弹芯长度比例、间隔距离等因素对两级弹芯结构侵彻性能的影响。研究结果表明:两级弹芯结构较普通弹芯的侵彻深度增加率可达到16%以上;两级弹芯长度比例和间距对侵彻效果影响较大,选择合理的长度比例和间距有助于提高两级分段弹丸对陶瓷/钢复合靶板的侵彻性能;研究结果为两级分段弹芯的设计及应用奠定了基础。 展开更多
关键词 分段弹芯 弹体破碎 陶瓷/钢复合靶板 侵彻行为
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