线粒体COI基因在少鳞鳜属(Coreoperca)鱼类条形码区段的变异分析

为了研究线粒体COI基因作为DNA条形码对少鳞鳜属(Coreoperca)鱼类进行物种鉴定的可行性。采用PCR扩增与测序技术与GenBank已有序列联合分析的方法,对少鳞鳜属3种84个个体的条形码区段进行比较分析。结果表明,碱基T(U)的平均含量为30.3%,C的平均含量为27.8%,A的含量为23.1%,G的含量为18.8%。在4种碱基中,G的含量最低,其在第三密码子的使用率上也低至9.3%。少鳞鳜属3种鱼类种内平均遗传距离值为0.003 8,种间为0.146 3,种间遗传距离是种内的38倍;通过构建的系统发育树,少鳞鳜属中的分支明确,种间无交叉情况,说明种间具有明显差异,种内没有亚种的分化。研究证明,线粒体COI基因可作为条形码序列对少鳞鳜属鱼类物种鉴别的有效片段,并且还为其物种的鉴定与分类提供辅助方法。

湖南省鱼类3新纪录

2009年10月至2011年5月,对湖南省沅、澧水水域鱼类资源进行了调查,发现湖南鱼类3新纪录:张氏Hemiculter tchangi Fang、长脂拟鲿Pseudobagrus adiposalis、中国少鳞鳜Coreoperca whiteheadi。

中国少鳞鳜不同群体mtDNA控制区序列的遗传变异分析

少鳞鳜为东亚特有鱼类,为了解中国少鳞鳜在我国不同水域内的遗传结构特征,利用PCR扩增和直接测序法分析了长江、钱塘江、西江、南渡江34尾样品mtDNA控制区的序列差异。在长度838 bp的同源序列中,共发现81个变异位点,占分析位点总数的9.67%;定义了4个单倍型,每个群体仅发现一个单倍型,群体之间没有共享单倍型,且每个群体都有鉴别位点。群体间的核苷酸歧义度（Dxy）在0.360%-8.043%之间,南渡江群体与长江、钱塘江、西江3个群体间的差异最大。分子变异分析（AMOVA）得出群体间的遗传分化指数（Fst）为1.000（P〈0.001）,差异极显著。构建的NJ树中,4个群体分为两支,一支为南渡江群体,另一支为长江、钱塘江、西江群体。这些表明中国少鳞鳜群体的遗传多样性较低,不同地理群体之间出现了明显的遗传分化,南渡江群体与长江、钱塘江、西江3个群体之间的分化水平最高。

中国少鳞鳜消化系统解剖结构研究

[目的]为中国少鳞鳜的人工养殖和进一步研究提供基础资料,为其种质资源保护提供科学的理论依据。[方法]肉眼和体视解剖镜下解剖观察中国少鳞鳜消化系统的解剖结构,探讨其消化系统结构与食性的适应关系。[结果]中国少鳞鳜的消化道分段明显,具有典型的肉食性鱼类特点;口裂大,口裂宽/口裂长为(1.996±0.811),口咽腔宽阔,口腔长/头长为(0.943±0.171),肠较短,肠长/体长为(0.513±0.061);食道、胃和肠壁内突形成明显的黏膜皱褶。具有独立的肝脏和散布致密型胰脏。[结论]中国少鳞鳜的消化系统结构与食肉习性相适应。

基于Cytb和D-Loop基因对中国少鳞鳜种群遗传多样性的分析

为探究贵州省中国少鳞鳜野生资源多样性状况,利用线粒体DNA Cytb基因和D-Loop基因分析评价沅江上游铜仁锦江、平塘县平舟河及荔波县樟江3个自然群体的86尾中国少鳞鳜的遗传多样性、遗传结构及种群历史动态。测序结果表明,中国少鳞鳜Cytb基因的序列长度为1141 bp,D-Loop为822 bp。在Cytb区段共检测出11个变异位点,界定了18种单倍型,3个群体平均的单倍型多样性、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性分别为0.918、3.342和0.00293;在D-Loop区段中共检测出17个变异位点,其中有3个缺失和2个插入,界定了23种单倍型,3个群体平均的单倍型多样性、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性分别为0.903、3.343和0.00410。遗传分化指数显示出3个群体间存在极大的遗传分化;中性检验和核苷酸不配对分布分析表明,本试验的中国少鳞鳜未经历过种群扩张。中国少鳞鳜属迁徙能力弱、较封闭的小群体,因近交衰退效应,种群结构较为原始,长江流域群体生境理想,进化潜力较大。荔波樟江种群面临生存危机,而锦江更适宜中国少鳞鳜栖息繁育。本试验从分子水平评价贵州省中国少鳞鳜遗传多样性水平,将为其种质资源的保护和开发利用提供依据。

锦江河3种鳜的遗传变异及其多样性评价

为探究锦江河国家级水产种质资源保护区内鳜类遗传变异特征及其多样性水平,基于PCR扩增与测序技术对大眼鳜、斑鳜和中国少鳞鳜3个群体97尾鱼的线粒体控制区序列进行比较分析。结果显示,大眼鳜序列长度为843 bp,无变异位点,只有1种单倍型,斑鳜有852 bp和856 bp两种序列,28个多态位点和11个单倍型,中国少鳞鳜也有845 bp和846 bp两种长度,5个多态位点和5个单倍型;大眼鳜、斑鳜和中国少鳞鳜3种鳜鱼群体内的遗传距离分别为0. 000 0、0. 008 7±0. 002 0和0. 002 0±0. 000 9,单倍型多样度和核苷酸多态性分别为0. 000 0、0. 859 9、0. 736 7和0. 000 0、0. 008 7、0. 002 0。分析表明,3种鳜鱼在终止序列区和保守序列区存在种或属间差异,锦江斑鳜是一个遗传变异大,多样性丰富的稳定种群;中国少鳞鳜虽然单倍型多样度丰富,但遭受过瓶颈效应,导致其核苷酸多样性偏低;大眼鳜遗传组成单一,多样性十分贫乏,推测可能有入侵的养殖群体。锦江系梵净山国家级自然保护区内最大的河流,历史上鳜类资源丰富,但已遭严重的破坏,加强其鳜类遗传资源的研究与保护十分必要。

中国浙江少鳞鳜属一新种(鲈形目,鮨科,鳜亚科)

根据采自浙江淳安的19尾标本鉴定描记了少鳞鳜属1新种，刘氏少鳞鳜Coreopercaliuisp．nov．。在一些形态性状上与属内已知种存在明显差异：以侧线鳞50以上（vs．50以下）和体高／体长（28．3％-31．9％vs．43．5％）区别于日本少鳞鳜C．kawamebari；以下鳃盖骨边缘有（vs．无）锯齿和臀鳍条10以上（vs．10以下）区别于朝鲜少鳞鳜eherzi；以体高／体长（28．3％-31．6％vs．33．5％-39．1％）和眼间距／体长（4．6％～5．6％Vs．6．6％-8．5％）区别于中国少鳞鳜ewhiteheadi。新种的分布区与属内其它已知种亦不同。