基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS鉴定棒状杆菌和类棒状菌群效能分析

目的通过与API Coryne法比较,分析基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定棒状杆菌和类棒状菌群的效能。方法收集分离自50例患者临床样本的129株棒状杆菌和类棒状菌群分离株,通过基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS进行棒状杆菌和类棒状菌群鉴定,并以截断分数(种水平≥1.7,属水平≥1.5,无鉴定结果<1.5)为标准进行菌种的二次鉴定,同时采用API Coryne法鉴定,并对菌株16S rRNA基因的前500 bp进行测序,确定各分离株的种类。结果129株菌株16S rRNA基因的测序结果显示:95株为棒状杆菌,来源于13个物种;34株为类棒状菌群,来源于15个属。MALDI-TOF MS进行菌种鉴定时,以截断分数为标准,100%的棒状杆菌可被鉴定到属水平,98.9%的棒状杆菌可被鉴定到种水平;94.1%的类棒状菌群可被鉴定到属水平,88.2%的类棒状菌群可被鉴定到种水平。而API Coryne法能够鉴定84.2%的棒状杆菌至种水平,61.8%的类棒状菌群至属水平。结论相较于API Coryne法,基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS在鉴定棒状杆菌和类棒状菌群时效能更佳。

牛源纹带棒状杆菌的分离鉴定及其耐药基因与agr管家基因的检测

首次于牛鼻拭子中分离得到1株优势菌株,经16S rRNA鉴定该菌为纹带棒状杆菌。动物回归试验、小鼠致病性试验结果显示,该菌具有一定的条件致病性。药敏试验与耐药基因检测结果显示,该菌四环素耐药基因与大环内酯类药物耐药基因均呈显性表达。PCR检测结果显示,该纹带棒状杆菌存在毒力相关基因——agr管家基因(accessory gene regulator)。