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Genomic surveillance of coxsackievirus A10 reveals genetic features and recent appearance of genogroup D in Shanghai,China,2016–2020 被引量:10
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作者 Jiayu Wang Jiajing Liu +8 位作者 Fanghao Fang Jiajin Wu Tianjiao Ji Yuying Yang Ling Liu Chongshan Li Wanju Zhang Xi Zhang Zheng Teng 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期177-186,共10页
Coxsackievirus A10(CVA10)is one of the major causative agents of hand,foot and mouth disease(HFMD).To investigate the epidemiological characteristics as well as genetic features of CVA10 currently circulating in Shang... Coxsackievirus A10(CVA10)is one of the major causative agents of hand,foot and mouth disease(HFMD).To investigate the epidemiological characteristics as well as genetic features of CVA10 currently circulating in Shanghai,China,we collected a total of 9,952 sporadic HFMD cases from January 2016 to December 2020.In the past five years,CVA10 was the fourth prevalent causatives associated with HFMD in Shanghai and the overall positive rate was 2.78%.The annual distribution experienced significant fluctuations over the past five years.In addition to entire VP1 sequencing,complete genome sequencing and recombination analysis of CVA10 isolates in Shanghai were further performed.A total of 64 near complete genomes and 11 entire VP1 sequences in this study combined with reference sequences publicly available were integrated into phylogenetic analysis.The CVA10sequences in this study mainly belonged to genogroup C and presented 91%-100%nucleotide identity with other Chinese isolates based on VP1 region.For the first time,our study reported the appearance of CVA10 genogroup D in Chinese mainland,which had led to large-scale outbreaks in Europe previously.The recombination analysis showed the recombination break point located between 5,100 nt and 6,700 nt,which suggesting intertypic recombination with CVA16 genogroup D.To conclusion,CVA10 genogroup C was the predominant genogroup in Shanghai during 2016-2020.CVA10 recombinant genogroup D was firstly reported in circulating in Chinese mainland.Continuous surveillance is needed to better understand the evolution relationships and transmission pathways of CVA10 to help to guide disease control and prevention. 展开更多
关键词 coxsackievirus a10(CVa10) Genogroup D Intertypic recombination Hand foot and mouth disease(HFMD)
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Pathogenic analysis of coxsackievirus A10 in rhesus macaques 被引量:1
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作者 Suqin Duan Fengmei Yang +14 位作者 Yanyan Li Yuan Zhao Li Shi Meng Qin Quan Liu Weihua Jin Junbin Wang Lixiong Chen Wei Zhang Yongjie Li Ying Zhang Jingjing Zhang Shaohui Ma Zhanlong He Qihan Li 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2022年第4期610-618,共9页
Coxsackievirus A10(CV-A10)is one of the etiological agents associated with hand,foot and mouth disease(HFMD)and also causes a variety of illnesses in humans,including pneumonia,and myocarditis.Different people,particu... Coxsackievirus A10(CV-A10)is one of the etiological agents associated with hand,foot and mouth disease(HFMD)and also causes a variety of illnesses in humans,including pneumonia,and myocarditis.Different people,particularly young children,may have different immunological responses to infection.Current CV-A10 infection animal models provide only a rudimentary understanding of the pathogenesis and effects of this virus.The characteristics of CV-A10 infection,replication,and shedding in humans remain unknown.In this study,rhesus macaques were infected by CV-A10 via respiratory or digestive route to mimic the HFMD in humans.The clinical symptoms,viral shedding,inflammatory response and pathologic changes were investigated in acute infection(1–11 day post infection)and recovery period(12–180 day post infection).All infected rhesus macaques during acute infection showed obvious viremia and clinical symptoms which were comparable to those observed in humans.Substantial inflammatory pathological damages were observed in multi-organs,including the lung,heart,liver,and kidney.During the acute period,all rhesus macaques displayed clinical signs,viral shedding,normalization of serum cytokines,and increased serum neutralizing antibodies,whereas inflammatory factors caused some animals to develop severe hyperglycemia during the recovery period.In addition,there were no significant differences between respiratory and digestive tract infected animals.Overall,all data presented suggest that the rhesus macaques provide the first non-human primate animal model for investigating CV-A10 pathophysiology and assessing the development of potential human therapies. 展开更多
关键词 coxsackievirus a10(cv-a10) HAND Foot and mouth disease(HFMD) Non-human primate model Rhesus macaque Pathogenic analysis
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The Establishment of Infectious Clone and Single Round Infectious Particles for Coxsackievirus A10 被引量:2
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作者 Min Wang Jingjing Yan +8 位作者 Liuyao Zhu Meng Wang Lizhen Liu Rui Yu Ming Chen Jingna Xun Yuling Zhang Zhigang Yi Shuye Zhang 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第4期426-435,共10页
Coxsackievirus A10(CVA10)is one of the major etiological agents of hand,foot,and mouth disease.There are no vaccine and antiviral drugs for controlling CVA10 infection.Reverse genetic tools for CVA10 will benefit its ... Coxsackievirus A10(CVA10)is one of the major etiological agents of hand,foot,and mouth disease.There are no vaccine and antiviral drugs for controlling CVA10 infection.Reverse genetic tools for CVA10 will benefit its mechanistic study and development of vaccines and antivirals.Here,two infectious clones for the prototype and a Myc-tagged CVA10 were constructed.Viable CVA10 viruses were harvested by transfecting the viral m RNA into human rhabdomyosarcoma(RD)cells.Rescued CVA10 was further confirmed by next generation sequencing and characterized experimentally.We also constructed the vectors for CVA10 subgenomic replicon with luciferase reporter and viral capsid with EGFP reporter,respectively.Co-transfection of the viral replicon RNA and capsid expresser in human embryonic kidney 293 T(HEK293 T)cells led to the production of single round infectious particles(SRIPs).Based on CVA10 replicon RNA,SRIPs with either the enterovirus A71(EVA71)capsid or the CVA10 capsid were generated.Infection by EVA71 SRIPs required SCARB2,while CVA10 SRIPs did not.Finally,we showed great improvement of the replicon activity and SRIPs production by insertion of a cis-active hammerhead ribozyme(HHRib)before the 50-untranslated region(UTR).In summary,reverse genetic tools for prototype strain of CVA10,including both the infectious clone and the SRIPs system,were successfully established.These tools will facilitate the basic and translational study of CVA10. 展开更多
关键词 coxsackievirus a10(CVa10) Reverse genetics ENTEROVIRUS Single round infectious particles(SRIPs) REPLICON
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柯萨奇病毒A组10型VP1的生物信息学分析
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作者 张高博 刘益文 +2 位作者 李子星 刘一洋 袁俊 《公共卫生与预防医学》 2023年第5期14-19,共6页
目的 柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CV-A10)是引发手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)的重要病原体之一,此研究运用生物信息学方法预测分析其病毒蛋白(viral protein, VP)中VP1的理化性质、结构特征以及抗原表位。... 目的 柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CV-A10)是引发手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)的重要病原体之一,此研究运用生物信息学方法预测分析其病毒蛋白(viral protein, VP)中VP1的理化性质、结构特征以及抗原表位。方法 通过ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、PDBsum、ProSA-web预测分析CV-A10 VP1的理化性质和结构特征。应用DNAstar、ABCpred、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTope-2.0、NetMHCpan-4.1、NetMHCIIpan-4.0、Consurf、VaxiJen v.2.0、AllerTOP v.2.0、ToxinPred2、IEDB immunogenicity预测分析CV-A10 VP1的抗原表位。结果 CV-A10 VP1为碱性、不稳定的亲水性蛋白,其二级结构以无规则卷曲为主。该蛋白还存在多个潜在B、T细胞抗原表位以及基于潜在表位之上的优势抗原表位。结论 CV-A10 VP1蛋白有多处可诱导特异性体液免疫和细胞免疫的潜在位点,研究为其实验鉴定、分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组10型(cv-a10) 病毒蛋白1(VP1) 生物信息学 抗原表位
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广东省2018年手足口病病原谱及柯萨奇病毒A10型基因特征分析 被引量:9
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作者 曾汉日 郑焕英 +5 位作者 刘冷 杨芬 陆靖 李彩霞 方苓 李晖 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1028-1036,共9页
广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测数据显示,2018年5~7月非肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)、非柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和非柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的其他肠道病毒... 广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测数据显示,2018年5~7月非肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)、非柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和非柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的其他肠道病毒(以下简称"其他EV")阳性率大幅度增高,经鉴定60%为柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)。因此,为了解广东省2018年HFMD病原谱及CV-A10的基因特征,本研究收集2018年哨点监测数据进行统计分析,采集HFMD其他EV标本进行分型鉴定,并随机选取2008~2018年CV-A10阳性标本开展VP1全长序列测序与分析。结果显示,广东省2018年HFMD病原谱包括24种肠道病毒,阳性率位于前三位的分别是CV-A16(30.73%)、CV-A6(24.29%)和CV-A10(≈11.0%)。CV-A10主要流行于5~7月份,且在各市广泛流行,所致HFMD重症率低于EV-A71,却高于CV-A16和CV-A6。遗传进化分析发现,CVA10可分为A、B、C、D、E、F、G 7个基因型,C基因型包括C0、C1和C23个亚型。广东省211株CV-A10中,2株为B基因型,2株为C1亚型,207株为C2亚型。207株C2亚型包括3个基因群,其中C2a基因群16株,流行于2008~2012年;C2b基因群36株,流行于2010~2014年和2016年;C2c基因群155株,流行于2011~2018年。根据以上结果表明,广东省2018年HFMD病原以柯萨奇A组肠道病毒为主,其中CV-A10是引起5~7月份手足口病暴发优势病原之一。基于VP1基因分析,CV-A10可分为A、B、C、D、E、F和G等7个基因型。广东省存在B和C基因型,其中C基因型的C2c基因群是优势流行株。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 病原谱 柯萨奇病毒a10型(cv-a10) 基因型
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上海市普陀区2013年手足口病病原学监测结果分析 被引量:21
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作者 李晓君 李芳 唐海丰 《海南医学》 CAS 2015年第5期755-757,共3页
目的了解2013年上海市普陀区手足口病的病原学特点,为手足口病的防控提供实验室依据。方法采用实时荧光定量PCR对366例疑似手足口病患者的咽拭子、疱疹液和肛拭子进行肠道病毒通用核酸(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16... 目的了解2013年上海市普陀区手足口病的病原学特点,为手足口病的防控提供实验室依据。方法采用实时荧光定量PCR对366例疑似手足口病患者的咽拭子、疱疹液和肛拭子进行肠道病毒通用核酸(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)、柯萨奇病毒A组10型(CA10)和柯萨奇病毒A组6型(CA6)基因检测。结果引起手足口病的肠道病毒主要为柯萨奇病毒A组6型(CA6)和肠道病毒71型(EV71),366例手足口病者中肠道病毒通用核酸阳性者273例(74.59%),柯萨奇病毒A组6型(CA6)阳性者169例(46.17%),肠道病毒71型(EV71)阳性者58例(15.85%),柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)阳性者18例(4.92%),柯萨奇病毒A组10型(CA10)阳性者8例(2.19%)。结论 2013年上海市普陀区手足口病者的病原学特点以CA6为主,占46.17%;EV71次之,占15.85%。提示上海市普陀区手足口病病原体组成复杂,应深入分析CA6的流行趋势,加强手足口病病原谱监测,为手足口病防治提供实验室依据。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组6型 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组10 柯萨奇病毒A组16型
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2014年陕西省柯萨奇病毒A10型相关手足口病的流行特征和其VP1区基因特征研究 被引量:4
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作者 徐艺 郑媛 +5 位作者 关路媛 余鹏博 马萍 张蕾 许晶 徐纪茹 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期90-95,共6页
了解陕西省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的致病病原体柯萨奇病毒A10型(CV-A10)的流行特征及VP1区基因特征。对2014年收集的HFMD病例标本,通过荧光定量PCR检测确定肠道病毒型别,对CV-A10引起的HFMD流行特征进行描述性分... 了解陕西省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的致病病原体柯萨奇病毒A10型(CV-A10)的流行特征及VP1区基因特征。对2014年收集的HFMD病例标本,通过荧光定量PCR检测确定肠道病毒型别,对CV-A10引起的HFMD流行特征进行描述性分析。使用RD细胞进行病毒分离,RT-PCR扩增CV-A10的VP1区基因片段并进行序列测定,使用Meg Align软件进行核苷酸及氨基酸的同源性分析,并使用MEGA5.0软件构建系统进化树。2014年CV-A10是陕西HFMD病原谱中的第三大病原,占其他肠道病毒的57.71%,13例重症HFMD病例的致病病原体鉴定为CV-A10,占重症病例的9.03%。CV-A10感染HFMD病例以≤3岁年龄组儿童为主(83.07%),男女性别比为1.15∶1。发病时间主要集中在4~7月。实验室分离出101株CV-A10,覆盖全省10市(区)。完成测序的18株CV-A10核苷酸和氨基酸同源性分别为94.0%~100.0%和97.3%~100.0%,与A型原型株的核苷酸和氨基酸同源性分别为76.2%~77.5%和91.9%~93.0%,与近年来河北、湖南和河南地区流行株具有较高的同源性。系统进化显示陕西CV-A10分离株属于C基因型。CV-A10是2014年陕西HFMD的优势病原,能引起重症HFMD,本次分离到的CV-A10毒株均属于C基因型。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒a10型(cv-a10) 流行特征 基因特征
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白细胞介素10-1082位点基因多态性与手足口病合并脑炎易感性研究 被引量:3
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作者 何俊峰 山峰 +2 位作者 赵娜 张萍 陈宗波 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2011年第8期578-581,共4页
目的研究白细胞介素(IL)-10-1082位点单核苷酸多态性(SNP)及表达水平与手足口病(HFMD)合并脑炎易感性的关系。方法对2009年5月至8月青岛大学医学院附属医院临床诊断为HFMD的患儿178例进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇A组16... 目的研究白细胞介素(IL)-10-1082位点单核苷酸多态性(SNP)及表达水平与手足口病(HFMD)合并脑炎易感性的关系。方法对2009年5月至8月青岛大学医学院附属医院临床诊断为HFMD的患儿178例进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇A组16型(CA16)检测。采用酶联免疫吸附(ELISA)法测定各组血中IL-10水平。通过顺序特异引物聚合酶链反应(PCR-SSP)方法检测各组IL-10-1082G/A位点多态性,进行统计学分析。对照组为本地区同时期儿外科手术患儿,无感染症状。结果 (1)178例患儿中检出EV1共62例,EV71共82例,CA16共67例。(2)EV71和CA16组IL-10均显著低于对照组。(3)EV71和CA16组分别与对照组比较,IL-10-1082基因型频率分布差异均有统计学意义,EV71组A等位基因频率显著高于对照组,而CA16组与对照组的频率分布差异无统计学意义;HFMD组和重症HFMD组基因型频率分布差异有统计学意义,重症HFMD组等位基因A频率较高。结论 HFMD患儿机体存在免疫紊乱,IL-10-1082位点基因多态性与HFMD有关,IL-10-1082位点A等位基因是HFMD并发脑炎的遗传易感因素。 展开更多
关键词 肠道病毒71 柯萨奇A组16型 白细胞介素-10 单核苷酸多态性
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新诊断2型糖尿病与柯萨奇病毒、巨细胞病毒感染及白介素-18、干扰素-γ、干扰素-γ诱导蛋白-10的相关性 被引量:2
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作者 何珂 胡蕴 毛晓明 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1106-1108,共3页
目的探讨新诊断T2DM与柯萨奇病毒(COX)、巨细胞病毒(CMV)、单纯疱疹病毒(HSV)及EB病毒(EBV)感染的关系,分析T2DM病毒感染患者血清IL-18、干扰素-γ(IFN-γ)及IFN-γ诱导蛋白-10(IP-10)的水平及意义。方法选取新诊断T2DM患者(T2DM组)208... 目的探讨新诊断T2DM与柯萨奇病毒(COX)、巨细胞病毒(CMV)、单纯疱疹病毒(HSV)及EB病毒(EBV)感染的关系,分析T2DM病毒感染患者血清IL-18、干扰素-γ(IFN-γ)及IFN-γ诱导蛋白-10(IP-10)的水平及意义。方法选取新诊断T2DM患者(T2DM组)208例和健康对照(NC组)者240名,检测血清COX、CMV、HSV、EBV IgG抗体阳性率和炎症因子IL-18、IFN-γ及IP-10水平,比较两组病毒抗体阳性率与炎症因子水平的差异,分析T2DM病毒感染与炎症因子的关系。结果 T2DM组COX、CMV抗体阳性率高于NC组(19.23%vs 0.83%,94.71%vs 83.33%,P<0.01),两组HSV和EBV抗体均为阴性。T2DM组IL-18、IFN-γ及IP-10水平均高于NC组[IL-18:(130.30±118.44)vs(41.69±40.39)pg/ml;IFN-γ:(103.93±110.10)vs(34.50±24.89)pg/ml;IP-10:(2215.50±3395.47)vs(234.55±64.40)pg/ml,P<0.05或P<0.01]。T2DM COX感染者IL-18高于无COX感染者[(142.84±150.63)vs(122.04±92.59)pg/ml,P<0.05]。结论 COX感染与新诊断T2DM的发生发展存在一定的相关性,可能与IL-18等的作用有关。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 柯萨奇病毒 巨细胞病毒 白介素-18 干扰素-Γ 干扰素-γ诱导蛋白-10
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柯萨奇病毒A10型VP1蛋白生物信息学分析 被引量:1
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作者 任倩 王世富 +3 位作者 李春苗 吴丹 李扬 张乐海 《国际病毒学杂志》 2016年第6期387-392,共6页
目的 对手足口病柯萨奇病毒A10型(CVA10) VP1蛋白进行生物信息学分析.方法 利用生物信息学软件对分离的毒株与CVA10其他基因型进行同源性比对,并构建系统进化树;预测和分析VP1蛋白的理化特性、二级结构和三级结构以及该蛋白的B细胞抗... 目的 对手足口病柯萨奇病毒A10型(CVA10) VP1蛋白进行生物信息学分析.方法 利用生物信息学软件对分离的毒株与CVA10其他基因型进行同源性比对,并构建系统进化树;预测和分析VP1蛋白的理化特性、二级结构和三级结构以及该蛋白的B细胞抗原表位.结果 JN-C10与CVA10 D型基因组同源性最高,核苷酸和氨基酸的同源性分别为91.0%-97.6%和90.4%-98.6%,属于D亚型.JN-C10 VP1基因全长为732个核苷酸,理论相对分子质量为60 580道尔顿,理论等电点为5.10,其二级结构中以无规则卷曲为主,属于胞外蛋白.以已知结构的蛋白质3vbhA为模板,构建JN-C10株VP1蛋白三级结构模型.综合多种抗原表位分析方法得出,JN-C10株VP1蛋白的B细胞抗原表位可能是13-22、101-108、120-127、169-180、213-230 5个区段等区域.结论 JN-C10毒株VP1蛋白多个可能B细胞抗原表位的预测,将为CVA10有效免疫疫苗的制备、特异性诊断系统的发展提供重要的参考依据. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a10 VP1蛋白 二级结构 三级结构 B细胞抗原表位 coxsackievirus a10 VP1
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七味白术散对相关肠道病原体感染HT-29细胞IP-10表达的影响 被引量:1
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作者 湛蓝 伍参荣 +6 位作者 谭晓凤 刘卫东 孙必强 周英 蔡锐 李杰 李珊 《湖南中医杂志》 2014年第8期152-154,共3页
目的:观察七味白术散对轮状病毒(HRV)、柯萨奇B3病毒(Cox B3)感染HT-29细胞干扰素诱导蛋白-10(IP-10)表达的影响。方法:将HT-29细胞株分别随机设成正常组、模型组、七味白术散组、病毒唑组,于37℃、5%CO2条件下培养48h,收获培养物。采用... 目的:观察七味白术散对轮状病毒(HRV)、柯萨奇B3病毒(Cox B3)感染HT-29细胞干扰素诱导蛋白-10(IP-10)表达的影响。方法:将HT-29细胞株分别随机设成正常组、模型组、七味白术散组、病毒唑组,于37℃、5%CO2条件下培养48h,收获培养物。采用RT-PCR技术测定IP-10mRNA的表达情况。结果:两种肠道病原体感染HT-29细胞后,与正常组比较,模型组IP-10mRNA的表达明显升高(P<0.05);与模型组比较,七味白术散组和病毒唑组的IP-10mRNA表达明显降低(P<0.05);七味白术散组表达值低于病毒唑组(P<0.05)。结论:七味白术散能下调HRV、COX B3感染HT-29细胞的IP-10的表达。 展开更多
关键词 七味白术散 人轮状病毒 柯萨奇B3病毒 IP-10
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Kruppel-like factor 10 protects against acute viral myocarditis by negatively regulating cardiac MCP-1 expression 被引量:4
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作者 Jie Yang Hongkai Zhang +10 位作者 Xuelian Wang Jing Guo Lin Wei Yahui Song Yuan Luo YinXia Zhao Malayannan Subramaniam Thomas C.Spelsberg Lie Wang Wei Xu Min Li 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2021年第9期2236-2248,共13页
Viral myocarditis(VMC)is a cardiac disease associated with myocardial inflammation and injury induced by virus infection.Cardiomyocytes have recently been regarded as key players in eliciting and modulating inflammati... Viral myocarditis(VMC)is a cardiac disease associated with myocardial inflammation and injury induced by virus infection.Cardiomyocytes have recently been regarded as key players in eliciting and modulating inflammation within the myocardium.Kruppel-like factor 10(KLF10)is a crucial regulator of various pathological processes and plays different roles in a variety of diseases.However,its role in VMC induced by coxsackievirus B3(CVB3)infection remains unknown.In this study,we report that cardiac KLF10 confers enhanced protection against viral myocarditis.We found that KLF10 expression was downregulated upon CVB3 infection.KLF10 deficiency enhanced cardiac viral replication and aggravated VMC progress.Bone marrow chimera experiments indicated that KLF10 expression in nonhematopoietic cells was involved in the pathogenesis of VMC.We further identified MCP-1 as a novel target of KLF10 in cardiomyocytes,and KLF10 cooperated with histone deacetylase 1(HDAC1)to negatively regulate MCP-1 expression by binding its promoter,leading to activation of MCP-1 transcription and recruitment of Ly6C^(high) monocytes/macrophages into the myocardium.This novel mechanism of MCP-1 regulation by KLF10 might provide new insights into the pathogenesis of VMC and a potential therapeutic target for VMC. 展开更多
关键词 Kruppel-like factor 10 coxsackievirus B MYOCARDITIS INFLAMMATION MCP-1
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柯萨奇病毒A组10型构象表位的生物信息学预测 被引量:2
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作者 戎浩 王丽萍 +1 位作者 高柳莺 董长征 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期762-769,共8页
近年来,柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)逐渐成为手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一。相比肠道病毒A组71型(Enterovirus 71,EV-A71),CV-A10尚未有上市的疫苗,其构象表位也缺乏系统性研究。... 近年来,柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)逐渐成为手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一。相比肠道病毒A组71型(Enterovirus 71,EV-A71),CV-A10尚未有上市的疫苗,其构象表位也缺乏系统性研究。本研究利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对CV-A10的构象表位进行系统性预测。结果显示:45个氨基酸残基聚集成三簇构象表位:site 1、site 2和site 3。site 1位于病毒衣壳表面峡谷的北侧,site 2和site 3位于峡谷南侧,三者呈现"品"字形分布。site 2和site 3与已报道的两个表位2G8和VP2-P28高度重叠,说明预测结果具有较高准确性。鼻病毒B种14型(Rhinovirus B14,RV-B14)、脊髓灰质炎病毒1型(Poliovirus type 1,PV1)和CV-A10同属于人肠道病毒。已有研究表明,RVB14和PV1的抗原表位也呈三簇分布,且每一簇都与CV-A10的预测结果高度重叠。这既说明了预测结果的准确性,同时也提示三簇构象表位的分布模式可能是人肠道病毒构象表位的基本分布规律。CV-A10构象表位的预测结果,为构象表位的实验鉴定、病毒的分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组10型(cv-a10) 构象表位 生物信息学预测 手足口病(HFMD)
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不同病原体感染手足口病患儿炎性因子变化与病情转归临床分析 被引量:4
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作者 李传生 应杰 《徐州医学院学报》 CAS 2015年第12期890-892,共3页
目的:通过分析不同病原体感染手足口病患儿病程中免疫功能改变及临床转归,探讨手足口病的临床治疗经验。方法回顾性分析1039例手足口病患儿的临床资料,根据病原体检测分为EV71阳性组(179例)、CoxA阳性组(121例)、EV71及CoxA均阳... 目的:通过分析不同病原体感染手足口病患儿病程中免疫功能改变及临床转归,探讨手足口病的临床治疗经验。方法回顾性分析1039例手足口病患儿的临床资料,根据病原体检测分为EV71阳性组(179例)、CoxA阳性组(121例)、EV71及CoxA均阳性组(38例)、EV71及CoxA均阴性组(701例)。对各组临床症状、体征等的恢复时间及血清IL-6、IL-10水平进行比较。结果 EV71阳性组、CoxA阳性组、EV71及CoxA均阳性组患儿皮疹消退时间、体温恢复正常时间和进食好转时间均较EV71及CoxA均阴性组明显延长(P<0.01)。 EV71及CoxA均阳性组患儿血清IL-6、IL-10水平明显高于EV71阳性组、CoxA阳性组、EV71及CoxA均阴性组( P<0.01)。结论手足口病病原体阳性患儿皮疹消退时间、体温恢复正常时间和进食好转时间均明显延长,炎性因子水平升高明显,且EV71及CoxA均阳性患儿重症倾向明显增高。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71 柯萨奇病毒A组16 型病毒 白细胞介素-6 白细胞介素-10
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2009-2019年上海市徐汇区HFMD流行病学特征分析 被引量:3
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作者 段蓉 周毅彬 +5 位作者 朱奕奕 陈远方 刘景壹 周祺 石敏 汪澜 《职业与健康》 CAS 2021年第14期1910-1915,共6页
目的了解上海市徐汇区手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)病原学及其流行特征,为其防控提供参考依据。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对2009—2019年上海市徐汇区采集的上海市徐汇区HFMD病例... 目的了解上海市徐汇区手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)病原学及其流行特征,为其防控提供参考依据。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对2009—2019年上海市徐汇区采集的上海市徐汇区HFMD病例标本进行肠道病毒检测,并对病原学检测数据进行整理分析。结果 2009—2019年上海市徐汇区共报告现住址在上海市徐汇区HFMD普通病例10 909例,年均报告发病率为84.79/10万(31.32/10万~135.53/10万),累计报告重症病例47例,重症率为0.43%。2009—2012年报告普通病例发病率呈现升高趋势,2013年始,发病率呈现隔年高发。HFMD发病呈现双峰模式,全年发病有2个高峰:4—7月(春夏高峰)占52.38%和9—11月(秋冬高峰)占26.17%,男性发病率(127.60/10万)高于女性发病率(83.58/10万)。实验室检测病例共1 239例,阳性标本1 029例(占83.05%)。其中,柯萨奇病毒A组6型(CA6)为29.78%、肠道病毒71型(EV71)为21.55%、柯萨奇病毒A组16型(CA16型)为21.23%和其他肠道病毒为10.09%、柯萨奇病毒A组10型(CA10)为0.32%、EV71/CA16混合感染0.08%。上海市徐汇区全年均有HFMD病例报告,发病高峰期为每年3—11月。每年HFMD病毒的型别特征各不相同。病毒核酸检测阳性病例以<18岁青少儿童为主(99.19%),男性病例阳性检出率(83.24%)略高于女性(82.75%),差异无统计学意义(χ^(2)=0.051,P>0.05)。47例重症患者标本中,重症病例EV71型阳性率为16.10%,CA16型为0.38%和其他类型EV为0.80%。结论 2009—2019年上海市徐汇区HFMD病原谱以CA6型为主,除了EV71和CA16型,还有其他新型肠道病毒,且近年占比呈上升趋势,应予以重视和加强监测。 展开更多
关键词 手足口病 其他肠道病毒 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组16型 柯萨奇病毒A组10
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2011年龙岩市手足口病例肠道病毒通用引物核酸阳性未分型样本病原分析 被引量:3
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作者 王炳发 曹春远 +3 位作者 何云 陈前进 张彦锋 李美华 《预防医学论坛》 2014年第6期407-408,412,共3页
目的了解龙岩市大量判定为其他肠道病毒(EV)感染的手足口病(HFMD)样本的病原组成。方法对龙岩市2011年经Real-time RT-PCR检测判为未分型EV感染的104份HFMD咽拭子样本经RD细胞分离培养后以RT-PCR法检测EV、EV71、CoxA16,对仍不能分型的... 目的了解龙岩市大量判定为其他肠道病毒(EV)感染的手足口病(HFMD)样本的病原组成。方法对龙岩市2011年经Real-time RT-PCR检测判为未分型EV感染的104份HFMD咽拭子样本经RD细胞分离培养后以RT-PCR法检测EV、EV71、CoxA16,对仍不能分型的样本以187/222引物进行扩增,对扩增产物进行纯化回收、克隆、测序,并用Blast程序在线比对判定型别。同时对培养物进行Real-time RT-PCR检测EV、EV71、CoxA16。任一法检出培养物阳性即判为阳性。结果 104份样本中检出EV阳性88份(84.62%),包括29份EV71,4份EV71+CoxA16,3份CoxB5,2份CoxA10,50份仍未能分型。结论 Real-time RT-PCR检测未能分型的HFMD病例中,相当部分(37.18%)还是由EV71所致,临床不应该随意排除该类病例EV71感染的可能,同时还包含CoxB5和CoxA10病毒。 展开更多
关键词 手足口病 其他肠道病毒 柯萨奇病毒B5型 柯萨奇病毒A 10
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2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型 被引量:10
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作者 肖金波 于秋丽 +10 位作者 张勇 宋洋 张曼 路环环 韩振志 刘莹莹 冀天娇 严冬梅 祝双利 许文波 李琦 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期192-200,共9页
肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手... 肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨基酸相似度为92.7%~99.7%,两株CV-A10与其余中国CVA10序列的3D区的核苷酸相似度为93.2%~97.1%,氨基酸相似度为97.4%~99.7%。本研究揭示,引起河北重症HFMD的CV-A6和CV-A10均是中国目前流行的优势基因型,与中国流行株相比,并未发生新的重组事件。CVA6和CV-A10在引起河北重症HFMD的病原谱中所占比例逐渐增高,CV-A6超过EV-A71,已成为引起HFMD重症病例的优势型别,提示应该加强对CV-A6和CV-A10的监测,积极研制这两种病毒的疫苗,这将有助于进一步减少重症HFMD病例数,并减轻重症HFMD疾病负担。 展开更多
关键词 重症手足口病(HFMD) 高通量测序(HTS) 病原谱 柯萨奇病毒A组6型(cv-a6) 柯萨奇病毒A组10型(cv-a10)
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长沙市2013—2016年HFMD重症病例肠道病毒谱及其基因特征 被引量:8
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作者 杨人贵 孙边成 +3 位作者 欧新华 黄政 李灵之 陈静芳 《中国热带医学》 CAS 2018年第2期121-124,共4页
目的了解2013年至2016年长沙市手足口重症病例感染柯萨奇病毒A组6型(CAV 6)和柯萨奇病毒A组10型(CAV 10)肠道病毒的流行趋势,并对其VP1基因进化概况进行分析。方法运用描述性统计学分析方法对全市重症手足口病流行病学资料进行整理。CA... 目的了解2013年至2016年长沙市手足口重症病例感染柯萨奇病毒A组6型(CAV 6)和柯萨奇病毒A组10型(CAV 10)肠道病毒的流行趋势,并对其VP1基因进化概况进行分析。方法运用描述性统计学分析方法对全市重症手足口病流行病学资料进行整理。CAV 6和CAV 10型肠道病毒阳性咽拭子、肛拭子或粪便标本用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP1基因片段,序列比对后用MEGA软件构建进化树。结果 2013—2016年全市共检测111份重症手足口病例标本,肠道病毒阳性标本80份,检出率为72.07%。80份肠道病毒阳性标本中,CAV 6型10株,CAV 10型8株。核苷酸序列的同源性分析发现,CAV 6型肠道病毒核苷酸序列之间存在0.8%~6.6%的差异。CAV 10型肠道病毒核苷酸序列之间存在1.1%~5.6%的变化差异。8株CAV 6型毒株均位于D2分支,1株处于D1分支。6株CAV 10型毒株位于E分支。结论 CAV 6和CAV 10肠道病毒在基因水平并未发生明显突变。重症病例中出现CAV 6型和CAV 10型感染高峰年份,但2016年有所降低,应将CAV 6和CAV 10型肠道病毒纳入常规监测,降低手足口发病风险。 展开更多
关键词 重症手足口病 柯萨奇病毒 进化树分析 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组10
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手足口病主要病原变迁及分子进化研究 被引量:14
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作者 韦欢欢 朱俊萍 何秋水 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期936-945,共10页
手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一种由多种肠道病毒引起的,以儿童急性感染为主的全球性传染病。引起该病的病原谱及优势流行毒株在世界范围内随时间推移而不断变化,情况日趋复杂。病原的不断进化在病原谱的变迁以及相关... 手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一种由多种肠道病毒引起的,以儿童急性感染为主的全球性传染病。引起该病的病原谱及优势流行毒株在世界范围内随时间推移而不断变化,情况日趋复杂。病原的不断进化在病原谱的变迁以及相关疾病的暴发流行中发挥重要作用。本文结合历年来欧美、东南亚及中国大陆HFMD重大疫情中的病原谱变化以及各主要病原的分子进化研究进行综述,为HFMD的持续有效防控及相关策略制定提供依据。 展开更多
关键词 手足口病(HFMD) 病原谱 分子进化 EV-A71 cv-a16 cv-a6 cv-a10
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柯萨奇病毒A组6型构象表位的生物信息学预测 被引量:5
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作者 王丽萍 戎浩 +2 位作者 方雨露 陈琴 董长征 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1075-1084,共10页
柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)近年成为手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一。本实验室在之前的研究中发展了人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,并成功应用于柯萨奇病毒A组10型(Coxsackie... 柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)近年成为手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一。本实验室在之前的研究中发展了人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,并成功应用于柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)构象表位的预测,发现CV-A10的构象表位在病毒衣壳表面呈现site 1、site 2和site 3三簇分布。本研究中,应用相同算法对CV-A6的构象表位进行系统性预测,并将CV-A6和CV-A10这两种手足口病的病原体的构象表位进行对比。结果显示:CV-A6(A颗粒)和CV-A10(A颗粒)的构象表位具有高度一致的site 1、site 2和site 3三簇分布模式,而且这种分布一致性超过了CV-A10两种颗粒状态(A颗粒和成熟颗粒)的一致性,说明衣壳结构和颗粒状态对于构象表位非常重要。虽然CV-A6(A颗粒)和CV-A10(A颗粒)具有高度一致的构象表位分布模式,但在共享的58个氨基酸残基位点中,仅有21个(36.2%)残基保守,而且绝大多数构象表位都有3个以上残基差异,提示构象表位残基上的差异造成了CV-A6和CV-A10的血清型差异。CV-A6构象表位的预测结果,为其构象表位的实验鉴定、分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组6型(cv-a6) 柯萨奇病毒A组10型(cv-a10) 构象表位 抗原表位 生物信息学预测 手足口病(HFMD)
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