一起由柯萨奇病毒A组引起的呼吸道感染疫情病原分子特征分析

目的分析2018年11月深圳市大鹏新区某小学1起呼吸道感染疫情的病原学及分子遗传学特征。方法采用实时荧光RT-PCR对采集的患儿咽拭子标本进行常见呼吸道病毒及肠道病毒的检测,对肠道病毒阳性样本进一步分型鉴定。通过RT-PCR扩增、测序并获得VP1基因序列,运用MEGA 7.0软件分析VP1的分子特征,构建遗传进化树。结果采集的11份样本全部是常见呼吸道病毒阴性,其中5份为柯萨奇病毒A组(简称CVA4)阳性。VP1区基因序列分析表明:本次疫情毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%,100.0%。系统进化树结果显示,5株毒株亲缘关系最近,应来自于同一亲缘株;与国内分离株位于同一分支,而且与2017年山东、2016年广东和宁夏的分离株亲缘关系较近;5株毒株与国外的CVA4毒株位于不同的分支,亲缘关系较远,其中包括来自美国的CVA4原型株AY421762,但未见特异性的氨基酸差异位点。结论本起呼吸道感染暴发疫情由CVA4毒株引起,肠道病毒引起的呼吸道系统疾病应受到足够重视。