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H1N1流感病毒聚合酶片段的CpG抑制及其对密码子偏爱性的影响 被引量:1
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作者 巩校东 樊少华 +1 位作者 张萃 李晓明 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期537-544,共8页
H1N1流感病毒的聚合酶具有RNA复制、转录等功能,并且对流感病毒片段包装、子代繁殖及宿主适应性等有着重要作用。通过分析人、猪及禽类H1N1流感病毒聚合酶片段的二核苷酸频率及同义密码子的偏爱性,发现不同宿主中,流感病毒聚合酶片段的... H1N1流感病毒的聚合酶具有RNA复制、转录等功能,并且对流感病毒片段包装、子代繁殖及宿主适应性等有着重要作用。通过分析人、猪及禽类H1N1流感病毒聚合酶片段的二核苷酸频率及同义密码子的偏爱性,发现不同宿主中,流感病毒聚合酶片段的CpG频率最低,且均被强烈抑制;通过三类宿主间的比较发现,人流感病毒抑制最为强烈,且其CpG频率随年份呈下降趋势,但2009年毒株的CpG频率突然上升。比较同义密码子使用频率发现,含有CpG的同义密码子相对使用频率均小于1,证明CpG抑制作用是影响同义密码子偏爱性的一个重要因素。以上结果暗示,CpG抑制对H1N1流感病毒的进化及跨宿主传播可能有重要影响。 展开更多
关键词 H1N1 cpg抑制 同义密码子偏爱性 聚合酶
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DNA CpG特征结构免疫学研究进展 被引量:6
2
作者 史霖 范桂香 袁育康 《国外医学(免疫学分册)》 1999年第5期279-281,共3页
随着对DNA免疫学特性的深入了解,人们对CpG特征结构在DNA免疫学中的重要作用有了初步的认识,本文就CpG特征结构的特点、免疫学活性及应用前景作一综述。
关键词 cpg特征结构 cpg抑制 DNA 免疫学
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拮抗细菌DNA的CpG-N ODN筛选 被引量:2
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作者 王良喜 鲁永玲 +2 位作者 丁国富 罗平 周红 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期53-56,共4页
目的在抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)分子设计的基础上,选择部分序列加以合成并对其生物学活性进行鉴定,筛选出能够拮抗细菌DNA的CpG-NODN。方法对合成的10条CpGODN进行生物学活性的初筛和复筛,观察其自身的刺激性及其对CpG-SODN诱导的T... 目的在抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)分子设计的基础上,选择部分序列加以合成并对其生物学活性进行鉴定,筛选出能够拮抗细菌DNA的CpG-NODN。方法对合成的10条CpGODN进行生物学活性的初筛和复筛,观察其自身的刺激性及其对CpG-SODN诱导的TNF-α释放的抑制作用。使用RNAstructureversion3.71预测CpGODN的二级结构及自由能,根据10条CpGODN构效关系分析结果,对CpG-NODN分子进行再设计,并从中选择11个序列进行生物活性的筛选。结果首次合成的10条CpGODN仅1条是对细菌DNA拮抗作用较弱的CpG-NODN。通过对其构效关系进行分析,推测CpGODN的生物活性可能与自由能相关。在此基础上对CpG-NODN分子进行了再设计,合成的11条CpGODN中有5条是拮抗作用较强的CpG-NODN。结论获得了6条CpG-NODN。CpGODN的生物活性可能与自由能密切相关。 展开更多
关键词 DNA 细菌 脓毒症 cpg基序 抑制cpg寡核苷酸 分子设计
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2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究 被引量:1
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作者 王良喜 丁国富 +2 位作者 鲁永玲 罗平 周红 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1095-1098,共4页
目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序... 目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12DNA和ECDNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN)。结果确定了19种Adv2、5DNA特征性的CpG基序,Adv2、5DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5DNA的CpG-NODN。 展开更多
关键词 DNA 细菌 DNA 腺病毒 cpg基序 抑制cpg寡核苷酸 计算生物学
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面向蛇形机器人的三维步态控制的层次化联结中枢模式生成器模型 被引量:7
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作者 杨贵志 马书根 +1 位作者 李斌 王明辉 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2013年第10期1611-1622,共12页
提高蛇形机器人的三维运动控制能力是提高蛇形机器人环境适应能力的关键之一.虽然联结中枢模式生成器(Connectionist central pattern generator,CCPG)模型具有复杂度小、适合硬件实现等优点,但是目前的CCPG模型难以生成相位协调的多自... 提高蛇形机器人的三维运动控制能力是提高蛇形机器人环境适应能力的关键之一.虽然联结中枢模式生成器(Connectionist central pattern generator,CCPG)模型具有复杂度小、适合硬件实现等优点,但是目前的CCPG模型难以生成相位协调的多自由度运动的控制信号,从而限制了它的三维步态控制能力.本文根据生物CPG机制的分层结构和运动神经元的功能,提出一个有层次化结构的CCPG(Hierarchical CCPG,HCCPG)模型.HCCPG模型由基本节律信号生成层、模式形成层、运动信号调整层这三个部分组成.运动信号调整层的运动神经元能够独立地对模式形成层的输出信号的幅值、相位等进行调整,从而较好地解决了CCPG模型难以生成相位协调的多自由度运动控制信号的问题.HCCPG模型具有步态控制能力强、复杂度小、有良好的扩展性等优点,从而适合用于控制三维步态.在HCCPG模型的基础上提出一个三维步态控制方法.仿真验证了这个控制方法的有效性. 展开更多
关键词 蛇形机器人 联结中枢模式生成器模型 运动神经元 循环抑制cpg模型 三维步态
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miR-29b upregulates miR-195 by targeting DNMT3B in tongue squamous cell carcinoma 被引量:2
6
作者 Ling-Fei Jia Yun-Fei Zheng +2 位作者 Ming-Yue Lyu Yi-Ping Huang Ye-Hua Gan 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2016年第3期212-219,共8页
MicroRNAs play important roles in the devel- opment and progression of various cancers, including tongue squamous cell carcinoma (TSCC). miR-29b and miR-195 have been reported to be tumor suppressors in TSCC. Here, ... MicroRNAs play important roles in the devel- opment and progression of various cancers, including tongue squamous cell carcinoma (TSCC). miR-29b and miR-195 have been reported to be tumor suppressors in TSCC. Here, we investigated the expression of miR-29b and miR- 195 and their relationship in TSCC. Our data showed that miR-29b and miR-195 were significantly downregulated in TSCC com- pared with their matched nonmalignant tissues in 60 paired samples. The level of miR-29b was positively correlated with that of miR-195 in TSCC and the matched nonmalignant tissues. Moreover, miR-29b overexpression induced the demethylation of CpG islands upstream of miR-195 via targeting DNMT3B, leading to the upregulation of miR-195 in TSCC cell lines. Following DNMT3B silencing, the expression of miR-195 was increased and the methylation of CpG islands upstream of miR-195 was reduced. Although overexpression of miR-29b alone significantly increased miR- 195 expression, co-transfection of miR-29b with DNMT3B resulted in no change in miR-195 expression. Taken together, our results demonstrated that miR-29b could upregulate miR- 195 by directly targeting DNMT3B in TSCC. The interaction between miR-29b and miR-195 might provide new insights in developing novel therapeutic approaches of TSCC. 展开更多
关键词 MIRNA miR-29b miR-195 DNMT3B Tongue squamous cell carcinoma
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