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藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析
被引量:
2
1
作者
田晓芹
褚晶
+4 位作者
丁洪霞
杨博
陈方军
郭善利
陈世华
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
CAS
2023年第2期149-156,共8页
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族...
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异,CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达,CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达;非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。
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关键词
藜麦
异戊烯转移酶
cqipt基因家族
生物信息学
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职称材料
题名
藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析
被引量:
2
1
作者
田晓芹
褚晶
丁洪霞
杨博
陈方军
郭善利
陈世华
机构
烟台大学生命科学学院
出处
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
CAS
2023年第2期149-156,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31370296)
山东省“渤海粮仓”科技示范工程升级版计划项目(2019BHLC001)
烟台大学研究生科技创新基金资助项目。
文摘
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦IPT(CqIPT)基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到12个可分为4个亚组的CqIPT基因,同亚组CqIPT基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;CqIPT基因家族所有成员的表达模式存在明显差异,CqIPT9仅在顶端分生组织和花序中显著表达,CqIPT5和CqIPT11在花和未成熟的种子及干种子中显著表达;非生物胁迫下的基因表达同样存在多种模式。本研究为深入研究藜麦CqIPT基因的功能提供了一定的理论基础。
关键词
藜麦
异戊烯转移酶
cqipt基因家族
生物信息学
Keywords
quinoa
isopentenyltransferase
cqipt
gene family
bioinformatics
分类号
Q751 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
藜麦异戊烯基转移酶基因(CqIPT)家族的全基因组鉴定与分析
田晓芹
褚晶
丁洪霞
杨博
陈方军
郭善利
陈世华
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
CAS
2023
2
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参考文献
引证文献
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