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藜麦2,3-氧化角鲨烯环化酶基因(CqOSC)家族的全基因组鉴定与分析
1
作者
杨博
丁洪霞
+2 位作者
陈方军
郭善利
陈世华
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
2024年第1期46-53,共8页
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员,可分为3个亚组,同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;在藜麦正常生...
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员,可分为3个亚组,同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;在藜麦正常生长发育过程中,CqOSC基因家族成员的表达模式存在明显差异,CqOSC7和CqOSC12在花和未成熟的种子及干种子中显著表达,而CqOSC9与CqOSC10在所有组织中均呈现出一定水平的表达;对于MeJA具有不同响应:CqOSC2、CqOSC4和CqOSC8基因表达量变化显著;CqOSC3、CqOSC6和CqOSC15基因表达量变化不明显;整体表现为“低促高抑”:在外施0.5 mmol/L和1 mmol/L MeJA时基因表达量显著上升,在浓度达到2 mmol/L时表达量显著下降。
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关键词
藜麦
2
3-氧化角鲨烯环化酶
cqosc基因家族
生物信息学
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职称材料
题名
藜麦2,3-氧化角鲨烯环化酶基因(CqOSC)家族的全基因组鉴定与分析
1
作者
杨博
丁洪霞
陈方军
郭善利
陈世华
机构
烟台大学生命科学学院
出处
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
2024年第1期46-53,共8页
基金
山东省“渤海粮仓”科技示范工程升级版计划项目(2019BHLC001)
烟台市校地融合发展项目。
文摘
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员,可分为3个亚组,同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;在藜麦正常生长发育过程中,CqOSC基因家族成员的表达模式存在明显差异,CqOSC7和CqOSC12在花和未成熟的种子及干种子中显著表达,而CqOSC9与CqOSC10在所有组织中均呈现出一定水平的表达;对于MeJA具有不同响应:CqOSC2、CqOSC4和CqOSC8基因表达量变化显著;CqOSC3、CqOSC6和CqOSC15基因表达量变化不明显;整体表现为“低促高抑”:在外施0.5 mmol/L和1 mmol/L MeJA时基因表达量显著上升,在浓度达到2 mmol/L时表达量显著下降。
关键词
藜麦
2
3-氧化角鲨烯环化酶
cqosc基因家族
生物信息学
Keywords
quinoa
2,3-oxidosqualene cyclases
cqosc
gene family
bioinformatics
分类号
Q751 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
藜麦2,3-氧化角鲨烯环化酶基因(CqOSC)家族的全基因组鉴定与分析
杨博
丁洪霞
陈方军
郭善利
陈世华
《烟台大学学报(自然科学与工程版)》
2024
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