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鳞翅目昆虫Cry毒素受体与人同名蛋白的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈贵东
李燕芳
+2 位作者
何颖
邹泽红
陶爱林
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期272-279,共8页
[目的]生物信息学分析鳞翅目昆虫Cry毒素受体氨肽酶N(APN)、类钙黏蛋白(Ca LP)、碱性磷酸酶(ALP)与人同名蛋白的关系。[方法]NCBI数据库获取人和鳞翅目昆虫的APN、Ca LP、ALP的氨基酸序列,利用生物信息学软件对序列一致性、系统发育关...
[目的]生物信息学分析鳞翅目昆虫Cry毒素受体氨肽酶N(APN)、类钙黏蛋白(Ca LP)、碱性磷酸酶(ALP)与人同名蛋白的关系。[方法]NCBI数据库获取人和鳞翅目昆虫的APN、Ca LP、ALP的氨基酸序列,利用生物信息学软件对序列一致性、系统发育关系、结构域、三维结构相似性等进行预测和分析。[结果]APN系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高58.06%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(62.80%,P<0.05)。ALP系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高46.03%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(59.63%和59.59%,P<0.05)。人与鳞翅目昆虫的Ca LP系统发育关系较远;Ca LP序列一致性最高是人与棉铃虫(28.12%),两者含2个相似结构域,三维结构相似性不显著(18.75%,P>0.05)。[结论]人和家蚕两者间的APN、ALP系统发育关系最近,序列一致性最高,含有相似的结构域且三维结构相似性显著,可能具有相似的生物学功能。
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关键词
鳞翅目昆虫
cry毒素受体
氨肽酶N
类钙黏蛋白
碱性磷酸酶
生物信息学
原文传递
题名
鳞翅目昆虫Cry毒素受体与人同名蛋白的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈贵东
李燕芳
何颖
邹泽红
陶爱林
机构
广州医科大学附属第二医院
广州医科大学附属第四医院病理科
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期272-279,共8页
基金
国家科技重大专项重大课题(“转基因生物的食用和饲用安全评价技术”
No.2014ZX08011-005)
+3 种基金
国家科技重大专项重点课题(“改善过敏原性评价方法的对比物的创建研究”
No.2014ZX0801105B)
广东高校科技创新项目(“优良待转化基因编码蛋白过敏原性医学评估与改造研究”
No.2013KJCX148)
文摘
[目的]生物信息学分析鳞翅目昆虫Cry毒素受体氨肽酶N(APN)、类钙黏蛋白(Ca LP)、碱性磷酸酶(ALP)与人同名蛋白的关系。[方法]NCBI数据库获取人和鳞翅目昆虫的APN、Ca LP、ALP的氨基酸序列,利用生物信息学软件对序列一致性、系统发育关系、结构域、三维结构相似性等进行预测和分析。[结果]APN系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高58.06%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(62.80%,P<0.05)。ALP系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高46.03%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(59.63%和59.59%,P<0.05)。人与鳞翅目昆虫的Ca LP系统发育关系较远;Ca LP序列一致性最高是人与棉铃虫(28.12%),两者含2个相似结构域,三维结构相似性不显著(18.75%,P>0.05)。[结论]人和家蚕两者间的APN、ALP系统发育关系最近,序列一致性最高,含有相似的结构域且三维结构相似性显著,可能具有相似的生物学功能。
关键词
鳞翅目昆虫
cry毒素受体
氨肽酶N
类钙黏蛋白
碱性磷酸酶
生物信息学
Keywords
Homo sapiens, lepidopteran insects, cry toxin receptor, aminopeptidase - N, cadherin - like protein, alkaline - phosphatase, bioinformatics
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鳞翅目昆虫Cry毒素受体与人同名蛋白的生物信息学分析
陈贵东
李燕芳
何颖
邹泽红
陶爱林
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
原文传递
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