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鳞翅目昆虫Cry毒素受体与人同名蛋白的生物信息学分析 被引量:2
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作者 陈贵东 李燕芳 +2 位作者 何颖 邹泽红 陶爱林 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期272-279,共8页
[目的]生物信息学分析鳞翅目昆虫Cry毒素受体氨肽酶N(APN)、类钙黏蛋白(Ca LP)、碱性磷酸酶(ALP)与人同名蛋白的关系。[方法]NCBI数据库获取人和鳞翅目昆虫的APN、Ca LP、ALP的氨基酸序列,利用生物信息学软件对序列一致性、系统发育关... [目的]生物信息学分析鳞翅目昆虫Cry毒素受体氨肽酶N(APN)、类钙黏蛋白(Ca LP)、碱性磷酸酶(ALP)与人同名蛋白的关系。[方法]NCBI数据库获取人和鳞翅目昆虫的APN、Ca LP、ALP的氨基酸序列,利用生物信息学软件对序列一致性、系统发育关系、结构域、三维结构相似性等进行预测和分析。[结果]APN系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高58.06%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(62.80%,P<0.05)。ALP系统发育关系最近的是人与家蚕,两者序列一致性最高46.03%,含2个相似结构域,三维结构相似性显著(59.63%和59.59%,P<0.05)。人与鳞翅目昆虫的Ca LP系统发育关系较远;Ca LP序列一致性最高是人与棉铃虫(28.12%),两者含2个相似结构域,三维结构相似性不显著(18.75%,P>0.05)。[结论]人和家蚕两者间的APN、ALP系统发育关系最近,序列一致性最高,含有相似的结构域且三维结构相似性显著,可能具有相似的生物学功能。 展开更多
关键词 鳞翅目昆虫 cry毒素受体 氨肽酶N 类钙黏蛋白 碱性磷酸酶 生物信息学
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