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青蛤(Cyclina sinensis)IκB基因的克隆及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的表达分析
被引量:
5
1
作者
魏星
张海静
潘宝平
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期793-799,共7页
利用青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库信息,设计引物并克隆得到了青蛤TLRs信号通路中的关键信号分子IκB(Cs IκB)基因的c DNA序列。该基因的开放阅读框为1134bp,编码377个氨基酸,分子量为41.79k Da,其结构具备IκB家族基因的典型特征...
利用青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库信息,设计引物并克隆得到了青蛤TLRs信号通路中的关键信号分子IκB(Cs IκB)基因的c DNA序列。该基因的开放阅读框为1134bp,编码377个氨基酸,分子量为41.79k Da,其结构具备IκB家族基因的典型特征,包括C端的6个锚蛋白重复序列(ankyrin repeat,ANK),N端的DS64GILS68降解序列以及C端的酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(S373DDES377)。经BLASTX比对及分子系统学分析证明其是IκB家族的一员。进一步利用实时荧光定量PCR技术检测了Cs IκB基因在青蛤不同组织及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)胁迫下在特定组织中的时序性表达情况。结果表明,该基因在样品的血淋巴、肝脏、外套膜、闭壳肌、鳃和性腺6种组织中普遍表达,其中以血淋巴中表达水平最高。在鳗弧菌刺激后3h Cs IκB在青蛤血淋巴中表达量明显上调,并于6h达到最大值,说明该基因参与了青蛤非特异免疫应答反应。
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关键词
青蛤
csiκb
鳗弧菌
TLRs信号通路
荧光定量PCR
下载PDF
职称材料
题名
青蛤(Cyclina sinensis)IκB基因的克隆及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的表达分析
被引量:
5
1
作者
魏星
张海静
潘宝平
机构
天津师范大学生命科学学院天津市动植物抗性重点实验室
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期793-799,共7页
基金
天津市科委应用基础与前沿技术重点项目资助
12JCZDJC22800号
+1 种基金
09JCZDJC19300号
14JCZDJC34200号
文摘
利用青蛤(Cyclina sinensis)转录组文库信息,设计引物并克隆得到了青蛤TLRs信号通路中的关键信号分子IκB(Cs IκB)基因的c DNA序列。该基因的开放阅读框为1134bp,编码377个氨基酸,分子量为41.79k Da,其结构具备IκB家族基因的典型特征,包括C端的6个锚蛋白重复序列(ankyrin repeat,ANK),N端的DS64GILS68降解序列以及C端的酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(S373DDES377)。经BLASTX比对及分子系统学分析证明其是IκB家族的一员。进一步利用实时荧光定量PCR技术检测了Cs IκB基因在青蛤不同组织及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)胁迫下在特定组织中的时序性表达情况。结果表明,该基因在样品的血淋巴、肝脏、外套膜、闭壳肌、鳃和性腺6种组织中普遍表达,其中以血淋巴中表达水平最高。在鳗弧菌刺激后3h Cs IκB在青蛤血淋巴中表达量明显上调,并于6h达到最大值,说明该基因参与了青蛤非特异免疫应答反应。
关键词
青蛤
csiκb
鳗弧菌
TLRs信号通路
荧光定量PCR
Keywords
Cyclina sinensis
csiκb
Vi
b
rio anguillarum
TLRs signaling pathway
real-time PCR
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
青蛤(Cyclina sinensis)IκB基因的克隆及其在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的表达分析
魏星
张海静
潘宝平
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
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