威宁短柱油茶MKK3基因克隆及生物信息学分析

【目的】分离克隆威宁短柱油茶MAPKK基因家族相关基因,为挖掘威宁短柱油茶抗逆相关基因奠定基础。【方法】利用RT-PCR扩增MAPKK基因全长cDNA序列,利用生物信息学分析软件对其开放阅读框、基本理化性质、磷酸化位点及蛋白互作等进行分析。【结果】克隆获得威宁短柱油茶CsMKK3基因,全长2 219 bp,包含1个1 557 bp的开放阅读框,编码518个氨基酸,蛋白的相对分子量为57 524.61 Da,理论等电点5.44,是无跨膜结构和信号肽的不稳定蛋白,定位于细胞核,含有多个磷酸化位点,与MAPK蛋白激酶家族的MPK2、MPK14、MPK1、MPK8、MPK5、MPK7及MPK6等蛋白存在相互作用;系统进化分析其与同科植物茶亲缘关系最近。【结论】克隆分离的CsMKK3基因符合MAPKK基因家族特征,属于该基因家族成员。