黄瓜病程相关蛋白CsPRp27基因的克隆与生物信息学分析

病程相关蛋白(pathogenesis related proteins,PRs)是植物受外界胁迫时诱导表达的一类重要的防卫蛋白,其中PR-17是病程相关蛋白家族中的新成员。本研究采用RT-PCR技术从抗黑斑病黄瓜品系D1322叶片中克隆基因CsPRp27,并对其进行了生物信息学分析。结果表明:CsPRp27开放阅读框(ORF)长度为750 bp,编码260个氨基酸,为稳定的碱性分泌蛋白,属于BSP(basic secretory proteins)家族蛋白,第37~59氨基酸区域含有一个跨膜螺旋区。系统发育分析结果指出CsPRp27与甜瓜CmPRp27属同一个分支,与烟草、马铃薯、辣椒和葡萄的亲缘关系较近,且具有相同的蛋白基序motif 1~motif 5。依据启动子序列与蛋白互作结果推测CsPRp27的表达可能受茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)调控及组蛋白修饰。研究结果为深入揭示CsPRp27在黄瓜抗黑斑病中的功能奠定了理论基础。