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黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析
1
作者
张国华
许燕
+1 位作者
蔡文启
方荣祥
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999年第1期8-14,共7页
分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA...
分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA2全长cDNA克隆pC2F。通过对pC25和pC23进行序列测定,得到了RNA2的全序列。序列分析结果表明CMVSDRNA2由3048nt组成,其中存在2个部分重叠的阅读框ORF1(79~2652nt)和ORF2(2414~2746nt),分别编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白,并在2a蛋白的序列中发现了动植物病毒复制酶所特有的两个保守序列。该株系RNA2核苷酸序列与分属CMVI亚组的Fny株系和II亚组的Q株系RNA2的核苷酸序列同源性分别为917%和756%;2a蛋白的氨基酸序列同源性分别为938%和677%,2b蛋白的氨基酸序列同源性分别为830%和513%。同源性比较的结果表明SD株系属于CMVI亚组。
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关键词
黄瓜花叶病毒山东株
rna2
全长
cdna
克隆
序列分析
下载PDF
职称材料
黄瓜花叶病毒香蕉株系(CMV-Xb)RNA3 cDNA的克隆和序列分析
被引量:
5
2
作者
王海河
谢联辉
林奇英
《中国病毒学》
CSCD
2001年第3期252-256,共5页
通过RT PCR方法 ,设计两对引物 ,克隆了黄瓜花叶病毒香蕉株系 (CMV Xb)RNA3 ,并进行了核苷酸和蛋白质水平上的分析。结果表明Xb株系RNA3全长 2 2 0 5nt,具有两个蛋白编码阅读框架 (ORF) ,其中 5’端 (97~ 936nt)编码一个 2 79aa的 3a蛋...
通过RT PCR方法 ,设计两对引物 ,克隆了黄瓜花叶病毒香蕉株系 (CMV Xb)RNA3 ,并进行了核苷酸和蛋白质水平上的分析。结果表明Xb株系RNA3全长 2 2 0 5nt,具有两个蛋白编码阅读框架 (ORF) ,其中 5’端 (97~ 936nt)编码一个 2 79aa的 3a蛋白 ;3’端 (12 2 5~ 1871nt)编码一个 2 18aa的CP蛋白。 5’非编码区域为 96nt;基因间隔区 (IR)长2 88nt;3’NR含有 32 4nt。通过与亚组Ⅱ其它株系RNA3核苷酸和所编码产物推导的氨基酸序列分析发现 ,亚组Ⅱ株系无论在编码区还是非编码区的核苷酸同源性都相对较高 ;亚组Ⅱ株系在进化过程中具有连续性。
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关键词
黄瓜花叶病毒香蕉株系
RNA3
全长
cdna
克隆
序列分析
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职称材料
题名
黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析
1
作者
张国华
许燕
蔡文启
方荣祥
机构
中国科学院微生物研究所植物生物技术开放实验室
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999年第1期8-14,共7页
基金
国家自然科学基金
"863"资助项目
文摘
分别利用5’RACE和3’RACE确定了CMVSDRNA2的5’和3’末端序列,在此基础上,利用RTPCR得到了RNA2的5’端一半的cDNA克隆pC25和3’端一半的cDNA克隆pC23,并通过拼接构建了RNA2全长cDNA克隆pC2F。通过对pC25和pC23进行序列测定,得到了RNA2的全序列。序列分析结果表明CMVSDRNA2由3048nt组成,其中存在2个部分重叠的阅读框ORF1(79~2652nt)和ORF2(2414~2746nt),分别编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白,并在2a蛋白的序列中发现了动植物病毒复制酶所特有的两个保守序列。该株系RNA2核苷酸序列与分属CMVI亚组的Fny株系和II亚组的Q株系RNA2的核苷酸序列同源性分别为917%和756%;2a蛋白的氨基酸序列同源性分别为938%和677%,2b蛋白的氨基酸序列同源性分别为830%和513%。同源性比较的结果表明SD株系属于CMVI亚组。
关键词
黄瓜花叶病毒山东株
rna2
全长
cdna
克隆
序列分析
Keywords
cucumber mosaic virus sd strain
,
rna2
,
full length cdna
,
nucleotide sequence
分类号
S436.421 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
黄瓜花叶病毒香蕉株系(CMV-Xb)RNA3 cDNA的克隆和序列分析
被引量:
5
2
作者
王海河
谢联辉
林奇英
机构
福建农业大学植物病毒研究所
出处
《中国病毒学》
CSCD
2001年第3期252-256,共5页
文摘
通过RT PCR方法 ,设计两对引物 ,克隆了黄瓜花叶病毒香蕉株系 (CMV Xb)RNA3 ,并进行了核苷酸和蛋白质水平上的分析。结果表明Xb株系RNA3全长 2 2 0 5nt,具有两个蛋白编码阅读框架 (ORF) ,其中 5’端 (97~ 936nt)编码一个 2 79aa的 3a蛋白 ;3’端 (12 2 5~ 1871nt)编码一个 2 18aa的CP蛋白。 5’非编码区域为 96nt;基因间隔区 (IR)长2 88nt;3’NR含有 32 4nt。通过与亚组Ⅱ其它株系RNA3核苷酸和所编码产物推导的氨基酸序列分析发现 ,亚组Ⅱ株系无论在编码区还是非编码区的核苷酸同源性都相对较高 ;亚组Ⅱ株系在进化过程中具有连续性。
关键词
黄瓜花叶病毒香蕉株系
RNA3
全长
cdna
克隆
序列分析
Keywords
cucumber
mosaic
mosaic
virus
strain
from banana
RNA3
full
-
length
cdna
nucleotide
sequence
分类号
S432.4 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄瓜花叶病毒山东株(CMV-SD)RNA2全长cDNA克隆的构建及全序列分析
张国华
许燕
蔡文启
方荣祥
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
1999
0
下载PDF
职称材料
2
黄瓜花叶病毒香蕉株系(CMV-Xb)RNA3 cDNA的克隆和序列分析
王海河
谢联辉
林奇英
《中国病毒学》
CSCD
2001
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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