-
题名免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究
被引量:10
- 1
-
-
作者
兰阿峰
杨曼
郭素芬
丁小维
邓百万
顾东升
-
机构
陕西理工学院生物科学与工程学院
陕西省食药用菌工程研究中心
陕西省勉县第一中学
-
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期1342-1349,共8页
-
基金
陕西省科技厅科技统筹创新计划项目(No.2012HBGC-20)
陕西理工学院人才引进启动项目
-
文摘
【目的】了解大鲵肠道内生细菌的组成及多样性。【方法】采用美国Mo Bio公司试剂盒提取大鲵肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建大鲵肠道内容物内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的101个阳性克隆归为28个不同的可操作分类单元(OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、梭菌门(Clostridia)、芽孢杆菌门(Bacilli)和衣原体门(Chlamydiae)4个门。其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的92.08%)为最优势类群。序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性。此外,还有一个OTU在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类。【结论】大鲵肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。
-
关键词
免培养
大鲵
肠道微生物
多样性
-
Keywords
culture-independent, chinese giant salamander (andrias davidianus), intestinal microbial, biodiversity
-
分类号
S917.4
[农业科学—水产科学]
-