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改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
被引量:
1
1
作者
李磊
敖日格乐
+1 位作者
王玢琪
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期413-420,共8页
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微...
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微卫星位点,其中60%为完美型(Perfect)SSR。根据这些位点设计、合成了25对引物,并对江西庐山及湖北恩施两地蜈蚣草种群各20个个体进行了遗传多样性检测,结果发现:其中8个完美型及1个间断型(intermittent)SSR位点的引物能够扩增出清晰、稳定且具有多态性的条带。9对引物共扩增出41个等位基因,各位点等位基因数在2~7之间,平均等位基因数为4.56个;期望杂合度在0.0494~0.8169之间;没有连锁不平衡现象发生。采用大叶井栏边草(Pteris multifida Poir.)进行跨种扩增,结果发现其中6对引物能够进行种间扩增。这些SSR分子标记的开发有助于蜈蚣草生态适应性进化分析、揭示蜈蚣草地理分布格局以及探讨蜈蚣草遗传多样性,还可用于品种鉴定及选育等。
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关键词
蜈蚣草
微卫星
多态性
FIASCO
CviQI接头
pig-tail
cviqi-n引物
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职称材料
题名
改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
被引量:
1
1
作者
李磊
敖日格乐
王玢琪
葛台明
机构
中国地质大学湿地演化与生态恢复湖北省重点实验室
中国地质大学(武汉)环境学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期413-420,共8页
基金
国家自然科学基金重点项目(40930210)
文摘
蜈蚣草(Pteris vittata L.)是目前用于砷污染土壤修复最好的超富集植物,但其分子水平上的研究数据较少。为了开发蜈蚣草特异性SSR遗传标记,本文采用改良的FIASCO方法从蜈蚣草AG和AC微卫星富集文库中随机挑选100个克隆,分离得到51个微卫星位点,其中60%为完美型(Perfect)SSR。根据这些位点设计、合成了25对引物,并对江西庐山及湖北恩施两地蜈蚣草种群各20个个体进行了遗传多样性检测,结果发现:其中8个完美型及1个间断型(intermittent)SSR位点的引物能够扩增出清晰、稳定且具有多态性的条带。9对引物共扩增出41个等位基因,各位点等位基因数在2~7之间,平均等位基因数为4.56个;期望杂合度在0.0494~0.8169之间;没有连锁不平衡现象发生。采用大叶井栏边草(Pteris multifida Poir.)进行跨种扩增,结果发现其中6对引物能够进行种间扩增。这些SSR分子标记的开发有助于蜈蚣草生态适应性进化分析、揭示蜈蚣草地理分布格局以及探讨蜈蚣草遗传多样性,还可用于品种鉴定及选育等。
关键词
蜈蚣草
微卫星
多态性
FIASCO
CviQI接头
pig-tail
cviqi-n引物
Keywords
Chinese brake fern ( Pteris vittata L.)
Microsatellite
Polymorphism
FIASCO
CviQI-adaptor
Pig-tail
cviqi-n
primer
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
改良FIASCO方法筛选砷超富集植物蜈蚣草SSR分子标记(英文)
李磊
敖日格乐
王玢琪
葛台明
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
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职称材料
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