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外源性C-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响 被引量:3
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作者 闫文娟 吴补领 +4 位作者 屈铁军 高杰 赵红萍 苏凌云 余擎 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期510-512,共3页
目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产... 目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产酸、耐酸能力明显下降,差异有统计学意义,经t检验,P<0.05。结论:c-di-GMP可以抑制变形链球菌的产酸、耐酸能力,可以单独也可以与其它的抗龋制剂联合应用控制龋病。 展开更多
关键词 c—dj—GMP 变形链球菌 产酸 耐酸
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细菌第二信使c-di-GMP的代谢调控及在致病性中的作用 被引量:1
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作者 魏超 杨军 +3 位作者 张元宝 王磊 孙文献 王云月 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期885-890,共6页
环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是细菌内广泛存在的一类全新的第二信使分子。具有鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)活性的GGDEF结构域蛋白以及具有磷酸二酯酶(phosphodiesterases,PDE)活性的EAL或HD-GYP结构域蛋白分... 环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是细菌内广泛存在的一类全新的第二信使分子。具有鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)活性的GGDEF结构域蛋白以及具有磷酸二酯酶(phosphodiesterases,PDE)活性的EAL或HD-GYP结构域蛋白分别负责c-di-GMP的合成与降解。细菌内存在多种类型c-di-GMP的受体,负责感知细胞内c-di-GMP浓度的变化,并启动或抑制下游特定基因的表达。这些受体包括PilZ结构域蛋白,退化的GGDEF和EAL结构域蛋白,转录因子以及核糖开关(riboswitch)。c-di-GMP参与调控细菌的多种生物学功能,如生物膜形成、运动性、胞外多糖的合成、胞外酶的分泌和三型分泌系统等,从而影响病原细菌的致病性。本文对近期c-di-GMP相关研究进展进行综述,并就其应用前景进行了讨论。 展开更多
关键词 环鸟苷二磷酸 受体 生物膜 运动性 三型分泌系统 致病性
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环二鸟苷酸调控细菌胞外多糖生物合成的研究进展 被引量:1
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作者 于连升 葛菁萍 +1 位作者 平文祥 杜仁鹏 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2023年第9期422-430,共9页
细菌胞外多糖(Exopolysaccharide,EPS)是细菌生长代谢过程中自身合成并分泌到细胞壁外的一种次级代谢产物,可以调节细胞对不同基质的初始附着,保护细胞抗环境胁迫和脱水。作为潜在的益生元,EPS具有安全,无毒和特殊的理化性质,广泛应用... 细菌胞外多糖(Exopolysaccharide,EPS)是细菌生长代谢过程中自身合成并分泌到细胞壁外的一种次级代谢产物,可以调节细胞对不同基质的初始附着,保护细胞抗环境胁迫和脱水。作为潜在的益生元,EPS具有安全,无毒和特殊的理化性质,广泛应用在食品、医药、生物和工业等领域。然而,细菌代谢系统复杂,EPS的生物合成机制仍未得到全面解析。环二鸟苷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)作为一类重要的第二信使,在细菌的生物被膜形成、运动性、黏附、毒力以及EPS合成等众多生理活动上发挥重要的调控作用。c-di-GMP转录调控机制的解析,为探明细菌EPS的生物合成机理提供了全新的思路。本文详细总结了c-di-GMP的特性及合成降解途径,重点综述c-di-GMP在介导细菌EPS生物合成过程中的调控机理。本篇综述为揭示细菌EPS生物合成机理和构效关系的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 细菌 胞外多糖 生物合成 环二鸟苷酸
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生物被膜初始黏附调控机制及其在食品品质控制中的应用研究进展 被引量:1
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作者 熊儒恒 阎俊 谢晶 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第13期203-215,共13页
生物被膜态是细菌在自然界中主要的存在形式。细菌的初始黏附开启了生物被膜形成的生命周期。初始黏附是浮游态细菌在细菌元器件、胞外聚合物等因素的影响下,吸附于生物或非生物表面并开始形成生物被膜的过程。细菌的初始黏附受到多种... 生物被膜态是细菌在自然界中主要的存在形式。细菌的初始黏附开启了生物被膜形成的生命周期。初始黏附是浮游态细菌在细菌元器件、胞外聚合物等因素的影响下,吸附于生物或非生物表面并开始形成生物被膜的过程。细菌的初始黏附受到多种调控系统的影响,因此,对相关调控系统进行深入研究具有重要的意义。本文对环二鸟苷酸、双组分调控系统和群体感应系统3个主要影响细菌初始黏附的调控系统进行综述,并介绍这些调控系统调控细菌初始黏附作用的机制,同时对从控制初始黏附角度保证食品品质进行总结和展望。本文可为控制细菌生物被膜危害食品品质提供理论依据,对促进食品产业发展具有一定的现实意义。 展开更多
关键词 初始黏附 生物被膜 环二鸟苷酸 双组分调控系统 群体感应系统 食品品质控制
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环二鸟苷酸调控铜绿假单胞菌生物被膜研究进展
5
作者 费冰 刘莹 +4 位作者 任彦颖 郭梦雨 刘心伟 刘冬梅 李永伟 《检验医学》 CAS 2023年第2期186-189,共4页
从浮游到生物被膜(BF)生命周期的转变能够促进细菌对非生物表面的黏附,逃避宿主免疫系统,增强其对常见抗菌药物的抗性,在导致人类病原菌感染率不断增加的同时,也大大增加了临床治疗的难度。第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)对BF的调控起重... 从浮游到生物被膜(BF)生命周期的转变能够促进细菌对非生物表面的黏附,逃避宿主免疫系统,增强其对常见抗菌药物的抗性,在导致人类病原菌感染率不断增加的同时,也大大增加了临床治疗的难度。第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)对BF的调控起重要作用。通过直接靶向c-di-GMP信号传导抑制抗菌药物抗性和BF形成意义重大。文章对c-di-GMP在铜绿假单胞菌BF调控中的作用进行综述。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 铜绿假单胞菌 生物被膜 调控作用
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食源性副溶血性弧菌生物被膜调控机制的研究进展
6
作者 唐佳灵 郭星蓝 +3 位作者 饶钧玥 杨茂杰 曹芸榕 韩国全 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第24期372-380,共9页
副溶血性弧菌是一种广泛存在于海产品中并可引起人类急性肠胃炎的食源性致病菌,极大地危害人类身体健康。生物被膜是细菌面对极端环境而产生的一类抗逆性极强的形态,且对抗生素及机体免疫力有着天然的抵抗能力,普通的消毒手法不能完全... 副溶血性弧菌是一种广泛存在于海产品中并可引起人类急性肠胃炎的食源性致病菌,极大地危害人类身体健康。生物被膜是细菌面对极端环境而产生的一类抗逆性极强的形态,且对抗生素及机体免疫力有着天然的抵抗能力,普通的消毒手法不能完全将其除尽。当副溶血性弧菌形成生物被膜之后,会对人体健康和食品工业造成更加严重的危害。本综述主要从环二鸟苷酸、群体感应系统和双组分系统3个调控因素来阐述影响副溶血性弧菌生物被膜形成的相关信号分子,重点对形成过程中的信号分子调控机制进行概述,这对进一步揭示以上几种调控因素调控生物被膜形成的机制十分必要。以期为食品安全、微生物防控等提供理论基础,有助于探究副溶血性弧菌生物被膜的控制方法。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 生物被膜 环二鸟苷酸 群体感应系统 双组分系统
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环二鸟苷酸——新型的细菌第二信使 被引量:9
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作者 路新枝 刘湛军 于文功 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期400-406,共7页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是新近发现的在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、从运动状态到生物被膜状态的转变、致病因子产生等.基于其对细菌抗生素耐药的物理屏障—生物被膜形成的影响,... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是新近发现的在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、从运动状态到生物被膜状态的转变、致病因子产生等.基于其对细菌抗生素耐药的物理屏障—生物被膜形成的影响,c-di-GMP的研究越来越受到人们的关注.细胞内c-di-GMP的产生受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)合成和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)降解两条途径调控.在结构上,通常DGC含有GGDEF结构域,PDE含有EAL结构域.c-di-GMP的作用靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型.本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机理、生物学功能等方面的最新研究进展,并对c-di-GMP在今后研究中的应用和发展趋势进行展望. 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 第二信使 细菌生物被膜
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外源性单磷酸鸟苷环二聚体防龋的实验研究 被引量:3
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作者 闫文娟 杨德鸿 吴补领 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期639-642,共4页
目的初步探讨外源性单磷酸鸟苷环二聚体(c-di-GMP)对大鼠口腔内龋齿的防龋效果。方法 SPF大鼠感染致龋菌后,随机分成3组,分别用外源性c-di-GMP、氟化钠水溶液、质量体积比为0.9%氯化钠给大鼠施药,用唾液取样细菌培养、龋齿记分观察外源... 目的初步探讨外源性单磷酸鸟苷环二聚体(c-di-GMP)对大鼠口腔内龋齿的防龋效果。方法 SPF大鼠感染致龋菌后,随机分成3组,分别用外源性c-di-GMP、氟化钠水溶液、质量体积比为0.9%氯化钠给大鼠施药,用唾液取样细菌培养、龋齿记分观察外源性c-di-GMP在动物口内对致龋菌的生长繁殖以及对龋病发生、发展的影响。结果通过唾液取样进行变形链球菌培养计数,c-di-GMP组与阴性对照组相比,无显著性差别(P>0.05);Keyes龋齿记分结果显示,c-di-GMP组龋损程度及数量都均少于对照组(P<0.05),从龋病发展程度看,c-di-GMP组最为缓慢,仅存在釉质和牙本质浅层龋损。结论外源性c-di-GMP可以有效抑制大鼠龋齿的发生和发展,有望成为一种新型防龋药物。 展开更多
关键词 单磷酸鸟苷环二聚体 SD大鼠 防龋 动物实验
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问号钩端螺旋体GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学分析 被引量:1
9
作者 丁士标 肖国辉 +2 位作者 孔亮亮 严杰 林旭瑷 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期109-113,共5页
目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物... 目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物信息学软件对蛋白信号肽序列、跨膜序列、蛋白结构、同源性进行分析并构建目的蛋白进化树。结果问号钩体中22个蛋白分别含有GGDEF或EAL/HD-GYP结构域,多数蛋白均有感受器结构域和跨膜区。7个具有PAS输入感受器的GGDEF结构域蛋白进化较为独立,位于单独的一个分支,其余6个GGDEF结构域蛋白则分散在不同的分支上。4个EAL结构域蛋白和2个HD-GYP结构域蛋白进化上也较为独立,分别处于同一进化分支。3个GGDEF和EAL结构域耦合的蛋白在进化关系上更趋向于PDE活性蛋白。结论钩体具有多拷贝的合成和降解c-di-GMP相关蛋白编码基因,表明在钩体中c-di-GMP网络具有高度复杂性,同时反映出钩体对环境条件的改变具有复杂的应对机制。 展开更多
关键词 问号钩端螺旋体 环二鸟苷酸 鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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环二鸟苷酸对M1型巨噬细胞极化及促炎作用的体外研究 被引量:1
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作者 潘佳慧 李格格 +6 位作者 唐秋玲 王柳然 孟阳 丁小涵 岳轶云 刘东宁 于维先 《口腔生物医学》 2017年第3期122-126,共5页
目的:探讨牙龈卟啉单胞菌毒力因子环二鸟苷酸(c-di-GMP)对M1型巨噬细胞极化的调控作用及其体外促炎作用。方法:使用不同质量浓度(0.25、1、4、16、64μg/m L)的c-di-GMP分别处理RAW 264.7细胞3、6、12、24 h,采用实时定量RTPCR、ELISA... 目的:探讨牙龈卟啉单胞菌毒力因子环二鸟苷酸(c-di-GMP)对M1型巨噬细胞极化的调控作用及其体外促炎作用。方法:使用不同质量浓度(0.25、1、4、16、64μg/m L)的c-di-GMP分别处理RAW 264.7细胞3、6、12、24 h,采用实时定量RTPCR、ELISA及流式细胞术检测炎症因子肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6以及巨噬细胞M1型极化标志细胞因子IL-23和M2型极化标志细胞因子IL-10的mRNA、蛋白质和细胞表面标志物的表达。结果:RAW 264.7细胞TNF-α、IL-6和IL-23的mRNA表达水平随c-di-GMP的浓度和时间的变化均有不同程度的增高,具有剂量和时间依赖性,而IL-10的表达水平在各组中无显著升高;ELISA结果与实时定量RT-PCR结果基本相同;流式细胞术结果显示在c-di-GMP刺激RAW 264.7细胞24h后,细胞表面分子F4/80与CD86双阳性率、CD86单阳性率明显增高。结论:c-di-GMP能够刺激M1型巨噬细胞相关细胞因子IL-23及炎症因子TNF-α和IL-6的表达,诱导巨噬细胞发生M1型巨噬细胞极化,进而导致炎症反应,提示c-di-GMP可能通过诱导巨噬细胞发生M1型极化,进而在牙周炎的发生、发展过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 牙周炎 环二鸟苷酸 巨噬细胞 极化
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Overexpression of the diguanylate cyclase CdgD blocks developmental transitions and antibiotic biosynthesis in Streptomyces coelicolor 被引量:2
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作者 Xiaocao Liu Guosong Zheng +3 位作者 Gang Wang Weihong Jiang Lei Li Yinhua Lu 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2019年第11期1492-1505,共14页
Cyclic dimeric GMP(c-di-GMP)has emerged as the nucleotide second messenger regulating both development and antibiotic production in high-GC,Gram-positive streptomycetes.Here,a diguanylate cyclase(DGC),CdgD,encoded by ... Cyclic dimeric GMP(c-di-GMP)has emerged as the nucleotide second messenger regulating both development and antibiotic production in high-GC,Gram-positive streptomycetes.Here,a diguanylate cyclase(DGC),CdgD,encoded by SCO5345 from the model strain Streptomyces coelicolor,was functionally identified and characterized to be involved in c-di-GMP synthesis through genetic and biochemical analysis.cdgD overexpression resulted in significantly reduced production of actinorhodin and undecylprodigiosin,as well as completely blocked sporulation or aerial mycelium formation on two different solid media.In the cdgD-overexpression strain,intracellular c-di-GMP levels were 13-27-fold higher than those in the wild-type strain.In vitro enzymatic assay demonstrated that CdgD acts as a DGC,which could efficiently catalyze the synthesis of c-di-GMP from two GTP molecules.Heterologous overproduction of cdgD in two industrial Streptomyces strains could similarly impair developmental transitions as well as antibiotic biosynthesis.Collectively,our results combined with previously reported data clearly demonstrated that c-di-GMP-mediated signalling pathway plays a central and universal role in the life cycle as well as secondary metabolism in streptomycetes. 展开更多
关键词 STREPTOMYCES c-di-gmp diguanylate CYCLASE CdgD morphological differentiation antibiotic BIOSYNTHESIS
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鱼腥蓝细菌PCC7120 alr3504基因缺失突变体的构建及表型分析
12
作者 戴燕 王莉 陈雯莉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1532-1536,共5页
c-di-GMP是新发现的真细菌所特有的第二信使,其合成和降解由双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶分别完成。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr3504可能编码含有保守GGDEF结构域的双鸟苷酸环化酶。【目的】为了鉴定该基因的功能,【方法... c-di-GMP是新发现的真细菌所特有的第二信使,其合成和降解由双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶分别完成。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr3504可能编码含有保守GGDEF结构域的双鸟苷酸环化酶。【目的】为了鉴定该基因的功能,【方法】采用标记置换方法将alr3504缺失。【结果】敲除该基因后,发现缺失突变体的形态、生长速度及异形胞发育与野生型无明显差异,但在盐胁迫条件下,突变体比野生型对钠盐更敏感。【结论】可见alr3504虽不直接影响异形胞发育,但参与了其它信号途径,研究结果为阐明蓝细菌丰富而复杂的信号转导机制奠定了基础。 展开更多
关键词 鱼腥蓝细菌 c-di—GMP GGDEF结构域 双鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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Peptide nanotube loaded with a STING agonist,c-di-GMP,enhance cancer immunotherapy against melanoma 被引量:1
13
作者 Ziyuan Zhang Juan Liu +5 位作者 Min Xiao Quanfeng Zhang Zhonghua Liu Meiyan Liu Peng Zhang Youlin Zeng 《Nano Research》 SCIE EI CSCD 2023年第4期5206-5215,共10页
The activation of the stimulating factor of the interferon gene(STING)pathway can enhance the immune response within the tumor.Cyclic diguanylate monophosphate(c-di-GMP)is a negatively charged,hydrophilic STING agonis... The activation of the stimulating factor of the interferon gene(STING)pathway can enhance the immune response within the tumor.Cyclic diguanylate monophosphate(c-di-GMP)is a negatively charged,hydrophilic STING agonist,however,its effectiveness is limited due to the poor membrane permeability and low bioavailability.Herein,we introduced KL-7 peptide derived from Aβamyloid fibrils that can self-assemble to form nanotubes to load and deliver c-di-GMP,which significantly enhanced c-di-GMP’s effectiveness and then exhibited a robust“in situ immunity”to kill melanoma cells.KL-7 peptide nanotube,also called PNT,was loaded with negatively charged c-di-GMP via electrostatic interaction,which prepared a nanocomposite named c-di-GMP-PNT.Treatment of RAW 264.7 cells(leukemia cells in mouse macrophage)with c-di-GMP-PNT markedly stimulated the secretion of IL-6 and INF-βalong with phospho-STING(Ser365)protein expression,indicating the activation of the STING pathway.In the unilateral flank B16-F10(murine melanoma cells)tumor-bearing mouse model,compared to PNT and cdi-GMP,c-di-GMP-PNT can promote the expression of INF-β,TNF-α,IL-6,and IL-1β.At the same time,up-regulated CD4 and CD8 active T cells kill tumors and enhance the immune response in tumor tissues,resulting in significant inhibition of tumor growth in tumor-bearing mice.More importantly,in a bilateral flank B16-F10 tumor model,both primary and distant tumor growth can also be significantly inhibited by c-di-GMP-PNT.Moreover,c-di-GMP-PNT demonstrated no obvious biological toxicity on the main organs(heart,liver,spleen,lung,and kidney)and biochemical indexes of mice.In summary,our study provides a strategy to overcome the barriers of free c-di-GMP in the tumor microenvironment and c-di-GMP-PNT may be an attractive nanomaterial for anti-tumor immunity. 展开更多
关键词 cyclic diguanylate monophosphate stimulating factor of the interferon gene(STING) peptide nanotubes in situ immunity tumor immunotherapy
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c-di-GMP信号途径对细菌致病性的调控作用 被引量:8
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作者 管文静 吴茂森 何晨阳 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期427-431,共5页
环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的新型第二信使。鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二脂酶(PDE)分别控制了c-di-GMP的合成和降解,其中DGC活性由GGDEF结构域决定,PDE活性由EAL和HD-GYP结构域决定。c-di-GMP调控着细菌多种生物学功... 环鸟苷二磷酸(c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的新型第二信使。鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二脂酶(PDE)分别控制了c-di-GMP的合成和降解,其中DGC活性由GGDEF结构域决定,PDE活性由EAL和HD-GYP结构域决定。c-di-GMP调控着细菌多种生物学功能,抑制毒性因子产生和运动性,促进生物膜形成。c-di-GMP下游是一个包括转录、翻译以及翻译后等多层次的复杂调控网络。本文结合本室有关水稻白叶枯病菌的研究结果,综述近年来国内外在c-di-GMP研究领域的最新进展。 展开更多
关键词 环乌苷二磷酸 毒性 运动性 生物膜形成 调控作用
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铜绿假单胞菌中PA0847二鸟苷酸环化酶活性受非催化位点Y700调控
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作者 肖王鑫 杨婷婷 +3 位作者 黄卫东 袁文肃 张燕 林志 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2337-2351,共15页
【目的】鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中PA0847胞内结构域及其突变体的二鸟苷酸环化酶活性,并初步探究其催化机制。【方法】利用刚果红平板染色法验证PA0847胞内域的二鸟苷酸环化酶活性;采用PCR技术构建PA0847 PAS-GGDEF... 【目的】鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中PA0847胞内结构域及其突变体的二鸟苷酸环化酶活性,并初步探究其催化机制。【方法】利用刚果红平板染色法验证PA0847胞内域的二鸟苷酸环化酶活性;采用PCR技术构建PA0847 PAS-GGDEF结构域及其单点突变体,并经过表达纯化获得相应蛋白;经凝胶分子筛层析分析蛋白在溶液中的聚集状态;通过体外酶促反应鉴定蛋白的二鸟苷酸环化酶活性,基于噻唑橙荧光染色检测蛋白酶促反应后环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的生成量,并筛选与二鸟苷酸环化酶活性密切相关的氨基酸残基;联用结构预测和分子对接获得PA0847 PAS-GGDEF二聚体以及结合三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)的复合物结构模型。【结果】PA0847 PAS-GGDEF主要以二聚体形式发挥催化活性,PAS结构域促进二聚体形成,有效提高二鸟苷酸环化酶活性;突变筛选发现,在低蛋白浓度(0.6 mg/m L)下,非催化位点突变体Y700A活性较野生型显著提高;凝胶分子筛层析表明,其高活性可能与Y700A突变促进GGDEF(Gly-Gly-Asp-Glu-Phe)结构域二聚化有关;结构模型分析显示,PA0847 PAS-GGDEF与GTP结合位点保守,其中K722的氨基侧链在结合GTP的磷酸基团中发挥着重要作用,而Y700芳香环侧链与K722所在的α螺旋有疏水互作,因此Y700A突变可能改变了K722所在螺旋的空间取向,进而促进K722与底物GTP的结合以及GGDEF二聚化。【结论】铜绿假单胞菌PA0847的非催化位点Y700可间接调控二鸟苷酸环化酶活性。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 PA0847 环鸟苷二磷酸(c-di-gmp) 三磷酸鸟苷
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铜绿假单胞菌fur基因缺失突变株的构建及其表型分析
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作者 马鑫 李雯雯 +2 位作者 肖维 成娟丽 林金水 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期917-937,共21页
铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)是控制铜绿假单胞菌铁代谢和毒力的关键调节因子。许多课题组尝试构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株均失败,因此铜绿假单胞菌的fur一直被认为是必需基因,这导致其生物学功能一直未得到全面... 铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)是控制铜绿假单胞菌铁代谢和毒力的关键调节因子。许多课题组尝试构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株均失败,因此铜绿假单胞菌的fur一直被认为是必需基因,这导致其生物学功能一直未得到全面的解析。【目的】构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株,并对该突变株的表型进行分析。【方法】以铜绿假单胞菌PAO1为亲本菌株,通过同源重组的方法构建fur缺失突变株,研究该基因对铜绿假单胞菌生长、铁载体生物合成、抗氧胁迫能力、鞭毛形成、生物被膜形成和毒力等的影响。同时,通过遗传分析对fur缺失突变株生长缺陷表型的原因进行探究。【结果】本研究成功构建了铜绿假单胞菌fur基因的缺失突变株,发现缺失突变fur极大地限制了铜绿假单胞菌的生长能力,并降低了该菌对限铁环境的生长适应性,但不影响该菌对高铁环境的生长适应性。铜绿假单胞菌Δfur的这种生长缺陷表型是细胞生长增殖变慢造成的,而不是诱导细胞死亡引起的。然而,其他异源的fur基因能完全互补Δfur的这种生长缺陷表型,暗示铜绿假单胞菌的Fur蛋白在功能上不存在独特性。尽管Fur与毒素-抗毒素系统PacTA存在功能关联性,但是铜绿假单胞菌Δfur的这种生长缺陷表型却与PacT毒素无关。除了影响铜绿假单胞菌的生长表型,缺失突变fur还使铜绿假单胞菌丧失了对铁载体生物合成的抑制作用,导致该菌对H_(2)O_(2)更敏感并丧失了鞭毛的形成能力,同时降低了该菌对大蜡螟幼虫的毒力。此外,缺失突变fur还显著提升了铜绿假单胞菌的胞内环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)水平,从而诱导pelF和pslA基因的表达,进而促进铜绿假单胞菌生物被膜的形成。【结论】fur是可以缺失的非必需基因,在铜绿假单胞菌的正常生长、铁载体生物合成、抗氧胁迫能力、鞭毛形成、生物被膜形成和毒力等方面都发挥着十分重要的作用,这为针对铜绿假单胞菌的疫苗和抗菌药物开发奠定了基础。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 铁摄取调节蛋白 缺失突变 表型分析 环二鸟苷酸(c-di-gmp) 鞭毛 毒力
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c-di-GMP抑制转录调控因子Clpxoo与葡聚糖酶基因启动子的结合 被引量:6
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作者 李波 田芳 +2 位作者 陈华民 吴茂森 何晨阳 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1166-1171,共6页
【目的】阐明水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体和转录调控因子Clpxoo对葡聚糖酶基因(engAxoo)的转录调控作用机制。【方法】通过基因表达载体的构建和转化、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进... 【目的】阐明水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)c-di-GMP信号受体和转录调控因子Clpxoo对葡聚糖酶基因(engAxoo)的转录调控作用机制。【方法】通过基因表达载体的构建和转化、蛋白诱导表达及其Ni-NTA Resin亲和层析,进行了clpxoo基因的原核表达和产物纯化。通过荧光素(FAM)探针标记和凝胶阻滞试验(EMSA)对Clpxoo纯化蛋白与葡聚糖酶基因启动子(engAxoo-p)的结合活性及其c-diGMP信号分子的抑制作用进行了测定分析。【结果】在优化的诱导表达和纯化条件下,成功地获得了Clpxoo纯化蛋白。Clpxoo可与engAxoo-p序列发生阻滞现象,表明它具有与启动子特异性结合的活性。在反应体系中加入c-di-GMP可导致结合作用的消除。【结论】Clpxoo接受c-di-GMP信号后,可能通过构象的改变,从而与engAxoo-p的结合活性受到抑制;优化的Clpxoo蛋白纯化和EMSA方法可以用于后续的调控元大规模鉴定的研究。 展开更多
关键词 水稻白叶枯病菌 c-di-gmp 信号受体蛋白 启动子 结合作用
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)在微生物体内的作用及其类似物的研究 被引量:5
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作者 那路新 杨振军 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期307-312,258,共6页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)调控,DGC和PDE共处于同一个蛋白中,是一个双功能蛋白酶的两个区域,分别负责菌体内c-di-GMP的合成和降解。c-di-GMP作用菌体内下游靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型。目前发现c-di-GMP核开关是唯一不参与代谢活动而参与信号传导的一类核开关。本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机制、生物学功能,以及c-di-GMP结构类似物合成及生物学评价等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 c-di-gmp 细菌信号传导 代谢酶 GEMM核开关
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鉴定cyclic di-GMP效应蛋白:高通量筛选策略与实验验证方法 被引量:2
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作者 程寿廷 王芳芳 钱韦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1376-1389,共14页
环二鸟苷单磷酸(cyclic di-GMP或c-di-GMP)是细菌细胞中广泛存在的第二信使,调控细菌生物被膜发育、致病力、运动性、胞外多糖产生及细胞周期在内的诸多重要生理表型。c-di-GMP通过结合多种类型的效应子(包括核糖开关或效应蛋白)来发挥... 环二鸟苷单磷酸(cyclic di-GMP或c-di-GMP)是细菌细胞中广泛存在的第二信使,调控细菌生物被膜发育、致病力、运动性、胞外多糖产生及细胞周期在内的诸多重要生理表型。c-di-GMP通过结合多种类型的效应子(包括核糖开关或效应蛋白)来发挥调控功能。由于c-di-GMP分子在构象上具有多变性,其结合的效应子同样具有多样性。新型效应蛋白的筛选、鉴定是当前细菌信号转导领域的研究热点和难点,也是解析c-di-GMP调控机制的首要环节。本文在阐述c-di-GMP结合不同类型的效应蛋白并调控细菌生物被膜发育的基础上,综述了目前筛选c-di-GMP效应蛋白的方法,包括遗传筛选、亲和色谱结合质谱鉴定、DRa CALA系统鉴定以及基于分子对接的预测等。同时,对验证c-di-GMP效应蛋白的技术,如等温微量热滴定、表面等离子共振、微量热泳动在内的多种验证方法进行了总结,对比了这些策略和方法在应用上的优、缺点,为在细菌及其真核宿主基因组水平鉴定c-di-GMP效应蛋白的研究提供参考。 展开更多
关键词 环二乌苷酸单磷酸 二乌苷酸环化酶 磷酸二酯酶 效应蛋白 生物被膜
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Synthesis of c-di-GMP analogs modified by ganciclovir and biological activity to induce type Ⅰ interferon
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作者 Hong Dai Xiaotong Yu +2 位作者 Zhu Guan Lihe Zhang Zhenjun Yang 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2019年第12期825-834,共10页
C-di-GMP is one kind of second messengers which plays an important role not only in the regulation of various bacterial physiological activities but also in the activation of innate immune response to induce typeⅠint... C-di-GMP is one kind of second messengers which plays an important role not only in the regulation of various bacterial physiological activities but also in the activation of innate immune response to induce typeⅠinterferon in mammalian cells.In this assay,by using one-pot phosphoramidite method,three novel kinds of analogs of c-di-GMP including its phosphorthiates modified by ganciclovir(7 a,7 b,7 c)have been designed and synthesized.The immune-stimulatory results of these c-di-GMP analogs in RAW-Lucia ISG cells indicated that they couldn’t induce the release of typeⅠinterferon,which demonstrated that the intact structure of ribose moieties is very vital for their bioactivity upon the activation of STING signaling pathway. 展开更多
关键词 cyclic dinucleotides c-di-gmp analogs GANCICLOVIR TypeⅠinterferon
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