乙型肝炎病毒全基因克隆及序列分析发现一D/C基因型重组株

目的 构建含有adr、adw、ayw 3个血清型的HBV全基因组质粒 ,并进行测序及序列分析。方法 从HBsAg携带者的血清中扩增出S区克隆 ,筛选出adr、adw、ayw血清型的血清 ,然后扩增HBV的全基因组 ,对扩增产物进行克隆测序。利用DNAStar的MegAlign ,Phylogenetictree对HBV全基因序列以及分段序列进行比较和进化树分析。结果 构建了含有adw、adr、ayw 3种血清型的HBV全基因组质粒 ,代码分别为 :H1、H2、H3,对 3株完成序列测定 ,按照S区核苷酸顺序划分基因型分别为B、C、D ,全序列分型显示H1、H2为B、C基因型 ,与按S区的分型一致 ,但H3为C基因型 ,与按S区的分型不同 ,进一步的序列分析表明H3为一株异常的基因型 ,按照S区和preS2区分型为D基因型 ,但是全基因组 C P X区的进化树分析 ,H3株均位于C基因型 ,提示该异常的基因型可能是由于D C基因型间基因重组引起 ,对重组位点进行了分析 :3181nt～ 10nt、799～ 834nt为可能的重组位点所在区。结论 H3病毒株的发现进一步证明了HBV基因型间的基因重组 ,但澄清该问题需要在HBV感染的高流行区进一步的积累HBV异常基因型的全序列 ,以及发现新的基因型资料。