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D-Tyr-tRNA^(Tyr) Deacylase,a New Role in Alzheimer's-associated Disease in SAMP8 Mice 被引量:2
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作者 wei Liu Chang Liu +4 位作者 Jing-xi Zhu Ai-hua Li Zhi-qiang Zhao Bin Yin Xiao-zhong Peng 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2010年第2期90-94,共5页
Objective To assess the expression level of D-Tyr-tRNATyr deacylase(DTD) in SAMP8 mice and speculate the function of DTD in disorders associated with Alzheimer's disease(AD).Methods Altogether 12 SAMP8 mice and 12... Objective To assess the expression level of D-Tyr-tRNATyr deacylase(DTD) in SAMP8 mice and speculate the function of DTD in disorders associated with Alzheimer's disease(AD).Methods Altogether 12 SAMP8 mice and 12 SAMR1 mice were used in this study.Semi-quantita-tive reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR) and Western blot were performed to detect the mRNA and protein levels of DTD in the mice.Purified DTD protein was injected into lateral ventricle to investigate the function of DTD in SAMP mice.The behavior of the mice was tested by using a Step-through Test System.Results Both mRNA and protein levels of DTD were found to be significantly lower in SAMP8 mice compared with those in SAMR1 mice(P<0.05).In vivo injection of DTD protein did not lead to an obvious change in behavior of SAM mice.Conclusions DTD might function in the process of AD-associated pathology and could possibly participate in physiology process in a long-term manner to orchestrate with other regulators in order to maintain the balance of organism. 展开更多
关键词 d-tyr-trna^Tyr deacylase D-amino acid SAMP8 mice neurodegenerative disease
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Structural Characterization of the D-Tyr-tRNA<sup>Tyr</sup>Deacylase from <i>Bacillus lichenformis</i>, an Organism of Great Industrial Importance
2
作者 Angshuman Bagchi 《Computational Molecular Bioscience》 2011年第1期1-6,共6页
A new class of enzyme was established that hydrolyze the ester bond between D-Tyr bound onto its cognate t-RNA. The enzyme is called D-Tyr-tRNA deacylase. The three dimensional structure of the D-Tyr-tRNA deacylase fr... A new class of enzyme was established that hydrolyze the ester bond between D-Tyr bound onto its cognate t-RNA. The enzyme is called D-Tyr-tRNA deacylase. The three dimensional structure of the D-Tyr-tRNA deacylase from industrially important microorganism Bacillus lichenformis DSM13 was predicted by comparative modeling approach. Since the protein acts as a dimer a dimeric model of the enzyme was constructed. The interactions responsible for dimerization were also predicted. With the help of docking and molecular dynamics simulations the favourable binding mode of the enzyme was predicted. The probable biochemical mechanism of the hydrolysis process was elucidated. This study provides a rational framework to interpret the molecular mechanistic details of the removal of toxic D-Tyr-tRNA from the cells of industrially important microorganism Bacillus lichenformis DSM13 using the enzyme D-Tyr-tRNA deacylase. 展开更多
关键词 MOLECULAR Modeling MOLECULAR Docking MOLECULAR Dynamics Industrially Important Microorganism Ester Hydrolysis d-tyr-trna deacylase
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新来源棘白霉素B脱酰基酶产生菌的筛选和转化条件优化 被引量:4
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作者 丁彦博 可爱兵 +8 位作者 蔡超靖 穆云龙 单越琦 李业英 石英 崔晓兰 徐岩 朱京童 路新华 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期449-454,共6页
目的筛选放线菌来源的棘白霉素B脱酰基酶产生菌,并对其转化条件进行优化。方法根据菌株转化产物对白念珠菌的抑制活性进行初筛,再以HPLC、LC-MS检测确定目的菌株;对目的菌株转化棘白霉素B的培养基、转化温度和时间、缓冲液、甲醇含量等... 目的筛选放线菌来源的棘白霉素B脱酰基酶产生菌,并对其转化条件进行优化。方法根据菌株转化产物对白念珠菌的抑制活性进行初筛,再以HPLC、LC-MS检测确定目的菌株;对目的菌株转化棘白霉素B的培养基、转化温度和时间、缓冲液、甲醇含量等条件进行优化以提高转化率。结果筛选得到4株可产生脱酰基酶的阳性菌株,其中,N07W-.61为小单孢菌属菌株,其余3株为链霉菌属菌株;通过转化条件优化,菌株N07W-61对棘白霉素B的转化率从2.60%提高至61.24%。结论小单孢菌属菌株产生棘白霉素B脱酰基酶为首次报道;该属菌株N07W-61在优化转化条件下对棘白霉素B的转化率有了大幅提高。 展开更多
关键词 小单孢菌属 棘白霉素B 脱酰基酶 转化 优化
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皮肤屏障结构脂质研究进展-脂质代谢相关酶 被引量:2
4
作者 崔乐 高莹 +4 位作者 张高磊 贾焱 李靖怡 成志伟 何聪芬 《中国皮肤性病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期964-967,共4页
角质层细胞间脂质做为构成皮肤屏障的主要结构脂质成分,其含量的降低或结构的改变均会影响皮肤屏障功能的稳定。脂质代谢相关酶在脂质的合成、水解和分泌中起到了重要作用。本文综述了多种与脂质代谢相关的酶,如激肽释放酶(kallikreins,... 角质层细胞间脂质做为构成皮肤屏障的主要结构脂质成分,其含量的降低或结构的改变均会影响皮肤屏障功能的稳定。脂质代谢相关酶在脂质的合成、水解和分泌中起到了重要作用。本文综述了多种与脂质代谢相关的酶,如激肽释放酶(kallikreins,KLKs)、脂肪酸延长酶(elongation of very long chain fatty acids,ELOVL)、β-葡糖脑苷脂酶(β-glucocerebrosidase,GCase)、酸性鞘磷脂酶(acidic sphingomyelinase,aSMase)、鞘磷脂脱酰酶等,同时也对酶与皮肤屏障之间的密切关系进行了阐述,以期为开发针对维护和修复皮肤屏障功能的护肤产品和洗涤用品等提供理论基础。 展开更多
关键词 皮肤屏障 脂质 激肽释放酶 脂肪酸延长酶 酸性鞘磷脂酶 鞘磷脂脱酰酶
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棘白菌素B脱酰基酶工程菌的构建及酶学性质研究 被引量:3
5
作者 邹树平 廖思行 +2 位作者 牛坤 郑裕国 沈寅初 《浙江工业大学学报》 CAS 北大核心 2016年第1期99-103,共5页
棘白菌素B(ECB)脱酰基酶能选择性催化水解脱去ECB酰基侧链,得到ECB母核,可用于合成新型抗真菌药物阿尼芬净.从实验室保藏的犹他游动放线菌(Actinoplanes utahensis)ZJB-0801基因组中克隆到ECB脱酰基酶基因,并将其构建入表达质粒pSET152... 棘白菌素B(ECB)脱酰基酶能选择性催化水解脱去ECB酰基侧链,得到ECB母核,可用于合成新型抗真菌药物阿尼芬净.从实验室保藏的犹他游动放线菌(Actinoplanes utahensis)ZJB-0801基因组中克隆到ECB脱酰基酶基因,并将其构建入表达质粒pSET152,通过接合转移的方法将表达质粒导入到天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)A3中,构建可以高效表达ECB脱酰基酶的工程菌.对重组ECB脱酰基酶的酶学性质进行了考察,结果表明:重组酶的最适反应温度为45℃,最适pH为7.5.Zn^(2+),Mg^(2+),Mn^(2+),Fe^(2+)对重组酶有显著的激活作用,而Cu^(2+),Co^(2+)具有显著地抑制作用.动力学参数分析表明:该酶对底物ECB的K_m和V_(max)分别为0.356mmol/L和397μmol/(min·mg). 展开更多
关键词 棘白菌素B脱酰基酶 天蓝色链霉菌 重组表达 酶学性质
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棘白霉素B脱酰基酶产生菌N07W61的分类鉴定 被引量:1
6
作者 穆云龙 丁彦博 +4 位作者 蔡超靖 单越琦 可爱兵 路新华 孟雅娟 《河北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第6期622-627,共6页
菌株N07W61是由前期筛选获得的具有棘白霉素B脱酰基酶活性的菌株.通过形态特征、培养特征观察、生理生化特征、胞壁分析及16SrDNA基因序列同源性分析等多相分类研究对该菌株进行了鉴定,结果表明N07W61属于小单孢菌属(Micromonospora).
关键词 棘白霉素B 脱酰基酶 鉴定 小单孢菌属
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固定化酶解法合成7-ACA的方法研究 被引量:1
7
作者 张宏 王艳戎 罗兰 《化学试剂》 CAS 北大核心 2019年第2期194-198,共5页
天然类头孢菌素C通过化学法或酶解法可制得半合成头孢菌素的重要母核7-氨基头孢烷酸(7-ACA)。主要研究头孢菌素C在自制固定化CA-Co-Fe/KIT-6催化下,通过一步裂解制备7-ACA的方法,先自行合成负载Co-Fe活性组分的KIT-6载体,再将头孢菌素... 天然类头孢菌素C通过化学法或酶解法可制得半合成头孢菌素的重要母核7-氨基头孢烷酸(7-ACA)。主要研究头孢菌素C在自制固定化CA-Co-Fe/KIT-6催化下,通过一步裂解制备7-ACA的方法,先自行合成负载Co-Fe活性组分的KIT-6载体,再将头孢菌素脱酰酶(CA)通过物理吸附固定在Co-Fe/KIT-6上。经过正交实验,优化了7-ACA的制备条件:温度28℃,p H 8. 0,底物浓度4%,固定化CA酶用量0. 3 g,时间40 min,反应液中7-ACA浓度93. 5%,收率84. 3%。第5次使用经离心回收的固定化CA-Co-Fe/KIT-6,其相对酶活性为87. 6%,7-ACA收率为78. 4%。 展开更多
关键词 头孢菌素C 头孢菌素脱酰酶 7-ACA
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棘白霉素B脱酰基酶产生菌转化条件的优化研究 被引量:1
8
作者 关亚鹏 娄忻 +2 位作者 张莉 刘靓 佟杰 《化学与生物工程》 CAS 2014年第7期50-52,共3页
为提高棘白霉素B脱酰基酶产生菌的转化率,通过紫外诱变复合Cu2+抗性处理筛选转化高产菌种,利用均匀设计方法优化菌种的转化工艺。结果表明,筛选得到的突变株132#的棘白霉素B转化率比出发菌株提高了22.6%,优化后的转化条件为:底物浓度2 ... 为提高棘白霉素B脱酰基酶产生菌的转化率,通过紫外诱变复合Cu2+抗性处理筛选转化高产菌种,利用均匀设计方法优化菌种的转化工艺。结果表明,筛选得到的突变株132#的棘白霉素B转化率比出发菌株提高了22.6%,优化后的转化条件为:底物浓度2 400μg·mL-1,转化时间56h,转化温度30℃,发酵培养基pH值6.0。132#菌株在优化转化条件下的转化率较出发菌株在原始转化条件下提高了57.3%。优化的转化条件更有利于高产菌株的转化,转化率得到大幅提高,也为其工业化应用打下基础。 展开更多
关键词 脱酰基酶产生菌 诱变 均匀设计法 转化条件
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棘白霉素B脱酰基酶高产菌株的选育及转化条件优化
9
作者 郄丽萍 王小连 +3 位作者 马婕 钱思宇 代明伟 张炜 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第6期696-700,共5页
目的为提高棘白霉素B脱酰基酶产生菌的转化率。方法采用常压室温等离子体诱变复合链霉素抗性筛选转化高产菌株;对新菌株转化棘白霉素B的底物溶剂、转化温度和转化时间等条件进行优化。结果获得稳定突变株ZH-6-78比出发菌的转化率提高了2... 目的为提高棘白霉素B脱酰基酶产生菌的转化率。方法采用常压室温等离子体诱变复合链霉素抗性筛选转化高产菌株;对新菌株转化棘白霉素B的底物溶剂、转化温度和转化时间等条件进行优化。结果获得稳定突变株ZH-6-78比出发菌的转化率提高了26.7%;优化后转化条件为:转化温度35℃,转化时间24h。结论高产菌种在优化的转化条件下,转化率达到90%,比出发菌原工艺提高了50.0%,为工业化生产奠定基础。 展开更多
关键词 棘白霉素B 脱酰基酶 转化 优化
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棘白霉素类化合物脱酰基酶产生菌的转化工艺研究
10
作者 刘靓 娄忻 +1 位作者 张莉 关亚鹏 《化学与生物工程》 CAS 2012年第2期84-86,共3页
对棘白霉素类化合物脱酰基酶产生菌ZH-020的转化工艺进行了研究。确定最佳转化条件为:底物浓度1200 mg.L-1、转化时间24 h、转化温度30℃;通过均匀设计实验确定优化的发酵培养基配方为:花生饼粉2.5%、葡萄糖1.3%、蔗糖1.0%、磷酸二氢钾0... 对棘白霉素类化合物脱酰基酶产生菌ZH-020的转化工艺进行了研究。确定最佳转化条件为:底物浓度1200 mg.L-1、转化时间24 h、转化温度30℃;通过均匀设计实验确定优化的发酵培养基配方为:花生饼粉2.5%、葡萄糖1.3%、蔗糖1.0%、磷酸二氢钾0.1%、无水硫酸镁0.05%;在优化条件下,转化率比对照提高了33.29%。 展开更多
关键词 脱酰基酶 转化率 均匀设计 优化
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酰胺水解酶基因工程菌的构建及其对棘白菌素B的转化 被引量:2
11
作者 常青 邵雷 +2 位作者 李继安 倪兵 陈代杰 《工业微生物》 CAS CSCD 2011年第2期11-15,共5页
棘白菌素B_0(ECB)去侧链母核为重要抗真菌药物阿尼芬净的半合成前体。本实验室从保存的犹他游动放线菌(Actinoplanes utahensis)SIPI-A.2001基因组中克隆到ECB酰胺水解酶及其上下游基因,并将其构建入表达质粒pTGV2,通过接合转移的方法... 棘白菌素B_0(ECB)去侧链母核为重要抗真菌药物阿尼芬净的半合成前体。本实验室从保存的犹他游动放线菌(Actinoplanes utahensis)SIPI-A.2001基因组中克隆到ECB酰胺水解酶及其上下游基因,并将其构建入表达质粒pTGV2,通过接合转移的方法将此表达质粒导入到变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)TK24中,构建可以水解ECB底物生成其母核的基因工程菌,静息细胞转化法生成ECB母核。HPLC检测表明,构建的基因工程菌可以有效水解ECB侧链,转化率达53.2%。 展开更多
关键词 ECB酰胺水解酶 阿尼芬净 微生物转化
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达托霉素前体脱酰酶产生菌的筛选 被引量:1
12
作者 崔金城 武雪光 +2 位作者 罗敏玉 洪文荣 陈代杰 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期95-98,共4页
筛选得到一株对达托霉素前体具有脱酰基转化作用的游动放线菌(Actinoplanes sp.HCCB10085),经试验得到其产生脱酰基酶的最佳培养条件为pH7.0、28℃培养60~90h;菌体对达托霉素前体的最佳转化条件为pH7.0、35℃。
关键词 达托霉素前体 脱酰基酶 微生物转化
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棘白菌素B脱酰基酶的研究 被引量:2
13
作者 崔建卫 邹树平 郑裕国 《生物技术通讯》 CAS 2016年第4期592-595,共4页
棘白菌素B脱酰基酶是合成阿尼芬净重要中间产物棘白菌素B母核的关键酶。本文综述了近年来国内外学者对该酶的成熟机制、酶学性质、重组表达及生物催化应用等方面的相关研究进展。
关键词 棘白菌素B脱酰基酶 重组表达 生物催化
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一株链霉菌菌株NCPC-1020中棘白霉素B脱酰基酶基因的克隆与功能分析 被引量:1
14
作者 徐冬梅 可爱兵 +2 位作者 路新华 陈文青 邓子新 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1564-1573,共10页
【目的】从一株土壤放线菌来源的野生型链霉菌菌株NCPC-1020中克隆一个具有棘白霉素B脱酰基酶活性的新基因。【方法】采用Degenerate和TAIL PCR两种方法,从链霉菌菌株NCPC-1020基因组中快速克隆获得了该基因序列,然后将基因在变铅青链霉... 【目的】从一株土壤放线菌来源的野生型链霉菌菌株NCPC-1020中克隆一个具有棘白霉素B脱酰基酶活性的新基因。【方法】采用Degenerate和TAIL PCR两种方法,从链霉菌菌株NCPC-1020基因组中快速克隆获得了该基因序列,然后将基因在变铅青链霉菌TK24中进行异源表达,并进行全细胞催化底物脱酰基反应,采用LC-MS检测反应产物。【结果】LC-MS检测证实,棘白霉素B结构中脂肪链被酶促水解,从而证实该基因具有脱酰基酶活性。【结论】采用Degenerate以及TAIL PCR的方法能够快速获得未知功能的新基因。此基因的克隆,奠定了进行半合成棘白霉素类药物的研发基础。 展开更多
关键词 链霉菌 棘白霉素B Degenerate PCR TAIL PCR 脱酰基酶
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犹他游动放线菌中酰胺水解酶基因拷贝数增加对转化棘白菌素B效率的影响
15
作者 刘爱娟 常青 +4 位作者 李继安 卢亮 陈代杰 苏敏 邵雷 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期17-20,47,共5页
目的:利用ΦC31整合酶介导的位点特异性重组方法,构建棘白菌素B酰胺水解酶基因拷贝数增加的犹他游动放线菌重组菌株。方法:构建含有棘白菌素B酰胺水解酶基因的基因整合型质粒pYGCQ-03-13,通过属间接合转移的方法将该基因片段转入犹他游... 目的:利用ΦC31整合酶介导的位点特异性重组方法,构建棘白菌素B酰胺水解酶基因拷贝数增加的犹他游动放线菌重组菌株。方法:构建含有棘白菌素B酰胺水解酶基因的基因整合型质粒pYGCQ-03-13,通过属间接合转移的方法将该基因片段转入犹他游动放线菌SIPI-T2001中;利用静息细胞转化法,考察其对转化效率的影响。结果:筛选得到的阳性重组菌株SIPI-GE.T2001,对棘白菌素B的转化效率最高达到61.7%。结论:增加棘白菌素B酰胺水解酶基因拷贝数,有效地提高了犹他游动放线菌对棘白菌素B的转化效率。 展开更多
关键词 棘白菌素 酰胺水解酶 犹他游动放线菌 生物转化 基因重组
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EchinocandinB微生物转化工艺优化 被引量:3
16
作者 尹腾飞 陈少欣 《中国医药工业杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期333-336,共4页
犹他游动放线菌产生的酰基水解酶可以将echinocandin B(ECB)水解脱去酰基侧链得到ECB母核,用于化学合成抗真菌药阿尼芬净。本研究考察并优化了犹他游动放线菌产酶的发酵培养基组分和ECB转化反应体系的有机溶剂、底物浓度,建立了ECB的微... 犹他游动放线菌产生的酰基水解酶可以将echinocandin B(ECB)水解脱去酰基侧链得到ECB母核,用于化学合成抗真菌药阿尼芬净。本研究考察并优化了犹他游动放线菌产酶的发酵培养基组分和ECB转化反应体系的有机溶剂、底物浓度,建立了ECB的微生物转化工艺。结果表明,在含麦芽糖30 g/L和麦芽浸粉20 g/L的发酵培养基中,犹他游动放线菌发酵培养72 h后,加入终浓度为2.55 g/L的ECB和7.5%甲醇,转化18 h,ECB的转化率为97.8%。进一步在5 L发酵罐中进行发酵培养和微生物转化,结果表明该微生物转化工艺可用于制备ECB母核。 展开更多
关键词 ECHINOCANDIN B ECHINOCANDIN B母核 犹他游动放线菌 酰基水解酶 微生物转化
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D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶的研究进展
17
作者 张晓刚 刘楠 《药物生物技术》 CAS 2018年第4期372-376,共5页
D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶广泛存在于细菌、真核生物、古生菌等多种生物体中,其主要功能是水解D-氨酰-tRNA成游离的D-氨基酸和tRNA,避免D-氨基酸对生物体的毒性,对于不同生物体的生长均有重要作用。D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶在不同生物中序列... D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶广泛存在于细菌、真核生物、古生菌等多种生物体中,其主要功能是水解D-氨酰-tRNA成游离的D-氨基酸和tRNA,避免D-氨基酸对生物体的毒性,对于不同生物体的生长均有重要作用。D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶在不同生物中序列高度保守,使得其水解功能具有一致性及稳定性。D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶利用自身的Gly-cis Pro二肽模块识别并排除L-氨基酸,捕获D-氨酰-tRNA,并通过亲核催化反应水解底物产生游离的产物,具有底物选择性。随着近年来研究的深入,科学家研究发现D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶具有抑制生物膜分解、增加对乙醇的抗性等特殊功能。文章从D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶的种类、晶体结构、催化机制、功能及其应用等方面进行了综述,并在此基础上对D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶的应用及功能进行了展望。 展开更多
关键词 D-酪氨酰-tRNA脱酰基酶 机制 结构 D-氨基酸 阿尔兹海默症 热激反应 药物靶点
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