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基于线粒体DNA D-loop序列分析刀鲚与短颌鲚的遗传多样性
被引量:
6
1
作者
张燕萍
贺刚
+4 位作者
王生
吴斌
周辉明
傅培峰
方春林
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第20期59-64,共6页
以线粒体DNA D-loop全序列为分子标记,研究4个刀鲚群体(长江口刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚、鄱阳湖湖区刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚幼鱼)及鄱阳湖短颌鲚群体的遗传多样性。结果显示:刀鲚的D-loop序列长1 212~1 293 bp,短颌鲚的序列长1 210~1 252 bp;...
以线粒体DNA D-loop全序列为分子标记,研究4个刀鲚群体(长江口刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚、鄱阳湖湖区刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚幼鱼)及鄱阳湖短颌鲚群体的遗传多样性。结果显示:刀鲚的D-loop序列长1 212~1 293 bp,短颌鲚的序列长1 210~1 252 bp;在5个群体的55尾个体中,共检测到变异位点72个,其中单一多态位点50个,简约信息位点22个;共检测到45个不同的单倍型,单倍型多态性为0.989,核苷酸多样性为0.009 1,平均核苷酸差异数(K)为10.079。5个群体的遗传多样性丰富程度排序为鄱阳湖刀鲚幼鱼>鄱阳湖湖口刀鲚>鄱阳湖短颌鲚>鄱阳湖刀鲚>长江口刀鲚;不同单倍型间的遗传距离为0.014~0.728,平均遗传距离为0.188。此外,系统发育树也表明,刀鲚、短颌鲚共同构成1个单系群,为2种生态型种群,尚未达到种或亚种的分化。
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关键词
刀鲚
短颌鲚
线粒体DNA
d-lop
序列
遗传多样性
遗传结构差异
下载PDF
职称材料
基于D-loop和Cyt b序列的大海马遗传变异分析
被引量:
1
2
作者
袁吉贵
罗杰
+2 位作者
刘丽
张艳苹
梁万宁
《安徽农业科学》
CAS
2017年第36期140-142,235,共4页
[目的]对大海马D-loop和Cyt b序列进行遗传变异分析。[方法]基于D-loop和Cyt b部分序列对东山岛(20尾)和泉州市(20尾)养殖场大海马进行遗传变异分析。[结果]获得的D-loop和Cyt b序列分别为707~709 bp和404 bp,且2种序列在2个大海马群体...
[目的]对大海马D-loop和Cyt b序列进行遗传变异分析。[方法]基于D-loop和Cyt b部分序列对东山岛(20尾)和泉州市(20尾)养殖场大海马进行遗传变异分析。[结果]获得的D-loop和Cyt b序列分别为707~709 bp和404 bp,且2种序列在2个大海马群体之间极其保守。D-loop和Cyt b序列G+C含量明显低于A+T含量,C含量也低于G含量,Cyt b序列第3位密码子G含量最少。东山岛和泉州市的大海马(各20条)D-loop序列的平均核苷酸差异数分别为0.489和0.958,且分别定义了3种和6种单倍型,东山岛和泉州市的大海马(各20条)Cyt b序列在2个群体之间相似度为100%,只定义了1种单倍型。[结论]研究表明D-loop和Cyt b序列在2个大海马群体中变异较小。
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关键词
遗传变异
大海马
d-lop
CYTB
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职称材料
题名
基于线粒体DNA D-loop序列分析刀鲚与短颌鲚的遗传多样性
被引量:
6
1
作者
张燕萍
贺刚
王生
吴斌
周辉明
傅培峰
方春林
机构
江西省水产科学研究所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2017年第20期59-64,共6页
基金
赣鄱英才555工程刀鲚调查专项基金(编号:赣财教指[2012]213号)
江西省科技计划(编号:20141BBF60036)
文摘
以线粒体DNA D-loop全序列为分子标记,研究4个刀鲚群体(长江口刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚、鄱阳湖湖区刀鲚、鄱阳湖湖口刀鲚幼鱼)及鄱阳湖短颌鲚群体的遗传多样性。结果显示:刀鲚的D-loop序列长1 212~1 293 bp,短颌鲚的序列长1 210~1 252 bp;在5个群体的55尾个体中,共检测到变异位点72个,其中单一多态位点50个,简约信息位点22个;共检测到45个不同的单倍型,单倍型多态性为0.989,核苷酸多样性为0.009 1,平均核苷酸差异数(K)为10.079。5个群体的遗传多样性丰富程度排序为鄱阳湖刀鲚幼鱼>鄱阳湖湖口刀鲚>鄱阳湖短颌鲚>鄱阳湖刀鲚>长江口刀鲚;不同单倍型间的遗传距离为0.014~0.728,平均遗传距离为0.188。此外,系统发育树也表明,刀鲚、短颌鲚共同构成1个单系群,为2种生态型种群,尚未达到种或亚种的分化。
关键词
刀鲚
短颌鲚
线粒体DNA
d-lop
序列
遗传多样性
遗传结构差异
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
基于D-loop和Cyt b序列的大海马遗传变异分析
被引量:
1
2
作者
袁吉贵
罗杰
刘丽
张艳苹
梁万宁
机构
广东海洋大学水产学院
湛江溢鑫源水产科技有限公司
出处
《安徽农业科学》
CAS
2017年第36期140-142,235,共4页
基金
广东省科技计划项目(2014A020208124)
文摘
[目的]对大海马D-loop和Cyt b序列进行遗传变异分析。[方法]基于D-loop和Cyt b部分序列对东山岛(20尾)和泉州市(20尾)养殖场大海马进行遗传变异分析。[结果]获得的D-loop和Cyt b序列分别为707~709 bp和404 bp,且2种序列在2个大海马群体之间极其保守。D-loop和Cyt b序列G+C含量明显低于A+T含量,C含量也低于G含量,Cyt b序列第3位密码子G含量最少。东山岛和泉州市的大海马(各20条)D-loop序列的平均核苷酸差异数分别为0.489和0.958,且分别定义了3种和6种单倍型,东山岛和泉州市的大海马(各20条)Cyt b序列在2个群体之间相似度为100%,只定义了1种单倍型。[结论]研究表明D-loop和Cyt b序列在2个大海马群体中变异较小。
关键词
遗传变异
大海马
d-lop
CYTB
Keywords
Genetic variation
Hippocampus kwda
D-loop
Cyt 6
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体DNA D-loop序列分析刀鲚与短颌鲚的遗传多样性
张燕萍
贺刚
王生
吴斌
周辉明
傅培峰
方春林
《江苏农业科学》
北大核心
2017
6
下载PDF
职称材料
2
基于D-loop和Cyt b序列的大海马遗传变异分析
袁吉贵
罗杰
刘丽
张艳苹
梁万宁
《安徽农业科学》
CAS
2017
1
下载PDF
职称材料
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引证文献
统计分析
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