D18S51基因座等位基因侧翼序列四碱基缺失3例

3例无关人员口腔拭子经DNA提取后采用AGCU EX20、AGCU EX30、VeriFiler Plus和PowerPlex?21四种试剂盒检测,同一样本在D18S51基因座获得了相差1个重复单元的两种等位基因分型。本文利用Sanger测序法分别对上述3例人员样本的D18S51基因座及上下游区域进行检测。经序列比对,发现3个样本的基因组中D18S51基因座下游chr18:63281892-63281895位置均存在[GTTT]的四碱基缺失。建议针对D18S51基因座设计引物时,应选择在上述碱基缺失位置上游区域进行。

广东汉族人群D18S51基因座等位基因分型现象分析

目的分析广东汉族人群D18S51基因座等位基因的特殊分型现象。方法采用Chelex-100法提取DNA,采用Powerplex■21体系对广东汉族9 419例研究对象进行PCR复合扩增,采用毛细管电泳分析STR基因座的等位基因分型,采用Identifiler^(TM)体系验证其特殊分型。结果发现D18S51基因座存在三带型等位基因和off-ladder(OL)等位基因2种特殊分型,基因型频率分别为0.010 6%和0.021 2%。OL等位基因命名为28,由母亲遗传给孩子。不同检测体系证实了特殊分型发生的真实性。结论对于STR基因座的特殊分型,应采用不同试剂盒验证,正确命名OL等位基因及计算三带型等位基因的亲权指数。

基因突变导致D18S51等位基因检测缺失1例

目的鉴定刘某及其子之间的亲缘关系。方法被鉴定人血斑用Chelex-100法提取DNA,用Goldeneye-20A试剂盒(基点认知技术(北京)有限公司)、Sinofiler试剂盒(美国ABI公司)进行扩增,在3130基因分析仪(美国ABI公司)上进行基因检测。结果Goldeneye-20A试剂盒分析19个基因座(CSF1PO、D12S391、D13S317、D16S539、D19S433、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、FGA、vWA、D18S51、TH01、TPOX、Penta D、Penta E),结果显示D18S51基因座刘某为纯合子16,儿子为纯合子13,其余18个基因座都符合遗传。

河南汉族群体D18S51基因座的遗传多态性研究

目的 研究人类短串联重复序列D18S5 1在河南汉族人群中的遗传多态性 ,并探讨该基因座在法医学和基因诊断中的应用可能性。方法 采集河南无血缘关系汉族个体血样 ,应用Chelex法提取DNA ,聚合酶链式反应扩增 ,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分型 ,统计学计算。结果 得到D18S5 1在河南汉族群体中的基因频率 ,有 11个等位基因 ,2 9个基因型 ,杂合度为 0 84,个体识别率为 0 98,非父排除率为 0 5 8。结论 在河南汉族人群中D18S5 1基因座多态性较好 ,分布符合Hardy -Weinberg平衡 。

不同位点STR复合扩增技术在亲权鉴定及D18S51基因座分型异常中的应用

目的运用多位点STR复合扩增技术进行亲权鉴定,探讨Identifiler Plus及Goldeneye 20A试剂盒在突变性亲权鉴定或STR异常分型中的作用。方法用Identifiler Plus及Goldeneye 20A试剂盒对亲权鉴定中的样本DNA进行PCR扩增、扩增产物进行毛细管电泳,应用Gene Mapper v3.2软件基因分型,最后进行亲权关系的鉴定。结果两种试剂盒的扩增产物共同的16个STR基因座分型一致,在D18S51基因座均出现STR分型异常,从而确认D18S51基因座为异常三带型。由于本亲权鉴定中共有5个基因座不符合孟德尔遗传定律,故排除单亲遗传关系。结论 Identifiler Plus及Goldeneye 20A两种试剂盒在基因突变或STR分型异常的亲权鉴定案例中可以起到相互佐证、补充的作用。

基于Ion Torrent PGM^(TM)测序平台的CSF1PO和D18S51基因座分析

目的应用二代测序(next generation sequencing,NGS)技术对CSF1PO和D18S51基因座进行分析检测,研究CSF1PO和D18S51基因座的序列多态性。方法采集165例中国汉族无关个体外周血样,应用QIAamp DNA Mini试剂盒提取样本DNA,Ion Plus Fragment Library试剂盒构建文库,在Ion Torrent PGMTM测序平台上进行DNA序列测定,针对新发现的等位基因进行Sanger测序验证。应用Torrent SuiteTMv5.0.2和Integrative Genomics Viewer软件分析数据,进行基因型鉴定和频率统计,运用PowerState v12软件对数据进行统计学处理。结果应用NGS技术同时获得了CSF1PO和D18S51基因座长度多态性和序列多态性,在CSF1PO基因座中,发现了1个新的基因型,在D18S51基因座中,发现2个新的基因型。采用Sanger测序法对NGS技术检测新发现的等位基因进行验证,验证结果一致。结论应用二代测序技术可检测CSF1PO和D18S51基因座核心重复序列的结构,提高基因座的识别效能。

D18S51基因座等位基因丢失3例

随着STR试剂盒的应用越来越普遍,在过去几年内研究人员做了大量的引物一致性研究,使用不同STR试剂盒,在某个基因座会出现不同分型结果[1]。本鉴定所在采用GoldenEye^（TM） 20A试剂盒（由北京基点认知技术有限公司生产）和PowerPlex~？21试剂盒（由美国Promega公司生产）进行亲子鉴定过程中,发现了3个案例两种类型D18S51基因座等位基因丢失情况。

亲子鉴定中D18S51基因座等位基因丢失分析1例

1 案例资料 1.1 简要案情:某日,为办理入户需要,要求本中心对何某(父)、张某(生母)与女儿之间有无亲权关系进行鉴定.于询问详情,告知风险后,受理委托,分别采集指尖血于FTA采血卡上备检. 1.2 DNA提取:采用Chelex-100法提取样本DNA. 1.3 PCR扩增及分型:分别采用Goldeneye 20A试剂盒(北京基点认知技术有限公司)和PowerPlex21试剂盒(普洛麦格(北京)生物科技有限公司).PCR反应总体积均为10ul,9700扩增仪进行PCR复合扩增.扩增产物通过ABI 3130XL遗传分析仪进行毛细管电泳,用GeneMapper ID v3.2软件进行基因分型分析.

D18S51基因座可疑等位基因分析1例

1案例资料 1例亲权鉴定案件中，提取的DNA用AGCU Expressmarker22 STR荧光检测试剂盒（无锡中德美联生物技术有限公司）进行检测，2个样本中D18S51基因座分型结果中都出现一个越界OL等位基因，不能准确判读，该OL等位基因在Allelic Ladder（10—26）后约12bp处出现（图1）。

应用NGS确认STR检测中的OL峰案例研究

基于毛细管电泳平台的短串联重复序列(Short tandem repeats,STR)检测(Capillary electrophoresis-Polymerase chain reaction,CE-PCR)是现阶段法医DNA实验室的金标准,二代测序(Next-generation sequencing,NGS)在法医学上的应用已经初现端倪,通过NGS可以解决传统CE-STR对OL(Off-ladder)峰形成原因难以判定的问题.本文对在毛细管电泳(CE)平台的STR鉴定工作中发现的一种OL峰血样进行NGS研究,确定了此样品的OL峰为D18S51基因座稀有等位基因,该基因型因超出试剂盒Ladder范围而形成OL峰.研究结果表明,NGS对阐明OL峰形成原因具有独特的优势,相关技术将在今后法医物证鉴定中得到广泛推广和应用.