D19S433稀有等位基因8.2的分子生物学确认与分析

目的对D19S433基因座稀有等位基因8.2,用分子生物学方法,验证其命名,对突变发生的位置进行确认和分析。方法设计引物对目的基因进行扩增和测序,验证常规命名法。将测序所得序列与D19S433基因座的基础序列进行比对分析。结果Goldeneye DNA 20A和AGCU EX22亲子鉴定系统联合检测,相互比对,确定在检案中发现的分型标准物之外(Off⁃ladder,OL)的等位基因为D19S433基因座的稀有等位基因。经常规漂移校正计算该等位基因为8.2。测序后分析其重复序列确定该等位基因为8.2无误。结论对STR分型中发现的稀有等位基因进行测序,分析其重复序列,可以准确的对其进行命名,确定稀有等位基因突变的位置,丰富中国人群STR数据信息。

D19S433基因座稀有等位基因4的发现与确认

在检案过程中发现D19S433基因座有一个超出ladder最小范围的稀有基因,分别采用Identifi ler Plus及AGCU17+1试剂盒对提取产物进行扩增及电泳分析,经测序确认该等位基因为4。查询STRbase数据库,等位基因4尚未见报道,为新发现的稀有等位基因。本文对确认类似OL基因提供了参考方案。

国内首次发现及确认D1S1656基因座等位基因7鉴定1例

1案例1.1简要案情因申报北京户口,母亲王某与孩子需进行亲子鉴定。采集二人指尖血备检。1.2 DNA提取用DNA IQ^(TM)试剂盒(美国Promega公司)在工作站(美国Beckman公司NX)上提取上述两人血样DNA。1.3常规检验采用PowerPlex^(■)21 System(美国Promega公司)进行PCR复合扩增,PCR反应体系和循环参数按说明书要求。使用3130XL型遗传分析仪(美国AB公司)电泳分离扩增产物。GeneMapper ID v3.2软件进行基因座分型。

不同亲子鉴定试剂盒对D7S820基因座稀有等位基因检测结果比较

目的:观察分析用不同亲子鉴定试剂盒对D7S820基因座稀有等位基因检测结果的差异。方法:280名不同个体的血样DNA提取和基因型检测,按中华人民共和国公共安全行业标准GA/T382-2002和GA/T383-2002进行;分别用Identifiler试剂盒(美国AB公司)、PowerPlex誖18Dsystem试剂盒(美国普洛麦格公司)、GoldeneyeTM20A试剂盒(北京基点认知技术有限公司),经PCR复合扩增STR基因座,用AB公司DNA序列分析仪电泳分离扩增产物和激光扫描分析。结果:检测到280名不同个体的常用常染色体STR基因座的等位基因。其中六份样本在D7S820基因座上,Identifiler试剂盒检测的基因型与PowerPlex誖18D-system和GoldeneyeTM20A试剂盒检测的基因型结果有差异。结论:不同厂家生产的试剂盒检测常用常染色体D7S820基因座的稀有等位基因存在有一定误差。

1例D7S820基因座三带型等位基因检出报告

目的探讨华南地区人群亲子鉴定案例中三带型等位基因的频率及特点。方法采用Chelex-100法提取血液DNA,通过复合荧光PCR扩增和毛细管电泳分析2 200个案例(6 000名个体)的DNA-STR(STR:短串连重复序列)基因型。结果在2 200个案例(共6 000名个体)中共检出1例D7S820基因座三带型等位基因,位于父子单亲鉴定案例中儿子的D7S820基因座等位基因8、11和12,父亲D7S820基因座的基因分型为11和12。在本研究中,该D7S820基因座三带型等位基因的频率为1/6 000。Powerples TM16 system荧光标记复合扩增试剂盒对包含D7S820在内的16个STR基因座进行检测,儿子D7S820基因座基因分型8/11/12的电泳峰高和峰面积之比均为1∶1∶1,D7S820基因座三带型等位基因的检测结果与Indentifiler誖试剂盒检测结果相同。结论在本文发现的案例中,父亲的等位基因11和12均遗传给了儿子,导致儿子表现为三带型等位基因。三带型的等位基因在单个STR基因座中很少出现,在分析时应采用不同方法或者试剂盒进行验证,保证鉴定结果的可靠性。

落入相邻基因座范围的D13S325稀有等位基因分析

目的探讨在STRtyper-10G体系中，落入D12S391基因座范围的D13S325基因座稀有等位基因的识别及其对法医物证鉴定的影响。方法采用SinofilerTM体系和单基因座扩增体系对疑为包含落入D12S391基因座范围的D13S325稀有等位基因的家系案例进行分型验证，分离等位基因并进行DNA序列测定。结果在2618份亲子鉴定中共检出5个家系包含被误判为D12S391等位基因20的D13S325稀有等位基因，根据其DNA序列命名为5．1，等位基因频率为0．156×10-2。结论STRtyper-10G体系中D13S325的稀有等位基因5．1易被错误判读，在进行亲子鉴定、个体识别和DNA数据库比对时应引起注意。

甘肃藏族人群3个STR基因座的遗传多态性(英文)

通过Ｄ１６Ｓ５３９、Ｄ７Ｓ８２０和Ｄ１３Ｓ３１７ ３个ＳＴＲ基因座复合扩增，采用高分辨率的聚丙烯酰胺变性测序胶电泳分离，银染检测，对１２９名无关甘肃藏族个体进行遗传多态性研究。所有基因座经检验均符合Ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡。在藏族人群中，观察杂合率分别是７３.３％、８１．４％和８０．６％；ＰＩＣ值分别是０．８４、０．８０和０．８３；联合识别率是０．９９９９，联合亲子关系指数是７．０９。结果显示恢复合扩增体系在藏族人群中等位基因分布较好，适于法医个体识别及遗传学、人类学相关研究。所得数据与以前报道的汉族数据相比较，除Ｄ１６Ｓ５３９基因座外，未发现显著差异性。

广东省瑶族人群15个STR基因座的多态性调查

目的调查广东省瑶族人群无关个体 15个STR基因座 (D3S135 8、TH0 1、D2 1S11、D18S5 1、PentaE、D5S818、D13S317、D7S82 0、D16S5 39、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA)的多态性 ,研究其在法医学检验中的应用价值。方法应用PowerplexTM16荧光标记复合扩增系统对 2 2 2例广东省瑶族无关个体血样DNA进行 15个STR基因座的复合扩增 ,用ABI 310 0遗传分析仪对扩增产物进行检测 ,用GeneScan、GenoTyper软件进行基因分型 ,统计计算 15个STR基因座的群体遗传学参数。结果PowerplexTM16荧光标记系统的 15个STR基因座在广东省瑶族人群的累积偶合率为 7 5 8× 10 - 17,三联体累积非父排除率为 0 999998,二联体累积非父排除率为 0 9996 6。结论本研究 15个STR基因座可满足广东省瑶族人群法医学的个体识别及亲权鉴定的需要。

D5S818基因座稀有等位基因5的确认

1案例资料1.1案情概述本鉴定所日常检案中的一起亲子鉴定案,鉴定案件两样本均为滤纸血斑(下文代称:被检父、孩子)。1.2初次检验采用chelex-100法提取血斑样品DNA,使用MicroreaderTM21 ID System身份鉴定试剂(苏州阅微基因技术有限公司)在K960型PCR仪(杭州晶格科学仪器有限公司)上扩增。

亲缘鉴定发现D7S820基因座基因变异1例

1案例资料 1．1简要案情 全某，女，32岁，患有精神病，无性防卫能力。2010年3月2313晚，被同村喻某等人强奸，调查证实全某在近几年多次被同村几名男子强奸，且致孕生有两个女儿。分别提取全某及两个女儿（2周岁、未满周岁）、全某丈夫袁某、嫌疑人喻某、邓某、卢姓兄弟（卢甲、卢乙）的血样进行DNA检验。

贵州汉族群体D16S539、D7S820、D13S317基因座遗传多态性研究

目的 了解贵州汉族人群 D16 S5 39、D7S82 0、D13S317基因座的遗传多态性分布。方法 应用聚合酶链反应复合扩增技术 ,对 15 4名无血缘关系的汉族个体进行 D16 S5 39、D7S82 0、D13S3173个短串联重复序列 (short tandem repeats,STR)基因座等位基因频率进行了调查分析 ,并与其他汉族人群进行了比较。结果 3个 STR基因座基因频率的分布均符合 Hardy- Weinberg平衡 ,3个 STR基因座总个体识别率为 0 .996 2 ,累积多态信息量为 0 .9879,获得了贵州汉族人群这 3个位点等位基因频率数据 ,且不同地区汉族人群中的分布无明显差异。结论 所得到的等位基因频率数据可为贵州汉族人群法医个体识别、亲子鉴定及遗传学研究提供更多依据。

武汉汉族人群短串联重复序列D5S818,D7S820位点多态性研究

目的研究Ｄ５Ｓ８１８，Ｄ７Ｓ８２０的多态性及法医学应用价值。方法应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离及银染显带技术对武汉地区汉族２３２例无关个体作Ｄ５Ｓ８１８，Ｄ７Ｓ８２０位点分型调查。结果Ｄ５Ｓ８１８和Ｄ７Ｓ８２０位点分别检出８个和６个等位基因，获汉族人群基因频率分布。二位点基因型频率分布符合ＨａｒｄｙＷｅｉｎｂｅｒｇ平衡。位点杂合度分别为０８１２１和０７９３４，个人识别能力分别为０９４１６和０９２５５，非父排除率分别为０５８４２和０５８１６。结论Ｄ５Ｓ８１８和Ｄ７Ｓ８２０ＳＴＲ位点均是高杂合度、高鉴别能力的遗传标记系统。