对于未知来源个体进行族群推断的自动分析系统

建立一种基于概率算法、聚类分析和主成分分析的DNA族群推断系统(DNA Ancestry Analyzer Version1.0,简称DAA v1.0),用于对未知来源个体进行族群推断。DAA v1.0基础部分用Python语言、R语言、C语言编写;前端部分用node.js语言、HTML语言、css语言编写。DAA v1.0可对未知来源个体的族群进行推断,与已有分析方法相比,结果的一致性为100%,运算效率提升了600%。该系统可界面化、自动化地计算DNA来源人的群体匹配概率和似然比值、群体成分,绘制群体归类图,在人类遗传学、法医遗传学等领域有重要的应用价值。

族群来源推断自动分析系统的应用研究

通过祖先信息位点(AIMs,Ancestry informative markers)推断未知个体祖先来源已成为法医遗传领域的重要研究内容。由于祖先来源推断数据分析方法复杂,分析人员除了掌握Python、R等计算机语言外,还需熟练运用structure、R、Forensic Intelligence v1.0等软件才能完成数据分析。族群来源推断自动分析系统(DNA ancestry analyzer Version 1.0,以下简称DAA v1.0)的研发有效简化了族群推断数据分析和结果解读过程。本研究通过对DAA v1.0系统与传统数据分析方法在新疆兵团案件应用中的准确性和效率进行比较,发现两种分析方法在案件中的4份检材与4份对照样本推断结果的准确性均为100%,但DAA v1.0自动分析系统比传统数据分析方法简单快速,效率是传统方法的8.7倍。