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基于医学知识指南的中文DDI图数据库的构建
1
作者
张百平
《中国数字医学》
2022年第9期48-54,共7页
本研究基于药品(包括化学药、中成药、中药饮片)领域不同层次的本体概念构建了基本的药品概念图谱骨架;然后从权威医学药学知识库中抽取药物与药物间重复、拮抗和配伍3种关系构建高质量中文DDI图数据库,并以具体的用药说明书为例,详细...
本研究基于药品(包括化学药、中成药、中药饮片)领域不同层次的本体概念构建了基本的药品概念图谱骨架;然后从权威医学药学知识库中抽取药物与药物间重复、拮抗和配伍3种关系构建高质量中文DDI图数据库,并以具体的用药说明书为例,详细阐述药物匹配概念图谱及其对应DDI关系构建的全过程;最后将数据结果以图数据库的形式存储,并进行了可解释推理方面的应用探索。
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关键词
药品本体
药学知识
ddi
关系
中文图数据库
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职称材料
基于双向GRU和CNN的药物相互作用关系抽取
被引量:
3
2
作者
龚乐君
刘晓林
+1 位作者
高志宏
李华康
《陕西师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期108-113,共6页
不同药物由于药效动力学和药代动力学的差异可能会产生不可预知的副作用,甚至威胁患者的生命安全。在信息技术飞速发展及指数级生物医学文献增加的背景下,从文本中提取药物相互作用成为可能,为此本文提出一种基于双向门控循环单元(GRU)...
不同药物由于药效动力学和药代动力学的差异可能会产生不可预知的副作用,甚至威胁患者的生命安全。在信息技术飞速发展及指数级生物医学文献增加的背景下,从文本中提取药物相互作用成为可能,为此本文提出一种基于双向门控循环单元(GRU)和卷积神经网络(CNN)相融合的双层药物关系抽取模型,使用DDIExtraction2013作为数据集进行多组实验评估,实验结果获得最高75%的综合测评率;与其他方法相比较,基于双向GRU和CNN的双层模型可以有效地抽取文本中的药物相互作用关系。
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关键词
药物相互作用
生物医学关系抽取
药物关系抽取
门控循环单元
卷积神经网络
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职称材料
题名
基于医学知识指南的中文DDI图数据库的构建
1
作者
张百平
机构
广州医科大学附属第三医院信息科
出处
《中国数字医学》
2022年第9期48-54,共7页
文摘
本研究基于药品(包括化学药、中成药、中药饮片)领域不同层次的本体概念构建了基本的药品概念图谱骨架;然后从权威医学药学知识库中抽取药物与药物间重复、拮抗和配伍3种关系构建高质量中文DDI图数据库,并以具体的用药说明书为例,详细阐述药物匹配概念图谱及其对应DDI关系构建的全过程;最后将数据结果以图数据库的形式存储,并进行了可解释推理方面的应用探索。
关键词
药品本体
药学知识
ddi
关系
中文图数据库
Keywords
Drug ontology
Pharmaceutical knowledge
ddi relationship
Chinese graph database
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
R96 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
基于双向GRU和CNN的药物相互作用关系抽取
被引量:
3
2
作者
龚乐君
刘晓林
高志宏
李华康
机构
南京邮电大学计算机学院、软件学院、网络空间安全学院
江苏大数据安全与智能处理重点实验室
浙江省智慧医疗工程技术研究中心
自然资源部城市国土资源监测与仿真重点实验室
苏州派维斯信息科技有限公司
出处
《陕西师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期108-113,共6页
基金
浙江省智慧医疗工程技术研究中心资助项目(2016E10011)
苏州市姑苏科技创业天使计划项目(CYTS2018233)
南京邮电大学引进人才科研启动基金(NY217136)。
文摘
不同药物由于药效动力学和药代动力学的差异可能会产生不可预知的副作用,甚至威胁患者的生命安全。在信息技术飞速发展及指数级生物医学文献增加的背景下,从文本中提取药物相互作用成为可能,为此本文提出一种基于双向门控循环单元(GRU)和卷积神经网络(CNN)相融合的双层药物关系抽取模型,使用DDIExtraction2013作为数据集进行多组实验评估,实验结果获得最高75%的综合测评率;与其他方法相比较,基于双向GRU和CNN的双层模型可以有效地抽取文本中的药物相互作用关系。
关键词
药物相互作用
生物医学关系抽取
药物关系抽取
门控循环单元
卷积神经网络
Keywords
drug-drug interaction(
ddi
)
biomedical
relationship
extraction
drug
relationship
extraction
GRU
CNN
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于医学知识指南的中文DDI图数据库的构建
张百平
《中国数字医学》
2022
0
下载PDF
职称材料
2
基于双向GRU和CNN的药物相互作用关系抽取
龚乐君
刘晓林
高志宏
李华康
《陕西师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
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导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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