荧光原位杂交检测MDM2和DDIT3基因信号改变在诊断脂肪肉瘤中的价值

目的:探讨荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)法检测MDM2和DDIT3基因在各亚型脂肪肉瘤的临床诊断价值。方法:回顾性分析北京大学第一医院病理科2015年1月至2019年12月诊断的62例脂肪肉瘤的临床病理学特征,所有病例进行了MDM2基因扩增FISH检测,其中48例进行了DDIT3基因断裂FISH检测,观察MDM2和DDIT3基因信号改变模式,并综合临床病理学特征确诊不同亚型脂肪肉瘤。结果:62例患者以男性多见(男∶女=1.75∶1),中位年龄59(31~89)岁。脂肪肉瘤组织学亚型包括20例非典型脂肪瘤性肿瘤/高分化脂肪肉瘤(atypical lipomatous tumour/well differentiated liposarcoma,ALT/WDLPS)、26例去分化脂肪肉瘤(dedifferentiated liposarcoma,DDLPS)、13例黏液样脂肪肉瘤(myxoid liposarcoma,MLPS)和3例多形性脂肪肉瘤(pleomorphic liposarcoma,PLPS),其中23例(23/26)DDLPS和8例(8/20)WDLPS位于腹膜后,而MLPS和PLPS则均不位于腹膜后。肿瘤发生部位在不同亚型脂肪肉瘤间的差异具有统计学意义(P<0.05)。组织形态学上,各亚型脂肪肉瘤均可见多少不等的黏液样间质,且差别具有统计学意义(P<0.05)。MDM2基因扩增见于所有ALT/WDLPS和DDLPS(均为100%,20/20及26/26);DDIT3分离探针典型信号表现为基因断裂/易位,仅见于MLPS(100%,13/13),但值得注意的是,该探针还可出现非典型信号(端粒侧信号簇状扩增),比较常见,包括绝大多数DDLPS(96.2%,25/26)和ALT/WDLPS(83.3%,5/6,探针只随机检测6例)。对照分析探针说明书上的设计图,DDIT3分离探针之红绿色探针并未覆盖DDIT3基因本身,而是跨越了DDIT3基因,且探针端粒侧红色探针覆盖了CDK4基因,而DDIT3基因与CDK4基因距离很近,因此,当DDIT3分离探针端粒侧出现簇状扩增信号,提示CDK4基因扩增而非DDIT3基因断裂。随机挑选10例出现这种非典型信号的病例,以FISH法进一步应用CDK4和DDIT3计数探针进行验证,证实为CDK4基因扩增(100%,10/10),其中2例同时检测到DDIT3基因扩增(20%,2/10);DDIT3分离探针还存在另一种少见的非典型信号,即基因拷贝数增加(黄色融合信号数目≥3个),对应形态学表现为多形性和预后差,见于1例DDLPS和2例PLPS。结论:利用FISH技术观察MDM2和DDIT3基因信号改变模式时,需要注意对非典型信号做出正确判读,并结合患者的临床病理学特征,才能对不同亚型脂肪肉瘤做出正确诊断,进一步指导临床治疗。

DDIT3在甲状腺滤泡型良恶性肿瘤中的表达及意义

目的探讨DDIT3在甲状腺良恶性滤泡型肿瘤中的表达及意义。方法采用免疫组化Envi-sion法检测24例滤泡性腺瘤、44例滤泡癌中DDIT3的表达情况。结果DDIT3在甲状腺滤泡性腺瘤、滤泡癌中的表达率分别为20.8%和93.2%,两者比较差异有统计学意义(P<0.001)。同时观察10例甲状腺滤泡癌癌旁组织,DDIT3不表达或表达甚少。结论DDIT3可作为鉴别甲状腺滤泡癌和滤泡性腺瘤的一个较有价值的指标。

甲状腺癌DDIT3 mRNA表达及意义

目的探讨DNA损伤诱导转移因子3(DDIT3)mRNA在甲状腺癌中的表达及意义。方法采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测40例甲状腺病变组织中DDIT3mRNA的表达,并与甲状腺良性病变组相比较。结果DDIT3mRNA在甲状腺癌中的表达显著高于良性病变组(P<0.01),滤泡癌组与滤泡性腺瘤组相比差异有显著性(P<0.01),同时观察5例甲状腺癌癌旁组织,DDIT3不表达。结论DDIT3mRNA在甲状腺癌中表达明显增强,可能参与甲状腺癌的发生发展。

牦牛 DDIT3 基因克隆及组织表达特性分析

旨在探究DNA损伤诱导转录本3(DDIT3)基因序列特征及其在母牦牛组织表达特性。以母牦牛为研究对象,利用RT-PCR技术克隆牦牛DDIT3基因,利用生物信息学软件分析DDIT3蛋白的结构和功能,并利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测DDIT3基因在牦牛不同组织及不同生理阶段的生殖器官和卵母细胞中的表达特征。结果显示:牦牛DDIT3基因CDS区全长507 bp,共编码168个氨基酸;核苷酸序列比对发现,牦牛与野牛同源性最高,为99.71%,与其他物种的同源性均在88%以上,说明DDIT3基因在进化过程中表现出高度保守性;牦牛DDIT3基因在卵巢中的表达量极显著高于心脏、肝脏、肾脏、脾脏、肺、子宫和输卵管(P<0.01);在卵巢中,妊娠期DDIT3基因的表达水平显著高于卵泡期、黄体期和胎儿期(P<0.05),黄体期的表达量显著高于胎牛期(P<0.05);在子宫中,妊娠期DDIT3基因的表达水平显著高于卵泡期和胎牛期(P<0.05);DDIT3在各时期输卵管中表达水平差异不显著;MⅡ期卵母细胞中DDIT3基因的表达水平显著高于GV期和MⅠ期(P<0.05),MⅡ颗粒细胞DDIT3基因的表达量也显著高于GV期和MⅠ期(P<0.05),GV期、MⅠ期的卵母细胞和颗粒细胞DDIT3表达量差异不显著。综上,牦牛DDIT3基因可能在维持母牦牛卵巢机能与妊娠以及卵泡发育与成熟过程中发挥重要的调控作用。

Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚不同时期的表达研究

目的:检测Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚不同时期的表达分布及变化规律,初步揭示Ddit3在小鼠牙胚发育中的作用。方法:取不同胚胎时间点的ICR妊娠小鼠,制备牙胚发育标本,通过免疫荧光和免疫组化的方法显示Ddit3在小鼠下颌第一磨牙牙胚发育不同时间点的表达分布。结果:Ddit3在牙胚发育的早期主要表达于胞浆中,从钟状期开始,Ddit3不仅在胞浆中有阳性表达,同时也微弱地表达于细胞核中。分布如下:在小鼠下颌第一磨牙发育的板状期,Ddit3几乎没有表达。在蕾状期,Ddit3主要表达于釉上皮的细胞质中,在牙外胚间充质细胞中几乎无表达。在帽状期,Ddit3的表达模式基本和蕾状期相同。在钟状期早期,Ddit3在成釉细胞、前成牙本质细胞和牙乳头胞质中呈阳性表达,在部分细胞核中也检测到了Ddit3的表达。钟状期晚期,Ddit3在新形成的硬组织周围的高柱状成釉细胞、成牙本质细胞和牙乳头细胞的胞浆中有阳性表达,在大多数成釉细胞、成牙本质细胞和牙乳头细胞的细胞核中也有表达。结论:Ddit3可能会调节成釉细胞和成牙本质细胞的分化及其硬组织的生物矿化。

过表达DDIT3对人牙髓干细胞增殖和分化能力影响的研究

目的:通过构建DDIT3过表达质粒,进一步验证过表达DDIT3对人牙髓干细胞(human dental pulp cells,HDPCs)增殖和分化能力的影响。方法:构建带有绿色荧光标记的DDIT3慢病毒载体,分为3组:空白(A组)对照组,绿色荧光对照组(B组),DDIT3过表达组(C组);荧光显微镜观察病毒感染效率;qRT-PCR和Westernblot检测过表达效果;MTT检测三组细胞的增殖能力;ALP、茜素红、vonKossa染色和qRT-PCR检测DDIT3对HDPCs成骨/成牙本质分化能力的影响。结果:荧光显微镜下观察C组绿色荧光表达面积>90%,qRT-PCR和Westernblot结果表明,C组DDIT3mRNA和蛋白表达明显升高;MTT结果显示,与对照组相比,过表达DDIT3在72h和96h可明显抑制HDPCs的增殖;qRT-PCR结果表明,DDIT3过表达可明显增加矿化相关基因OSX,DSPP,DMP1和OCNmRNA表达水平,同时增加DSPP蛋白表达;ALP染色结果表明,3组细胞在成骨/成牙本质分化第7天,均可见明显的ALP染色阳性细胞,但染色面积无明显差异。然而,在成骨/成牙本质分化第14天,茜素红染色和vonKossa染色结果表明,过表达DDIT3可明显增加钙沉积。结论:DDIT3可促进HDPCs晚期的成骨/成牙本质分化。

DDIT3调控TNF-α刺激下ATDC5细胞软骨向分化

目的:探究在肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)刺激下,DNA损伤诱导转录因子3(DNA damage inducible transcript 3,DDIT3)对ATDC5细胞软骨向分化的调控。方法:不同浓度TNF-α(0、1、10、20 ng/mL)刺激下诱导ATDC5细胞分化7 d,同时在10 ng/mL TNF-α刺激下诱导慢病毒稳定转染ATDC5细胞分化7 d,qRT-PCR检测炎症相关因子环氧化酶(cyclooxygenase,COX)2、白细胞介素(interleukin,IL)-6、一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS)2、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)-13的表达,Western blot检测DDIT3、软骨向分化指标Sox9、Col10a1以及p-AKT、AKT蛋白表达情况,阿尔新蓝染色检测细胞外基质形成情况。结果:不同浓度TNF-α刺激下诱导ATDC5细胞分化引起COX2、IL-6、NOS2、MMP-13和DDIT3表达明显升高,Sox9、X型胶原蛋白(collagen type X alpha 1 chain,Col10a1)的表达下降。敲低DDIT3部分逆转了10 ng/mL TNF-α刺激导致的Sox9、Col10a1的表达下降和细胞外基质形成减少,同时促进磷酸化蛋白激酶B(phosphorylated protein kinase B,AKT)蛋白表达。结论:在TNF-α诱导的炎症微环境中,DDIT3调控了ATDC5细胞软骨向分化。

DDIT3对肿瘤的影响及其相关药物研究进展

DDIT3作为多种癌症治疗靶点日益受到重视,相应药物也被广泛研究开发。DDIT3作为调控细胞凋亡的关键因素很可能是多种疾病临床治疗的突破口,有望成为抗肿瘤药物研发的新靶点。该文综述了DNA损伤诱导转录因子DDIT3的表达对肿瘤发生发展的影响及其临床意义,分析了DDIT3在内质网应激下诱导细胞凋亡的作用机制,总结了在肿瘤微环境下DDIT3的调控途径及其对细胞稳态的影响,也对靶向DDIT3的肿瘤临床前及实验室阶段的药物进行了汇总并阐明其作用机制。

生物信息学方法分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控

目的 研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控.方法 采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度.结果 开发软件工具无需安装且操作简单.成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低.结论 本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控.

表没食子儿茶素没食子酸酯逆转小剂量辐射引起的DNA甲基化

目的探讨表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）对0.5 Gy X射线引起的小鼠Rad23b和Ddit3基因启动子CpG岛甲基化及表达改变的逆转作用。方法 BALB/c雄性小鼠30只按随机数字表法均分为6组：对照组、单纯照射组、EGCG低剂量单纯给药组、EGCG高剂量单纯给药组、EGCG低剂量给药照射组、EGCG 高剂量给药照射组。照射方式为6 MV X 射线分次照射（0.05 Gy/d ×10 d）。小鼠在末次照射后2 h取血后处死，收集肾脏、肝脏、脾脏、脑及肺组织。采用BSP和Real-time PCR法检测各组小鼠外周血单个核细胞（PBMC）及各组织Rad23b和Ddit3启动子CpG岛的甲基化水平和 mRNA 表达变化。结果末次照射后2 h，与对照组比较，单纯照射组Rad23b在PBMC、肝脏、脾脏、脑和肺组织中甲基化水平均升高（ t ＝-20.19、-14.80、-12.05、-28.42、-12.58，P＜0.05），同时mRNA水平在PBMC、肝脏、脑和肺组织中表达降低（t＝25.25、17.43、11.53、22.85，P ＜0.05）；Ddit3甲基化水平在 PBMC、肝脏和肺组织中升高（t ＝-52.89、-20.31和-3.85，P ＜0.05），mRNA 水平在 PBMC 和肝脏中表达降低（t ＝11.89和16.52，P ＜0.05）。与单纯照射组比较，除脾脏中Rad23b外，不同浓度EGCG（10、20 mg/kg）给药照射组均能明显降低X射线引起的Rad23b和Ddit3启动子CpG岛高甲基化（t＝-13.39～7.99，P＜0.05），并诱导mRNA重新表达（t＝-34.02～-2.89，P＜0.05），且转录激活作用在高剂量给药照射组中更加明显。结论 EGCG作为逆转小剂量辐射损伤效应的天然药物，可能通过影响DNA甲基化来发挥作用。

亚致死剂量马拉硫磷导致小鼠肾损伤及内质网应激分析

[目的]探讨有机磷化合物对哺乳动物肾组织的毒效作用,为有机磷的非胆碱能毒理机制研究提供参考。[方法]选取马拉硫磷为有机磷代表,分别以1/3 LD50、1/10 LD50、1/25 LD50亚致死剂量马拉硫磷经口灌胃小鼠18 d,苏木精-伊红(HE)染色观察各组肾组织病理变化情况,荧光定量PCR和免疫组织化学染色法测定药物处理前后肾组织DDIT3基因的m RNA和蛋白表达情况。[结果]亚致死剂量马拉硫磷可以升高小鼠血液中的血尿素氮、肌酐、尿酸含量。HE染色显示,与对照组比较,1/3 LD50和1/10 LD50剂量组对小鼠肾小球、肾小囊腔内、肾静脉血管损伤显著。荧光定量PCR和IHC结果显示,马拉硫磷可显著升高小鼠肾组织中内质网应激的标志基因DDIT3的m RNA水平和蛋白表达。[结论]以上结果提示,亚致死剂量马拉硫磷可致肾组织损伤,增加肾细胞的内质网应激,诱导肾细胞凋亡可能是其产生损伤的原因之一。