水牛DDR1基因生物信息学及细胞学功能分析

为了了解水牛DDR1蛋白的生物信息学和细胞学功能,试验采用ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、PSORTⅡPredictio、NetPhos 3.1在线软件对水牛DDR1蛋白进行生物信息学分析,采用基因干扰的方法研究水牛DDR1基因对水牛乳腺上皮细胞增殖、凋亡、基因表达和迁移的影响。结果表明:水牛DDR1蛋白由915个氨基酸组成,分子式为C_(4538)H_(7029)N_(1261)O_(1287)S_(43),分子量为101222.99 u,半衰期为30 h,理论等电点为6.22,属于酸性、不稳定、可溶性蛋白质。DDR1蛋白的二级结构由256个α-螺旋(27.98%)、175个延伸链(19.13%)、55个β-折叠(6.01%)、429个无规则卷曲(46.89%)构成。亚细胞定位于内质网(44.4%)、高尔基体(33.3%)和质膜中(22.2%)中。DDR1蛋白共含有65个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点35个,苏氨酸磷酸化位点18个,酪氨酸磷酸化位点12个。DDR1基因的最佳干扰片段为siDDR1-1,最佳干扰时间为48 h。DDR1基因干扰72小时时可极显著抑制水牛乳腺上皮细胞的增殖(P<0.01)。DDR1基因干扰显著或极显著上调凋亡相关基因BCL-2(P<0.01)、XIAP(P<0.05)、TP53(P<0.01)和增殖相关基因CCND1(P<0.01)的表达,下调凋亡相关基因CASPASE3(P<0.05)和CCDB1(P>0.05)的表达,但对细胞凋亡率的影响不显著(P>0.05)。此外,DDR1基因干扰可极显著降低水牛乳腺上皮细胞的迁移率(P<0.01)。说明DDR1基因干扰可极显著影响水牛乳腺上皮细胞的增殖和迁移。

DDR1基因在不同复发倾向肝癌患者中的表达水平差异及在肝癌临床预后中的价值

目的探讨盘状结构域受体1(DDR1)基因在不同复发倾向肝癌患者中的表达水平差异及在肝癌临床预后中的价值。方法选取行肝癌根治性切除手术的患者的肝癌标本40例为研究材料。根据复发情况将肝癌患者分为早期复发组(n=20)和非早期复发组(n=20),另选取本院同期收治的无肝脏疾病的胆囊结石患者的正常肝组织为正常对照组(n=10)。采用免疫组化法和Western Blot检测肝癌组织和正常肝组织中DDR1的表达情况,对不同组别的DDR1表达情况及不同DDR1表达情况的肝癌患者的生存率进行比较分析。结果早期复发组肝癌组织DDR1基因阳性率高于非早期复发组肝癌组织和正常对照组正常肝组织(P﹤0.05);非早期复发组肝癌组织的DDR1基因阳性率与正常对照组正常肝组织比较,差异无统计学意义(P﹥0.05);DDR1蛋白在早期复发组肝癌组织的表达量较非早期复发组肝癌组织高(P﹤0.05);肝癌组织中DDR1基因的表达与患者的性别、年龄、肿瘤直径和Edmonson分级无关,与患者早期复发倾向有着较为明显的关系(P﹤0.01);DDR1在肝癌组织中的表达情况与术后患者的生存率并无明显的关系。结论 DDR1基因在早期复发的肝癌患者中的阳性率及表达量明显增高,可以将其表达情况作为判断肝癌患者术后预后的指标之一。

不同复发倾向肝癌患者DDR1基因的表达水平差异及其在肝癌临床预后中的价值

目的:分析DDR1基因在不同复发倾向肝癌患者中的表达水平和在肝癌临床预后中的价值。方法:将我院40例接受根治性切除术治疗的肝癌患者依据术后复发倾向不同分为早期复发组20例和非早期复发组20例,另选择20例同期健康体检肝组织正常者作为对照组,采用免疫组化法分析各组DDR1基因的表达情况。采用SPSS 11.0软件对结果进行统计学分析。结果:40例肝癌患者和20例肝组织正常者的DDR1阳性表达率分别为65%和10%,组间差异有统计学意义(χ2=31.45,P<0.05);早期复发组和非早期复发组患者的阳性表达率分别为85%和45%,组间差异有统计学意义(χ2=11.32,P<0.05);DDR1基因的阳性表达率和患者年龄、性别、肿瘤直径没有直接关系(P>0.05)。结论:DDR1基因表达和肝癌患者术后复发倾向关系密切,阳性表达率越高,术后肝癌早期复发和淋巴结转移的可能性越大。因此,DDR1基因表达水平的高低可以作为预后判断的一项重要指标。