DDX39蛋白表达与结直肠癌预后的关系

目的研究结直肠癌组织中DDX39蛋白表达与患者预后的关系。方法收集2010年1月至2011年12月期间在上海海军军医大学附属长海医院肛肠外科接受外科手术的824例初治结直肠癌患者的临床资料及其术后肿瘤组织石蜡标本，选取其中38例患者的癌旁组织石蜡样本作为对照；同时纳入同期37例吻合器痔上黏膜环切钉合术后正常直肠黏膜样本和33例内镜治疗后结直肠腺瘤样本。所有标本制作成组织芯片，采用免疫组织化学方法检测DDX39蛋白表达情况，分别以平均染色强度（H-Score）和染色阳性的细胞数来对DDX39在上皮和间质中的表达进行评估；H-Score≥200定义为上皮中高表达，200倍视野间质内阳性细胞数≥50定义为间质中高表达。分析DDX39表达水平与结直肠癌临床病理参数和患者预后的关系。结果无论是在上皮还是间质中，DDX39在结直肠癌组织中的表达水平均低于与正常黏膜、癌旁组织和腺瘤组织[各组织上皮中DDX39水平：正常组织253.2 ± 64.1，癌旁组织238.8 ± 79.2，腺瘤组织259.4 ± 51.6，结直肠癌组织194.2 ± 76.5（P = 0.000，P = 0.005，P = 0.000）；各组织间质中DDX39水平：正常组织110.1±64.8，癌旁组织106.0 ± 49.2，腺瘤组织108.5 ± 79.1，结直肠癌组织54.1 ± 34.7，均P = 0.000]。结直肠癌病例中，上皮DDX39高表达者541例，低表达者283例；间质DDX39高表达者424例，低表达者400例。结直肠癌上皮和间质中DDX39蛋白表达的高低分别与肿瘤部位（P = 0.006，P = 0.016）、肿瘤分化程度（P = 0.002，P = 0.064）、肿瘤TNM分期（P = 0.021，P = 0.000）、血清癌胚抗原水平（P = 0.003，P = 0.005）、血清CA199水平（P = 0.040，P = 0.005）及肿瘤复发转移（P = 0.000，P = 0.000）均有关。全组结直肠癌病例术后随访（41.6±15.7）月，上皮中DDX39低表达者5年总体生存率和5年无病生存率分别为84.1%和61.5%，均显著低于高表达者（95.4%和88.2%，均P = 0.000）；间质中DDX39低表达者5年总体生存率和5年无病生存率分别为86.8%和66.8%，亦均低于高表达者（96.1%和90.6%，均P = 0.000）。Cox多因素分析显示，肿瘤分化程度（总体生存：HR = 0.252，95%CI：0.128～0.497，P = 0.000；无病生存：HR = 0.266，95%CI：0.134～0.530，P = 0.000）、上皮DDX39表达水平（总体生存：HR = 0.229，95% CI：0.138～0.382，P = 0.000；无病生存：HR = 0.266，95%CI：0.158～0.446，P = 0.000）及间质DDX39表达水平（总体生存：HR = 0.331，95% CI：0.188～0.582，P = 0.000；无病生存：HR=0.326，95% CI：0.184～0.578，P = 0.000）是结直肠癌患者总体生存或无病生存的独立影响因素。结论结直肠癌组织中DDX39蛋白低表达提示患者预后不良，DDX39有望成为结直肠癌的一种新的预后标志物。

DDX39及PODXL蛋白在胃癌中的表达及与病理特征的统计分析

目的分析胃癌组织中DDX39及PODXL蛋白的表达情况,并探讨DDX39及PODXL表达与病理特征的相关性。方法回顾性分析65例行手术治疗的胃癌患者的临床资料,以术中采集的胃癌组织为胃癌组,以术中采集的癌旁正常组织为癌旁组。对比两组DDX39及PODXL蛋白表达阳性率,分析两组DDX39及PODXL在组织中H-SCORE评分差异;同时探讨DDX39及PODXL蛋白表达情况与临床病理特征的相关性。结果胃癌组DDX39及PODXL蛋白表达阳性率高于癌旁组(P<0.05),胃癌组DDX39及PODXL在组织中H-SCORE评分高于癌旁组(P<0.05)。同时,DDX39高表达组低分化者、TNM分期Ⅲ级及以上者高于低表达组(P<0.05),PODXL高表达组低分化者、TNM分期Ⅲ级及以上者高于低表达组(P<0.05)。而胃癌组织中DDX39及DPODXL表达与分化程度呈负相关、与TNM分期呈正相关(P<0.05)。结论胃癌组织中DDX39及PODXL蛋白表达明显升高,且其表达程度与分化程度呈负相关、与TNM分期呈正相关。

刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39生物信息学分析

目的采用生物信息学技术对刚地弓形虫RNA结合蛋白DDX39(TgDDX39)进行分析,评估该蛋白的免疫原性,从而为研发弓形虫病疫苗提供参考依据。方法在ToxoDB数据库中检索TgDDX39氨基酸序列后,利用ProtParam、TMHMM 2.0、SignalP 5.0、NetPhos 3.1、COILS、SOPMA、Phyre2、ProtScale、ABCpred、SYFPEITHI、DNASTAR等生物信息学软件预测TgDDX39蛋白的理化性质、蛋白跨膜结构域、信号肽位点、翻译后修饰位点、卷曲螺旋、二级和三级结构、亲疏水性及抗原表位。结果Tg DDX39蛋白是一种不稳定亲水性蛋白,分子式C_(2173)H_(3458)N_(598)O_(661)S_(18),含有434个氨基酸,预测分子量为49.1 kDa,理论等电点为5.55。预测该蛋白存在信号肽的可能性极低,无跨膜区,并含有27个磷酸化位点;TgDDX39蛋白二级结构中β转角和无规则卷曲占39.63%,有1个部位有形成卷曲螺旋的倾向,且TgDDX39蛋白含有多个B、T细胞抗原表位。结论生物信息学预测显示,TgDDX39蛋白具有高免疫原性、含有多种抗原表位,具有作为弓形虫病疫苗候选蛋白分子的潜力。