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DDX46基因调控TE-1食管鳞状细胞癌细胞侵袭转移行为的相关性研究
1
作者
蔺军平
孟于琪
+2 位作者
李斌
冯海明
李政
《中国胸心血管外科临床杂志》
CSCD
北大核心
2023年第7期1030-1037,共8页
目的 探索DDX46基因与TE-1食管鳞状细胞癌(鳞癌)细胞侵袭和转移行为的相关性及可能的分子机制。方法 荧光标记shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞敲减DDX46基因为实验组(shDDX46组),空载体转染为对照组(shCtrl组)。镜下绿色荧光蛋白表达...
目的 探索DDX46基因与TE-1食管鳞状细胞癌(鳞癌)细胞侵袭和转移行为的相关性及可能的分子机制。方法 荧光标记shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞敲减DDX46基因为实验组(shDDX46组),空载体转染为对照组(shCtrl组)。镜下绿色荧光蛋白表达率评价细胞转染效率,实时荧光定量聚合酶链式反应和蛋白质印迹法(Western blotting,WB)分别检测DDX46基因在mRNA和蛋白表达水平的敲减效率。采用划痕实验、侵袭实验、Transwell小室实验检测DDX46基因敲减前后TE-1食管鳞癌细胞侵袭和转移能力的变化。采用生物信息学方法进行经典通路分析探讨信号通路的变化,进一步通过WB检测纤连蛋白表达,探讨DDX46在食管鳞癌细胞侵袭和转移过程中可能存在的作用机制。结果 shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞后DDX46基因在mRNA和蛋白水平上的表达受到显著抑制。划痕实验提示shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在划痕后8 h细胞迁移率相比shCtrl组明显降低(P=0.001)。侵袭实验表明shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在培养24 h后侵袭细胞数量低于shCtrl组(P<0.001)。Transwell实验结果显示shDDX46组在24 h观察点的转移细胞数少于shCtrl组(P<0.001)。经典通路分析结果表明整合素信号通路活性被抑制,进一步探究其作用机制发现,敲减DDX46基因后与细胞黏附相关的纤连蛋白表达下降11%。结论 DDX46基因与TE-1食管鳞癌细胞的侵袭和转移行为相关,敲减DDX46基因可能是通过下调整合素通路信号,降低细胞黏附性及细胞骨架重构,从而抑制食管鳞癌细胞侵袭和转移过程。
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关键词
食管鳞状细胞癌
ddx46
侵袭
转移
整合素
原文传递
敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析
被引量:
2
2
作者
李斌
李政
+5 位作者
尹泚
蔺军平
杨建宝
朱多杰
冯海明
敬涛
《中国胸心血管外科临床杂志》
CAS
CSCD
2020年第1期61-67,共7页
目的探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合...
目的探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性。结果按照表达差异倍数之绝对值≥2,且P<0.05的筛选条件,筛选出差异基因1006个,其中表达下调基因644个,表达上调基因362个。生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子。qRT-PCR检测结果与基因芯片结果的验证符合率为100%。结论利用生物信息学方法能有效挖掘DDX46敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究DDX46与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索。
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关键词
ddx46
食管鳞癌
基因芯片
差异基因
生物信息学
原文传递
题名
DDX46基因调控TE-1食管鳞状细胞癌细胞侵袭转移行为的相关性研究
1
作者
蔺军平
孟于琪
李斌
冯海明
李政
机构
兰州大学第二医院胸外科兰州大学第二临床医学院
出处
《中国胸心血管外科临床杂志》
CSCD
北大核心
2023年第7期1030-1037,共8页
基金
甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2017-04)
兰州市城关区科技计划项目(2018-9-2)
甘肃省自然科学基金项目(1606RJZA040)。
文摘
目的 探索DDX46基因与TE-1食管鳞状细胞癌(鳞癌)细胞侵袭和转移行为的相关性及可能的分子机制。方法 荧光标记shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞敲减DDX46基因为实验组(shDDX46组),空载体转染为对照组(shCtrl组)。镜下绿色荧光蛋白表达率评价细胞转染效率,实时荧光定量聚合酶链式反应和蛋白质印迹法(Western blotting,WB)分别检测DDX46基因在mRNA和蛋白表达水平的敲减效率。采用划痕实验、侵袭实验、Transwell小室实验检测DDX46基因敲减前后TE-1食管鳞癌细胞侵袭和转移能力的变化。采用生物信息学方法进行经典通路分析探讨信号通路的变化,进一步通过WB检测纤连蛋白表达,探讨DDX46在食管鳞癌细胞侵袭和转移过程中可能存在的作用机制。结果 shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞后DDX46基因在mRNA和蛋白水平上的表达受到显著抑制。划痕实验提示shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在划痕后8 h细胞迁移率相比shCtrl组明显降低(P=0.001)。侵袭实验表明shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在培养24 h后侵袭细胞数量低于shCtrl组(P<0.001)。Transwell实验结果显示shDDX46组在24 h观察点的转移细胞数少于shCtrl组(P<0.001)。经典通路分析结果表明整合素信号通路活性被抑制,进一步探究其作用机制发现,敲减DDX46基因后与细胞黏附相关的纤连蛋白表达下降11%。结论 DDX46基因与TE-1食管鳞癌细胞的侵袭和转移行为相关,敲减DDX46基因可能是通过下调整合素通路信号,降低细胞黏附性及细胞骨架重构,从而抑制食管鳞癌细胞侵袭和转移过程。
关键词
食管鳞状细胞癌
ddx46
侵袭
转移
整合素
Keywords
Esophageal squamous cell carcinoma
ddx46 gene
invasion
metastasis
integrin
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析
被引量:
2
2
作者
李斌
李政
尹泚
蔺军平
杨建宝
朱多杰
冯海明
敬涛
机构
兰州大学第二医院胸外科兰州大学第二临床医学院
出处
《中国胸心血管外科临床杂志》
CAS
CSCD
2020年第1期61-67,共7页
基金
兰州市城关区科技计划项目(2018-9-2)
甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2017-04)
+2 种基金
甘肃省自然科学基金项目(1606RJZA040)
兰州大学第二医院“萃英科技创新”计划项目(CY2017-MS02)
兰州大学第二医院配套经费项目资金
文摘
目的探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性。结果按照表达差异倍数之绝对值≥2,且P<0.05的筛选条件,筛选出差异基因1006个,其中表达下调基因644个,表达上调基因362个。生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子。qRT-PCR检测结果与基因芯片结果的验证符合率为100%。结论利用生物信息学方法能有效挖掘DDX46敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究DDX46与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索。
关键词
ddx46
食管鳞癌
基因芯片
差异基因
生物信息学
Keywords
ddx46
esophageal squamous cell carcinoma
gene
chip
differential
gene
s
bioinformatics
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DDX46基因调控TE-1食管鳞状细胞癌细胞侵袭转移行为的相关性研究
蔺军平
孟于琪
李斌
冯海明
李政
《中国胸心血管外科临床杂志》
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
2
敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析
李斌
李政
尹泚
蔺军平
杨建宝
朱多杰
冯海明
敬涛
《中国胸心血管外科临床杂志》
CAS
CSCD
2020
2
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