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DDX46基因调控TE-1食管鳞状细胞癌细胞侵袭转移行为的相关性研究
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作者 蔺军平 孟于琪 +2 位作者 李斌 冯海明 李政 《中国胸心血管外科临床杂志》 CSCD 北大核心 2023年第7期1030-1037,共8页
目的 探索DDX46基因与TE-1食管鳞状细胞癌(鳞癌)细胞侵袭和转移行为的相关性及可能的分子机制。方法 荧光标记shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞敲减DDX46基因为实验组(shDDX46组),空载体转染为对照组(shCtrl组)。镜下绿色荧光蛋白表达... 目的 探索DDX46基因与TE-1食管鳞状细胞癌(鳞癌)细胞侵袭和转移行为的相关性及可能的分子机制。方法 荧光标记shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞敲减DDX46基因为实验组(shDDX46组),空载体转染为对照组(shCtrl组)。镜下绿色荧光蛋白表达率评价细胞转染效率,实时荧光定量聚合酶链式反应和蛋白质印迹法(Western blotting,WB)分别检测DDX46基因在mRNA和蛋白表达水平的敲减效率。采用划痕实验、侵袭实验、Transwell小室实验检测DDX46基因敲减前后TE-1食管鳞癌细胞侵袭和转移能力的变化。采用生物信息学方法进行经典通路分析探讨信号通路的变化,进一步通过WB检测纤连蛋白表达,探讨DDX46在食管鳞癌细胞侵袭和转移过程中可能存在的作用机制。结果 shRNA慢病毒转染TE-1食管鳞癌细胞后DDX46基因在mRNA和蛋白水平上的表达受到显著抑制。划痕实验提示shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在划痕后8 h细胞迁移率相比shCtrl组明显降低(P=0.001)。侵袭实验表明shDDX46组TE-1食管鳞癌细胞在培养24 h后侵袭细胞数量低于shCtrl组(P<0.001)。Transwell实验结果显示shDDX46组在24 h观察点的转移细胞数少于shCtrl组(P<0.001)。经典通路分析结果表明整合素信号通路活性被抑制,进一步探究其作用机制发现,敲减DDX46基因后与细胞黏附相关的纤连蛋白表达下降11%。结论 DDX46基因与TE-1食管鳞癌细胞的侵袭和转移行为相关,敲减DDX46基因可能是通过下调整合素通路信号,降低细胞黏附性及细胞骨架重构,从而抑制食管鳞癌细胞侵袭和转移过程。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 ddx46 侵袭 转移 整合素
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敲减DDX46后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析 被引量:2
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作者 李斌 李政 +5 位作者 尹泚 蔺军平 杨建宝 朱多杰 冯海明 敬涛 《中国胸心血管外科临床杂志》 CAS CSCD 2020年第1期61-67,共7页
目的探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合... 目的探讨DDX46基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法应用基因芯片技术检测DDX46基因敲减前后食管鳞癌TE-1细胞中全基因mRNA表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中6个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性。结果按照表达差异倍数之绝对值≥2,且P<0.05的筛选条件,筛选出差异基因1006个,其中表达下调基因644个,表达上调基因362个。生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子。qRT-PCR检测结果与基因芯片结果的验证符合率为100%。结论利用生物信息学方法能有效挖掘DDX46敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究DDX46与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索。 展开更多
关键词 ddx46 食管鳞癌 基因芯片 差异基因 生物信息学
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