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恶性疟原虫abstrakt同源基因的克隆及DEAD盒家族蛋白的序列分析(英文) 被引量:1
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作者 宋平 张竞男 +3 位作者 Pawan MALHOTRA Narendra TUTEJA Virender Singh CHAUHAN 李奎 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第3期420-430,共11页
DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)... DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)的基因组文库 ,克隆了FH1F———abstrakt同源基因的完整序列。通过搜索已经完成测序的恶性疟原虫基因组数据库 ,推测FH1F序列定位在第 5条染色体上。FH1F全长2 80 4bp,包含一个 1 1 6 1bp的完整阅读框 ,编码一个由 386个氨基酸组成的蛋白。对FH1F蛋白序列用BlastP进行搜索和分析以及用DNAStar与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果均提示FH1F蛋白应该是DEAD盒家族的一个Abstrakt蛋白。另一方面 ,用DNAStar对已知所有完整的DEAD盒蛋白进行详细的序列分析以及用Mega对这些序列进行系统发育研究的结果都显示 :DEAD盒家族的蛋白聚类成为若干不同的亚群 ;与DEAD盒蛋白的一般保守序列相比 ,Abstrakt,eIF 4A ,Vasa ,P6 8等不同亚群的DEAD盒蛋白在保守区具有各自不同的结构特征。本文对不同的DEAD盒蛋白的结构特征进行了总结并试图给出不同亚群分类上的结构标准 。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 abstrakt 同源基因 克隆 dead 序列分析 rna解旋酶
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DEAD盒RNA解螺旋酶5和微小RNA-205在前列腺癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 徐朝艳 刘维雪 +1 位作者 卢宏凯 刘春来 《国际泌尿系统杂志》 2022年第4期590-594,共5页
目的检测DEAD盒RNA解螺旋酶5(DDX5)和微小RNA-205(miR-205)在前列腺癌(PCa)中的表达情况,并分析二者与PCa预后的关系.方法选取2015年4月至2017年4月于北京市朝阳区双桥医院行前列腺癌根治术或穿刺活检术的86例PCa患者为研究对象,取患者... 目的检测DEAD盒RNA解螺旋酶5(DDX5)和微小RNA-205(miR-205)在前列腺癌(PCa)中的表达情况,并分析二者与PCa预后的关系.方法选取2015年4月至2017年4月于北京市朝阳区双桥医院行前列腺癌根治术或穿刺活检术的86例PCa患者为研究对象,取患者术中切除的癌组织及癌旁组织分别作为PCa组和对照组.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测组织中DDX5 mRNA、miR-205的水平.采用免疫组化法检测组织中DDX5的表达情况.分析DDX5、miR-205表达水平与临床病理特征的关系.采用Kaplan-Meier生存分析DDX5、miR-205表达水平与PCa患者的预后关系.采用Cox回归分析PCa预后不良的影响因素.结果PCa组的DDX5 mRNA及蛋白表达水平均高于对照组(均P<0.05),miR-205表达水平低于对照组(P<0.05).PCa患者中DDX5、miR-205表达与肿瘤分期、血清PSA、Gleason评分、肿瘤转移均有相关性(均P<0.05),而与患者年龄、切缘性质均无相关性(均P>0.05).经Kaplan-Meier生存分析,DDX5阳性表达患者的3年累积生存率低于DDX5阴性表达患者(P<0.05);miR-205高表达患者的3年累积生存率高于miR-205低表达患者(P<0.05).多因素Cox分析结果显示,DDX5水平偏高、miR-205水平偏低是PCa不良预后的危险因素(HR=2.598、3.342,均P<0.01).结论在PCa患者癌组织中DDX5高表达,miR-205低表达,二者与PCa的多种临床病理及预后有关,是PCa患者预后不良的危险因素. 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 微小rna-205 dead盒rna解旋酶5
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DEAD盒RNA解旋酶17在乳腺癌细胞中的表达及定位 被引量:2
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作者 李洋 邢瑶 +1 位作者 韩馥伊 李丰 《解剖科学进展》 2019年第1期1-3,共3页
目的研究DEAD盒RNA解旋酶17 (DDX17)在人乳腺癌细胞和组织中的表达和定位。方法蛋白印迹法检测DDX17在人乳腺癌细胞系中蛋白的表达,激光共聚焦扫描显微镜和Western blot检测DDX17在MCF-7乳腺癌细胞中的定位。结果 DDX17在人乳腺肿瘤细... 目的研究DEAD盒RNA解旋酶17 (DDX17)在人乳腺癌细胞和组织中的表达和定位。方法蛋白印迹法检测DDX17在人乳腺癌细胞系中蛋白的表达,激光共聚焦扫描显微镜和Western blot检测DDX17在MCF-7乳腺癌细胞中的定位。结果 DDX17在人乳腺肿瘤细胞系中蛋白表达水平增高,激光共聚焦扫描显微镜和Western blot观察发现DDX17主要定位于MCF-7细胞核中。结论 DDX17在人乳腺癌细胞系中高表达,主要定位于乳腺癌细胞核内,可能是人乳腺癌重要的调节因子。 展开更多
关键词 deadrna解旋酶17 乳腺癌 免疫印迹分析 定位
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脆性X智力障碍蛋白靶向DDX5调控Wnt/β-catenin信号通路促进乳腺癌细胞上皮-间质转化发生
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作者 曹佳 王晶 +3 位作者 石斌 马小兰 吴伟超 王南 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1138-1149,共12页
目的探讨脆性X智力障碍蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)促进乳腺癌细胞迁移、上皮-间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)发生及其可能的作用机制。方法采用RT-PCR、Western blot方法,分析FMRP在正常乳腺... 目的探讨脆性X智力障碍蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)促进乳腺癌细胞迁移、上皮-间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)发生及其可能的作用机制。方法采用RT-PCR、Western blot方法,分析FMRP在正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)和4种乳腺癌细胞系(MCF-7、BT474、MDA-MB-231、HCC1937)中mRNA和蛋白表达,免疫组化染色检测FMRP在乳腺癌组织中的表达;GEO数据库分析FMRP基因在乳腺癌中的表达及与临床预后的关系;采用慢病毒感染和siRNA干扰技术分别构建FMRP过表达及干扰载体,转染人乳腺癌细胞系MCF-7,设置对照组(Control)、干扰空载体组(NC)、敲低载体组(si FMRP)以及过表达空载体组(Lv-NC)、过表达载体组(Lv-FMRP);划痕实验和Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力,Western blot检测各组细胞中EMT标志物[上皮标志物E-cadherin,间质标志物N-cadherin、vimentin、ZEB1(zinc finger E-box binding homeobox 1)、Slug(snail family zinc finger 2)]表达;免疫共沉淀联合质谱分析(IP-MS)验证FMRP与DEAD box RNA解旋酶-5(DEAD-box helicase5,DDX5)蛋白的互作关系,利用蛋白合成抑制剂放线菌酮(cycloheximide,CHX)、蛋白酶体抑制剂MG132检测FMRP对DDX5蛋白表达的调控作用;同时转染si DDX5载体,观察DDX5是否可以逆转FMRP过表达对细胞迁移、EMT的影响;采用免疫荧光染色检测β-catenin的定位及表达,Western blot检测Wnt/β-catenin信号通路核心标志物蛋白表达。结果FMRP在乳腺癌组织及细胞中呈高表达(P<0.05),FMRP高表达组总生存和无进展生存低于FMRP低表达组(P<0.05);敲低FMRP后MCF-7细胞迁移能力减弱,过表达FMRP促进细胞迁移(P<0.05);敲低FMRP后E-cadherin表达升高,N-cadherin、vimentin、ZEB1、Slug表达降低,抑制EMT发生,而过表达FMRP则促进EMT进程(P<0.05);FMRP与DDX5蛋白互作,且通过阻断泛素-蛋白酶体途径促进DDX5蛋白稳定性;敲低DDX5逆转FMRP过表达对细胞迁移及EMT的促进作用(P<0.05),且有效抑制β-catenin核转位,降低β-catenin核分布;进一步发现DDX5下调后p-β-catenin、GSK3β、Axin2蛋白表达升高,C-myc蛋白表达降低(P<0.05),而联合FMRP过表达逆转上述蛋白的表达(P<0.05)。结论FMRP靶向DDX5通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进乳腺癌细胞迁移和EMT进程。 展开更多
关键词 脆性X智力障碍蛋白 dead box rna解旋酶-5 上皮-间质转化 WNT/Β-CATENIN信号通路
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DDX5通过上皮-间质转化促进人乳腺癌细胞侵袭 被引量:1
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作者 韩馥伊 邢瑶 +1 位作者 李洋 李丰 《解剖科学进展》 CAS 2023年第5期459-461,466,共4页
目的探究DEAD box RNA解旋酶-5(DEAD-box helicase 5,DDX5)蛋白对乳腺癌MCF-7细胞侵袭转移作用的影响及其机制。方法利用慢病毒感染法,构建过表达Flag-DDX5的人乳腺癌MCF-7稳转细胞系,划痕实验和Transwell实验检测DDX5蛋白过表达后对乳... 目的探究DEAD box RNA解旋酶-5(DEAD-box helicase 5,DDX5)蛋白对乳腺癌MCF-7细胞侵袭转移作用的影响及其机制。方法利用慢病毒感染法,构建过表达Flag-DDX5的人乳腺癌MCF-7稳转细胞系,划痕实验和Transwell实验检测DDX5蛋白过表达后对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响;Western blot实验检测上皮-间质转化(EMT)标志物上皮-钙黏蛋白(E-cadherin),纤维连接蛋白(Fibronectin),波形蛋白(Vimentin)的表达。结果成功构建了稳定过表达DDX5的乳腺癌MCF-7稳转细胞系;DDX5蛋白过表达后,乳腺癌细胞迁移和侵袭能力明显增强,乳腺癌细胞E-cadherin的表达明显下调,Fibronectin与Vimentin的表达明显上调。结论DDX5可能参与乳腺肿瘤细胞EMT过程,促进乳腺癌的恶性转移,进而影响乳腺癌的进程。 展开更多
关键词 乳腺癌 dead box rna解旋酶-5 上皮-间质转化 侵袭转移
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DDX5在恶性肿瘤中作用机制的研究进展
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作者 刘郭琦 黄玉梅 +4 位作者 宋娇娇 王文龙 马向瑞 于成龙 左金华 《中国医师杂志》 CAS 2022年第12期1909-1912,共4页
DDX5解螺旋酶(DEAD box helicases 5)又名P68,是一类依赖ATP的RNA解螺旋酶中重要成员之一。研究表明,DDX5在多种癌症中异常表达,靶向多种肿瘤相关的信号通路,调控上下游的因子从而影响肿瘤细胞的发生、侵袭及迁移。本文阐述DDX5在恶性... DDX5解螺旋酶(DEAD box helicases 5)又名P68,是一类依赖ATP的RNA解螺旋酶中重要成员之一。研究表明,DDX5在多种癌症中异常表达,靶向多种肿瘤相关的信号通路,调控上下游的因子从而影响肿瘤细胞的发生、侵袭及迁移。本文阐述DDX5在恶性肿瘤的生物学作用,为肿瘤的靶向治疗提供可能方向。 展开更多
关键词 肿瘤 dead蛋白质5 dead-box rna解旋酶
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DDX家族与肿瘤的相关性研究进展
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作者 张业骞 曹晖 《国际外科学杂志》 2017年第5期350-353,共4页
DEAD-box家族是一类以D(Asp)-E(Glu)-A(Ala)-D(Asp)为保守序列的RNA解旋酶家族,参与需要RNA调节的所有细胞过程。研究表明,DDX家族很多成员在肿瘤组织中表达失调,并且参与肿瘤的发生、发展,在肿瘤细胞的增殖、凋亡、细胞周... DEAD-box家族是一类以D(Asp)-E(Glu)-A(Ala)-D(Asp)为保守序列的RNA解旋酶家族,参与需要RNA调节的所有细胞过程。研究表明,DDX家族很多成员在肿瘤组织中表达失调,并且参与肿瘤的发生、发展,在肿瘤细胞的增殖、凋亡、细胞周期、侵袭、转移以及代谢等方面发挥关键作用,可以作为肿瘤的诊断、恶性程度的评价、临床预后的预测等新的分子标志物,也为肿瘤的治疗提供了新的潜在分子靶标。本文就DDX家族的结构、功能、以及与肿瘤的关系作一综述。 展开更多
关键词 dead蛋白 dead—box rna解旋酶 肿瘤 综述
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伴胚系DDX41突变髓系肿瘤的研究现状
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作者 曾燕平 曲士强 肖志坚 《国际输血及血液学杂志》 CAS 2023年第3期200-205,共6页
胚系DEAD盒RNA解旋酶(DDX)41突变在髓系肿瘤成年患者中检出率高达1.6%~6.0%,系统筛查DDX41突变有助于诊断伴胚系DDX41突变髓系肿瘤。DDX41参与前体mRNA剪接、固有免疫、核糖体生物合成和基因组稳定性调节,胚系DDX41突变可能促进髓系肿... 胚系DEAD盒RNA解旋酶(DDX)41突变在髓系肿瘤成年患者中检出率高达1.6%~6.0%,系统筛查DDX41突变有助于诊断伴胚系DDX41突变髓系肿瘤。DDX41参与前体mRNA剪接、固有免疫、核糖体生物合成和基因组稳定性调节,胚系DDX41突变可能促进髓系肿瘤的发生,并作为潜在的治疗靶点。笔者拟就伴胚系DDX41突变髓系肿瘤患者的临床特征、发病机制、诊治策略等研究现状进行阐述,旨在提高临床医师对此类遗传易感性髓系肿瘤的认识。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 白血病 髓样 急性 生殖细胞系突变 疾病遗传易感性 DDX41突变 deadrna解旋酶
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