DEAH盒解旋酶15对转化生长因子-β_(1)诱导的呼吸道平滑肌细胞增殖和迁移的影响

目的探讨DEAH盒解旋酶15(DHX15)对转化生长因子-β_(1)(TGF-β_(1))诱导的呼吸道平滑肌细胞(ASMCs)增殖和迁移的影响。方法将TGF-β_(1)(20 mg·L^(-1))诱导的ASMCs随机分为对照组、阴性对照组和沉默组。阴性对照组和沉默组细胞分别转染control-siRNA和DHX15-siRNA质粒,对照组细胞不作处理。转染24 h后,采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测各组细胞中DHX15 mRNA相对表达量,细胞计数试剂盒-8实验检测各组细胞增殖能力,Transwell小室实验检测各组细胞迁移能力,Western blot法检测各组细胞中磷酸化p65(p-p65)、磷酸化核因子抑制蛋白(p-IκB)、磷酸化c-Jun氨基末端激酶(p-JNK)、磷酸化p38(p-p38)蛋白的表达。结果对照组和阴性对照组ASMCs中DHX15 mRNA相对表达量、细胞增殖能力、细胞迁移能力比较差异无统计学意义(P>0.05);沉默组ASMCs中DHX15 mRNA相对表达量、细胞增殖能力、细胞迁移能力显著低于对照组和阴性对照组(P<0.05)。对照组和阴性对照组ASMCs中p-p65、p-IκB、p-JNK和p-p38蛋白相对表达量比较差异无统计学意义(P>0.05);沉默组ASMCs中p-p65、p-IκB、p-JNK和p-p38蛋白相对表达量均显著低于对照组和阴性对照组(P<0.05)。结论干扰DHX15表达可显著抑制TGF-β_(1)诱导的ASMCs的增殖和迁移能力,其机制可能与抑制核因子-κB和丝裂原活化蛋白激酶信号通路有关。

泛癌症分析DEAH盒解旋酶16的表达及其预后意义

目的泛癌症分析DEAH盒解旋酶16 (DHX16)的表达、预后意义及作用机制。方法利用癌症基因组图谱组织(TCGA)门户网站UALCAN泛癌症分析DHX16的表达及其与预后关系;通过蛋白之间相互作用平台InBio MapTM下载与DHX16相互作用的蛋白质谱,经DAVID 6.8进行基因本体(GO)和KEGG信号通路分析。结果 DHX16在膀胱尿路上皮癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、肝脏肝细胞癌和胆管癌中高表达(均P <0.001);DHX16高表达利于膀胱尿路上皮癌预后,而不利于肾上腺皮质癌、肉瘤、脑低级别胶质瘤、肝脏肝细胞癌和急性髓样白血病的预后。DHX16相互作用蛋白主要定位于剪接体、细胞核、质膜、胞内核糖核蛋白复合体等,参与mRNA剪接、加工过程等,主要结合多聚腺苷酸RNA、核苷酸、核酸、m RNA内含子等,具有RNA解旋酶活性等功能;参与的信号通路主要包括剪接体、mRNA监测、RNA降解和RNA转运过程。结论 DHX16在膀胱尿路上皮癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、肝脏肝细胞癌和胆管癌中高表达,DHX16高表达有利于膀胱尿路上皮癌预后,而不利于肾上腺皮质癌、肉瘤、脑低级别胶质瘤、肝脏肝细胞癌和急性髓样白血病预后,因此可作为上述肿瘤预后的潜在标志物。

乳腺癌中DEAH盒解旋酶16的表达及临床意义

目的揭示乳腺癌组织中DEAH盒解旋酶16 (DHX16)基因表达变化及其与乳腺癌患者预后的关系。方法利用c BioPortal分析DHX16基因突变、拷贝数变化、mRNA表达变化、m RNA差异表达与预后的关系,DHX16基因甲基化水平与其mRNA水平的关系。利用UALCAN数据平台分析乳腺癌组织与正常乳腺组织中DHX16基因的差异表达。利用LinkedOmics分析乳腺癌组织中DHX16表达与临床指标的相关性,DHX16基因拷贝数变化与mRNA水平的关系。结果 cBioPortal结果显示,16%(170/1 093)的乳腺癌患者发生了DHX16基因改变,包括基因突变、拷贝数变化、mRNA水平改变,其中DHX16 mRNA水平上调(超过对照组平均值2倍)的患者比例为12%,且DHX16高表达不利于患者预后(P <0.01);DHX16 mRNA表达水平与其基因甲基化水平呈负相关(r=-0.32,P <0.05)。UALCAN结果显示,乳腺癌组织中DHX16基因表达水平显著高于正常乳腺组织(P <0.001)。Linked Omics结果显示,乳腺癌患者中DHX16表达水平分别受PAM50分子分型、种族、病理分期、T分期和M分期影响(均P <0.05);DHX16 mRNA表达水平与其基因拷贝数变化呈正相关(r=0.56,P <0.01)。结论乳腺癌中DHX16基因拷贝数增加和低甲基化促进其高表达,DHX16高表达不利于预后,可作为乳腺癌预后的潜在标志物。

DHX33作为可切除结肠癌患者术后辅助化疗预后标志物的临床研究

目的:分析可切除结肠癌(CC)患者肿瘤组织DEAH盒解旋酶33(DHX33)表达作为术后辅助化疗(ACT)预后标志物的临床意义。方法:选取2014年1月至2018年9月期间在我院经根治性手术切除的CC患者215例,所有患者术后接受标准方案的ACT。采用免疫组织化学法分析肿瘤组织和癌旁正常组织中DHX33蛋白表达。以无病生存时间及总生存时间作为主要观察终点。结果:与癌旁正常组织(17.67%,38/215)相比,53.95%(116/215)的肿瘤组织样本中DHX33呈高表达(χ^(2)=61.545,P<0.001)。与DHX33低表达亚组相比,DHX33高表达亚组CC组织微卫星不稳定比例(P=0.020)、cTNMⅢ~ⅣA期比例(P=0.025)及癌旁正常组织DHX33蛋白高表达比例(P=0.049)更高。Kaplan-Meier分析显示,DHX33低表达者无病生存时间和总生存时间更长(χ^(2)分别为12.566、13.986,均P<0.001)。单因素及多因素COX回归分析的结果显示,CC组织中DHX33蛋白高表达是影响手术+ACT治疗后复发(OR为2.321,95%CI 1.359~3.962,P=0.002)和远期死亡(OR为3.327,95%CI 1.635~6.769,P=0.001)的独立危险因素。结论:原发性肿瘤组织中DHX33高表达可能是CC患者根治性手术+ACT治疗后复发和死亡的有效预测因子。

生物信息学分析DHX9在肝细胞癌中表达及临床意义

目的探讨DEAH盒解旋酶9(DHX9)在肝细胞癌(肝癌)早期诊断和治疗中的作用。方法利用GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台从DNA、mRNA和蛋白质3个层面分析肝癌组织和正常肝组织中DHX9的表达情况。通过UALCAN、Kaplan-Meier Plotter在线平台分析DHX9与肝癌临床特征和预后的关系。cBioPortal在线平台分析肝癌中的DHX9基因突变情况,LinkedOmics、WebGestalt在线平台分析DHX9基因的生物学意义。STRING在线平台构建DHX9蛋白相互作用网络。结果GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台分析结果显示,与正常肝组织相比,DHX9 mRNA、DHX9 DNA、DHX9蛋白质在肝癌中明显高表达。DHX9 mRNA表达与年龄、TP53突变、疾病分期和肿瘤分级有关。Kaplan-Meier Plotter在线平台分析显示,DHX9 mRNA低表达肝癌患者的总体生存、疾病特异性生存和无进展生存预后更好(HR=1.48,1.62,1.57;P<0.05)。DHX9基因突变发生率17%(63/370),大多数基因突变为扩增和mRNA增高。DHX9基因突变的表达水平与肿瘤组织学分级有关(P=0.017)。DHX9基因主要参与DNA修复、有丝分裂、DNA代谢、细胞周期调控、解螺旋酶活性、转录因子结合等活动。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,DHX9基因在mRNA监测通路、RNA转运、酪氨酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等中富集。DHX9蛋白参与DNA修复途径,促进核糖体招募、翻译起始,细胞的生长和分裂等活动。结论DHX9基因主要参与DNA修复、RNA转运、细胞周期调控、PPAR信号通路等重要生物学过程。DHX9在肝癌组织中高表达,与肿瘤分级、分期有关,且低表达患者生存预后较好。