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生物信息学分析DHX9在肝细胞癌中表达及临床意义 被引量:1
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作者 袁晓峰 徐雯 +2 位作者 闫凌 毕筱刚 李明亮 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 CAS 2021年第6期636-641,共6页
目的探讨DEAH盒解旋酶9(DHX9)在肝细胞癌(肝癌)早期诊断和治疗中的作用。方法利用GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台从DNA、mRNA和蛋白质3个层面分析肝癌组织和正常肝组织中DHX9的表达情况。通过UALCAN、Kaplan-Meier P... 目的探讨DEAH盒解旋酶9(DHX9)在肝细胞癌(肝癌)早期诊断和治疗中的作用。方法利用GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台从DNA、mRNA和蛋白质3个层面分析肝癌组织和正常肝组织中DHX9的表达情况。通过UALCAN、Kaplan-Meier Plotter在线平台分析DHX9与肝癌临床特征和预后的关系。cBioPortal在线平台分析肝癌中的DHX9基因突变情况,LinkedOmics、WebGestalt在线平台分析DHX9基因的生物学意义。STRING在线平台构建DHX9蛋白相互作用网络。结果GEPIA、Oncomine、The Human Protein Atlas在线平台分析结果显示,与正常肝组织相比,DHX9 mRNA、DHX9 DNA、DHX9蛋白质在肝癌中明显高表达。DHX9 mRNA表达与年龄、TP53突变、疾病分期和肿瘤分级有关。Kaplan-Meier Plotter在线平台分析显示,DHX9 mRNA低表达肝癌患者的总体生存、疾病特异性生存和无进展生存预后更好(HR=1.48,1.62,1.57;P<0.05)。DHX9基因突变发生率17%(63/370),大多数基因突变为扩增和mRNA增高。DHX9基因突变的表达水平与肿瘤组织学分级有关(P=0.017)。DHX9基因主要参与DNA修复、有丝分裂、DNA代谢、细胞周期调控、解螺旋酶活性、转录因子结合等活动。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,DHX9基因在mRNA监测通路、RNA转运、酪氨酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等中富集。DHX9蛋白参与DNA修复途径,促进核糖体招募、翻译起始,细胞的生长和分裂等活动。结论DHX9基因主要参与DNA修复、RNA转运、细胞周期调控、PPAR信号通路等重要生物学过程。DHX9在肝癌组织中高表达,与肿瘤分级、分期有关,且低表达患者生存预后较好。 展开更多
关键词 肝细胞 计算生物学 早期诊断 deah盒解旋酶9
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