SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1表达在三阴性乳腺癌组织中的临床意义

目的探讨分泌性卷曲相关蛋白4(SFRP4)、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)、程序性死亡蛋白配体-1(PD-L1)在三阴性乳腺癌(TNBC)组织中表达意义。方法选取83例TNBC患者作为研究对象,均于术中采集肿瘤组织及癌旁正常组织,采用免疫组化SP法检测SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1表达情况,比较肿瘤组织及正常组织内上述表达情况;并分析SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1表达与患者年龄、绝经状态、肿瘤直径、淋巴结转移、肿瘤分期等病理特征的关系。结果肿瘤组织内SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1阳性表达率高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05);SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1阳性表达患者肿瘤直径≥3 cm、临床分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移占比高于SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1阴性表达患者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SFRP4、HMGB1、DEPDC1B及PD-L1在TNBC组织内存在较高表达,且高表达与肿瘤分期、淋巴结转移关系密切,可用于指导临床完善治疗方案。

DEPDC1B结合p65在肝癌细胞和荷瘤小鼠肿瘤生长中的作用及机制研究

目的 研究DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)在肝癌细胞和荷瘤小鼠肿瘤生长中的作用及相关机制。方法 分别将过表达DEPDC1B的质粒(oe-flagDEPDC1B)与对照质粒(oe-NC)转染至H22肝癌细胞系中,采用蛋白质印迹法检测flag和DEPDC1B蛋白表达水平,采用CCK-8法检测细胞增殖能力。通过flag抗体富集flag-DEPDC1B结合蛋白,通过质谱进行鉴定,并对免疫共沉淀物进行关键蛋白验证。在oe-flag-DEPDC1B转染细胞中加入p65抑制剂Helenalin,采用实时荧光定量PCR法检测IL-1β、IL-6、TNF-α的m RNA表达水平,采用CCK-8法检测细胞增殖能力。分别将oe-flag-DEPDC1B和oe-NC转染细胞注射至C57/B6小鼠皮下,注射后2周开始监测小鼠肿瘤体积,注射后5周处死小鼠。分别采用实时荧光定量PCR法、蛋白质印迹法和ELISA法检测肿瘤组织中DEPDC1B、p65、IL-1β、IL-6和TNF-α的表达水平。结果 与oe-NC组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B组细胞中DEPDC1B蛋白表达水平显著升高,细胞增殖能力显著增强(P均<0.05)。flagDEPDC1B可结合关键蛋白p65,免疫沉淀物中可以检测到p65蛋白。与oe-NC组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B组细胞中IL-1β、IL-6、TNF-α的mRNA表达水平均显著升高(P均<0.05)。与oe-flag-DEPDC1B组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B+Helenalin组细胞中IL-1β、IL-6、TNF-α的m RNA表达水平均显著降低,细胞增殖能力均显著减弱(P均<0.05)。在荷瘤小鼠中,与oe-NC组小鼠比较,oe-flag-DEPDC1B组小鼠的肿瘤体积增长更快,肿瘤组织中DEPDC1B、p65、IL-1β、IL-6和TNF-α的表达水平均显著升高(P均<0.05)。结论 DEPDC1B可通过结合NF-κB信号通路中关键蛋白p65激活NF-κB信号通路,促进肝癌生长。

肝细胞癌组织中DEPDC1B和KIF23的表达及其预后预测价值

目的探究肝细胞癌(HCC)组织中DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)和驱动蛋白家族成员23(KIF23)的表达及其预后预测价值。方法选择2018年3月至2019年3月湖南中医药高等专科学校附属第一医院诊治的126例HCC患者作为研究对象,收集其HCC组织、癌旁组织及临床资料。采用免疫组织化学法检测组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达情况。分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中HCC组织和癌旁组织中DEPDC1B和KIF23的mRNA表达水平差异。分析HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达与患者临床病理特征的相关性。采用Kaplan-Meier曲线(Log-rank检验)分析DEPDC1B和KIF23的蛋白表达与患者预后的关系。采用单因素及多因素COX比例风险模型分析HCC患者预后的危险因素。结果TCGA数据分析结果显示,HCC组织中DEPDC1B和KIF23的mRNA相对表达量均显著高于癌旁正常肝组织(1.861±1.271比0.314±0.116,1.652±1.089比0.218±0.157,P均<0.0001)。HCC组织中DEPDC1B阳性表达主要位于细胞质和细胞膜,KIF23阳性表达主要位于细胞质和细胞核。HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达阳性率均显著高于癌旁组织[71.43%(90/126)比10.32%(13/126),χ^(2)=97.355,P=0.000;75.40%(95/126)比11.90%(15/126),χ^(2)=103.252;P=0.000]。HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达均与肿瘤分期、组织学分级及有无血管侵犯有关(P均<0.05)。HCC组织中DEPDC1B与KIF23的mRNA表达呈显著正相关(r=0.913,P=0.000),DEPDC1B与KIF23的蛋白表达亦呈显著正相关(Rs=0.811,P=0.000)。DEPDC1B阳性表达组的3年累积生存率显著低于DEPDC1B阴性表达组(χ^(2)=4.433,P=0.035)。KIF23阳性表达组的3年累积生存率显著低于KIF23阴性表达组(χ^(2)=6.125,P=0.013)。肿瘤分期Ⅱ~Ⅲ期、组织学分级Ⅲ级、血管侵犯、DEPDC1B阳性表达及KIF23阳性表达均是HCC患者预后的独立危险因素。结论HCC组织中DEPDC1B和KIF23的表达上调,两者均与肿瘤分期、组织学分级及有无血管侵犯有关,DEPDC1B、KIF23阳性表达均是HCC患者预后的独立危险因素。

沉默DEPDC1抑制鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移

DEPDC1(DEP domain containing 1)是一个新的肿瘤相关基因,在多种恶性肿瘤的发生发展进程中起着重要作用。我们前期工作中在鼻咽癌细胞内沉默了DEPDC1的表达,发现抑制细胞增殖并诱发细胞凋亡。本研究旨在探讨沉默DEPDC1表达后,对鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移能力的影响及其分子机制。结果显示,siRNA介导DEPDC1表达沉默后,细胞侧向运动能力、侵袭及迁移能力显著降低。qRT-PCR及Western印迹检测发现DEPDC1沉默导致EMT上游关键转录因子Twist1及间质细胞标志分子Vimentin表达显著下调。这些研究表明,鼻咽癌细胞中DEPDC1通过调节Twist1等EMT关键分子的表达在细胞侵袭转移过程中起关键作用。推测DEPDC1在鼻咽癌中高表达可能对于促进其侵袭转移具有重要作用,进而促进肿瘤发生发展,但具体分子机制仍有待更深入研究。

DEP结构域的功能研究进展

DEP结构域首先是在三种蛋白(鼠蓬乱蛋白、产卵缺陷10蛋白、血小板-白细胞C激酶底物2蛋白)中发现的,是一个由接近100个氨基酸组成的蛋白模序。人类基因组中至少有67种基因编码含DEP同源结构域蛋白。目前所了解的DEP结构域具有细胞膜定位、信号转导等多种功能。因此,它在细胞的生物学功能方面发挥着重要作用。可通过发掘DEP结构域与复杂的生物系统中多种分子和基因的相互作用,进一步研究DEP结构域的功能。

过表达DEPDC1对鼻咽癌细胞CNE-1增殖影响的研究

目的:DEPDC1(DEP domain containing 1)是近年来发现的一个肿瘤相关基因,前期研究结果显示其对鼻咽癌发生发展具有重要作用,本研究旨在进一步探讨过表达DEPDC1对鼻咽癌细胞增殖的影响。方法:在鼻咽癌细胞系CNE-1中,分别转染过表达DEPDC1-V1及DEPDC1-V2两种剪接体质粒,瞬时表达48 h后综合利用CCK-8、流式细胞技术及p HH3标记法检测细胞增殖情况。结果:Western blot检测显示在CNE-1细胞瞬时转染DEPDC1-V1和DEPDC1-V2质粒可过表达DEPDC1。CCK-8实验结果表明,过表达DEPDC1-V1及DEPDC1-V2均显著促进CNE-1细胞增殖。流式细胞检测结果表明,与对照组相比过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2后均导致G2/M期细胞增多。p HH3检测结果显示,过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2后有丝分裂活跃,细胞周期进程加快。进一步定量RT-PCR检测发现,过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2导致细胞周期进程关键调节因子Fox M1及其下游靶基因CCNB2、PLK1和MYBL2表达量上调。结论:本研究通过在鼻咽癌CNE-1细胞株中过表达两个剪接体DEPDC1-V1及DEPDC1-V2,证明DEPDC1在鼻咽癌细胞中高表达对促进细胞的增殖具有重要作用。

宫颈癌及宫颈癌前病变组织中DEPDC1、miR-216a-5p的表达及其与高危型HPV感染的相关性

目的探究DEP结构域蛋白1(DEPDC1)、miR-216a-5p在宫颈癌及宫颈癌前病变组织中的表达及其与高危人乳头瘤病毒(HR-HPV)感染的相关性。方法选取2020年12月至2022年4月汉中市中心医院妇科收治的94例宫颈病变患者为研究对象,其中62例宫颈癌前病变患者的宫颈病变组织作为癌前病变组,32例宫颈癌患者的癌组织作为宫颈癌组。同期选择因患子宫肌瘤行子宫全切患者的30例正常宫颈组织作为对照组。采用q RT-PCR检测DEPDC1、miR-216a-5p的表达水平;采用免疫组化法测定DEPDC1蛋白的表达水平;采用Pearson法分析宫颈组织中DEPDC1与miR-216a-5p表达水平的相关性,以及DEPDC1、miR-216a-5p表达水平与癌前病变组和宫颈癌组HR-HPV感染的相关性。结果与对照组比较,癌前病变组、宫颈癌组DEPDC1的阳性表达率显著升高,差异有统计学意义(P<0.05)。其阳性表达率分别为36.67%、40.32%、100.00%。随着宫颈病变程度的增加,DEPDC1的水平显著升高(1.02±0.21、1.42±0.23、1.78±0.25),miR-216a-5p水平显著降低(1.01±0.11、0.85±0.12、0.68±0.13),HR-HPV感染率显著增加(6.67%、91.94%、100.00%),差异有统计学意义(P<0.05)。经Pearson相关性分析结果显示,癌前病变组、宫颈癌组患者宫颈组织中DEPDC1与miR-216a-5p表达水平呈负相关(r=-0.442,P<0.001)。宫颈组织中DEPDC1表达水平与癌前病变组、宫颈癌组患者HR-HPV感染呈正相关(r=0.296,P=0.004),miR-216a-5p表达水平与癌前病变组、宫颈癌组患者HR-HPV感染呈负相关(r=-0.252,P=0.014)。结论癌前病变和宫颈癌患者宫颈组织中DEPDC的表达水平显著升高,miR-216a-5p水平显著降低,两者与HR-HPV感染有关。

基于生物信息数据库分析含DEP结构域的蛋白质1在子宫内膜癌中的表达和预后意义

目的通过探讨含DEP结构域的蛋白质1(DEP domain containing 1,DEPDC1)在子宫内膜癌(Endometrial cancer,EC)组织中的表达,阐明其对EC诊断和预后的意义。方法利用UALCAN在线分析工具分析DEPDC1 mRNA在EC中的表达以及与临床病理特征的相关性。利用人类蛋白质表达图谱(The human protein atlas,HPA)数据库分析DEPDC1蛋白在EC中的表达。Kaplan-Meier Plotter用于分析DEPDC1表达与EC预后的关系。采用STRING和Metascape在线分析工具探索DEPDC1相互作用蛋白网络以及功能富集。结果DEPDC1的mRNA和蛋白水平在EC中的表达高于正常子宫内膜组织,DEPDC1基因的表达与人种、肿瘤分期、组织亚型以及TP53突变状态相关。DEPDC1的高表达与EC的不良预后相关。与DEPDC1相互作用的蛋白富集于有丝分裂、微管相关运动等生物学进程。结论DEPDC1可能与EC的恶性表型和进展有关,可能作为EC潜在的诊断标志物和治疗靶点。

DEPDC1B在肝癌增殖、迁移和上皮间质转化中的作用及其临床相关性研究

目的:研究DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)对肝癌细胞增殖、迁移和上皮间质转化的作用以及在临床中的相关性。方法:收集39例肝癌肿瘤组织及其癌旁组织,qRT-PCR检测DEPDC1B表达水平并分析与临床病理特征的相关性,通过Kaplan-Meier数据库分析DEPDC1B表达水平与临床预后的相关性。采用qRT-PCR检测L-02正常肝上皮细胞和HepG2肝癌细胞DEPDC1B表达水平,Western Blot检测DEPDC1B、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平。将si-DEPDC1B和si-NC转染至HepG2细胞,采用qRT-PCR检测DEPDC1B表达水平,Western Blot检测DEPDC1B、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平,采用CCK8和集落形成实验检测细胞增殖水平,Transwell和细胞划痕实验检测细胞迁移水平。结果:与癌旁组织相比,肿瘤组织中DEPDC1B表达水平升高,DEPDC1B高表达与肿瘤分期和淋巴结转移相关,与治疗后的不良预后相关。与L-02细胞相比,HepG2细胞DEPDC1B表达升高,N-cadherin蛋白表达升高,E-cadherin蛋白表达降低。与si-NC组比较,si-DEPDC1B组DEPDC1B表达降低,细胞增殖、迁移水平降低,N-cadherin蛋白水平降低,E-cadherin蛋白表达升高。结论:DEPDC1B可以促进肝癌细胞增殖、迁移和上皮间质转化,临床上DEPDC1B高表达与肿瘤晚期、淋巴结发生转移以及不良预后相关。

DEPDC1稳定沉默CNE-1细胞株的构建与分析

目的:为了进一步探讨DEPDC1(DEP domain containing 1)在肿瘤发生发展中的作用。DEPDC1是近年发现的一个肿瘤相关基因,前期研究结果显示其在鼻咽癌细胞周期及癌变过程中具有作用。方法:利用qRT-PCR和免疫组织化学染色分别检测DEPDC1在18例新鲜样品和44例组织芯片肿瘤患者中的表达情况。人鼻咽癌细胞系CNE-1稳定沉默DEPDC1后,流式细胞检测细胞增殖并利用Transwell小室分析侵袭迁移情况。结果:DEPDC1在鼻咽癌组织中表达量(0.699±0.521)明显高于正常组织(0.408±0.183),差异有统计学意义(P<0.05)。DEPDC1稳定沉默后,CCK8检测结果表明CNE-1细胞增殖速度减慢。流式细胞检测的结果显示,G1期细胞减少,G2/M期细胞增多,细胞周期进程受阻。划痕及Transwell实验结果表明,DEPDC1稳定沉默明显减弱了CNE-1细胞运动,侵袭及迁移能力(77.033±5.183 vs.20.137±2.828,107.336±5.033 vs.26.326±1.414),差异均有统计学意义(P<0.05)。进一步定量qRT-PCR及Western blot检测发现,DEPDC1稳定沉默导致上皮细胞标志分子E-cadherin(0.457±0.022)显著上调、而间质细胞标志分子Vimentin(0.780±0.063)、N-cadherin(0.780±0.063)以及EMT上游关键转录因子Twist1(0.710±0.034)下调(P<0.05)。结论:本研究成功构建了DEPDC1稳定沉默细胞株,与前期si RNA介导的瞬时沉默相似的是,发现DEPDC1稳定沉默可抑制鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移,并改变EMT关键分子的表达,为进一步探索DEPDC1在鼻咽癌中的作用机制奠定了基础。

DEPDC1B与CDK1在甲状腺乳头状癌中的表达及临床病理意义

目的探讨含DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)与周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)在甲状腺乳头状癌(PTC)、甲状腺良性病变及癌旁正常组织中的表达,分析DEPDC1B和CDK1表达在PTC中的相关性及临床病理意义。方法收集66例PTC、40例良性病变及56例癌旁正常组织,采用免疫组化检测DEPDC1B与CDK1在PTC、良性病变及癌旁正常组织中的蛋白表达情况,分析DEPDC1B和CDK1的表达水平与PTC临床病理特征及DEPDC1B和CDK1之间表达的相关性。结果DEPDC1B和CDK1在PTC中呈高表达,在良性病变和癌旁组织中呈低表达,差异有统计学意义(P<0.05);DEPDC1B高表达率在肿瘤多灶发生病例中明显高于单灶发生病例,在肿瘤直径较大者中明显高于较小者(P均=0.027);CDK1的高表达率在肿瘤直径较大者中明显高于较小者(P均=0.030);在PTC中DEPDC1B与CDK1的表达呈现正相关(P=0.000)。结论DEPDC1B和CDK1在PTC组织中高表达,对区分甲状腺良性病变与PTC具有一定意义;DEPDC1B与CDK1可能协同促进PTC的发展。

癌蛋白DEPDC1B的研究进展

含有DEP结构域的蛋白质1B(DEPDC1B)高表达于多种恶性肿瘤组织及细胞,其作为癌蛋白参与了多种癌症的发生发展进程,调控了不同的恶性生物学行为,包括促进肿瘤细胞的侵袭、迁移和增殖以及抑制细胞凋亡等,这与其含有的DEP、Rho GAP等结构域的功能密切相关。本文主要结合癌蛋白DEPDC1B的结构域组成,探讨其与癌症发生发展及治疗的关系,旨在为深入研究DEPDC1B在癌症中的作用机制及潜在的抗癌疗法提供参考依据。

DEPDC1在子宫内膜癌中表达上调

目的观察DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在子宫内膜癌(UCEC)中的表达及作用。方法利用GEO和TCGA等公共数据库分析DEPDC1 mRNA在UCEC中的表达情况,以及其与临床病理参数及预后的相关性;利用组织芯片、免疫印迹和实时定量PCR检测DEPDC1在UCEC组织和细胞系中的表达;利用平板集落、CCK8法和裸鼠成瘤等实验检测DEPDC1对UCEC细胞系增殖的影响。结果DEPDC1 mRNA在UCEC中表达上调(P<0.001),其表达与UCEC临床分期(P<0.001)、组织分化程度(P<0.05)及病理类型(P<0.001)等临床病理参数显著相关;相较于DEPDC1 mRNA低表达的患者,高表达的患者疾病特异生存期(DSS)和无进展期(PFI)显著降低(P<0.01);DEPDC1在UCEC组织和细胞系中高表达,敲降DEPDC1后,UCEC细胞系的集落形成减少、细胞率降低(P<0.01)和体内成瘤能力下降(P<0.05)。结论DEPDC1在UCEC中表达上调,参与UCEC的恶性进展及影响患者预后,并在UCEC细胞系增殖中发挥重要调控作用。

DEPDC1B、NOB1水平变化与三阴性乳腺癌患者相关病理学参数的关系

目的 探讨DEP结构域蛋白质1B(DEPDC1B)、Nin-one结合蛋白(NOB1)水平变化与三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)患者相关病理学参数的关系及临床意义。方法 选取行乳腺癌根治术的81例TNBC患者设为观察组,选取同期因乳腺良性疾病行手术治疗的21例患者设为对照组。随访1年后(失访6例)根据预后情况分为预后良好者57例(生存)、预后不良者18例(病死、病情恶化或复发)。比较TNBC组织、癌旁组织、良性病变组织中DEPDC1B、NOB1表达量。分别比较不同病理学参数、不同预后患者癌组织中DEPDC1B、NOB1表达量。分析DEPDC1B、NOB1表达量与病理学参数、预后相关性。结果 TNBC组织、良性病变组织中DEPDC1B、NOB1表达量高于癌旁组织,且TNBC组织高于良性病变组织(P<0.05);预后不良者中DEPDC1B、NOB1表达量高于预后良好者(P<0.05);DEPDC1B、NOB1表达量与淋巴结转移、临床分期、脉管瘤栓呈正相关,与分化程度呈负相关(P<0.05);DEPDC1B、NOB1高表达者总生存率(66.67%、65.79%)分别低于其相应低表达者86.11%、86.49%(P<0.05)。结论 DEPDC1B、NOB1在TNBC组织中呈高表达,且与临床病理学参数相关,可能用于预后评估。

DEP结构域蛋白1B在肝细胞癌中的表达及功能

目的:探讨DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)在肝细胞癌(肝癌)中的表达及功能。方法:检索公共癌症数据库(UALCAN、HPA)分析DEPDC1B在肝癌中的表达;从癌症基因组图谱(TCGA)数据库()获得肝癌的RNAseq数据(level3)和相应的临床信息,Log-rank用于检验Kaplan-Meier生存分析比较上述两组或多组之间的生存差异;单因素及多因素Cox分析DEPDC1B的预后价值并构建列线图。利用siRNA抑制DEPDC1B表达,通过Transwell小室实验检测细胞侵袭、迁移变化;利用STRING构建DEPDC1B蛋白质相互作用网络(PPI)并分析其在肝癌中潜在作用机制。结果:肝癌组织中DEPDC1B基因表达量明显高于正常组织(P<0.05)。肝癌DEPDC1B蛋白的阳性表达率为70%,在20种常见癌症的阳性表达率中排名第一。TCGA数据分析显示,DEPDC1B高表达肝癌患者总体生存期和无病生存期均较差(HR=1.673,1.434;P<0.05),其可作为肝癌的独立预后因子且能效预测患者生存率。Transwell小室实验结果显示,siRNA能明显抑制MHCC97-H、Hep3B肝癌细胞DEPDC1Bb表达;下调DEPDC1B表达后,肿瘤细胞的侵袭及迁移能力减弱。PPI网络构建分析显示,DEPDC1B与TsC/mTOR、RTK、RAS/MAPK、PI3K/AKT、雌激素受体、雄激素受体、上皮间质转化、DNA损伤反应、细胞周期和细胞凋亡等肿瘤标志性信号通路密切相关。结论:DEPDC1B在肝癌中高表达,其高表达与患者预后差相关,下调其表达肝癌细胞侵袭迁移能力下降。

DEPDC超家族蛋白的结构与功能

DEP(Dishevelled,Egg-laying defective protein 10 and Pleckstrin)结构域由约90个保守的氨基酸残基组成,最早在DVL(Dishevelled)、EGL-10(Egg-laying defective protein 10)和PLEK(Pleckstrin)三个蛋白中被发现。越来越多的证据表明,DEPDC(DEP domain-containing)超家族蛋白在生物学中扮演着多种重要的角色,特别是与生物体内信号转导及癌症等相关。该文浅析了DEPDC超家族蛋白的结构与功能,以期为今后进一步揭开DEP结构域的结构与功能奠定基础。

DEPDC7基因在肝细胞及肿瘤细胞中的差异性表达

目的研究DEPDC7基因在正常肝细胞、肝癌细胞及其他肿瘤细胞中的表达情况。方法常规培养正常肝细胞HL-7702,肝癌细胞SMMC7721、HepG2、Huh-7,其他肿瘤细胞ZR-7530、MDA-MB-231、SGC7901、SW480。用MTT检测肝癌细胞转染前后的增殖情况,用RT-PCR方法在转录水平检测DEPDC7基因的表达,用Western blot方法从蛋白质水平检测DEPDC7蛋白的表达。结果 3株肝癌细胞生长增殖速度差异有统计学意义(P<0.05)。肝癌细胞DEPDC7基因在mRNA和蛋白质表达水平比正常肝细胞降低(P<0.05),而其他肿瘤细胞DEPDC7基因表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论 DEPDC7基因在正常肝细胞中选择性高表达,而在肝癌细胞株中呈低表达。

DEP结构域的结构与功能

DEP结构域首次在Dishevelled、EGL-10和Pleckstrin三种蛋白质中发现,是一个高度保守的蛋白结构域。过去20年的研究表明,DEP结构域存在于许多信号蛋白中,并参与了信号转导、细胞极性确立和小分子信号激活等生命活动过程,特别是在GPCR信号转导和Wnt信号通路中起着至关重要的作用。本文将结合最新研究进展,以及通过生物信息学的数据挖掘,对DEP结构域的结构和功能进行简要概述。

DEPTOR诱导Caspase-1介导的细胞焦亡提高食管鳞癌细胞顺铂化疗敏感性

化疗耐药是导致晚期食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)患者预后不良的主要原因。细胞焦亡是化疗药物发挥抗肿瘤作用的机制之一。研究表明,包含DEP域的与哺乳类动物雷帕霉素靶蛋白相互作用的蛋白(DEP-domain containing mTOR-interacting protein, DEPTOR)作为雷帕霉素靶蛋白(mammalian/mechanistic target of rapamycin, mTOR)的内源性抑制蛋白,与索拉非尼、吉非替尼耐药有关。本研究利用DEPTOR敲减(shDEPTOR)慢病毒载体,建立DEPTOR敲减的食管鳞癌细胞稳定表达株。结果表明:在DEPTOR敲减食管鳞癌细胞中,细胞对顺铂的敏感性降低。在顺铂刺激下, DEPTOR敲减的细胞发生典型细胞焦亡形态学的改变较对照组减少。进一步研究表明:DEPTOR表达的减少导致Caspase-1蛋白表达的降低及活化减少,从而抑制细胞焦亡经典途径的激活。本文结果表明, DEPTOR可以通过增加Caspase-1介导的细胞焦亡,提高食管鳞癌细胞对顺铂的敏感性。

DEP结构域蛋白质1B在胰腺癌中的表达及其临床意义

背景与目的:已有研究显示,DEP结构域蛋白质1B(DEPDC1B)在多种肿瘤中异常表达并在肿瘤进展中发挥重要作用,DEPDC1B在胰腺癌中的表达水平及临床意义尚不清楚。本研究通过检测胰腺癌组织中DEPDC1B的表达,分析其与胰腺癌患者临床病理特征及预后的关系,从而探讨其在胰腺癌中的临床意义。方法:下载癌症基因组图谱(TCGA)和高通量基因表达数据库(GEO)的胰腺癌患者临床数据,分析DEPDC1B在胰腺癌组织中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存曲线及Cox风险模型分析DEPDC1B表达与胰腺癌患者预后的关系。采用免疫组织化学法检测97例胰腺癌组织和癌旁组织中DEPDC1B的表达,根据患者临床资料进一步分析DEPDC1B与胰腺癌临床病理特征以及胰腺癌患者预后的关系。结果:在TCGA与GEO的GSE16515、GSE15471和GSE28735数据集中,DEPDC1B在胰腺癌组织中的表达明显高于匹配的正常组织(均P<0.05);在TCGA数据库与GSE28735数据集中,DEPDC1B高表达胰腺癌患者生存时间明显缩短(均P<0.05);TCGA中DEPDC1B表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.32,95%CI=1.118~1.559,P=0.001)。97例临床胰腺癌患者中,胰腺癌组织中DEPDC1B的阳性表达率明显高于癌旁组织胰腺组织(69.07%vs.11.34%,P<0.001);DEPDC1B的表达与分化程度、临床分期及淋巴结转移有关(均P<0.05);DEPDC1B高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.05);DEPDC1B表达是预后的独立危险因素(HR=1.126,95%CI=1.012~1.253,P=0.029)。结论:DEPDC1B高表达可能参与胰腺癌的发生、发展及转移过程,并可作为判断胰腺癌预后的重要指标。