DEP结构域蛋白质1B在胰腺癌中的表达及其临床意义

背景与目的:已有研究显示,DEP结构域蛋白质1B(DEPDC1B)在多种肿瘤中异常表达并在肿瘤进展中发挥重要作用,DEPDC1B在胰腺癌中的表达水平及临床意义尚不清楚。本研究通过检测胰腺癌组织中DEPDC1B的表达,分析其与胰腺癌患者临床病理特征及预后的关系,从而探讨其在胰腺癌中的临床意义。方法:下载癌症基因组图谱(TCGA)和高通量基因表达数据库(GEO)的胰腺癌患者临床数据,分析DEPDC1B在胰腺癌组织中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存曲线及Cox风险模型分析DEPDC1B表达与胰腺癌患者预后的关系。采用免疫组织化学法检测97例胰腺癌组织和癌旁组织中DEPDC1B的表达,根据患者临床资料进一步分析DEPDC1B与胰腺癌临床病理特征以及胰腺癌患者预后的关系。结果:在TCGA与GEO的GSE16515、GSE15471和GSE28735数据集中,DEPDC1B在胰腺癌组织中的表达明显高于匹配的正常组织(均P<0.05);在TCGA数据库与GSE28735数据集中,DEPDC1B高表达胰腺癌患者生存时间明显缩短(均P<0.05);TCGA中DEPDC1B表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.32,95%CI=1.118~1.559,P=0.001)。97例临床胰腺癌患者中,胰腺癌组织中DEPDC1B的阳性表达率明显高于癌旁组织胰腺组织(69.07%vs.11.34%,P<0.001);DEPDC1B的表达与分化程度、临床分期及淋巴结转移有关(均P<0.05);DEPDC1B高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.05);DEPDC1B表达是预后的独立危险因素(HR=1.126,95%CI=1.012~1.253,P=0.029)。结论:DEPDC1B高表达可能参与胰腺癌的发生、发展及转移过程,并可作为判断胰腺癌预后的重要指标。

含DEP结构域的蛋白质1在癌症发生发展中的作用

癌症是人类所面临的严重健康问题之一,如何从分子水平理解癌症的发生发展机制,发现新颖的诊断标志物和治疗靶点是当今癌症研究热点之一。近年的研究发现含DEP结构域的蛋白质1(DEPDC1)与多种癌症的发生发展及预后有着密切的关联,有望成为癌症诊断的标志物和预后预测标志物。本文对DEPDC1在癌症发生及发展中的作用研究进展做一综述。

肝细胞癌组织中DEPDC1B和KIF23的表达及其预后预测价值

目的探究肝细胞癌(HCC)组织中DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)和驱动蛋白家族成员23(KIF23)的表达及其预后预测价值。方法选择2018年3月至2019年3月湖南中医药高等专科学校附属第一医院诊治的126例HCC患者作为研究对象,收集其HCC组织、癌旁组织及临床资料。采用免疫组织化学法检测组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达情况。分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中HCC组织和癌旁组织中DEPDC1B和KIF23的mRNA表达水平差异。分析HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达与患者临床病理特征的相关性。采用Kaplan-Meier曲线(Log-rank检验)分析DEPDC1B和KIF23的蛋白表达与患者预后的关系。采用单因素及多因素COX比例风险模型分析HCC患者预后的危险因素。结果TCGA数据分析结果显示,HCC组织中DEPDC1B和KIF23的mRNA相对表达量均显著高于癌旁正常肝组织(1.861±1.271比0.314±0.116,1.652±1.089比0.218±0.157,P均<0.0001)。HCC组织中DEPDC1B阳性表达主要位于细胞质和细胞膜,KIF23阳性表达主要位于细胞质和细胞核。HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达阳性率均显著高于癌旁组织[71.43%(90/126)比10.32%(13/126),χ^(2)=97.355,P=0.000;75.40%(95/126)比11.90%(15/126),χ^(2)=103.252;P=0.000]。HCC组织中DEPDC1B和KIF23的蛋白表达均与肿瘤分期、组织学分级及有无血管侵犯有关(P均<0.05)。HCC组织中DEPDC1B与KIF23的mRNA表达呈显著正相关(r=0.913,P=0.000),DEPDC1B与KIF23的蛋白表达亦呈显著正相关(Rs=0.811,P=0.000)。DEPDC1B阳性表达组的3年累积生存率显著低于DEPDC1B阴性表达组(χ^(2)=4.433,P=0.035)。KIF23阳性表达组的3年累积生存率显著低于KIF23阴性表达组(χ^(2)=6.125,P=0.013)。肿瘤分期Ⅱ~Ⅲ期、组织学分级Ⅲ级、血管侵犯、DEPDC1B阳性表达及KIF23阳性表达均是HCC患者预后的独立危险因素。结论HCC组织中DEPDC1B和KIF23的表达上调,两者均与肿瘤分期、组织学分级及有无血管侵犯有关,DEPDC1B、KIF23阳性表达均是HCC患者预后的独立危险因素。

基于生物信息数据库分析含DEP结构域的蛋白质1在子宫内膜癌中的表达和预后意义

目的通过探讨含DEP结构域的蛋白质1(DEP domain containing 1,DEPDC1)在子宫内膜癌(Endometrial cancer,EC)组织中的表达,阐明其对EC诊断和预后的意义。方法利用UALCAN在线分析工具分析DEPDC1 mRNA在EC中的表达以及与临床病理特征的相关性。利用人类蛋白质表达图谱(The human protein atlas,HPA)数据库分析DEPDC1蛋白在EC中的表达。Kaplan-Meier Plotter用于分析DEPDC1表达与EC预后的关系。采用STRING和Metascape在线分析工具探索DEPDC1相互作用蛋白网络以及功能富集。结果DEPDC1的mRNA和蛋白水平在EC中的表达高于正常子宫内膜组织,DEPDC1基因的表达与人种、肿瘤分期、组织亚型以及TP53突变状态相关。DEPDC1的高表达与EC的不良预后相关。与DEPDC1相互作用的蛋白富集于有丝分裂、微管相关运动等生物学进程。结论DEPDC1可能与EC的恶性表型和进展有关,可能作为EC潜在的诊断标志物和治疗靶点。

DEPDC1B结合p65在肝癌细胞和荷瘤小鼠肿瘤生长中的作用及机制研究

目的 研究DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)在肝癌细胞和荷瘤小鼠肿瘤生长中的作用及相关机制。方法 分别将过表达DEPDC1B的质粒(oe-flagDEPDC1B)与对照质粒(oe-NC)转染至H22肝癌细胞系中,采用蛋白质印迹法检测flag和DEPDC1B蛋白表达水平,采用CCK-8法检测细胞增殖能力。通过flag抗体富集flag-DEPDC1B结合蛋白,通过质谱进行鉴定,并对免疫共沉淀物进行关键蛋白验证。在oe-flag-DEPDC1B转染细胞中加入p65抑制剂Helenalin,采用实时荧光定量PCR法检测IL-1β、IL-6、TNF-α的m RNA表达水平,采用CCK-8法检测细胞增殖能力。分别将oe-flag-DEPDC1B和oe-NC转染细胞注射至C57/B6小鼠皮下,注射后2周开始监测小鼠肿瘤体积,注射后5周处死小鼠。分别采用实时荧光定量PCR法、蛋白质印迹法和ELISA法检测肿瘤组织中DEPDC1B、p65、IL-1β、IL-6和TNF-α的表达水平。结果 与oe-NC组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B组细胞中DEPDC1B蛋白表达水平显著升高,细胞增殖能力显著增强(P均<0.05)。flagDEPDC1B可结合关键蛋白p65,免疫沉淀物中可以检测到p65蛋白。与oe-NC组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B组细胞中IL-1β、IL-6、TNF-α的mRNA表达水平均显著升高(P均<0.05)。与oe-flag-DEPDC1B组细胞比较,oe-flag-DEPDC1B+Helenalin组细胞中IL-1β、IL-6、TNF-α的m RNA表达水平均显著降低,细胞增殖能力均显著减弱(P均<0.05)。在荷瘤小鼠中,与oe-NC组小鼠比较,oe-flag-DEPDC1B组小鼠的肿瘤体积增长更快,肿瘤组织中DEPDC1B、p65、IL-1β、IL-6和TNF-α的表达水平均显著升高(P均<0.05)。结论 DEPDC1B可通过结合NF-κB信号通路中关键蛋白p65激活NF-κB信号通路,促进肝癌生长。

癌基因DEPDC1B及其编码蛋白功能结构域DEP的研究进展

肿瘤是人类面临的重大健康问题之一,从基因分子水平阐述肿瘤发生发展的机制,找到新的诊断与预后标志物和治疗靶点是当前肿瘤研究的热点。DEPDC1B与肿瘤的恶性生物学行为密切相关,其主要的功能结构域DEP被证实参与细胞内信号转导等多种生理功能。本文将对DEP结构域及DEPDC1B的生物学功能研究进展做一综述。

癌蛋白DEPDC1B的研究进展

含有DEP结构域的蛋白质1B(DEPDC1B)高表达于多种恶性肿瘤组织及细胞,其作为癌蛋白参与了多种癌症的发生发展进程,调控了不同的恶性生物学行为,包括促进肿瘤细胞的侵袭、迁移和增殖以及抑制细胞凋亡等,这与其含有的DEP、Rho GAP等结构域的功能密切相关。本文主要结合癌蛋白DEPDC1B的结构域组成,探讨其与癌症发生发展及治疗的关系,旨在为深入研究DEPDC1B在癌症中的作用机制及潜在的抗癌疗法提供参考依据。

DEP结构域蛋白1B在肝细胞癌中的表达及功能

目的:探讨DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)在肝细胞癌(肝癌)中的表达及功能。方法:检索公共癌症数据库(UALCAN、HPA)分析DEPDC1B在肝癌中的表达;从癌症基因组图谱(TCGA)数据库()获得肝癌的RNAseq数据(level3)和相应的临床信息,Log-rank用于检验Kaplan-Meier生存分析比较上述两组或多组之间的生存差异;单因素及多因素Cox分析DEPDC1B的预后价值并构建列线图。利用siRNA抑制DEPDC1B表达,通过Transwell小室实验检测细胞侵袭、迁移变化;利用STRING构建DEPDC1B蛋白质相互作用网络(PPI)并分析其在肝癌中潜在作用机制。结果:肝癌组织中DEPDC1B基因表达量明显高于正常组织(P<0.05)。肝癌DEPDC1B蛋白的阳性表达率为70%,在20种常见癌症的阳性表达率中排名第一。TCGA数据分析显示,DEPDC1B高表达肝癌患者总体生存期和无病生存期均较差(HR=1.673,1.434;P<0.05),其可作为肝癌的独立预后因子且能效预测患者生存率。Transwell小室实验结果显示,siRNA能明显抑制MHCC97-H、Hep3B肝癌细胞DEPDC1Bb表达;下调DEPDC1B表达后,肿瘤细胞的侵袭及迁移能力减弱。PPI网络构建分析显示,DEPDC1B与TsC/mTOR、RTK、RAS/MAPK、PI3K/AKT、雌激素受体、雄激素受体、上皮间质转化、DNA损伤反应、细胞周期和细胞凋亡等肿瘤标志性信号通路密切相关。结论:DEPDC1B在肝癌中高表达,其高表达与患者预后差相关,下调其表达肝癌细胞侵袭迁移能力下降。

DEPDC1B、NOB1水平变化与三阴性乳腺癌患者相关病理学参数的关系

目的 探讨DEP结构域蛋白质1B(DEPDC1B)、Nin-one结合蛋白(NOB1)水平变化与三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)患者相关病理学参数的关系及临床意义。方法 选取行乳腺癌根治术的81例TNBC患者设为观察组,选取同期因乳腺良性疾病行手术治疗的21例患者设为对照组。随访1年后(失访6例)根据预后情况分为预后良好者57例(生存)、预后不良者18例(病死、病情恶化或复发)。比较TNBC组织、癌旁组织、良性病变组织中DEPDC1B、NOB1表达量。分别比较不同病理学参数、不同预后患者癌组织中DEPDC1B、NOB1表达量。分析DEPDC1B、NOB1表达量与病理学参数、预后相关性。结果 TNBC组织、良性病变组织中DEPDC1B、NOB1表达量高于癌旁组织,且TNBC组织高于良性病变组织(P<0.05);预后不良者中DEPDC1B、NOB1表达量高于预后良好者(P<0.05);DEPDC1B、NOB1表达量与淋巴结转移、临床分期、脉管瘤栓呈正相关,与分化程度呈负相关(P<0.05);DEPDC1B、NOB1高表达者总生存率(66.67%、65.79%)分别低于其相应低表达者86.11%、86.49%(P<0.05)。结论 DEPDC1B、NOB1在TNBC组织中呈高表达,且与临床病理学参数相关,可能用于预后评估。

重组大鼠高迁移率族蛋白B1 A结构域(HMGB1-A)的原核表达及纯化

目的合成重组大鼠高迁移率族蛋白B1 A结构域(HMGB1-A)蛋白。方法利用基因工程技术,克隆并重组大鼠高迁移率族蛋白B1 A盒基因;利用原核表达技术,表达并纯化重组大鼠HMGB1-A盒蛋白,并利用Western blot法进行验证。结果琼脂糖凝胶电泳分析显示HMGB1-A盒基因大小约为250 bp;重组克隆p UC-A经双酶切鉴定,产物大小约为3000 bp、250 bp;重组克隆p GEX-A PCR产物大小约为250 bp。原核表达产物Mr大小约为36 000,与预期一致。结论成功表达并纯化HMGB1-A盒蛋白。

DEPDC1B在肝癌增殖、迁移和上皮间质转化中的作用及其临床相关性研究

目的:研究DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)对肝癌细胞增殖、迁移和上皮间质转化的作用以及在临床中的相关性。方法:收集39例肝癌肿瘤组织及其癌旁组织,qRT-PCR检测DEPDC1B表达水平并分析与临床病理特征的相关性,通过Kaplan-Meier数据库分析DEPDC1B表达水平与临床预后的相关性。采用qRT-PCR检测L-02正常肝上皮细胞和HepG2肝癌细胞DEPDC1B表达水平,Western Blot检测DEPDC1B、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平。将si-DEPDC1B和si-NC转染至HepG2细胞,采用qRT-PCR检测DEPDC1B表达水平,Western Blot检测DEPDC1B、E-cadherin、N-cadherin蛋白表达水平,采用CCK8和集落形成实验检测细胞增殖水平,Transwell和细胞划痕实验检测细胞迁移水平。结果:与癌旁组织相比,肿瘤组织中DEPDC1B表达水平升高,DEPDC1B高表达与肿瘤分期和淋巴结转移相关,与治疗后的不良预后相关。与L-02细胞相比,HepG2细胞DEPDC1B表达升高,N-cadherin蛋白表达升高,E-cadherin蛋白表达降低。与si-NC组比较,si-DEPDC1B组DEPDC1B表达降低,细胞增殖、迁移水平降低,N-cadherin蛋白水平降低,E-cadherin蛋白表达升高。结论:DEPDC1B可以促进肝癌细胞增殖、迁移和上皮间质转化,临床上DEPDC1B高表达与肿瘤晚期、淋巴结发生转移以及不良预后相关。

DEPDC1B与CDK1在甲状腺乳头状癌中的表达及临床病理意义

目的探讨含DEP结构域蛋白1B(DEPDC1B)与周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)在甲状腺乳头状癌(PTC)、甲状腺良性病变及癌旁正常组织中的表达,分析DEPDC1B和CDK1表达在PTC中的相关性及临床病理意义。方法收集66例PTC、40例良性病变及56例癌旁正常组织,采用免疫组化检测DEPDC1B与CDK1在PTC、良性病变及癌旁正常组织中的蛋白表达情况,分析DEPDC1B和CDK1的表达水平与PTC临床病理特征及DEPDC1B和CDK1之间表达的相关性。结果DEPDC1B和CDK1在PTC中呈高表达,在良性病变和癌旁组织中呈低表达,差异有统计学意义(P<0.05);DEPDC1B高表达率在肿瘤多灶发生病例中明显高于单灶发生病例,在肿瘤直径较大者中明显高于较小者(P均=0.027);CDK1的高表达率在肿瘤直径较大者中明显高于较小者(P均=0.030);在PTC中DEPDC1B与CDK1的表达呈现正相关(P=0.000)。结论DEPDC1B和CDK1在PTC组织中高表达,对区分甲状腺良性病变与PTC具有一定意义;DEPDC1B与CDK1可能协同促进PTC的发展。

炎症环境下敲低SHP2对人牙周膜干细胞增殖和成骨分化的影响

目的探讨炎症环境下含有Src同源结构域2的蛋白酪氨酸磷酸酶2(Src homology-2 domain containing protein tyrosine phosphatase-2,SHP2)对人牙周膜干细胞(human periodontal ligament stem cells,hPDLSCs)增殖及成骨分化的调节作用和相关机制,为牙周炎治疗提供新的靶点。方法使用慢病毒感染构建敲低SHP2基因的hPDLSCs细胞系,通过RT-qPCR、Western blot验证SHP2的敲低水平;使用肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)和白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)在体外模拟炎症环境;CCK-8检测正常及炎症条件下敲低SHP2对hPDLSCs增殖的影响;碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)染色、ALP活性检测、ARS染色、RT-qPCR以及Western blot检测成骨指标;Western blot检测敲低SHP2在炎症条件下,对丝裂原活化蛋白激酶/核因子κB(mitogen-activated protein kinase/nuclear factor-κB,MAPK/NF-κB)通路蛋白的影响。结果慢病毒感染细胞72 h后在荧光显微镜下显示出明显的绿色荧光,测得SHP2 shRNA重组慢病毒的滴度为2.9×10^(8) TU/mL;Western blot及RT-qPCR检测发现,SHP2敲低组的SHP2蛋白及基因的表达显著降低(P<0.001);在正常条件下,敲低SHP2在一定程度上抑制了hPDLSCs的增殖;敲低SHP2后,hPDLSCs的早期成骨指标增高,包括ALP活性显著增高,ALP和COL-1的表达增加(P<0.05),然而敲低SHP2对hPDLSCs最终产生钙结节的量无明显影响。在TNF-α和IL-1β诱导的炎症环境下,敲低SHP2对hPDLSCs的增殖无明显影响(P>0.05),敲低SHP2后,hPDLSCs成骨相关指标均增加(P<0.05),钙结节形成的量增多(P<0.05);炎症环境下,敲低SHP2后,hPDLSCs中p65的磷酸化和IκB-α的降解降低,并且NF-κB上游MAPK通路蛋白p-p38和p-JNK的表达降低(P<0.05)。结论炎症环境下,敲低SHP2对hPDLSCs的增殖无明显影响,但可通过抑制MAPK/NFκB通路促进hPDLSCs成骨分化。