ZNF224和DEPDC1在肺腺癌中的表达及其临床意义

目的探究锌指蛋白224(ZNF224)、DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。方法收集73例LUAD组织及相应的癌旁组织。采用qRT-PCR法测定LUAD组织、癌旁组织ZNF224、DEPDC1 mRNA相对表达量。免疫组化法测定LUAD组织、癌旁组织ZNF224、DEPDC1蛋白表达情况。分析LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA及其蛋白与LUAD临床病理特征的关系;Pearson相关性分析LUAD组织ZNF224 mRNA及其蛋白分别与DEPDC1 mRNA及其蛋白的相关性;Kaplan-Meier生存曲线法分析LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA表达与LUAD预后的关系;COX回归法分析影响LUAD患者预后的因素。结果LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA表达及其蛋白表达阳性率均高于癌旁组织(P<0.05)。LUAD组织TNM分期、分化程度、淋巴结转移,ZNF224低表达组与高表达组、DEPDC1低表达组与高表达组比较,差异均有显著性(P<0.05)。LUAD组织中ZNF224 mRNA和蛋白表达分别与DEPDC1 mRNA和蛋白表达呈正相关(P<0.05);ZNF224、DEPDC1 mRNA低表达组LUAD患者累积生存率分别高于其高表达组(P<0.05)。TNM分期、ZNF224 mRNA、DEPDC1 mRNA、淋巴结转移是影响LUAD患者不良预后的独立危险因素(P<0.05)。结论LUAD组织ZNF224、DEPDC1表达较高,二者呈正相关,且均与LUAD患者预后关系密切,有望作为评估LUAD患者预后的潜在标志物。

癌蛋白DEPDC1B的研究进展

含有DEP结构域的蛋白质1B(DEPDC1B)高表达于多种恶性肿瘤组织及细胞,其作为癌蛋白参与了多种癌症的发生发展进程,调控了不同的恶性生物学行为,包括促进肿瘤细胞的侵袭、迁移和增殖以及抑制细胞凋亡等,这与其含有的DEP、Rho GAP等结构域的功能密切相关。本文主要结合癌蛋白DEPDC1B的结构域组成,探讨其与癌症发生发展及治疗的关系,旨在为深入研究DEPDC1B在癌症中的作用机制及潜在的抗癌疗法提供参考依据。

DEPDC1基因在结直肠癌中的表达及其与预后的关系

目的探讨DEPDC1基因在结直肠癌(CRC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法以2015年1月至2015年12月中南大学湘雅医学院附属海口医院老年病科和病理科收集的60例CRC病理标本为CRC组(n=60),相应的癌旁组织为癌旁对照组(n=60),两组DEPDC1的mRNA和蛋白表达水平采用qRT-PCR和Western blotting技术检测,影响CRC患者预后的因素采用COX比例风险模型分析,预后采用Kaplan-Meier和Log-rank法分析。结果CRC组DEPDC1的mRNA和蛋白相对表达量均显著高于癌旁对照组(P<0.05)。CRC组DEPDC1高表达患者比例显著高于癌旁对照组(P<0.05)。CRC组织中DEPDC1的表达水平与肿瘤复发显著相关(P<0.05)。DEPDC1表达水平是影响CRC患者5年总体生存率和5年无瘤生存率的独立因素(P<0.05)。CRC组织中DEPDC1低表达患者5年总体生存率、5年无瘤生存率均高于DEPDC1高表达患者(P<0.05)。结论DEPDC1在CRC组织中高表达,与肿瘤复发有关,DEPDC1高表达的CRC患者预后较差。

DEPDC1在子宫内膜癌中表达上调

目的观察DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在子宫内膜癌(UCEC)中的表达及作用。方法利用GEO和TCGA等公共数据库分析DEPDC1 mRNA在UCEC中的表达情况,以及其与临床病理参数及预后的相关性;利用组织芯片、免疫印迹和实时定量PCR检测DEPDC1在UCEC组织和细胞系中的表达;利用平板集落、CCK8法和裸鼠成瘤等实验检测DEPDC1对UCEC细胞系增殖的影响。结果DEPDC1 mRNA在UCEC中表达上调(P<0.001),其表达与UCEC临床分期(P<0.001)、组织分化程度(P<0.05)及病理类型(P<0.001)等临床病理参数显著相关;相较于DEPDC1 mRNA低表达的患者,高表达的患者疾病特异生存期(DSS)和无进展期(PFI)显著降低(P<0.01);DEPDC1在UCEC组织和细胞系中高表达,敲降DEPDC1后,UCEC细胞系的集落形成减少、细胞率降低(P<0.01)和体内成瘤能力下降(P<0.05)。结论DEPDC1在UCEC中表达上调,参与UCEC的恶性进展及影响患者预后,并在UCEC细胞系增殖中发挥重要调控作用。

沉默DEPDC1抑制鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移

DEPDC1(DEP domain containing 1)是一个新的肿瘤相关基因,在多种恶性肿瘤的发生发展进程中起着重要作用。我们前期工作中在鼻咽癌细胞内沉默了DEPDC1的表达,发现抑制细胞增殖并诱发细胞凋亡。本研究旨在探讨沉默DEPDC1表达后,对鼻咽癌细胞HNE-1和CNE-1侵袭迁移能力的影响及其分子机制。结果显示,siRNA介导DEPDC1表达沉默后,细胞侧向运动能力、侵袭及迁移能力显著降低。qRT-PCR及Western印迹检测发现DEPDC1沉默导致EMT上游关键转录因子Twist1及间质细胞标志分子Vimentin表达显著下调。这些研究表明,鼻咽癌细胞中DEPDC1通过调节Twist1等EMT关键分子的表达在细胞侵袭转移过程中起关键作用。推测DEPDC1在鼻咽癌中高表达可能对于促进其侵袭转移具有重要作用,进而促进肿瘤发生发展,但具体分子机制仍有待更深入研究。

过表达DEPDC1对鼻咽癌细胞CNE-1增殖影响的研究

目的:DEPDC1(DEP domain containing 1)是近年来发现的一个肿瘤相关基因,前期研究结果显示其对鼻咽癌发生发展具有重要作用,本研究旨在进一步探讨过表达DEPDC1对鼻咽癌细胞增殖的影响。方法:在鼻咽癌细胞系CNE-1中,分别转染过表达DEPDC1-V1及DEPDC1-V2两种剪接体质粒,瞬时表达48 h后综合利用CCK-8、流式细胞技术及p HH3标记法检测细胞增殖情况。结果:Western blot检测显示在CNE-1细胞瞬时转染DEPDC1-V1和DEPDC1-V2质粒可过表达DEPDC1。CCK-8实验结果表明,过表达DEPDC1-V1及DEPDC1-V2均显著促进CNE-1细胞增殖。流式细胞检测结果表明,与对照组相比过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2后均导致G2/M期细胞增多。p HH3检测结果显示,过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2后有丝分裂活跃,细胞周期进程加快。进一步定量RT-PCR检测发现,过表达DEPDC1-V1或DEPDC1-V2导致细胞周期进程关键调节因子Fox M1及其下游靶基因CCNB2、PLK1和MYBL2表达量上调。结论:本研究通过在鼻咽癌CNE-1细胞株中过表达两个剪接体DEPDC1-V1及DEPDC1-V2,证明DEPDC1在鼻咽癌细胞中高表达对促进细胞的增殖具有重要作用。

DEPDC1基因在胰腺癌的表达及其siRNA对胰腺癌细胞的影响

目的:探讨DEPDC1基因在人胰腺癌细胞株、胰腺癌组织和癌旁组织的表达;应用RNA干扰技术靶向沉默胰腺癌细胞株PANC-1中DEPDC1基因,研究其对细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法:应用半定量RT-PCR方法检测4个胰腺癌细胞株、4例胰腺癌组织和癌旁组织DEPDC1基因的表达;靶向DEPDC1的siRNA载体转染胰腺癌细胞株PANC-1,采用实时定量PCR和Western印迹法检测基因沉默前、后DEPDC1基因及蛋白表达变化,CCK-8法和流式细胞术检测细胞增殖、周期及凋亡的变化。结果:胰腺癌细胞株和胰腺癌组织中DEPDC1基因呈高表达,癌旁组织呈低表达甚至不表达;转染siRNA的PANC-1细胞与对照组比较,DEPDC1基因及其蛋白表达下调,细胞增殖被显著抑制(P<0.05),细胞凋亡率显著增高(P<0.05),G0/G1期细胞比例显著上升、S期细胞比例则显著降低(P<0.01或P<0.05)。结论:DEPDC1基因在人胰腺癌细胞株、胰腺癌组织中呈高表达,在癌旁组织中呈低表达甚至不表达。DEPDC1 siRNA可明显下调靶基因DEPDC1及其蛋白质表达,阻滞胰腺癌细胞株PANC-1周期,诱导凋亡,抑制增殖,提示DEPDC1基因在胰腺癌发生、发展中起重要作用。

DEPDC1稳定沉默CNE-1细胞株的构建与分析

目的:为了进一步探讨DEPDC1(DEP domain containing 1)在肿瘤发生发展中的作用。DEPDC1是近年发现的一个肿瘤相关基因,前期研究结果显示其在鼻咽癌细胞周期及癌变过程中具有作用。方法:利用qRT-PCR和免疫组织化学染色分别检测DEPDC1在18例新鲜样品和44例组织芯片肿瘤患者中的表达情况。人鼻咽癌细胞系CNE-1稳定沉默DEPDC1后,流式细胞检测细胞增殖并利用Transwell小室分析侵袭迁移情况。结果:DEPDC1在鼻咽癌组织中表达量(0.699±0.521)明显高于正常组织(0.408±0.183),差异有统计学意义(P<0.05)。DEPDC1稳定沉默后,CCK8检测结果表明CNE-1细胞增殖速度减慢。流式细胞检测的结果显示,G1期细胞减少,G2/M期细胞增多,细胞周期进程受阻。划痕及Transwell实验结果表明,DEPDC1稳定沉默明显减弱了CNE-1细胞运动,侵袭及迁移能力(77.033±5.183 vs.20.137±2.828,107.336±5.033 vs.26.326±1.414),差异均有统计学意义(P<0.05)。进一步定量qRT-PCR及Western blot检测发现,DEPDC1稳定沉默导致上皮细胞标志分子E-cadherin(0.457±0.022)显著上调、而间质细胞标志分子Vimentin(0.780±0.063)、N-cadherin(0.780±0.063)以及EMT上游关键转录因子Twist1(0.710±0.034)下调(P<0.05)。结论:本研究成功构建了DEPDC1稳定沉默细胞株,与前期si RNA介导的瞬时沉默相似的是,发现DEPDC1稳定沉默可抑制鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移,并改变EMT关键分子的表达,为进一步探索DEPDC1在鼻咽癌中的作用机制奠定了基础。

DEPDC1B在膀胱癌组织中的表达及其临床相关性研究

目的探讨DEPDC1B在膀胱癌组织中的表达及其临床相关性。方法选取2015年1月至2020年12月广东省水电医院泌尿外科收治的153例膀胱癌患者作为研究对象。采集其膀胱癌组织和癌旁组织,使用qRT-PCR方法检测组织中DEPDC1B、Rac1和ERK1/2的mRNA水平,使用Western Blot方法检测组织中DEPDC1B的蛋白水平,进而行统计学分析。结果DEPDC1B在膀胱癌组织中的mRNA水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。DEPDC1B在膀胱癌组织中的蛋白表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。DEPDC1B高表达组的膀胱癌分化程度和TNM分级高于DEPDC1B低表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。DEPDC1B表达与膀胱癌患者的年龄、性别、肿瘤大小和数目无相关性(P>0.05)。膀胱癌组织中Rac1和ERK1/2的mRNA水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。结论DEPDC1B在膀胱癌中高表达,且与膀胱癌进展密切相关,DEPDC1B可能通过激活Rac1和ERK1/2发挥促癌作用。

癌基因DEPDC1B及其编码蛋白功能结构域DEP的研究进展

肿瘤是人类面临的重大健康问题之一,从基因分子水平阐述肿瘤发生发展的机制,找到新的诊断与预后标志物和治疗靶点是当前肿瘤研究的热点。DEPDC1B与肿瘤的恶性生物学行为密切相关,其主要的功能结构域DEP被证实参与细胞内信号转导等多种生理功能。本文将对DEP结构域及DEPDC1B的生物学功能研究进展做一综述。

DEPDC1基因在非肝炎病毒相关性肝细胞癌及癌旁组织中的表达及临床意义

目的探讨DEPDC1基因与非肝炎病毒相关性肝细胞癌临床病理特征的关系及其对预后判断的意义。方法收集56例非肝炎病毒相关性肝细胞癌及癌旁组织,实时定量PCR检测癌组织及癌旁组织中DEPDC1蛋白和mRNA的表达,结合临床数据分析DEPDC1表达的意义。结果 DEPDC1蛋白在肝癌组织中的表达(7. 83±0. 17)显著高于癌旁组织(4. 67±0. 22),差异比较有统计学意义(P<0. 05); DEPDC1 mRNA在肝癌组织中的表达高于癌旁组织中的表达,高表达率为73.2%(41/56);在DEPDC1高表达组,肿瘤分化程度较低,甲胎蛋白水平较高,微血管癌栓发生率高。结论 DEPDC1分子表达水平与非肝炎病毒相关性肝癌的生物学行为相关,可能位于致癌因素最终的共同通路上。

DEPDC1在肺腺癌中高表达并促进肿瘤细胞增殖

背景与目的肺癌是目前世界范围内造成死亡人数最多的癌症之一,而肺腺癌是其主要分型。DEPDC1(DEP domain containing 1)被证实与多数肿瘤的发生发展密切相关,DEPDC1在肺腺癌中过表达已被初步证实,本研究旨在探究DEPDC1的表达与肺腺癌临床预后的关系,对DEPDC1作为肺腺癌潜在生物标志物和治疗靶点的可能性进行初步探讨。方法利用生物信息学网站GEPIA搜集相关信息,在线分析DEPDC1表达与患者预后生存关系。收集本医院患者资料,对收集的样本进行免疫组化染色,并进行统计学分析。随后,体外培养肺腺癌系细胞,通过Western blot与逆转录定量聚合酶链反应(reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction, RT-q PCR)验证敲低效率,再进行细胞增殖的实验。结果 DEPDC1在肺腺癌组织中表达显著高于癌旁正常组织,DEPDC1在肺腺癌组织中高表达,DEPDC1高表达与肺腺癌的肿瘤大小临床分期相关,敲低DEPDC1可抑制A549和H1975细胞增殖。结论 DEPDC1在肺腺癌的进展演变中扮演着重要角色,有望成为肺腺癌重要的治疗靶点和一个潜在的新的生物标志物。

YAP1/DEPDC1B调控mTOR信号通路促进肝母细胞瘤增殖的机制研究

目的研究YAP1/DEPC1B信号轴在调控肝母细胞瘤细胞(hepatoblastoma,HB)增殖中的作用及潜在机制。方法从GEO数据库获取相关转录组测序数据集并行相应的生物信息学分析。实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)和Western blot实验检测基因表达水平变化。MTT实验和平板克隆形成实验检测肿瘤细胞增殖能力变化。基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)来探究YAP1/DEPDC1B调控的潜在信号通路。结果GSEA表明与正常肝脏组织相比,Hippo信号通路在肝母细胞瘤组织中异常激活,进一步分析证实YAP1在肝母细胞瘤组织中呈异常高表达。细胞学实验证实YAP1特异性抑制剂维替泊芬能显著抑制HB细胞HUH-6的增殖(P<0.05)。韦恩图和相关性分析表明YAP1可能调控DEPDC1B的表达,qRT-PCR和Western blot证实抑制YAP1表达后DEPDC1B表达量降低。GSEA表明在HB组织中,高表达的DEPDC1B能异常激活mTOR信号通路,进一步研究证实敲低DEPDC1B后,mTOR信号通路关键基因HRAS、MAP2K2的表达量明显降低。结论Hippo-YAP1信号通路在肝母细胞瘤中异常激活,YAP1可能通过DEPDC1B调控mTOR信号通路促进肿瘤细胞增殖,YAP1可能是治疗HB的潜在靶标。

沉默DEPDC1基因表达对鼻咽癌细胞系HNE-1生长和细胞周期的影响

为探讨沉默DEPDC1基因表达对鼻咽癌细胞系HNE-1生长和细胞周期的影响,该实验设计合成靶向DEPDC1的小分子干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)转染人鼻咽癌HNE-1细胞。转染后,采用荧光定量PCR、免疫印迹、MTT及流式细胞术方法检测细胞内DEPDC1的表达量以及细胞周期、生长增殖、凋亡的变化及其可能机制。结果显示,转染DEPDC1 siRNA后,DEPDC1基因在mRNA及蛋白水平的表达量明显降低;大量细胞被阻滞于G2/M期,生长增殖减慢,凋亡增加。荧光定量PCR结果表明,抑制NF-κB激活的A20基因表达量明显上调,受NF-κB调控的肿瘤相关靶基因的表达量下降,包括C-MYC、MMP9、ICAM-1、BCL-2基因。由此说明,沉默DEPDC1基因可以影响HNE-1细胞的周期,抑制其生长增殖,促进凋亡,其机制可能与抑制NF-κB通路有关。

DEPDC1通过KRAS信号通路调节肝癌细胞Huh-7糖酵解

为了探讨DEP结构域的蛋白质1(DEP domain containing 1,DEPDC1)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)细胞糖酵解中的作用及其调控机制,首先,通过基因芯片筛选出DEPDC1干扰后Huh-7细胞中差异表达的基因并进行基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA);通过葡萄糖摄取试剂盒和乳酸检测试剂盒检测DEPDC1干扰对Huh-7细胞葡萄糖摄取和乳酸生成的影响;通过Western blot检测DEPDC1干扰对Huh-7细胞KRAS、p-ERK1/2和ERK1/2蛋白水平的影响。通过KRAS表达质粒回复DEPDC1干扰对KRAS表达的抑制,并通过葡萄糖摄取试剂盒、乳酸检测试剂盒、CCK-8和Transwell小室检测KRAS在DEPDC1调节的Huh-7细胞糖酵解、增殖和迁移中的作用。结果表明,DEPDC1干扰后Huh-7细胞有21038个基因差异表达,其中9781个基因上调,11257个基因下调;GSEA结果表明,差异表达的基因明显富集于中心碳代谢信号通路;DEPDC1干扰后Huh-7细胞葡萄糖摄取、乳酸生成、KRAS和p-ERK1/2蛋白水平均明显降低。KRAS过表达可以明显逆转DEPDC1下调对葡萄糖摄取、乳酸生成、增殖和迁移的抑制。上述结果表明DEPDC1可能通过KRAS/p-ERK1/2通路调节糖酵解进而影响HCC进展。