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题名十字花科植物DFR蛋白的生物信息学分析
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作者
胡燕
尹明智
匡光炼
黄杰
严秋香
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机构
遵义师范学院生物与农业科技学院
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2019年第17期103-107,110,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(31501337)
贵州省科学技术厅、遵义市科学技术局、遵义师范学院联合科技基金项目(黔科合LH字[2016]7014号)
+1 种基金
贵州省高层次创新型人才培养计划(遵市科合人才[2017] 11号)
贵州省高等学校创新能力提升计划(黔教合协同创新字[2013]11)
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文摘
采用生物信息学的方法分析已经在GenBank上注册十字花科植物的DFR基因序列及相应氨基酸序列,并对其理化性质、结构特征、系统进化关系等进行预测。结果表明,十字花科植物的DFR蛋白大部分都有6个外显子,分子质量36481.89~43129.21Da,大多数蛋白亚细胞定位于叶绿体中;除了BnaDFRA402,其他的DFR蛋白均具有酶活性部位、NADP结合位点和底物特异结合位点,这些保守区域形成了5个motifs;每个DFR蛋白均有多个磷酸化位点,以Ser为主,以Thr和Tyr磷酸化为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋为主要结构元件。
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关键词
十字花科
花青素
dfr蛋白
生物信息学
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Keywords
Cruciferae
Anthocyanin
dfr protein
Bioinformatics
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分类号
S188
[农业科学—农业基础科学]
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