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HPV16 E6 下调 DHRS2 表达可介导宫颈上皮细胞的致癌转化
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作者 杜秀蓉 陶沐珩 +4 位作者 贾永琴 伍婷婷 凌开建 王延洲 梁志清 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期715-724,共10页
目的探讨HPV16 E6对宫颈上皮细胞基因及信号通路的影响,筛选与致癌转化相关的基因。方法构建HPV16 E6感染的正常人宫颈上皮细胞(HUCEC)模型,进行转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体(Gene ... 目的探讨HPV16 E6对宫颈上皮细胞基因及信号通路的影响,筛选与致癌转化相关的基因。方法构建HPV16 E6感染的正常人宫颈上皮细胞(HUCEC)模型,进行转录组测序筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析差异信号通路。采用RT-qPCR验证主要差异下调表达基因。对主要差异基因的蛋白结构与HPV16 E6蛋白进行分子对接预测分析,通过RT-qPCR及Western blot验证HUCEC细胞模型中主要差异基因表达情况,并采用RT-qPCR及Western blot实验在宫颈癌细胞系SiHa及CaSki中进一步验证差异基因的表达。结果共筛选出差异表达2倍以上的基因55个。本研究聚焦下调差异基因,结果表明:负调控的差异基因GO功能富集于氧化还原过程;KEGG富集分析主要与碳水化合物代谢及癌症等相关。10个差异基因mRNA下调表达趋势与测序结果基本一致。分子对接预测DHRS2与HPV16 E6蛋白存在相互作用。与对照组比较,HUCEC细胞模型中HPV16 E6下调DHRS2的mRNA(P<0.01)和蛋白(P<0.05)、ETV5的蛋白(P<0.01)表达;在SiHa、CaSki细胞系中,与对照组比较,DHRS2的mRNA及蛋白表达亦明显下调(P<0.05),并与P53蛋白表达趋势正相关。结论HPV16 E6可能通过下调DHRS2表达介导宫颈细胞致癌转化,促进宫颈癌发生。 展开更多
关键词 HPV16 E6 dhrs 2 宫颈上皮细胞 致癌转化 宫颈癌
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MARDHRS4的鉴定及其对DHRS4转录的调节
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作者 常晓兰 冯雷 冯广友 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2013年第2期120-123,共4页
目的:筛选新的小鼠DHRS4反义链转录本并对其功能进行研究。方法:采用快速cDNA末端扩增方法,从小鼠正常肝细胞株NCTC1469中克隆DHRS4反义链转录本,据此转录本设计合适siRNA,然后转染NCTC1469细胞,转染成功36h后应用RT-qPCR检测细胞内DHRS... 目的:筛选新的小鼠DHRS4反义链转录本并对其功能进行研究。方法:采用快速cDNA末端扩增方法,从小鼠正常肝细胞株NCTC1469中克隆DHRS4反义链转录本,据此转录本设计合适siRNA,然后转染NCTC1469细胞,转染成功36h后应用RT-qPCR检测细胞内DHRS4mRNA水平的改变。结果:成功克隆出1个新的天然反义RNA,全长835nt,属于长链非编码RNA(longnon-coding RNA,LncRNA),命名为MARDHRS4,应用siRNA干扰MARDHRS4后,DHRS4mRNA降低约40%。结论:来自DHRS4反义链的LncRNA MARDHRS4具有增强DHRS4转录的作用。 展开更多
关键词 MARdhrs4 dhrs4 长链非编码RNA 转录
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DHRS4L2非编码RNA调控CPNE6基因表达(英文) 被引量:2
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作者 李一凡 黄东阳 +6 位作者 王磊 杜冀晖 刘戈飞 王永 周蓓 李蓉 麦丽文 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1098-1105,共8页
DHRS4/NRDR基因编码一种属于SDR家族的酶,在维甲酸合成、类固醇代谢和苯甲基代谢中发挥生物合成催化作用.DHRS4基因定位于14q11.2,有两个相似的拷贝基因,分别为DHRS4L2和DHRS4L1.我们前期发现了DHRS4L2基因一个上游转录起始位点,命名为D... DHRS4/NRDR基因编码一种属于SDR家族的酶,在维甲酸合成、类固醇代谢和苯甲基代谢中发挥生物合成催化作用.DHRS4基因定位于14q11.2,有两个相似的拷贝基因,分别为DHRS4L2和DHRS4L1.我们前期发现了DHRS4L2基因一个上游转录起始位点,命名为DHRS4L2-Ea.在本研究中,我们用RT-PCR和双脱氧测序法发现一个新的从DHRS4L2-Ea转录的选择性剪接亚型DHRS4L2-900a(KC237374).同时RT-PCR结果显示在SK-N-SH细胞DHRS4L2-Ea选择性剪接亚型中DHRS4L2-iso(AY616183)表达最多,为主要亚型.在SK-N-SH细胞过表达DHRS4L2-800a(AY920361)使DHRS4L2-Ea基因下游CPNE6 mRNA表达下调.在HeLa细胞过表达DHRS4L2-800a(AY920361)或DHRS4L2-900a(KC237374)进一步表明DHRS4L2-Ea抑制CPNE6表达的作用.定量PCR结果显示si-RNA抑制DHRS4L2-Ea表达使CPNE6 mRNA表达上调.亚硫酸盐测序结果显示在SK-N-SH转染DHRS4L2-800a(AY920361)的样本中CPNE6基因DNA CpG甲基化增加.综上所述,本研究揭示DHRS4L2表达的非编码RNA抑制其下游基因CPNE6的表达. 展开更多
关键词 dhrs4L2 CPNE6 选择性剪接 转录调控 人神经母细胞瘤
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鹅DHRS7基因克隆、序列分析及其在鹅肥肝形成过程中的表达特点 被引量:1
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作者 何桦 潘志雄 +7 位作者 刘贺贺 李乐 夏露 胡深强 鲁凯 董霞 李亮 王继文 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1385-1391,共7页
为获得鹅DHRS7基因全长cDNA,并探讨该基因是否参与鹅肥肝的形成过程。本研究应用抑制消减杂交文库获得鹅DHRS7基因部分EST序列,采用RACE技术扩增了鹅该基因全长cDNA,并对其序列进行了生物信息分析;用荧光定量PCR技术检测了DHRS7在鹅肝... 为获得鹅DHRS7基因全长cDNA,并探讨该基因是否参与鹅肥肝的形成过程。本研究应用抑制消减杂交文库获得鹅DHRS7基因部分EST序列,采用RACE技术扩增了鹅该基因全长cDNA,并对其序列进行了生物信息分析;用荧光定量PCR技术检测了DHRS7在鹅肝脏、皮脂、腹脂等10个组织中的差异表达,以及填饲对鹅肝脏中DHRS7表达变化的影响。结果发现,鹅DHRS7基因cDNA全长1 279bp,含一个完整的开放阅读框1 011bp(可编码336个氨基酸),25bp的5′UTR和243bp的3′UTR序列;生物信息学分析结果显示,鹅DHRS7含有跨膜结构域以及NADP结合位点,且在这些功能区域变异较少;荧光定量结果显示,DHRS7在鹅肝脏和脂肪组织中都有较高表达,填饲后鹅肝脏中DHRS7的表达水平显著上调(P<0.05)。以上结果表明,DHRS7在鹅肥肝形成过程中具有重要的作用。 展开更多
关键词 短链脱氢酶7(dhrs7) RACE CDNA全序列 生物信息学分析
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结直肠癌患者DHRS9的表达及其临床意义
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作者 贾利 贾霖 韩建军 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第3期430-436,共7页
目的:探讨脱氢酶/还原酶家族成员9(DHRS9)表达对结直肠癌临床预后的意义。方法:采用免疫组织化学染色方法检测163例临床结直肠癌组织样本,并挑选58例新鲜样本,提取总蛋白和总RNA,采用Western blot和q PCR方法检测DHRS9表达情况。结果:We... 目的:探讨脱氢酶/还原酶家族成员9(DHRS9)表达对结直肠癌临床预后的意义。方法:采用免疫组织化学染色方法检测163例临床结直肠癌组织样本,并挑选58例新鲜样本,提取总蛋白和总RNA,采用Western blot和q PCR方法检测DHRS9表达情况。结果:Western blot和q PCR检测结果表明,结直肠癌组织中DHRS9蛋白和mRNA表达均下调,且淋巴结转移(P=0.032)、TNM晚期(P=0.021)、疾病复发(P=0.001)和患者死亡(P=0.014)显著影响DHRS9表达。Kaplan-Meier分析结果显示,DHRS9表达下调预示患者无病生存期(P=0.003)和疾病特异性生存时间(P=0.021)较短。Cox多变量分析表明,DHRS9表达下调是结直肠癌患者疾病预后不良的独立预后标志物。此外,联合采用DHRS9表达检测和TNM分期对患者预后进行判断更加准确。结论:DHRS9表达下调与结直肠癌患者肿瘤发展密切相关,可以作为结直肠癌患者疾病临床预后标志物。 展开更多
关键词 dhrs9 结直肠癌 生存率 预后 标志物
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DHRS4反义RNA结合蛋白的高通量检测与分析
6
作者 苏中静 宋旭红 +1 位作者 常晓兰 黄东阳 《解剖学研究》 CAS 2018年第1期17-22,共6页
目的 DHRS4是细胞内NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶家族成员4的编码基因。与人类DHRS4基因以头对头形式存在的反义转录本AS1DHRS4,可以调控DHRS4基因的转录。本研究高通量检测分析DHRS4反义RNA结合的蛋白以探讨DHRS4反义转录本调控正... 目的 DHRS4是细胞内NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶家族成员4的编码基因。与人类DHRS4基因以头对头形式存在的反义转录本AS1DHRS4,可以调控DHRS4基因的转录。本研究高通量检测分析DHRS4反义RNA结合的蛋白以探讨DHRS4反义转录本调控正义基因表达的作用机制。方法采用甲醛交联细胞内的核酸-蛋白复合物,然后通过生物素标记的奇数组和偶数组寡核苷酸作为探针pull-down AS1DHRS4结合的蛋白,LCMS/MS鉴定后数据库比对分析DHRS4反义RNA结合的蛋白。结果奇数组和偶数组探针pull-down后分别鉴定得到650种和508种蛋白,两组探针检测的共同蛋白434种。大部分蛋白为结合蛋白并与RNA的加工和修饰相关。结论 DHRS4反义RNA结合的蛋白的检测和分析为今后进一步研究反义RNA功能和机制提供了线索和基础。 展开更多
关键词 dhrs4 反义RNA RNA结合蛋白 寡核苷酸探针
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DHRS4基因簇缺失型神经母细胞瘤细胞株的克隆和鉴定
7
作者 苏中静 刘戈飞 +3 位作者 宋旭红 陈海滨 常晓兰 黄东阳 《解剖学研究》 CAS 2011年第2期89-91,共3页
目的单克隆培养人神经母细胞瘤SH-SY5Y-细胞株,并鉴定其在基因水平缺失DHRS4基因簇,包括DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1的基因序列。方法有限稀释法培养实验室偶得的低表达DHRS4基因的人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞,相差显微镜观察细胞的生长和增... 目的单克隆培养人神经母细胞瘤SH-SY5Y-细胞株,并鉴定其在基因水平缺失DHRS4基因簇,包括DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1的基因序列。方法有限稀释法培养实验室偶得的低表达DHRS4基因的人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞,相差显微镜观察细胞的生长和增殖,PCR、RT-PCR检测DHRS4、DHRS4L2和DHRS4L1基因的DNA和RNA含量,Westernblotting检测DHRS4蛋白的表达。结果筛选得到单克隆神经母细胞瘤细胞SH-SY5Y,在DNA、RNA和蛋白水平均未检测到DHRS4基因簇的DNA序列及表达产物。结论经过克隆低表达DHRS4基因簇的SH-SY5Y细胞,得到纯系的DHRS4基因簇缺失的SH-SY5Y-细胞株,该细胞对于进一步研究DHRS4基因簇的功能和表达调控都是难得的细胞模型。 展开更多
关键词 dhrs4基因簇 人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞株 基因缺失
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正常肝和肝癌细胞中DHRS4L2基因选择性剪接亚型的克隆及其表达调控研究 被引量:1
8
作者 甘雪琼 宋旭红 +3 位作者 李蕊 张巧霞 杜牡丹 黄东阳 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2010年第5期329-334,共6页
目的:鉴定正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞Hep-G2中DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型,并探讨其表达调控机制。方法:应用RT-PCR,3′RACE和生物信息学方法发现并鉴定DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型;去甲基化药物5-aza-dC处理HL-7702和Hep-G2细... 目的:鉴定正常肝细胞HL-7702和肝癌细胞Hep-G2中DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型,并探讨其表达调控机制。方法:应用RT-PCR,3′RACE和生物信息学方法发现并鉴定DHRS4L2基因的选择性剪接新亚型;去甲基化药物5-aza-dC处理HL-7702和Hep-G2细胞,通过RT-PCR和real-time PCR方法检测DHRS4L2的表达情况。结果:发现了2个新的DHRS4L2剪接亚型DHRS4L2A和DHRS4L2A3,2个新亚型均出现了新的第1个外显子,命名为Ea,前者缺失外显子1,后者缺失外显子1和3;在正常肝细胞中去甲基化后含DHRS4L2外显子1的转录产物比处理前明显增加,在肝癌细胞中则比处理前减少。结论:获得2个新的DHRS4L2剪接亚型,并发现DHRS4L2的表达和甲基化调控相关,且甲基化的调控作用在正常肝与肝癌细胞之间存在差异,其机制尚待进一步探讨。 展开更多
关键词 辅酶Ⅱ-依赖性视黄醇脱氢/还原酶 表达调控 dhrs4L2基因 选择性剪接
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DHRS4基因在猪骨骼肌中的表达及其与生长性状的关联分析 被引量:1
9
作者 张垒霞 杨言昭 +4 位作者 李文通 刘颖 周荣 杨亚岚 李奎 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第1期131-139,共9页
为探讨猪DHRS 4基因在骨骼肌中的表达及其与生长性状的相关性,本研究分析了DHRS 4基因在长白猪出生后30、180和300 d不同类型骨骼肌中的表达,并在蓝思白猪资源群体中筛选DHRS 4基因的多态性位点,进一步通过Sequenom SNP分型技术对DHRS ... 为探讨猪DHRS 4基因在骨骼肌中的表达及其与生长性状的相关性,本研究分析了DHRS 4基因在长白猪出生后30、180和300 d不同类型骨骼肌中的表达,并在蓝思白猪资源群体中筛选DHRS 4基因的多态性位点,进一步通过Sequenom SNP分型技术对DHRS 4基因进行基因分型,分析了DHRS 4基因多态性位点与猪生长性状(料重比、平均日增重和平均背膘厚)的相关性。结果显示,DHRS 4基因在30、180和300 d长白猪的胸肌、腿肌和背肌中均有表达,在胸肌和腿肌中,DHRS 4基因在30 d的表达显著或极显著高于180和300 d(P<0.05;P<0.01),而在背肌的不同发育时期中,其表达水平没有显著差异(P>0.05)。此外,本研究在蓝思白猪资源群体中找到了3个位于DHRS 4基因上的单核苷酸多态性位点:rs334250151、rs342446613和rs326982309。关联分析结果表明,rs334250151位点与料重比呈显著相关,该位点AA基因型个体的料重比显著低于TT基因型个体(P<0.05)。研究揭示,DHRS 4基因可能参与猪的骨骼肌发育,rs334250151位点可以作为一个新的分子标记应用于猪生长性状的遗传改良中。 展开更多
关键词 dhrs 4基因 SNP 生长性状 骨骼肌
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DHRS2蛋白对结直肠癌细胞化疗敏感性的影响 被引量:1
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作者 李济民 杨芳 +2 位作者 袁伟奇 王昊 罗以勤 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第12期1899-1903,共5页
目的研究DHRS2蛋白对肠癌耐药细胞敏感性影响及其机制。方法利用串联质谱标签法(TMT)对结直肠癌耐药细胞系HCT116/OXA与其亲本进行差异蛋白筛选;CCK-C法检测结直肠癌耐药细胞株HCT116/OXA对奥沙利钳敏感性及沉默DHRS2蛋白对其耐药性影响... 目的研究DHRS2蛋白对肠癌耐药细胞敏感性影响及其机制。方法利用串联质谱标签法(TMT)对结直肠癌耐药细胞系HCT116/OXA与其亲本进行差异蛋白筛选;CCK-C法检测结直肠癌耐药细胞株HCT116/OXA对奥沙利钳敏感性及沉默DHRS2蛋白对其耐药性影响;蛋白质印迹法验证差异表达蛋白以及检测沉默DHRS2蛋白后对相关信号通路蛋白调节作用。结果耐药细胞株HCT116/OXA中DHRS2蛋白水平明显高于亲本细胞株(P<0.001);沉默DHRS2蛋白可增加HCT116/OXA对奥沙利钳的敏感性;同时下调P53蛋白和切除修复交叉互补基1(ERCC1)蛋白的表达。此外,干扰P53蛋白后,ERCC1蛋白表达也明显减少。结论沉默DHRS2蛋白可部分恢复结直肠癌耐药细胞株HCT116/OXA对化疗药物敏感性,其机制可能为通过下调P53蛋白进而抑制ERCC1蛋白表达引起。 展开更多
关键词 结直肠癌 化疗耐药 dhrs2蛋白 P53蛋白 ER-CC1蛋白 奥沙利铂
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DHRS7对人乳腺癌细胞MCF-7细胞周期的影响及其在乳腺癌组织中的表达
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作者 张伟红 张西臣 +5 位作者 邢沈阳 李泽中 宫鹏涛 李建华 杨举 倪劲松 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期537-542,F0003,共7页
目的:探究DHRS7基因过表达和DHRS7特异性短发夹RNA(shRNA)重组质粒对人乳腺癌细胞MCF-7细胞周期的影响及DHRS7与乳腺癌浸润癌的关系,阐明DHRS7在乳腺癌发生、发展中的作用。方法:利用RT-PCR技术将DHRS7基因全长克隆入真核表达载体pcDNA3... 目的:探究DHRS7基因过表达和DHRS7特异性短发夹RNA(shRNA)重组质粒对人乳腺癌细胞MCF-7细胞周期的影响及DHRS7与乳腺癌浸润癌的关系,阐明DHRS7在乳腺癌发生、发展中的作用。方法:利用RT-PCR技术将DHRS7基因全长克隆入真核表达载体pcDNA3.1(+)质粒中,构建pcDNA3.1-DHRS7重组真核表达质粒。实验分为pcDNA3.1-DHRS7组、阴性对照组(pcDNA3.1组)、空白对照组和DHRS7-shRNA-pGenesil组,用Fugene HD转染试剂将各种质粒转染MCF-7细胞,采用RT-PCR和Westernblotting法检测各组MCF-7细胞中DHRS7的表达情况,流式细胞术分析细胞周期变化,免疫组织化学SP法检测乳腺原位癌和乳腺浸润癌组织中DHRS7蛋白的表达情况。结果:成功构建pcDNA3.1-DHRS7重组表达质粒。PCR和Western blotting结果显示,pcRNA-DHRS7组蛋白的表达量高于空白对照组(P<0.05),DHRS7-shRNA-pGenesil组蛋白的表达量低于空白对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。流式细胞术显示,DHRS7表达上调使MCF-7细胞S期细胞增多(P<0.05),DHRS7的表达下调使处于G2期的细胞增多(P<0.05)。免疫组织化学染色显示,DHRS7蛋白在原位癌中高表达,阳性表达率为100%(37/37);在乳腺浸润癌的表达明显降低,阳性率为18.9%(7/37),两者比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论:DHRS7基因参与了MCF-7细胞细胞周期的调控过程,可以抑制细胞增殖,DHRS7蛋白的表达丢失可能促进乳腺癌浸润。 展开更多
关键词 dhrs7基因 过表达 干扰 细胞周期 乳腺肿瘤 MCF-7细胞
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小鼠DHRS4基因原核表达载体的构建、表达及多克隆抗体的制备 被引量:1
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作者 张廷银 闫银侠 黄东阳 《汕头大学医学院学报》 2011年第1期5-8,共4页
目的:构建小鼠pDESTTM17/DHRS4重组载体,制备小鼠抗DHRS4多克隆抗体。方法:应用RT-PCR从小鼠肝组织扩增DHRS4的开放阅读框序列,测序确认后将其编码区构建到载体pDONRTM201上,再通过LR置换反应再将其置换到载体pDESTTM17上,测序后转化到E... 目的:构建小鼠pDESTTM17/DHRS4重组载体,制备小鼠抗DHRS4多克隆抗体。方法:应用RT-PCR从小鼠肝组织扩增DHRS4的开放阅读框序列,测序确认后将其编码区构建到载体pDONRTM201上,再通过LR置换反应再将其置换到载体pDESTTM17上,测序后转化到E.coliBL21-AI工程菌中,并经阿拉伯糖诱导表达出抗DHRS4融合蛋白。以小鼠融合蛋白作为免疫原免疫大白兔,制备小鼠抗DHRS4多克隆抗体。结果:成功构建小鼠DHRS4重组载体;转化重组质粒的E.coliBL21-AI经阿拉伯糖诱导4 h后高效表达DHRS4融合蛋白;Western bolt实验结果显示制备的多克隆抗体可特异性检测小鼠肝组织DHRS4相应蛋白的表达。结论:成功构建小鼠pDESTTM17/DHRS4原核表达载体和获得小鼠抗DHRS4多克隆抗体。 展开更多
关键词 dhrs4 基因克隆 蛋白表达 多克隆抗体
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Effects of DHRS3 in C2C12 Myoblast Differentiation and Mouse Skeletal Muscle Injury
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作者 Zhang Wen-yu Xu Jia-hui +3 位作者 Zhang Chun-yu Tong Hui-li Li Shu-feng Yan Yun-qin 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2021年第3期38-47,共10页
Myoblast differentiation is an essential process during skeletal muscle development.C2C12 myoblast is a commonly used experimental model to study muscle cell differentiation in vitro.Dehydrogenase/reductase(SDR family... Myoblast differentiation is an essential process during skeletal muscle development.C2C12 myoblast is a commonly used experimental model to study muscle cell differentiation in vitro.Dehydrogenase/reductase(SDR family)member 3(DHRS3)is a highly conserved member in short-chain alcohol dehydrogenase/reductase superfamily and has been shown to be involved in the metabolism of retinol.Previous experimental results showed that the expression of DHRS3 increased significantly during the differentiation of myoblasts differentiation.However,the effect of DHRS3 on mouse muscle cell differentiation was unclear.The objective of current study was to determine if DHRS3 affected muscle cell differentiation,and if DHRS3 was involved in muscle regeneration.Protein expression was determined by western blot and immunofluorescence analysis.The activation and inhibition of DHRS3 increased and decreased C2C12 myoblast differentiation respectively,which indicated that DHRS3 could affect C2C12 myoblast differentiation.DHRS3 expression was significantly changed during muscle regeneration,with the regeneration of muscle injury,the expression of DHRS3 tended to increase first and then decrease.It suggested that DHRS3 might be involved in muscle regeneration.In summary,this study confirmed the involvement of DHRS3 in C2C12 myoblast differentiation and mouse skeletal muscle regeneration and provided a theoretical basis for further elucidating the molecular mechanism of muscle development. 展开更多
关键词 dhrs3 C2C12 cell differentiation mouse skeletal muscle injury
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K562细胞DHRS4 L1基因新选择性剪接亚型的克隆及二级结构预测 被引量:2
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作者 李一凡 罗玮 +6 位作者 徐广健 杜冀晖 王磊 周蓓 李蓉 麦丽文 龚慧 《医学分子生物学杂志》 CAS 2016年第2期68-72,77,共6页
目的: K562细胞DHRS4L1[ dehydrogenase/reductase ( SDR family) member 4 like 1]的表达及其二级结构分析。方法以K562细胞cDNA为模板, PCR扩增DHRS4[ dehydrogenase/reductase ( SDR fami-ly) member 4]基因簇Ea2转录本。将... 目的: K562细胞DHRS4L1[ dehydrogenase/reductase ( SDR family) member 4 like 1]的表达及其二级结构分析。方法以K562细胞cDNA为模板, PCR扩增DHRS4[ dehydrogenase/reductase ( SDR fami-ly) member 4]基因簇Ea2转录本。将PCR产物A-T克隆至pGEMT-Easy质粒,对质粒进行DNA Sanger测序。将测序所得序列用NCBI ORF finder分析是否存在编码区,用Clustal Omega分析RNA序列系统树,用RNAfold web server分析RNA最小自由能二级结构。结果用RT-PCR和Sanger测序方法发现, K562表达DHRS4L1 Ea2转录本,未检测到其表达DHRS4L2[dehydrogenase/reductase (SDR family) member 4 like 2] Ea1转录本。 K562表达的DHRS4L1 Ea2至少有8种选择性剪接亚型( KU058702、 KU058703、 KU058704、KU058705、 KU058706、 KU058707、 KU058708、 KU058709),其中6种为首次发现。 KU058702、 KU058703、KU058704、 KU058705和KU058707第二外显子受到多种形式的选择性剪接,恰好仅影响第2臂的二级结构,不影响其他臂的二级结构,提示这些不同亚型的二级结构有一定相似性,第二外显子所对应的二级结构臂可能在区分不同 DHRS4L1亚型功能中发挥关键作用。结论研究发现 K562细胞至少表达8种DHRS4L1选择性剪接亚型,为长链非编码RNA。其二级结构分析为后续研究DHRS4L1在白血病细胞中的潜在功能奠定基础。 展开更多
关键词 dhrs4L1 非编码RNA 选择性剪接 二级结构
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DHRS4L1基因选择性剪接亚型的克隆及分析 被引量:2
15
作者 苏中静 陈海滨 +4 位作者 宋旭红 刘戈飞 李奇 王瑞俭 黄东阳 《解剖科学进展》 CAS 2011年第1期63-66,73,共5页
目的检测分析DHRS4基因簇新命名基因DHRS4L1的RNA选择性剪接亚型和转录特点,并预测其功能。方法 cDNA末端快速扩增克隆DHRS4L1转录本剪接亚型的全长序列,Jellyfish软件比对RNA亚型的外显子组成,RNAStructure和在线开放读码框预测其二级... 目的检测分析DHRS4基因簇新命名基因DHRS4L1的RNA选择性剪接亚型和转录特点,并预测其功能。方法 cDNA末端快速扩增克隆DHRS4L1转录本剪接亚型的全长序列,Jellyfish软件比对RNA亚型的外显子组成,RNAStructure和在线开放读码框预测其二级结构和蛋白编码功能,定量PCR检测DHRS4L1剪接亚型在不同细胞系中的表达水平。结果在人神经母细胞瘤细胞克隆得到3个DHRS4L1RNA剪接亚型的全长序列,它们具有相对稳定的二级结构,开放读码框短并且缺乏真核生物的翻译起始位点。定量PCR检测显示DHRS4L1在肝细胞表达高,在神经母细胞瘤和睾丸细胞中表达较低。结论 DHRS4L1转录产物存在不同长度的剪接亚型,它们可能不是蛋白的编码序列,而是作为非编码RNA参与其它基因的表达调控。 展开更多
关键词 dhrs4L1 选择性剪接 转录 人神经母细胞瘤
原文传递
神经母细胞瘤SK-N-SH细胞内DHRS4L2基因一种新选择性剪接亚型S4的克隆和亚细胞定位
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作者 龚慧 李一凡 +6 位作者 祝胜郎 杜冀晖 王磊 周蓓 廉婕 李蓉 麦丽文 《医学分子生物学杂志》 CAS 2017年第4期192-198,共7页
目的 神经母细胞瘤SK-N-SH细胞系脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类2[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 2,DHRS4L2]基因的一种新的选择性剪接亚型克隆、生物信息学分析及其亚细胞定位.方法 以SK-N-SH细胞cDNA为模板,... 目的 神经母细胞瘤SK-N-SH细胞系脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类2[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 2,DHRS4L2]基因的一种新的选择性剪接亚型克隆、生物信息学分析及其亚细胞定位.方法 以SK-N-SH细胞cDNA为模板,PCR扩增DHRS4基因簇Ea1转录本.将PCR产物A-T克隆至pGEMT-Easy质粒,对质粒进行DNA Sanger测序.将测序所得序列用NCBI ORF finder分析其编码区,用Motif Scan分析预测蛋白氨基酸序列.用Clustal Omega进行蛋白序列比对分析.将新亚型完整编码框cDNA以及删除偶核定位信号的编码框分别插入pEGFP-C1质粒,所得质粒和空质粒分别转染SK-N-SH细胞,在荧光显微镜下观察转染表达蛋白亚细胞定位.结果 用RT-PCR和Sanger测序方法发现,SK-N-SH表达DHRS4L2 Ea1转录本,未检测到其表达脱氢酶/还原酶(SDR家族)成员4类1[dehydrogenase/reductase(SDR family)member 4 like 1,DHRS4L1]的Ea2转录本.DHRS4L2 Ea1表达一个新的选择性剪接亚型DHRS4L2-S4(KU141377),由AY616183基础上在Ea1与E2外显子之间插入新外显子Ej形成,外显子Ej含有新亚型翻译起始密码子ATG.转录本KU141377预测蛋白羧基端具有偶核定位信号(bipartite nuclear localization signal,NLS),提示其可能定位于细胞核.绿色荧光蛋白融合蛋白实验显示,在SK-N-SH细胞该蛋白定位于细胞核.该蛋白还含有一个甘氨酸密集区(glycine-rich region)和阿片样生长因子受体重复(opioid growth factor receptor repeat)序列.结论 研究发现SK-N-SH细胞表达的一种DHRS4L2新选择性剪接亚型KU141377,其预测编码蛋白含有细胞偶核定位信号,融合荧光蛋白实验显示该新亚型定位于细胞核,这为后续研究DHRS4L2在神经母细胞瘤中的潜在功能奠定基础. 展开更多
关键词 dhrs4L2基因 选择性剪接 细胞核定位
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6G天地一体化信息网络内生安全技术 被引量:2
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作者 季新生 黄开枝 +2 位作者 邬江兴 陈亚军 游伟 《天地一体化信息网络》 2023年第2期2-12,共11页
6G天地一体化信息网络面临因网络高度暴露、节点高速运动、计算资源受限等特点带来的安全挑战,且新架构、新应用、新技术也将引入新的安全问题,亟须提出普适性安全理论,一体化解决其功能安全及网络安全问题。为此,首先阐述网络空间内生... 6G天地一体化信息网络面临因网络高度暴露、节点高速运动、计算资源受限等特点带来的安全挑战,且新架构、新应用、新技术也将引入新的安全问题,亟须提出普适性安全理论,一体化解决其功能安全及网络安全问题。为此,首先阐述网络空间内生安全主要理论基础,提出6G天地一体化信息网络内生安全架构;然后,在网络空间内生安全理论的指导下,从星载系统、6G地面移动网、星地链路探讨相关安全理论与技术构想;最后,从安全认证、高安全通信加密等方面分析天地一体化信息网络通信/安全一体化的认证加密机制,及传统安全与内生安全技术的交叉融合。 展开更多
关键词 6G 天地一体化信息网络 网络空间内生安全 DHR构造 通信/安全一体化
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一种基于内生安全的攻击反馈动态调度策略 被引量:1
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作者 陈楠楠 姜禹 +1 位作者 胡爱群 郭丞 《信息安全研究》 CSCD 2023年第1期2-12,共11页
为了提高内生安全机制调度策略的高效性和鲁棒性,设计了一种调度时机与调度数量动态调整方法.该方法首先提出一种调度触发器,使用工作时长与异常反馈2种属性共同控制调度进程的切换,并综合考虑系统异构、冗余等因素设计调度工作的整体流... 为了提高内生安全机制调度策略的高效性和鲁棒性,设计了一种调度时机与调度数量动态调整方法.该方法首先提出一种调度触发器,使用工作时长与异常反馈2种属性共同控制调度进程的切换,并综合考虑系统异构、冗余等因素设计调度工作的整体流程;然后利用历史攻击反馈信息对问题建模,针对不同攻击场景设计更新计算公式,以动态调整调度机制工作时长、执行体数量等属性值;最后设计一个仿真模拟器模拟不同攻击场景,比较各算法运行效果.仿真结果表明,该方法通过自适应调整来协调应对复杂的内外部环境,为DHR结构提供较好的安全性;同时提高执行体利用率,减少冗余资源浪费,以较低的系统开销实现较高的安全增益,性能优于其他单一策略,具有较强的实用性. 展开更多
关键词 内生安全 DHR架构 调度策略 时机选择 执行体数量
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Production of Railwayscape in urban environment:Analysing railway heritage tourism potential in Siliguri City,India
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作者 Iman BANERJEE 《Regional Sustainability》 2023年第1期1-12,共12页
For a long time,it has been argued that the theories and practices devoted to urban planning and management should conform to the fundamental role of planning policies in the production of urban space,but not merely t... For a long time,it has been argued that the theories and practices devoted to urban planning and management should conform to the fundamental role of planning policies in the production of urban space,but not merely the spatial distribution of the produced services.Towards this wider connotation,this study introduces the notion of Railwayscape,grounded on the theory of‘The Production of Space’,to examine the role of railway station districts as catalysts of urban development through the social production of urban space.The present research sets out to establish the notion of Railwayscape and apply it in a railway heritage,i.e.,the Darjeeling Himalayan Railway(DHR)and its point of inception,Siliguri City,India.Accordingly,a criteria-based evaluation of four railway station districts(New Jalpaiguri,Siliguri Town,Siliguri Junction,and Sukna)in Siliguri and its surroundings was performed.The information regarding the selected four railway station districts is obtained through field observation and key informant consultation,supplemented by published literature and remote sensing data.This evaluation is succeeded by the strengths,weaknesses,opportunities and threats(SWOT)analysis accentuating the potential strengths,weaknesses,opportunities and threats associated with the selected four railway station districts and their prospects to become the potential Railwayscape.The results of this research show that there is no railway station district in Siliguri that can fully meet the demands of the locals and tourists,therefore,relfecting a lack of awareness of the historical values of these districts.The results also indicate that there are significant differences in the relative potentials of railway station districts to become the Railwayscape in urban environment.The outcomes of this research,therefore,are expected to encourage policy-making insitutions and practitioners to realise the‘place value’of some railway station districts and their potentials to yield better economic,social and structural virtue for a wide range of actors. 展开更多
关键词 Railwayscape Darjeeling Himalayan Railway(DHR) The production of space Siliguri city Railway heritage tourism potential
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运用动态谐波回归模型对MODIS叶面积指数时间序列产品的分析与预测 被引量:2
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作者 江波 梁顺林 +1 位作者 王锦地 肖志强 《遥感学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第1期13-32,共20页
运用动态谐波回归模型(Dynamic Harmonic Regression,DHR)对MODIS的长时间序列的LAI产品进行分析,可以从中分离出LAI随时间变化的多年趋势、季节变化及残差等主要成分,通过建立的模型实现LAI年间变化的短时预测。本文将所述DHR模型分析... 运用动态谐波回归模型(Dynamic Harmonic Regression,DHR)对MODIS的长时间序列的LAI产品进行分析,可以从中分离出LAI随时间变化的多年趋势、季节变化及残差等主要成分,通过建立的模型实现LAI年间变化的短时预测。本文将所述DHR模型分析方法试用于遥感数据产品随时间变化的信息提取,对LAI年间变化的预测结果证明该方法用于遥感像元尺度LAI产品的时间序列分析与预测的效果良好。 展开更多
关键词 叶面积指数 时间序列 MODIS DHR模型
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