DNA条形码技术在大型红藻分子鉴定中的应用

本研究对浙江省枸杞岛贻贝养殖区大型海藻资源进行了调查，在形态学观察的基础上，选取93株红藻样品运用DNA分子条形码技术进行分子鉴定分析。采用的3个分子标记分别为rbcL（叶绿体基因组中1，5-二磷酸核酮糖羧化／加氧酶大亚基基因），COI（细胞色C氧化酶亚基I）和UPA（23 SrRNA基因片段，通用质体扩增区1基因片段。通过实验，我们共扩增出rbcL基因片段79条，扩增成功率为84．95％；共扩增出COI基因片段63条，扩增成功率为67．74％；共扩增出UPA基因片段76条，扩增成功率为81．72％。3个分子标记的测序成功率分别为：rbcL基因78．49％，COI基因29．03％，UPA基因72．04％。COI基因的扩增效率和测序成功率均低于rbcL和UPA基因。基于3个基因构建（Neighbor-joining，N—J）系统进化树表明，rbcL基因可以将红藻样品归类为5目，6科，7属，12种；COI基因可以将样品归类为4目，5科，5属，5种；UPA基因可以将样品归类为6目，7科，8属，11种。rbcL、COI和UPA3个基因结合可以将样品归类为7目8科11属21种。研究表明rbcL基因以及UPA基因较适合做为鉴定大型红藻的分子标记，C01基因做为红藻分子标记的潜力有待进一步开发和研究。