一种新型基因芯片技术在人乳头瘤病毒(HPV)高通量基因分型检测的应用研究

目前应用比较多的采用反向点杂交/线性杂交方法的人乳头瘤病毒(HPV)基因分型检测方法,操作比较繁琐。该文通过设计针对29种HPV基因型的引物对和特异性探针,对HPV样品进行PCR扩增后,将反向引物生物素标记的PCR产物与固定在HPV基因芯片上的HPV DNA探针杂交、清洗和酶标显色,再对芯片进行图像分析转化为数字信号、确定HPV型别,建立HPV高通量基因分型方法(HPG)。HPV基因芯片大小为0.36 cm2,每个芯片可在96孔板内的小孔中进行杂交和显色。与HCII方法检测的203例样本比较,对13种高危型检测的结果表明,HPG和HCII方法的一致性较好(kappa值0.663),HPG的分析灵敏度更高。显示了高通量快速检测的在大规模流行病调查、疫苗试验和常规诊断的临床应用前景。

高通量人乳头瘤病毒分型检测方法与序列分析和杂交捕获法的性能比较研究

选取HCII试剂检测的样本500例,比较自主研发的HPV高通量分型检测方法(HPG)对13种高危型HPV的检测结果,用L1特异性PCR结合DNA测序法进行验证。高通量HPV分型检测方法与HCII,总符合率94.4%(95%置信区间(CI):92.4%-96.4%),Kappa值=0.870(95%置信区间:0.782-0.958),两者几乎完全一致。用DNA测序法对分型结果进行分析验证,HPG方法的灵敏度和特异度分别为96.2%和98.5%,HCII的灵敏度和特异度分别为93.7%和97.4%。高通量HPV分型检测的灵敏度和特异度略高于HCII,而且具有检测通量高、操作简便、成本低等特点,为HPV的临床分型检测提供了可靠的高效率检测方法。