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胶质瘤组织中TRIP4和DDIT4水平表达及其与临床病理特征和预后的关系
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作者 井山泉 梁莉萍 +3 位作者 刘林林 李辉 李聪慧 徐丽峰 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第2期18-22,128,共6页
目的研究胶质瘤组织中甲状腺激素受体结合蛋白4(thyroid hormone receptor interacting protein 4,TRIP4)和DNA损伤诱导转录因子4(DNA damage inducing transcription factor 4,DDIT4)水平表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法选取... 目的研究胶质瘤组织中甲状腺激素受体结合蛋白4(thyroid hormone receptor interacting protein 4,TRIP4)和DNA损伤诱导转录因子4(DNA damage inducing transcription factor 4,DDIT4)水平表达及其与临床病理特征和预后的关系。方法选取2018年2月~2019年2月河北医科大学第一医院收治的94例胶质瘤患者为研究对象。应用免疫组织化学法检测组织中TRIP4和DDIT4蛋白表达。比较不同临床病理特征脑胶质瘤组织中TRIP4和DDIT4蛋白表达。采用Kaplan-Meier生存曲线分析不同TRIP4和DDIT4蛋白表达胶质瘤患者生存预后的差异。单因素和多因素COX回归分析影响胶质瘤患者生存预后的因素。结果胶质瘤组织中TRIP4(68.09%)和DDIT4(65.96%)蛋白阳性率高于瘤旁组织(13.83%,10.64%),差异具有统计学意义(χ^(2)=57.212,60.866,均P<0.05)。胶质瘤组织中TRIP4与DDIT4蛋白表达呈显著正相关性(r=0.722,P<0.05)。WHO分级Ⅲ级、肿瘤直径≥3cm胶质瘤组织中TRIP4和DDIT4蛋白阳性率均高于WHO分级Ⅰ~Ⅱ级、肿瘤直径<3cm胶质瘤组织,差异具有统计学意义(χ^(2)=6.393~14.754,均P<0.05)。TRIP4阳性表达组和阴性表达组三年总体生存率分别为37.50%(24/64),66.67%(20/30),TRIP4阳性表达组三年累积生存率低于阴性表达组,差异具有统计学意义(Log-rankχ^(2)=5.949,P=0.015)。DDIT4阳性表达组和阴性表达组三年总体生存率分别为37.10%(23/62),70.00%(21/30),DDIT4阳性表达组三年累积生存率低于阴性表达组,差异具有统计学意义(Log-rankχ^(2)=7.642,P=0.006)。肿瘤直径≥3cm(HR=1.614,P=0.000),WHO分级Ⅲ级(HR=1.790,P=0.000),TRIP4阳性表达(HR=1.665,P=0.000),DDIT4阳性表达(HR=1.476,P=0.000)是影响胶质瘤患者生存预后的独立危险因素。结论胶质瘤组织中TRIP4和DDIT4蛋白表达升高,两者与肿瘤直径及WHO分级相关,是潜在的评估胶质瘤预后的肿瘤标志物。 展开更多
关键词 胶质瘤 甲状腺激素受体结合蛋白4 dna损伤诱导转录因子4
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血清PKN1、TNFRSF4、DDIT4预测子宫内膜癌患者淋巴结转移及预后的临床价值
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作者 厉昕妤 刘英杰 +3 位作者 郭佳 许楠 杨小杰 董仙萍 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第16期1931-1935,1940,共6页
目的探讨血清蛋白激酶N1(PKN1)、肿瘤坏死因子受体超家族成员4(TNFRSF4)、DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)预测子宫内膜癌患者淋巴结转移和预后的临床价值。方法选取2019年10月至2021年10月于唐山市妇幼保健院治疗的180例子宫内膜癌患者为... 目的探讨血清蛋白激酶N1(PKN1)、肿瘤坏死因子受体超家族成员4(TNFRSF4)、DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)预测子宫内膜癌患者淋巴结转移和预后的临床价值。方法选取2019年10月至2021年10月于唐山市妇幼保健院治疗的180例子宫内膜癌患者为子宫内膜癌组。另选取同期在该院治疗的子宫良性疾病患者180例作为良性疾病组,以及在该院体检的180例健康者作为健康组。子宫内膜癌组根据是否发生淋巴结转移分为淋巴结转移组42例和无淋巴结转移组138例,按照随访结果将患者分为预后不良组和预后良好组。比较各组血清PKN1、TNFRSF4、DDIT4水平,Logistic模型分析患者预后的影响因素,以及绘制受试者工作特征曲线分析血清PKN1、TNFRSF4、DDIT4对患者预后的预测价值。结果与健康组比较,子宫内膜癌组、良性疾病组血清PKN1、DDIT4水平升高,血清TNFRSF4水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。淋巴结转移组血清PKN1、DDIT4水平高于无淋巴结转移组,TNFRSF4水平低于无淋巴结转移组,差异有统计学意义(P<0.05)。预后不良组低分化程度、淋巴脉管间隙浸润阳性、肌层浸润≥1/2的占比高于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05)。预后不良组血清PKN1、DDIT4水平高于预后良好组,TNFRSF4水平低于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05)。血清PKN1、DDIT4、LVSI、肌层浸润是子宫内膜癌预后的危险因素,血清TNFRSF4为子宫内膜癌预后的保护因素(P<0.05)。血清PKN1、TNFRSF4、DDIT4联合对子宫内膜癌患者预后状况的预测效能高于各血清指标单独预测(P<0.05)。结论血清PKN1、TNFRSF4、DDIT4与子宫内膜癌患者淋巴结转移及预后有关,且对患者预后的预测效能较高。 展开更多
关键词 蛋白激酶N1 肿瘤坏死因子受体超家族成员4 dna损伤诱导转录因子4 子宫内膜癌 预后
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circMAN1A2调节miR-212-3p/DDIT4轴对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响
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作者 曹博威 贾腾飞 +2 位作者 宋钉町 赵昱清 张文斌 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2024年第7期868-874,共7页
目的探究circMAN1A2靶向miR-212-3p/DNA损伤诱导转录子4(NDA damage-inducible transcript 4,DDIT4)轴对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法qRT-PCR法检测胃癌组织和细胞中circMAN1A2、miR-212-3p表达水平。荧光素酶检测circMAN1A2与... 目的探究circMAN1A2靶向miR-212-3p/DNA损伤诱导转录子4(NDA damage-inducible transcript 4,DDIT4)轴对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法qRT-PCR法检测胃癌组织和细胞中circMAN1A2、miR-212-3p表达水平。荧光素酶检测circMAN1A2与miR-212-3p、DDIT4和miR-212-3p的靶向关系。在胃癌细胞SGC-7901、HGC-27中转染si-NC、si-circMAN1A2、si-circMAN1A2+anti-NC、si-circMAN1A2+anti-miR-212-3p、miR-NC、miR-212-3p mimics,将未转染的SGC-7901、HGC-27细胞设为对照。平板克隆实验检测细胞增殖;细胞划痕及Transwell实验分别检测细胞迁移、侵袭能力。Western blotting检测增殖、迁移及侵袭相关蛋白表达。结果在胃癌组织及细胞中,circMAN1A2高表达,miR-212-3p低表达;下调circMAN1A2可以靶向上调miR-212-3p表达,且下调DDIT4表达,进而抑制胃癌细胞增殖、侵袭和迁移能力。抑制miR-212-3p表达可部分逆转抑制circMAN1A2表达对胃癌细胞恶性增殖的抑制作用。结论在胃癌细胞中抑制circMAN1A2表达可抑制胃癌细胞增殖、迁移与侵袭,其与调节miR-212-3p/DDIT4信号轴有关。 展开更多
关键词 环状RNA MAN1A2 微小RNA-212-3p dna损伤诱导转录子4 胃癌 增殖 侵袭 迁移
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DDIT4通过自噬相关通路影响大肠癌的发生研究
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作者 黄合 李剑敏 +1 位作者 谭玲 游淑清 《浙江创伤外科》 2024年第6期1003-1008,共6页
目的观察DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)在大肠癌(CRC)组织和癌旁组织中的表达,探索其与临床病理特征的相关性、预后及作用机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集CRC数据集,比较DDIT4mRNA的表达及预后相关性分析,筛选关键基因进行功... 目的观察DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)在大肠癌(CRC)组织和癌旁组织中的表达,探索其与临床病理特征的相关性、预后及作用机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集CRC数据集,比较DDIT4mRNA的表达及预后相关性分析,筛选关键基因进行功能富集分析。收集2022年5月至2023年5月在温州医科大学黄岩医院诊断为CRC的石蜡标本观察组100例,对照组60例,通过免疫组化染色检测肿瘤和癌旁DDIT4的表达,并进行临床病理特征的相关性分析。培养CRC及正常肠上皮细胞系,RT-PCR检测其DDIT4 mRNA的表达,基因干预DDIT4的表达,Western blot法检测自噬通路相关蛋白(mTOR、p-mTOR、Beclin1、P62)的表达。结果TCGA数据库数据和免疫组化结果显示DDIT4在CRC中表达显著增加(P<0.001),与患者总体生存率、浸润深度、肿瘤大小、淋巴结转移、DUKES分期和血清CEA水平相关(P<0.05)。沉默DDIT4基因,mTOR自噬相关通路下游p-mTOR/mTOR比值及P62相对升高,Beclin1相对降低(P<0.05)。结论DDIT4基因与CRC的发生发展及不良预后显著相关,其机制可能与DDIT4参与调控mTOR信号通路激活自噬有关。 展开更多
关键词 dna损伤诱导转录物4 自噬 大肠癌 免疫组化 不良预后
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DNA损伤诱导转录因子4过表达可能通过Wnt/β-catenin信号通路抑制HT-22细胞增殖并促进其凋亡 被引量:5
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作者 王宇飞 孙雨晴 +7 位作者 张凯丽 宋美燕 李佳琪 张娟 王磊 吴雪梅 赵虹 刘志贞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期927-936,共10页
神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一种由细胞增殖凋亡紊乱引起的先天缺陷性疾病。本室前期利用RNA-Seq技术,发现小鼠神经管畸形胚胎脑组织中DNA损伤诱导转录因子-4(DNA damage-inducible transcript 4,Ddit4)表达水平增加,但其... 神经管畸形(neural tube defects,NTDs)是一种由细胞增殖凋亡紊乱引起的先天缺陷性疾病。本室前期利用RNA-Seq技术,发现小鼠神经管畸形胚胎脑组织中DNA损伤诱导转录因子-4(DNA damage-inducible transcript 4,Ddit4)表达水平增加,但其在神经管畸形中的作用尚不清楚。本文拟探索Ddit4过表达对海马神经元HT-22细胞增殖和凋亡的影响及相关机制,从而为后续研究Ddit4在小鼠神经管畸形中的作用奠定基础。本研究首先根据小鼠Ddit4序列构建真核表达载体pEX-3-Ddit4,限制性酶切分析和测序结果表明pEX-3-Ddit4构建成功。qRT-PCR和Western印迹检测显示转染pEX-3-Ddit4后,HT-22细胞中DDIT4的表达水平明显增加(P<0.01)。CCK-8和Western印迹结果显示,Ddit4过表达导致HT-22细胞增殖下降(P<0.01)。流式细胞仪结果显示,转染pEX-3-Ddit4后,G0/G1期细胞比例增加、S期比例下降(P<0.01),细胞凋亡率增加(P<0.05)。Western印迹检测发现,转染pEX-3-Ddit4能够显著上调切割胱天蛋白酶3(cleaved caspase3)水平(P<0.05),表明Ddit4过表达促进HT-22细胞凋亡。细胞免疫荧光及Western印迹结果显示,过表达Ddit4显著降低细胞β-联蛋白(β-catenin)、T细胞因子4、细胞周期蛋白D1和C-myc的表达水平(P<0.05),核内β-联蛋白减少,提示Ddit4过表达抑制了Wnt/β-catenin信号通路。过表达Ddit4的同时加入Wnt/β-catenin信号通路激动剂LiCl处理细胞可逆转上述现象,表明Ddit4过表达可能通过Wnt/β-catenin信号通路对HT-22细胞发挥抗增殖和促凋亡作用。 展开更多
关键词 dna损伤诱导转录因子-4 真核表达载体 HT-22细胞 WNT/Β-CATENIN信号通路
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miR-22通过靶向抑制DDIT4促进糖尿病肾病肾小管上皮细胞DNA损伤 被引量:4
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作者 梁丹 赵思琪 +4 位作者 李志阳 肖雅文 丁菁 肖瑛 郭兵 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1933-1941,共9页
目的:探究在糖尿病肾病(DKD)中微小RNA-22(miR-22)是否能靶向抑制DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)的表达,进而通过毛细血管扩张性共济失调突变蛋白(ATM)-细胞周期检查点激酶2(Chk2)通路促进DNA损伤。方法:(1)C57BL小鼠建立糖尿病(DM)模型,于1... 目的:探究在糖尿病肾病(DKD)中微小RNA-22(miR-22)是否能靶向抑制DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)的表达,进而通过毛细血管扩张性共济失调突变蛋白(ATM)-细胞周期检查点激酶2(Chk2)通路促进DNA损伤。方法:(1)C57BL小鼠建立糖尿病(DM)模型,于16周后处死,分析其生化指标并对肾脏组织做HE染色,Western blot检测肾脏组织中p-ATM、p-Chk2和DDIT4蛋白水平;(2)分别用高糖(30 mmol/L葡萄糖)和正常糖(5.5 mmol/L葡萄糖)培养基培养大鼠肾小管上皮细胞NRK-52E,彗星实验检测DNA双链断裂程度,流式细胞术检测高糖对细胞周期的影响,Western blot检测细胞中p-ATM、p-Chk2和DDIT4蛋白水平;(3)构建DDIT4过表达质粒,转染NRK-52E细胞后通过彗星实验检测DDIT4过表达对DNA双链断裂的影响,并构建miR-22模拟物(mimics)和抑制物(inhibitor),分别转染miR-22 mimics和inhibitor,通过Western blot检测细胞中p-ATM、p-Chk2和DDIT4蛋白水平。结果:(1)DM组小鼠肾组织中p-ATM和p-Chk2蛋白水平显著增高,DDIT4蛋白水平显著下降(P<0.05)。(2)高糖培养的NRK-52E细胞比正常糖培养的细胞彗尾更长,p-ATM和p-Chk2蛋白水平显著增高,DDIT4蛋白水平显著下降(P<0.05)。(3)高糖培养的NRK-52E细胞过表达DDIT4后,p-ATM和p-Chk2蛋白水平显著降低,细胞彗尾变短;转染miR-22 mimics后,p-ATM和p-Chk2蛋白水平显著增高,DDIT4蛋白水平显著下降;转染miR-22 inhibitor后,p-ATM和p-Chk2蛋白水平显著下降,DDIT4蛋白水平显著增高(P<0.05)。结论:高糖可导致DNA损伤加重,其机制可能为miR-22靶向抑制DDIT4表达,诱导肾小管上皮细胞发生DNA损伤,从而促进DKD的发生发展。 展开更多
关键词 dna损伤 微小RNA-22 dna损伤诱导转录物4 糖尿病肾病 ATM-Chk2信号通路
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DNA损伤诱导转录子4基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 戈春城 汪羽 +4 位作者 何三纲 徐佳 王曦 童国勇 余周庆 《口腔医学研究》 CAS 北大核心 2019年第11期1044-1047,共4页
目的:探讨DNA损伤诱导转录子4(DNA damage inducible transcript 4,DDIT4)基因在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其临床意义。方法:分别下载癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库... 目的:探讨DNA损伤诱导转录子4(DNA damage inducible transcript 4,DDIT4)基因在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达水平及其临床意义。方法:分别下载癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的OSCC队列数据(n=362)及基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中的GSE42743数据集(n=103)。比较OSCC组和正常对照组中DDIT4的表达水平,并分析DDIT4与OSCC患者临床特征和预后的关系。此外,利用生物信息学方法寻找DDIT4可能参与的生物学功能。结果:DDIT4在OSCC组中的表达水平高于对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。在OSCC患者中,DDIT4的表达水平与肿瘤分期呈正相关(P<0.001),且OSCC高表达组的总生存率明显低于低表达组(Log-rank检验,P<0.01)。进一步行Cox回归分析,结果提示DDIT4高表达是OSCC患者预后不良的独立预测因素(P<0.05)。生物信息学分析表明,DDIT可能与低氧反应、糖酵解、雷帕霉素靶蛋白C1(mammalian target of rapamycin C1,mTORC1)信号通路、核因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)介导的肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)信号通路、G 2M检查点、p53信号通路等生物学功能有关。结论:DDIT4基因在OSCC患者中呈高表达状态,并且其表达水平与肿瘤分期有关。高表达DDIT4基因的OSCC患者预后不佳。因此,DDIT4可作为OSCC预后评估的一种标记物。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 dna损伤诱导转录子4 预后 生物标志物
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LncRNA SNHG15通过miR-483-3p/DDIT4轴调节非小细胞肺癌细胞的顺铂敏感性和上皮间质转化 被引量:1
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作者 王韵 宋姗 +1 位作者 彭斐 胡文霞 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第5期557-563,共7页
目的 探究LncRNA SNHG15对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞的顺铂(DDP)敏感性和上皮间质转化的影响以及miR-483-3p/DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)轴在其中发挥的作用。方法 体外培养NSCLC细胞(A549)、NSCLC耐药细胞(A549/DDP),检测两种细胞对DDP的... 目的 探究LncRNA SNHG15对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞的顺铂(DDP)敏感性和上皮间质转化的影响以及miR-483-3p/DNA损伤诱导转录物4(DDIT4)轴在其中发挥的作用。方法 体外培养NSCLC细胞(A549)、NSCLC耐药细胞(A549/DDP),检测两种细胞对DDP的IC50及LncRNA SNHG15、miR-483-3p、DDIT4 mRNA与蛋白表达,将A549/DDP细胞随机分为A549/DDP组、si NC组、si SNHG15组、si SNHG15+inhibitor NC组、si SNHG15+miR-483-3p inhibitor组、si SNHG15+miR-483-3p inhibitor+si NC组、si SNHG15+miR-483-3p inhibitor+si DDIT4组;蛋白印迹分析法检测各组细胞E-cad、N-cad、DDIT4蛋白表达变化;双荧光素酶报告实验验证miR-483-3p与LncRNA SNHG15、DDIT4的靶向关系。结果 与A549细胞相比,A549/DDP细胞对DDP的IC50、LncRNA SNHG15、DDIT4 mRNA与蛋白升高,miR-483-3p水平降低(P <0.05);A549/DDP组细胞间黏附明显被破坏;si SNHG15组、si SNHG15+miR-483-3p inhibitor+si DDIT4组细胞排列相对紧密,呈现上皮细胞特性;si SNHG15+miR-483-3p inhibitor组较si SNHG15组细胞排列松散、扩散细胞多;与A549/DDP组相比,si SNHG15组A549/DDP细胞增殖抑制率、E-cad表达升高,侵袭细胞数、迁移细胞数、N-cad、DDIT4表达降低(P <0.05);与si SNHG15组相比,si SNHG15+miR-483-3p inhibitor组A549/DDP细胞增殖抑制率、E-cad表达降低,侵袭细胞数、迁移细胞数、N-cad、DDIT4表达升高(P <0.05)。结论沉默A549/DDP细胞中SNHG15表达可通过调控miR-483-3p/DDIT4,抑制A549/DDP细胞增殖、侵袭、迁移、EMT,并降低A549/DDP细胞对DDP的耐药性。 展开更多
关键词 LncRNA SNHG15 miR-483-3p dna损伤诱导转录物4 非小细胞肺癌 顺铂 上皮间质转化
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多房棘球蚴囊液对沉默DDIT4后小鼠肝细胞生物学功能的影响
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作者 尹凤娇 徐凯 +8 位作者 陈佳昕 仁增卓嘎 乜茹 冶赓搏 庞明泉 樊海宁 曹得萍 王海久 王志鑫 《中国高原医学与生物学杂志》 CAS 2023年第3期195-202,共8页
目的探讨多房棘球蚴囊液(Hydatid cyst fluid,HCF)对沉默DNA损伤诱导转录因子4(DNA damage-inducible transcript 4,DDIT4)后小鼠肝细胞生物学功能的影响。方法1.采用免疫蛋白印迹法(Western Blot)、实时荧光定量法(RT-qPCR)检测经HCF... 目的探讨多房棘球蚴囊液(Hydatid cyst fluid,HCF)对沉默DNA损伤诱导转录因子4(DNA damage-inducible transcript 4,DDIT4)后小鼠肝细胞生物学功能的影响。方法1.采用免疫蛋白印迹法(Western Blot)、实时荧光定量法(RT-qPCR)检测经HCF处理的小鼠肝细胞中DDIT4蛋白的表达量,以检测转染效率;2.选用慢病毒转染小鼠正常肝细胞DDIT4后做HCF处理,采用细胞计数试剂8法(CCK-8)检测各组小鼠肝细胞的细胞活性;3.用Western Blot法检测Beclin-1、Caspase-3、LC3等凋亡自噬相关蛋白水平;4.用透射电镜观察HCF对小鼠肝细胞超微结构的影响。结果1.经HCF作用后慢病毒转染小鼠肝细胞的DDIT4基因及蛋白表达水平检测结果显示,LV-Ddit4-RNAi 1、LV-Ddit4-RNAi 2、LV-Ddit4-RNAi 3组分别与LV-Ddit4-NC组比较,前三组DDIT4蛋白含量显著下降,LV-Ddit4-RNAi 3组尤为显著(P<0.01)。2.LV-Ddit4-RNAi 0.4、0.8 mg/mL组细胞OD值明显大于LV-Ddit4-NC 0.4、0.8 mg/mL组(P<0.01);与HCF共培养48 h后,沉默DDIT4组细胞形态接近正常AML-12细胞的形态,多呈椭圆形或者圆形,且细胞生长密度较LV-Ddit4-NC组明显为高。3.与LV-Ddit4-NC con组比较,LV-Ddit4-NC 0.4 mg/mL HCF组和LV-Ddit4-NC 0.8 mg/mL HCF组的LC3-II、Beclin-1、Caspase-3蛋白表达水平显著增高(P<0.01);分别与LV-Ddit4-NC 0.4、0.8 mg/mL HCF组比较,LV-Ddit4-RNAi 0.4、0.8 mg/mL HCF组的LC3-II、Beclin-1、Caspase-3蛋白表达水平显著降低,均具有统计学意义。4.两对照组细胞胞质未见明显损伤,线粒体基质较均匀,粗面内质网未见明显扩张,自噬水平低;LV-Ddit4-RNAi 0.4、0.8 mg/mL组细胞损伤较轻,未见粗面内质网扩张,胞质内存在较多脂滴,自噬数量增多;LV-Ddit4-NC 0.4、0.8 mg/mL组细胞损伤严重,粗面内质网严重扩张,胞质内存在大量脂滴,可见大量自噬结构。结论HCF对沉默DDIT4后小鼠肝细胞生物学功能的影响:1.AML-12细胞增殖;2.AML-12细胞凋亡、自噬数量减少。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 囊液 沉默dna损伤诱导转录因子4 细胞 凋亡 自噬
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Expression and Activities Experiment of DNA Transduction Motif Based on GAL4 in Pichia Pastoris
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作者 XU Xiao-hong CHI Bao-rong +7 位作者 LI Xiao YANG En-cheng GAO Peng LIU Yan JIA Peng KAN Shi-fu WEN Zong-mei JIN Ning-yi 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期221-224,共4页
The genes encoding DNA-binding domain(BD) designed based on the yeast transcriptional activator GAL4 and protein transduction domain of HIV-1 Tat protein were fused via soft linker peptide sequence, and cloned into ... The genes encoding DNA-binding domain(BD) designed based on the yeast transcriptional activator GAL4 and protein transduction domain of HIV-1 Tat protein were fused via soft linker peptide sequence, and cloned into yeast expression vector pPIC9k. The resulted plasmid pTG was linearized and transfected into Pichia pastoris strains GS 115 by electroporation. High copies of transformants were obtained with Muts and HIS+ phenotype identi- fication, PCR amplification and screening of G418. After flask culture and expression induced by methanol, the target protein named TG was well expressed and analyzed by SDS-PAGE and Western blot. Under optimized conditions, the yield of soluble recombinant protein was approximately 39.7 mg/L. DNA binding activity and cell transduction property of TG were analyzed by gel eleetrophoresis and fluorescent microscopy. The results show that the recombinant protein could bind strongly to the plasmid containing upstream activating sequence(UAS). The cell experiments revealed that TG could deliver the binding plasmid into HEK-293 cells effectively. In summary, the work presented here suggests that TG is specific toward UAS containing plasmid and has the potential for use as nonviral DNA delivery agent. 展开更多
关键词 Nonviral dna delivery Yeast transcription activator(GAL4 Cell-penetrating peptide Upstream activating sequence(UAS) Secrete expression Pichia pastoris
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DDIT4对脑缺血再灌注损伤中自噬的调控作用 被引量:3
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作者 张怡 高维娟 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期956-960,共5页
脑卒中(stroke)是危害人类健康与生命的常见病和多发病,是造成我国居民死亡的首位原因^([1]),其中缺血性脑卒中(ischemia stroke)的发病率及致死致残率更是居高不下,约占全部脑血管病的60%~80%。
关键词 dna损伤诱导转录物4 脑缺血再灌注损伤 自噬
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DDIT4在皮肤基底细胞癌中的表达及对细胞增殖和自噬通路的调控 被引量:3
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作者 张晓姣 李婧 罗福玲 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期177-180,共4页
目的:检测DNA损伤诱导转录因子-4(DNA damage-inducible transcript 4,DDIT4)在皮肤基底细胞癌(basal cell carcinoma,BCC)中的表达及其对下游的细胞蛋白合成、增殖和自噬水平的影响。方法:采用免疫组化和Western blot分别对15例人皮肤... 目的:检测DNA损伤诱导转录因子-4(DNA damage-inducible transcript 4,DDIT4)在皮肤基底细胞癌(basal cell carcinoma,BCC)中的表达及其对下游的细胞蛋白合成、增殖和自噬水平的影响。方法:采用免疫组化和Western blot分别对15例人皮肤BCC组织和正常皮肤15例进行检测,比较两者DDIT4、p S6K1、p4E-BP1和LC3Ⅱ/Ⅰ的表达。结果:与正常组织相比,DDIT4(0.247±0.152,P=0.005)在BCC中的表达被明显抑制,伴p4E-BP1表达(0.290±0.169,P=0.015)和LC3Ⅱ/Ⅰ的比值(0.692±0.154,P=0.007)降低,但p S6K1(0.837±0.050,P=0.000)表达明显增加,具有统计差异。结论:DDIT4在BCC中的表达受抑制,可能通过其下游的mTORC1通路进而促进癌细胞的蛋白合成和增殖能力,但自噬流受阻,参与BCC的发生发展过程;DDIT4及其下游通路信号可能作为BCC的进一步治疗及预后研究的靶点。 展开更多
关键词 dna损伤诱导转录因子-4 基底细胞癌 肿瘤增殖 自噬流
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左旋多巴处理SH-SY5Y细胞可能通过DNA甲基化调节单胺氧化酶B基因的转录
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作者 杨兆菲 王勇 +2 位作者 杨俭 汪璇 王晓民 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2015年第5期734-739,共6页
目的探究左旋多巴(L-3,4-dihydroxyphenylalanine,L-DOPA)对多巴胺代谢关键基因单胺氧化酶B(monoamine oxidase B,MAO-B)转录的影响及其表观遗传学调控机制。方法以人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞作为研究对象,应用基因组甲基化定量试剂盒检... 目的探究左旋多巴(L-3,4-dihydroxyphenylalanine,L-DOPA)对多巴胺代谢关键基因单胺氧化酶B(monoamine oxidase B,MAO-B)转录的影响及其表观遗传学调控机制。方法以人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞作为研究对象,应用基因组甲基化定量试剂盒检测L-DOPA对基因组甲基化的影响;采用半定量RT-PCR方法探究L-DOPA和DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-aza-d C)对MAO-B转录的影响;应用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)技术检测L-DOPA对MAO-B基因启动子区Cp G岛甲基化程度的影响。结果 1L-DOPA(2μmol/L和20μmol/L)和50μmol/L 5-aza-d C处理SH-SY5Y细胞24 h均会使其基因组甲基化降低。2L-DOPA(2μmol/L和20μmol/L)处理SH-SY5Y细胞24 h会使MAO-B mRNA下调,而多巴脱羧酶(DOPA-decarboxylase,DDC)和儿茶酚胺氧位甲基转移酶(catechol-O-methyltransferase,COMT)转录无明显变化。3不同浓度5-aza-d C(0、50、100和150μmol/L)处理细胞24 h,MAO-B mRNA表达明显上调,DDC和COMT转录无明显变化,提示MAO-B可能受到DNA甲基化调控。4L-DOPA处理可使MAO-B基因启动子区Cp G岛甲基化升高,而5-aza-d C可使该区域Cp G岛甲基化降低,说明该区域甲基化受L-DOPA影响而升高,并可能是MAO-B基因转录活性下调的原因。结论 LDOPA可能对MAO-B基因的转录活性有抑制作用,且可能是通过L-DOPA诱导的高Cp G甲基化所导致,从表观遗传学(主要是DNA甲基化)对临床上L-DOPA治疗可能产生的多巴胺代谢紊乱及其不良反应做出了新的解释。 展开更多
关键词 左旋多巴 单胺氧化酶B dna甲基化 基因转录
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Methylation profile of bovine Oct4 gene coding region in relation to three germ layers 被引量:4
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作者 ZHOU Xin-yu LIU Liang-liang +1 位作者 JIA Wen-chao PAN Chuan-ying 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第3期618-628,共11页
Previous studies have shown that octamer-binding transcription factor 4(Oct4) plays a significant role in early embryonic development of mammalian animals, and different Oct4 expression levels induce multi-lineage d... Previous studies have shown that octamer-binding transcription factor 4(Oct4) plays a significant role in early embryonic development of mammalian animals, and different Oct4 expression levels induce multi-lineage differentiation which are regulated by DNA methylation. To explore the relationship between the methylation pattern of Oct4 gene exon 1 and embryonic development, in this work, five different tissues(heart, liver, lung, cerebrum and cerebellum) from three germ layers were chosen from low age(50–60 d) and advanced age(60–70 d) of fetal cattle and the differences between tissues or ages were analyzed, respectively. The result showed that the DNA methylation level of Oct4 gene exon 1 was significant different(P〈0.01) between any two of three germ layers in low age(〈60 d), but kept steady of advanced age(P〉0.05)(〉60 d), suggesting that 60-d post coital was an important boundary for embryonic development. In addition, in ectoderm(cerebrum and cerebellum), there was no significant methylation difference of Oct4 gene exon 1 between low age and advanced age(P〉0.05), but the result of endoderm(liver and lung) and mesoderm(heart) were on the contrary(P〈0.01), which indicated the development of ectoderm was earlier than endoderm and mesoderm. The methylation differences from the 3rd, 5th and 9th Cp G-dinucleotide loci of Oct4 gene exon 1 were significantly different between each two of three germ layers(P〈0.05), indicating that these three loci may have important influence on bovine embryonic development. This study showed that bovine germ layers differentiation was significantly related to the DNA methylation status of Oct4 gene exon 1. This work firstly identified the DNA methylation profile of bovine Oct4 gene exon 1 and its association with germ layers development in fetus and adult of cattle. Moreover, the work also provided epigenetic information for further studying bovine embryonic development and cellular reprogramming. 展开更多
关键词 bovine dna methylation octamer-binding transcription factor 4(Oct4 exon germ layer
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白血病患者ID4、hMLH1、CDX2基因启动子区异常甲基化及mRNA表达分析 被引量:3
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作者 韩松 侯志新 +2 位作者 刘承祥 张雷 郑伟 《疑难病杂志》 CAS 2020年第4期367-370,共4页
目的分析白血病患者DNA结合抑制因子4(ID4)、人类Mut L同源物1(hMLH1)、尾型同源盒转录因子-2(CDX2)基因启动子区异常甲基化及mRNA表达。方法选取2015年1月—2019年3月中国人民解放军联勤保障部队第九六四医院确诊的白血病患者90例作为... 目的分析白血病患者DNA结合抑制因子4(ID4)、人类Mut L同源物1(hMLH1)、尾型同源盒转录因子-2(CDX2)基因启动子区异常甲基化及mRNA表达。方法选取2015年1月—2019年3月中国人民解放军联勤保障部队第九六四医院确诊的白血病患者90例作为研究组,按照白血病类型分为急性髓系白血病(AML)38例、慢性粒细胞白血病(CML)24例、急性淋巴细胞白血病(ALL)28例,并选取同期健康志愿者30例作为健康对照组。比较各组ID4、hMLH1、CDX2基因启动子区异常甲基化及mRNA表达情况。结果AML、CML、ALL患者ID4基因甲基化发生率分别为73.68%、75.00%、85.71%,明显高于健康对照组的3.33%(χ^2=52.683,P<0.001),AML、CML、ALL患者hMLH1基因甲基化发生率分别为57.89%、58.33%、60.71%,明显高于健康对照组的6.67%,差异均有统计学意义(χ^2=24.772,P<0.001);AML、CML、ALL患者CDX2基因甲基化发生率均为100.00%,与健康对照组的96.67%比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。AML、CML、ALL患者ID4、hMLH1、CDX2基因mRNA表达均明显低于健康对照组,差异均有统计学意义(F=349.916、339.255、114.064,P<0.001)。结论白血病患者ID4、hMLH1、CDX2基因启动子区异常甲基化与白血病的发病机制密切相关,ID4、hMLH1基因的mRNA表达受到甲基化的影响,CDX2基因的mRNA表达与甲基化无关。 展开更多
关键词 白血病 dna结合抑制因子4 人类Mut L同源物1 尾型同源盒转录因子-2 基因甲基化 mRNA表达
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CHD4基因表达对急性T淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定
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作者 杨彩霞 陆超 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期331-338,共8页
目的:探讨人染色质解旋酶DNA结合蛋白4(recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4)基因表达对急性T细胞淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定。方法:使用siRNA-CHD4瞬时转染T淋巴细胞白血病细胞(Jurk... 目的:探讨人染色质解旋酶DNA结合蛋白4(recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4)基因表达对急性T细胞淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定。方法:使用siRNA-CHD4瞬时转染T淋巴细胞白血病细胞(Jurkat)敲低CHD4基因表达,实时荧光定量q RT-PCR和Western blot检测细胞转染后CHD4表达量,流式细胞术测定细胞凋亡率及细胞周期变化;CCK-8分析测定CHD4基因对Jurkat细胞增殖的影响。根据生物信息学分析,以Jurkat细胞提取的全基因组DNA为模板,PCR扩增CHD4基因候选启动子区2 091 bp片段,以pGL3-Basic为载体,克隆含有CHD4基因候选启动子区的序列,制备重组质粒,并且构建一系列含CHD4基因候选启动子5′侧翼区截短序列质粒。将含CHD4启动子序列的质粒及截短序列质粒转染至Jurkat细胞和人胚胎肾T细胞(HEK293T),双荧光素酶报告基因检测各片段的启动子活性,确定CHD4基因启动子最小活性区域,并通过生物信息学方法分析该区域转录因子结合位点,构建结合位点突变的质粒,通过双荧光素酶报告基因检测,分析结合位点对CHD4转录的影响。结果:流式细胞检测结果发现,与对照组比较,CHD4抑制Jurkat细胞凋亡,转染siRNA-CHD4的Jurkat细胞G0/G1期比例显著升高,而S期比例下降(P<0.01);CCK-8检测CHD4基因对Jurkat细胞的增殖有促进作用(P<0.05);成功构建含有CHD4基因候选启动子序列的质粒及其截短序列质粒,与pGL3-Basic空载体相比,含有CHD4基因候选启动子序列的质粒活性明显增加(P<0.05)。CHD4基因最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,其中包含NF-κB、MZF1等转录因子结合位点;NF-κB对CHD4启动子活性具有正向调控作用。结论:CHD4基因对Jurkat细胞凋亡有抑制作用,并且促进其增殖。CHD4最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,转录因子NF-κB对CHD4基因启动子活性具有正向调控作用。 展开更多
关键词 急性T细胞淋巴细胞白血病 凋亡 染色质解旋酶dna结合蛋白4(CHD4) 启动子 转录因子
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微小RNA-221-3p通过DDIT4抑制镉诱导的TM3细胞凋亡机制
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作者 罗皓珑 陈梦圆 +2 位作者 骈雅婧 周丽 任香梅 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期478-486,共9页
目的探讨微小RNA(microRNA,miRNA)中的miR-221-3p靶向DNA损伤诱导转录本4(DNA-damage-inducible transcript 4,DDIT4)对镉诱导小鼠睾丸间质细胞凋亡的影响和机制。方法小鼠睾丸间质细胞(mouse testicular stromal cells,TM3)经不同浓度... 目的探讨微小RNA(microRNA,miRNA)中的miR-221-3p靶向DNA损伤诱导转录本4(DNA-damage-inducible transcript 4,DDIT4)对镉诱导小鼠睾丸间质细胞凋亡的影响和机制。方法小鼠睾丸间质细胞(mouse testicular stromal cells,TM3)经不同浓度的镉(0、10、20、30和40μmol/L)染毒后,使用CCK-8检测细胞活性。提取镉染毒TM3细胞的总RNA,以差异倍数(fold change,FC)>1.2,P<0.05作为标准筛选显著差异表达miRNA。TM3细胞分为空白对照组、阴性对照组、镉染毒组(CdCl2,20μmol/L)和镉染毒+miR-221-3p模拟物组,其中对镉染毒+miR-221-3p模拟物组,先将miR-221-3p模拟物转染进TM3细胞,再联合镉染毒24 h。Hoechst染色检测细胞形态,流式细胞仪分析细胞凋亡率,实时荧光定量PCR和Western blot免疫印迹法检测DDIT4表达水平,双荧光素酶报告基因实验验证miR-221-3p与DDIT4的结合,生物信息学分析DDIT4的功能及与细胞凋亡的关联,过表达miR-221-3p后观察B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)和B淋巴细胞瘤-2相关X蛋白(Bcl-2 associated X protein,BAX)的表达水平。结果镉染毒可降低TM3细胞活性且存在剂量-效应关系。细胞形态学发现,与对照组相比,镉染毒组细胞皱缩、细胞核浓染,凋亡率升至19.66%±0.45%(P<0.01);与镉染毒组相比,镉染毒+miR-221-3p模拟物组正常形态细胞增多,凋亡率降至13.76%±0.37%(P<0.05)。镉染毒组miR-221-3p表达水平下调(P<0.01),DDIT4表达水平上调(P<0.05)。生物信息学分析和双荧光素酶报告分析发现DDIT4为miR-221-3p的靶基因之一。与镉染毒组相比,镉染毒+miR-221-3p模拟物组DDIT4表达水平下调(P<0.05),Bcl-2/BAX比值由0.54±0.03增加为0.71±0.04。结论miR-221-3p通过靶向DDIT4进而抑制镉诱导的TM3细胞凋亡。 展开更多
关键词 细胞凋亡 微小RNA-221-3p dna损伤诱导转录本4
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miR-7-5p抑制胰腺癌细胞放疗后加速再增殖的体外实验研究 被引量:3
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作者 叶志强 郭贵龙 +2 位作者 陈涵斌 吕奇原 谷甸娜 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2020年第5期297-303,共7页
目的研究放疗后濒死胰腺癌细胞(PANC-1)释放的微小RNA-7-5p(miR-7-5p)对存活PANC-1加速再增殖效应的相关机制。方法通过慢病毒感染,建立荧光素酶标记的PANC-1-LUC胰腺癌细胞放疗后加速再增殖模型。通过RT-qPCR检测miRNA-7-5p的表达水平... 目的研究放疗后濒死胰腺癌细胞(PANC-1)释放的微小RNA-7-5p(miR-7-5p)对存活PANC-1加速再增殖效应的相关机制。方法通过慢病毒感染,建立荧光素酶标记的PANC-1-LUC胰腺癌细胞放疗后加速再增殖模型。通过RT-qPCR检测miRNA-7-5p的表达水平,流式细胞仪检测细胞周期及凋亡,双荧光素酶法验证miR-7-5p靶基因,Western blotting检测γH2A.X与DDIT4蛋白的表达情况。结果miR-7-5p在受辐照PANC-1(10 Gy)濒死细胞上清中表达下调,受辐照PANC-1细胞与存活PANC-1-LUC细胞共培养,可促进放疗后存活PANC-1-LUC细胞加速再增殖及其DNA损伤修复,而上调miR-7-5p可抑制放疗后胰腺癌细胞PANC-1-LUC再增殖。进一步研究表明,miR-7-5p在胰腺癌细胞中通过靶向下调DDIT4通路促进凋亡信号。结论受辐照胰腺癌细胞可通过下调miR-7-5p促进DDIT4表达,从而抑制细胞凋亡及调控细胞周期再分布来加速再增殖,表明提高miR-7-5p的水平能够提高胰腺癌细胞的放疗敏感性,这将为改善胰腺癌放疗抵抗提供了一种新的思路和方法。 展开更多
关键词 胰腺癌 肿瘤再增殖 微小RNA-7 dna损伤诱导转录因子4(DDIT4) 凋亡 体外实验
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高通量数据分析DNA损伤诱导转录样蛋白4在脑多形性胶质母细胞瘤中表达及临床意义 被引量:3
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作者 张少校 吴瑛 《临床军医杂志》 CAS 2017年第10期1018-1021,共4页
目的探讨DNA损伤诱导转录样蛋白4(DDIT4L)在人脑多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达与患者预后的关系及相关机制。方法分别从癌症基因组图谱(TCGA)和人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载GBM的RNASeq V2数据,以及GBM样本数据集GSE769... 目的探讨DNA损伤诱导转录样蛋白4(DDIT4L)在人脑多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达与患者预后的关系及相关机制。方法分别从癌症基因组图谱(TCGA)和人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载GBM的RNASeq V2数据,以及GBM样本数据集GSE7696的系列矩阵数据。应用Kaplan-Meier和多因素COX逐步回归分析方法确定DDIT4L的预后价值,采用基因集富集分析方法分析DDIT4L相关的信号通路。结果 DDIT4L高表达是提示GBM术后患者预后不良的独立因素,其高表达与烟酸-烟酰胺代谢、组氨酸代谢、氮代谢、苯丙氨酸代谢相关通路增强有关。结论 DDIT4L高表达的GBM患者预后不良,可能通过对GBM中的烟酸-烟酰胺、组氨酸、氮或苯丙氨酸代谢的调节而发挥促肿瘤作用。 展开更多
关键词 人类肿瘤相关基因表达汇编 多形性胶质母细胞瘤 dna损伤诱导转录样蛋白4 癌症基因组图谱
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m4C DNA methylation regulates biosynthesis of daptomycin in Streptomyces roseosporus L30 被引量:1
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作者 Jiao-Le Fang Wen-Li Gao +6 位作者 Wei-Feng Xu Zhong-Yuan Lyu Lie Ma Shuai Luo Xin-Ai Chen Xu-Ming Mao Yong-Quan Li 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE 2022年第4期1013-1023,共11页
Despite numerous studies on transcriptional level regulation by single genes in drug producing Actinomyces,the global regulation based on epigenetic modification is not well explored.N4-methylcytosine(m4C),an abundant... Despite numerous studies on transcriptional level regulation by single genes in drug producing Actinomyces,the global regulation based on epigenetic modification is not well explored.N4-methylcytosine(m4C),an abundant epigenetic marker in Actinomycetes’genome,but its regulatory mechanism remains unclear.In this study,we identify a m4C methyltransferase(SroLm3)in Streptomyces roseosporus L30 and multi-omics studies were performed and revealed SroLm3 as a global regulator of secondary metabolism.Notably,three BGCs inΔsroLm3 strain exhibited decreased expression compared to wild type.In-frame deletion of sroLm3 in S.roseosporus L30 further revealed its role in enhancing daptomycin production.In summary,we characterized a m4C methyltransferase,revealed the function of m4C in secondary metabolism regulation and biosynthesis of red pigment,and mapped a series of novel regulators for daptomycin biosynthesis dominated by m4C methylation.Our research further indicated that m4C DNA methylation may contribute to a metabolic switch from primary to secondary metabolism in Actinomyces. 展开更多
关键词 N4-methylcytosine dna methyltransferase DAPTOMYCIN transcriptional regulator Secondary metabolism
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